Xspa017378.1
Basic Information
- Insect
- Xanthorhoe spadicearia
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_947086425.1
- Location
- OX352216.1:4369930-4373215[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-MIZ
- Domain
- zf-MIZ domain
- PFAM
- PF02891
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 24 35 19 43 0.84 2 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 58 69 53 77 0.84 3 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 92 103 87 111 0.84 4 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 126 137 121 145 0.84 5 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 160 171 155 179 0.84 6 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 194 205 189 213 0.84 7 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 228 239 223 247 0.84 8 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 262 273 257 281 0.84 9 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 296 307 291 315 0.84 10 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 330 341 325 349 0.84 11 31 0.0041 17 5.5 0.2 18 29 364 375 359 380 0.83 12 31 0.0027 11 6.1 0.3 16 29 396 409 381 417 0.80 13 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 432 443 427 451 0.84 14 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 466 477 461 485 0.84 15 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 500 511 495 519 0.84 16 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 534 545 529 553 0.84 17 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 568 579 563 587 0.84 18 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 602 613 597 621 0.84 19 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 636 647 631 655 0.84 20 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 670 681 665 689 0.84 21 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 704 715 699 723 0.84 22 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 738 749 733 757 0.84 23 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 772 783 767 791 0.84 24 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 806 817 801 825 0.84 25 31 0.0044 19 5.4 0.3 18 29 840 851 835 854 0.82 26 31 0.0044 19 5.4 0.3 18 29 874 885 869 888 0.82 27 31 0.0044 19 5.4 0.3 18 29 908 919 903 922 0.82 28 31 0.0037 15 5.6 0.1 18 29 942 953 937 961 0.84 29 31 0.0044 19 5.4 0.3 18 29 976 987 971 990 0.82 30 31 0.0044 19 5.4 0.3 18 29 1010 1021 1005 1024 0.82 31 31 0.005 21 5.2 0.4 18 29 1044 1055 1039 1057 0.81
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGTTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTTGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCAGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGAGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGAGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGAGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGAGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGAGCGGGTGACGTCCGCTAGCTCCGCTAGGCCGCGGGTGACCTCGGGAACATGCCCGGGCGCGGTGTGTACTCACTTGCAGTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGAGCGGGTGACTGCACTAGCATGGCGGCGGGCGCGCGGGTGA
- Protein Sequence
- MAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSACSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGERVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGERVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGERVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGARVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGERVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGERVTSASSARPRVTSGTCPGAVCTHLQCTSMAAGERVTALAWRRARG
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -