Xate026951.1
Basic Information
- Insect
- Xylophagus ater
- Gene Symbol
- osa
- Assembly
- GCA_963422695.1
- Location
- OY730485.1:2871142-2902682[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 9 3.3e+04 -9.4 8.9 27 79 79 129 66 137 0.53 2 2 4.6e-25 1.7e-21 77.3 0.0 3 89 615 701 613 701 0.91
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGGTTCTGGCCCACCAGGTACACCAAATTCCCAACAGGCGATGAGACCAACACCATCACCAACTGGTTCATCTGGTTCAAGGTCTATGTCACCGGCTGTAggCCAACAGAGCCTTCCGATGCCGCCTCGTCCATCAAGTAGTCAACCACAAACAGGAGTTACACAGTTGCCACCAACGACAGCTGGAGTTAttagtaatagtaataatttAGTGAATGCACAACAGCATCatcaacagcagcaacaacatcttcatcatcttcatcagcagcagcaacaacaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacagcaacaacaacagcaacagcaacaacagcatcatcagcagcagcaacaacaacagcagcatcatctgcaacagcaacaacaacaacatttaCCACCAAgccaacatcaacaacaacaaccaacACCACAACAATTATTAGATTCATCCGGAGGTCCGGGATCTAGAACGCCTCAAACATCTGGTGGTTTACCAGGATTAGGCGGTGTTGGCTCAGGGTTAGGTTTAGGATTAGGAGTAGGAATTGGAGGTATTGGAACAGGTGGTGGTCCACCCACAAAtcctcaacaacaacaacaacaacagcaaccaCCAAGCTCATTACCAGGAACAATTCCTccacatcaacaacaacagcaacaacagcaaCCCGGTCAAACCGGAAATACAATGGCGGCACAAGGTAGTTATCAGACGCCACCGCCAATATCTCATATGCATGGTTATAAAATGGGACCGAGTCCAGGACAAGGTCCTGGGCCAGGTCCACAAAATATGCCTCCATATCCACCACCTCAGTCACAACAGTATTCACAAGGCAATTATCCGCCACGTCCACAATATACAAGTAATTATGGTCCAACTGGACCACCAACAGGACAACCACCGCCTGCAAATAGTATGCCACCAGGACCTGGACAATATCCAGGTCGGCCGTTACCAAATCATGTTGGTGGACCGCATTCACAATTCCCTCCATACCAACAAAGTTGGGCGCCACCATCACCACAAGCACCGAGTATGATAAGTAATCATGTACAGGGTAAAGGGACACCACCGCCATCACAGGCGAATGTTGGTTCACCGCGacctttaaattatttaaaacaacatTTACAACATAAAGGCGGTTATGTGGGTGCACAGAGTCCAACACCACCTCAAGGATATGGAAATGGTCCTGGTATGCATCCGCCAATGGGTCCACCACATCATATGGGTCCGCCACTTGGTCCGACAAATATGGGTCCGCCAACATCAGCACCACAAAGTACACCTCCACCACCGCCACCACCAATACAAACATTACAAACTCCTGGTGGCGGTATTATAGGTGGTGTTGGTGGTATTCCCGGTTCAAATATTAATTCAGATGCTAGTTCAACACCTGATCTAAATAGTTTATCACAGGATAATGGTGTTAGCTCATCAGGATCATCGGCAGCTAGTTCACATCCTGTAACATCTGTTGTTACAACTGGTCCGGATGGTGCACCCTTAGATGAAGCTAGCCAACAAAGTACATTATCAAATGCTTCAGCAGCTTCTGGTGAAGATCCACAATGTGTAACACCGAAATCAAGAAAAAATGAACCATATAATCAAAGTCATTTGGCACCACCAAGTGCCTCACCTGGTGCTCATCCACATGGTGGTGATGATTTTGAAATGAATTCACCATCATCATGGTCACGAACAGCAGCTAGTcctGTATTTAATAGCCACGTTCCACAGGAAACGTATCGAACATCTTCTAAGaaaTCCGATAGCCTATGCAAATTATATGATATGGATGATAATCCTGATAGACGTGGATGGTTAGATAAATTACTTAGTTTTATGGAAGAGAGACGTACACCCATATCAGCTTGTCCTACAATATCAAAACAACCATTAGATTTATATAGGTTATATATGTTGGTTAAAGAACGTGGAGGATTCGTCGAGGTATGCAAGgTTACCAAAAGTAAAACATGGAAAGATATTGCCGGTTTATTAGGAATTGGTGCAAGCAGTAGTGCAGCGTATACGTTAAGAAAacattatacaaaaaatttactAGCATTCGAATGTCATTTTGATCGTGGCGGTGTTGATCCACTACCAATAATCCAGCAAGTTGAGGCTGGATCAAAAAAGAAATCCGCCAAAGCAGCATCAGTACCATCACCAGGCTCATCAAATTCACAAGATTCATTTCCACCGCCGGGTGCAACACCAACATCAATGGATGGTTATCCTGGTTATCCTGGAAATTATCCACCAGGTGGTACGCAACAAGATTATCCGACACCACCGCAAATGCAAAGGCCGCCATCACAACAAAATAATGCACAGACGCCTCATACagGTAATACGCCGCAACAAACTGCTGGTGGTGACAATGTAAGTGTGAGCAATCCATTTGACGAGCCGGTTATTGGCACATCTTCCCGTGGCCCATATCAACAGGGTAGTGCCACATATCCTCCGGTGTCGCGGCCACAAgGTCCACCCTATCAAGGACAACCTGGTTATAATCAATATGGAGCAACTGAACAATATGGACCAACACCTGGTCCGCCTGGTCAATATCCACCAACGCAAGGTCAATTTCCACCACCAAATCGAACAATGTATCCGCCGTATGTACCCGAAAGTGATACtaatACACCTCCAACATCAGGTACATATGGATCTTATGTTCCTCCGCCACGACCATATAATCAACCGCCAGGAACTGTTGGTGCACAACAGCCGACACCAGGTGGTACACCAGGAACACCAGCTGGTGGGGCACAAACAGTTCCACCACCAGGTACACCAGGAACATATCCTCCACCGCCACCACAACAAGATTATTATAGACAACCAGAACAGaatgcaCAACCAAGAAGACATCCAGATTTTGCTAAAGATTCACAACCTTATCCACCATATGGTCAAAGACCTCAAATTTATggAGGATGGCAAAATAATACTGGTCAATATCGTGGTCAATATCCATCACAGCCAGGACCACAACCATGGGGTGCTGCTTCAAATCAACGTCCAACTGGTCCACCAGTACCAGGACAACAAGCAGCCGCTGCTGCAGCAGCTGCAGCACAATGGGAACAACAACATCGTTATCCACCAGTACAGGGTCAACAAGGACCATATCCAAATCCAGCAAATCAACCACAATGGAACAGTATAAGTGGTGGTCCAACACCGACTAGTCAAAATTCACCATTACGTCCGCCACAACGTACTAGCGGTAAACCGTTTAGTATGCCACCACCACAAGGTGGTGCTGGTGGTAAACAGGGTGGTCCACAACAACAAATTGGTGGTTATCCACCGGGTGTACCAATTGGCCAACCACAAAAACGTGATATTGTATTTCCACCAGATAGTGTGGAAGCAACAACACCAGTTTTATATAGACGAAAACGTTTGGCACGTAATGATGTTTGCCCGATTGATCCATGGCGTGTCTTTATGTCATTAAGATCTGGTCTGCTGGCAGAAAGTACATGGGCATTAGATATtcttaatatattattatttgatgataCCGCGGTGCATTATTTCGGTTTAACACATTTACCTGgactattaaatttattattagatcattttcaaaagaatttatccgaTATGTTCGATCCGGATGATGATAATAAACATGCATATGGATGGAAttgttttcataataataaaaataataaacaaataaataattataatcatAATAGTGTTGGTAGTAGTACTGGTCGATGTAGtcaaataaatgataataataataaaaataataatagtaataataataacaataataataataatgatgatgatgacgacgtTGATTTAGGACAAGTTACCAATGTACCAAATCCAGATGAACGTATACTAATACTtacctcaacaccaaattataCAATGATAACACGTAAAGGTATACCAGTACGGATACAAAATGCTGATGATGATATATTTGTATCggaattaccaaaaaaatggGATTATGatgcaaataaaaattatcaattaacAACACCAATCGGTAGTGATCCATGGACATTTGGACATATCGTAAGGCATCCACATGATGATCTTATTGATGTATTTAAAGCTGAAATTGTTAACATTCCATTTGCACGTTATATAAAAAATGATACTAAAAaagacaaaatattaaatataaatcgtGATCATCTTGAtgatggtggtggtggtggttctGGTATTGATGAAAATCTTAATACACAAAATGATGATGAAAATGGTGGTGATGTTAAAACTGcaataataacaattaaaaatgaTGTTAATATTGATGAGAAcgaggatgatgatgatgatgagacGCATACAAATGATGGTGATGATAATGATTCaattgataatgaaaatgatgatgacGAAGATGAGGATGAAtgtaatatattaaaaagaaataaacgtTGTAATTCAATATTTGGTCGTAAAAATAGCACtaatataaatatgaataataataataaacgtcGGTCATGTTCTAAAAATGGCCTAACCGAATCAAGTGCTAGTAAACGTGCTAAACTGAAAGATGATAAAGCAACAATAATaacgacaacaacaacaacagttgTATCATCAATTTcagcaacaacaataacaacatcaaaatggttggataataatacaaaattagatattaaaaatgaaataattaaacaaGAGATAATATTTGATGCTAAGAATACTATGAAAAAGGAACCAATCGATAGTGATTGTCGTGAAGTTGATATGGAATTGGAACCTCGTATATTACCGAATGGTccacaacaacagcaacagcaacagcaacaaacGAATACAGATGATACAATATGTGATGATAAAACAATTATTGATGTTAAAGAAACTACTCAATCATCAATAACATCATTAACATCGGCTGTATCATCAGCATCAATTACATCTGGTGGTGGTTCCTCTGATGATGATAAtagtatttcaaa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- Protein Sequence
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Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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