Basic Information

Gene Symbol
osa
Assembly
GCA_963422695.1
Location
OY730485.1:2871142-2902682[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 9 3.3e+04 -9.4 8.9 27 79 79 129 66 137 0.53
2 2 4.6e-25 1.7e-21 77.3 0.0 3 89 615 701 613 701 0.91

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGGTTCTGGCCCACCAGGTACACCAAATTCCCAACAGGCGATGAGACCAACACCATCACCAACTGGTTCATCTGGTTCAAGGTCTATGTCACCGGCTGTAggCCAACAGAGCCTTCCGATGCCGCCTCGTCCATCAAGTAGTCAACCACAAACAGGAGTTACACAGTTGCCACCAACGACAGCTGGAGTTAttagtaatagtaataatttAGTGAATGCACAACAGCATCatcaacagcagcaacaacatcttcatcatcttcatcagcagcagcaacaacaacaacaacaacaacaacagcaacaacaacagcaacaacaacagcaacagcaacaacagcatcatcagcagcagcaacaacaacagcagcatcatctgcaacagcaacaacaacaacatttaCCACCAAgccaacatcaacaacaacaaccaacACCACAACAATTATTAGATTCATCCGGAGGTCCGGGATCTAGAACGCCTCAAACATCTGGTGGTTTACCAGGATTAGGCGGTGTTGGCTCAGGGTTAGGTTTAGGATTAGGAGTAGGAATTGGAGGTATTGGAACAGGTGGTGGTCCACCCACAAAtcctcaacaacaacaacaacaacagcaaccaCCAAGCTCATTACCAGGAACAATTCCTccacatcaacaacaacagcaacaacagcaaCCCGGTCAAACCGGAAATACAATGGCGGCACAAGGTAGTTATCAGACGCCACCGCCAATATCTCATATGCATGGTTATAAAATGGGACCGAGTCCAGGACAAGGTCCTGGGCCAGGTCCACAAAATATGCCTCCATATCCACCACCTCAGTCACAACAGTATTCACAAGGCAATTATCCGCCACGTCCACAATATACAAGTAATTATGGTCCAACTGGACCACCAACAGGACAACCACCGCCTGCAAATAGTATGCCACCAGGACCTGGACAATATCCAGGTCGGCCGTTACCAAATCATGTTGGTGGACCGCATTCACAATTCCCTCCATACCAACAAAGTTGGGCGCCACCATCACCACAAGCACCGAGTATGATAAGTAATCATGTACAGGGTAAAGGGACACCACCGCCATCACAGGCGAATGTTGGTTCACCGCGacctttaaattatttaaaacaacatTTACAACATAAAGGCGGTTATGTGGGTGCACAGAGTCCAACACCACCTCAAGGATATGGAAATGGTCCTGGTATGCATCCGCCAATGGGTCCACCACATCATATGGGTCCGCCACTTGGTCCGACAAATATGGGTCCGCCAACATCAGCACCACAAAGTACACCTCCACCACCGCCACCACCAATACAAACATTACAAACTCCTGGTGGCGGTATTATAGGTGGTGTTGGTGGTATTCCCGGTTCAAATATTAATTCAGATGCTAGTTCAACACCTGATCTAAATAGTTTATCACAGGATAATGGTGTTAGCTCATCAGGATCATCGGCAGCTAGTTCACATCCTGTAACATCTGTTGTTACAACTGGTCCGGATGGTGCACCCTTAGATGAAGCTAGCCAACAAAGTACATTATCAAATGCTTCAGCAGCTTCTGGTGAAGATCCACAATGTGTAACACCGAAATCAAGAAAAAATGAACCATATAATCAAAGTCATTTGGCACCACCAAGTGCCTCACCTGGTGCTCATCCACATGGTGGTGATGATTTTGAAATGAATTCACCATCATCATGGTCACGAACAGCAGCTAGTcctGTATTTAATAGCCACGTTCCACAGGAAACGTATCGAACATCTTCTAAGaaaTCCGATAGCCTATGCAAATTATATGATATGGATGATAATCCTGATAGACGTGGATGGTTAGATAAATTACTTAGTTTTATGGAAGAGAGACGTACACCCATATCAGCTTGTCCTACAATATCAAAACAACCATTAGATTTATATAGGTTATATATGTTGGTTAAAGAACGTGGAGGATTCGTCGAGGTATGCAAGgTTACCAAAAGTAAAACATGGAAAGATATTGCCGGTTTATTAGGAATTGGTGCAAGCAGTAGTGCAGCGTATACGTTAAGAAAacattatacaaaaaatttactAGCATTCGAATGTCATTTTGATCGTGGCGGTGTTGATCCACTACCAATAATCCAGCAAGTTGAGGCTGGATCAAAAAAGAAATCCGCCAAAGCAGCATCAGTACCATCACCAGGCTCATCAAATTCACAAGATTCATTTCCACCGCCGGGTGCAACACCAACATCAATGGATGGTTATCCTGGTTATCCTGGAAATTATCCACCAGGTGGTACGCAACAAGATTATCCGACACCACCGCAAATGCAAAGGCCGCCATCACAACAAAATAATGCACAGACGCCTCATACagGTAATACGCCGCAACAAACTGCTGGTGGTGACAATGTAAGTGTGAGCAATCCATTTGACGAGCCGGTTATTGGCACATCTTCCCGTGGCCCATATCAACAGGGTAGTGCCACATATCCTCCGGTGTCGCGGCCACAAgGTCCACCCTATCAAGGACAACCTGGTTATAATCAATATGGAGCAACTGAACAATATGGACCAACACCTGGTCCGCCTGGTCAATATCCACCAACGCAAGGTCAATTTCCACCACCAAATCGAACAATGTATCCGCCGTATGTACCCGAAAGTGATACtaatACACCTCCAACATCAGGTACATATGGATCTTATGTTCCTCCGCCACGACCATATAATCAACCGCCAGGAACTGTTGGTGCACAACAGCCGACACCAGGTGGTACACCAGGAACACCAGCTGGTGGGGCACAAACAGTTCCACCACCAGGTACACCAGGAACATATCCTCCACCGCCACCACAACAAGATTATTATAGACAACCAGAACAGaatgcaCAACCAAGAAGACATCCAGATTTTGCTAAAGATTCACAACCTTATCCACCATATGGTCAAAGACCTCAAATTTATggAGGATGGCAAAATAATACTGGTCAATATCGTGGTCAATATCCATCACAGCCAGGACCACAACCATGGGGTGCTGCTTCAAATCAACGTCCAACTGGTCCACCAGTACCAGGACAACAAGCAGCCGCTGCTGCAGCAGCTGCAGCACAATGGGAACAACAACATCGTTATCCACCAGTACAGGGTCAACAAGGACCATATCCAAATCCAGCAAATCAACCACAATGGAACAGTATAAGTGGTGGTCCAACACCGACTAGTCAAAATTCACCATTACGTCCGCCACAACGTACTAGCGGTAAACCGTTTAGTATGCCACCACCACAAGGTGGTGCTGGTGGTAAACAGGGTGGTCCACAACAACAAATTGGTGGTTATCCACCGGGTGTACCAATTGGCCAACCACAAAAACGTGATATTGTATTTCCACCAGATAGTGTGGAAGCAACAACACCAGTTTTATATAGACGAAAACGTTTGGCACGTAATGATGTTTGCCCGATTGATCCATGGCGTGTCTTTATGTCATTAAGATCTGGTCTGCTGGCAGAAAGTACATGGGCATTAGATATtcttaatatattattatttgatgataCCGCGGTGCATTATTTCGGTTTAACACATTTACCTGgactattaaatttattattagatcattttcaaaagaatttatccgaTATGTTCGATCCGGATGATGATAATAAACATGCATATGGATGGAAttgttttcataataataaaaataataaacaaataaataattataatcatAATAGTGTTGGTAGTAGTACTGGTCGATGTAGtcaaataaatgataataataataaaaataataatagtaataataataacaataataataataatgatgatgatgacgacgtTGATTTAGGACAAGTTACCAATGTACCAAATCCAGATGAACGTATACTAATACTtacctcaacaccaaattataCAATGATAACACGTAAAGGTATACCAGTACGGATACAAAATGCTGATGATGATATATTTGTATCggaattaccaaaaaaatggGATTATGatgcaaataaaaattatcaattaacAACACCAATCGGTAGTGATCCATGGACATTTGGACATATCGTAAGGCATCCACATGATGATCTTATTGATGTATTTAAAGCTGAAATTGTTAACATTCCATTTGCACGTTATATAAAAAATGATACTAAAAaagacaaaatattaaatataaatcgtGATCATCTTGAtgatggtggtggtggtggttctGGTATTGATGAAAATCTTAATACACAAAATGATGATGAAAATGGTGGTGATGTTAAAACTGcaataataacaattaaaaatgaTGTTAATATTGATGAGAAcgaggatgatgatgatgatgagacGCATACAAATGATGGTGATGATAATGATTCaattgataatgaaaatgatgatgacGAAGATGAGGATGAAtgtaatatattaaaaagaaataaacgtTGTAATTCAATATTTGGTCGTAAAAATAGCACtaatataaatatgaataataataataaacgtcGGTCATGTTCTAAAAATGGCCTAACCGAATCAAGTGCTAGTAAACGTGCTAAACTGAAAGATGATAAAGCAACAATAATaacgacaacaacaacaacagttgTATCATCAATTTcagcaacaacaataacaacatcaaaatggttggataataatacaaaattagatattaaaaatgaaataattaaacaaGAGATAATATTTGATGCTAAGAATACTATGAAAAAGGAACCAATCGATAGTGATTGTCGTGAAGTTGATATGGAATTGGAACCTCGTATATTACCGAATGGTccacaacaacagcaacagcaacagcaacaaacGAATACAGATGATACAATATGTGATGATAAAACAATTATTGATGTTAAAGAAACTACTCAATCATCAATAACATCATTAACATCGGCTGTATCATCAGCATCAATTACATCTGGTGGTGGTTCCTCTGATGATGATAAtagtatttcaaa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Protein Sequence
MGSGPPGTPNSQQAMRPTPSPTGSSGSRSMSPAVGQQSLPMPPRPSSSQPQTGVTQLPPTTAGVISNSNNLVNAQQHHQQQQQHLHHLHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHHQQQQQQQQHHLQQQQQQHLPPSQHQQQQPTPQQLLDSSGGPGSRTPQTSGGLPGLGGVGSGLGLGLGVGIGGIGTGGGPPTNPQQQQQQQQPPSSLPGTIPPHQQQQQQQQPGQTGNTMAAQGSYQTPPPISHMHGYKMGPSPGQGPGPGPQNMPPYPPPQSQQYSQGNYPPRPQYTSNYGPTGPPTGQPPPANSMPPGPGQYPGRPLPNHVGGPHSQFPPYQQSWAPPSPQAPSMISNHVQGKGTPPPSQANVGSPRPLNYLKQHLQHKGGYVGAQSPTPPQGYGNGPGMHPPMGPPHHMGPPLGPTNMGPPTSAPQSTPPPPPPPIQTLQTPGGGIIGGVGGIPGSNINSDASSTPDLNSLSQDNGVSSSGSSAASSHPVTSVVTTGPDGAPLDEASQQSTLSNASAASGEDPQCVTPKSRKNEPYNQSHLAPPSASPGAHPHGGDDFEMNSPSSWSRTAASPVFNSHVPQETYRTSSKKSDSLCKLYDMDDNPDRRGWLDKLLSFMEERRTPISACPTISKQPLDLYRLYMLVKERGGFVEVCKVTKSKTWKDIAGLLGIGASSSAAYTLRKHYTKNLLAFECHFDRGGVDPLPIIQQVEAGSKKKSAKAASVPSPGSSNSQDSFPPPGATPTSMDGYPGYPGNYPPGGTQQDYPTPPQMQRPPSQQNNAQTPHTGNTPQQTAGGDNVSVSNPFDEPVIGTSSRGPYQQGSATYPPVSRPQGPPYQGQPGYNQYGATEQYGPTPGPPGQYPPTQGQFPPPNRTMYPPYVPESDTNTPPTSGTYGSYVPPPRPYNQPPGTVGAQQPTPGGTPGTPAGGAQTVPPPGTPGTYPPPPPQQDYYRQPEQNAQPRRHPDFAKDSQPYPPYGQRPQIYGGWQNNTGQYRGQYPSQPGPQPWGAASNQRPTGPPVPGQQAAAAAAAAAQWEQQHRYPPVQGQQGPYPNPANQPQWNSISGGPTPTSQNSPLRPPQRTSGKPFSMPPPQGGAGGKQGGPQQQIGGYPPGVPIGQPQKRDIVFPPDSVEATTPVLYRRKRLARNDVCPIDPWRVFMSLRSGLLAESTWALDILNILLFDDTAVHYFGLTHLPGLLNLLLDHFQKNLSDMFDPDDDNKHAYGWNCFHNNKNNKQINNYNHNSVGSSTGRCSQINDNNNKNNNSNNNNNNNNNDDDDDVDLGQVTNVPNPDERILILTSTPNYTMITRKGIPVRIQNADDDIFVSELPKKWDYDANKNYQLTTPIGSDPWTFGHIVRHPHDDLIDVFKAEIVNIPFARYIKNDTKKDKILNINRDHLDDGGGGGSGIDENLNTQNDDENGGDVKTAIITIKNDVNIDENEDDDDDETHTNDGDDNDSIDNENDDDEDEDECNILKRNKRCNSIFGRKNSTNINMNNNNKRRSCSKNGLTESSASKRAKLKDDKATIITTTTTTVVSSISATTITTSKWLDNNTKLDIKNEIIKQEIIFDAKNTMKKEPIDSDCREVDMELEPRILPNGPQQQQQQQQQTNTDDTICDDKTIIDVKETTQSSITSLTSAVSSASITSGGGSSDDDNSISNNNNNLKNNLKLKLEKDPKFNPIETVRDPASILKRRRITEYEDECYTRDESSLYLVNESHDTLARRCICISNIFRNLTFVPGNETVLAKSSTFLALLGKLLLLNHEHLIRAQKTRNYDREEDTDFADSCSSLQGEQEWWWDYLIQIRENMLVAVANIAGHLELSRYEEIITRPVLDGLLHWAVCPSAHGQDPFPSCGPNSSLSPQRLALEALCKLCVTDANVDLVIATPPFSRLEKLCSVLTRHLCRNEDQVLREFSVNLLHYLAAADSSMSRTVALQSPCISYLVAFIEQAEQTALGVANQHGINYLRENPDSMGTSLDMLRRAAGTLLHLSKHPDNRPLFMQQEQRLLGLVMSHILDQQVALIISRVLFQVSRGIISGCGQSTSSSDYKSLNHRRQQRKTNLLNSNGQMLIGNDINLICGNNNNNINNNNNNNNNNNNSNQQILSFGGSHSNTSTTTNLNNLNNMNMNNLNSNNNTCNITTGLNNNTTNNEILSNTNNTTILMSSATVSSISSSSSSSLSSSSSTILPPLSGTTTTIGNCNINNTINCSNSNSSSISSNSNSSCSSIISGNIIDDNATTAATTTTTAKMISTNLQSTIDSVGSGAGGGGGGGCDVSATTILTATTSSLTSSTTTTQLPMTLTSGLNLNNNNNSLNSNINNSGKNLTSINNSSSSSSSSNNNNSNSNNFNIISSGVDITTKTNINCNSSNNNNDNSNNNNSSNSSTSSSSSSSSSSNNSNNSGNSGNNNNNNNKNNISTTTTASTTTATTTTTNSSSNSNNNNNNNNNNNTSNSTTPTTAAVA

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
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80% Identity
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