Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_956483605.1
Location
OY101437.1:18954120-18957587[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 6 2.4 2.8e+03 -1.1 0.0 23 43 139 160 133 163 0.85
2 6 0.038 44 4.6 0.0 23 44 238 260 212 262 0.86
3 6 0.0049 5.7 7.5 0.0 22 41 591 612 586 617 0.85
4 6 0.29 3.4e+02 1.8 0.0 22 42 660 683 636 685 0.76
5 6 1.5 1.8e+03 -0.5 0.0 23 31 850 858 823 879 0.80
6 6 1.4 1.7e+03 -0.4 0.0 10 44 1021 1070 1018 1072 0.64

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCTTCAAGAAGCATTTTTAAAACTGTGGAAGatatgaatacatttaaaaaccaatCAACTACTAAACTTATTAATTCGTCTACTTTGACCAAGATTTCTGAGAAAACTACATTAGTACCGTCTACATCATCCGTCCAGTCGAATCAAATATTGGTAATTAATAATGCTGAAGGTCAAACCATGTCCGGCATATTGTTACCTCTTAATCATTTCATGGTGAAATTGAATCAAAATCAATCACAAACTGCACCAGATACAGATGATTACATTGAGCGTGAATCtacttcaaaatatttttcaatgaataAGATCGAAAAGAAAATGTTTCGAGAAACATTTTTTCATACGCTCCTTGATTTTATGCATCAAATTATAAAGGATGGTCGTATTGTAAGCTCCTCTGACCCTATTTGGGATCATGTCGCTTCAAAGCTGGATAATATACTGAAGCCAAAAAGTATCTACAACCGTTTTGTTCTTAATAAACATTCTTGTAGAACTAGATTAATTGAAGTATATCTGTCAGATCCGAAAAGTCAAACAACAGATAAATCTGTGTTAAACCATATGATGGAAACAGATATGCATCACGAAGTAGTTGATAAAAGACCAGGTCATGTTGATAATGACACATTCTATGAagctttgtttttgtttaaagatagagttttaaaaaatggaGAGGTTGTCCCGAGTGTTGACTCTGTTTGGAATAATATTTCAGCACACTTGAACTATGCTTTAAAGccaaatagtatttatttgagATTCAAACGTAACACCCACAATTGCCATAAAAAGTTGCTTACACATTGCAAGCTGGATCCTTCCAAAGCTAAGACATATGATGTACCTAATCGAAAATGTGTACCATCAACagacaaatcaattaataaaataaaaaagaaaagtttaaaatttgaagattCTTCCAAATTTTTTAAAGCCTTATACACTCATAGACATAAGATCATACTAAATGGTTCCATagcaaaatacaataattctgTTTGGGGTGAAGTCTCAAGTATGTTAGATCAAGCTTTACAACCATCTGACGTCCACTCAaaatttattcgtaatcatgatTTATGCCAGACTAAACTCATCGAAGCGTGTAAAGAAGACGACAATTTTACTCCATTAGTTGTACCCAAGTTTAATAAGCCAAACTGTGTGTCTGATGAAACGTTTTTTAGTCTTTTATGTAAATATCGCAATGATATTTTACCAAATGGAAGTGAAATAGCCAAATTTTCTCATCCTGTTTGGACTCAAATTTCAAAAGATCTTAATGATACATTAAAACCGGCAACTGTATACTTTAGGGTGACAAGAAATGCACAGTTGTGTTTAAACAGACTAATTAAGCCTACTTCATTagtaaatactattaataatgataatttttttgaaataatttctttGTACAAATATTCAATAATGAACGGTGATCAAGTTGTAGATTTAAACGATCCAGTTTGGAATGAAATGTCTCTAAGATTAAACTCTTCGTTAACTCCTGAAGCTATCTATGAAGCTATTTCTCAAGATAAAGACTCGTGTAAGACAAAAATGATTGAAGCTTTAAAAACAGAACGTAGTGTATTTTCTGGTGAAAATCCTGAAATAACTGATAATATGACTGAATTAGCACCAATTGTTGAGtgtaaagtttttaatgaatcTATTAATgactttaatgaaatattaactaaatttaaaGACTCTATTTTAAAACCCAATGGACAAATAGCTTTAGAAAACGATCCTGTTTGGAAACAAGTATCTAgtcatttaaacaatttaacccCTGACGAAGTTTATTCACGTAtcgttaataattacaaaaattgtcgAACTCTACTTTTTGGCGTTGATAGTGTTGATACAGTTAATAATAACAAGTTATTTGAAGTAATATCTTCATACGGACATTTAGTTATGAATAATGATGTTATTGCACATGTTAATAATGAAGTCTGGACAAAAATCAGTGAAAAATTAAACCACTTATTGACACCGATGGAAATTTATATGCGATTTGTCAAAGACATTGATGGCTGTCGTACGAAATTGTTgaaatcttcaaaaaaaaaagacttgacTCGATCTCAAGGTATTGATAAAGACAAATTTTTAGATGTTATAATTAGCCATAAGagttctatatttaaaaatggatCACATGCTAAACCTAGTGATCCAATTTGGAGAGAAATGGCGtctaaacttaattttttagtaaaacctTTAACTTTGTATAATAACTTTATGTTAAATAGACATAATTGCCAACATAAACTTTTAGAAGCTTGTGAACAAGACAATGAAGAGGTAGTAACTTCACCAATTTCATCAAAAATAACTTCTCAGATGGACCATGACTATACAAAAGGAGAAGTAGATACAAGTTTTGAAGATTTAGTATCCATGAGACAAAAAGTTGGTTATGTACAAGAAAATGACTTTATTGAAGCttgtttaatgtttaaagacagattgttaaaaaataagaatatagtGCCTTCAACTGATAAAGTTTGGACTGATATAtcaaaacatcttaattatgcAATCAAAGCGAAAACAGCTTATTTGAGATTTAAACGTAACACTCATAATTGCCAGGAGAAATTGTTTCCAAGTTTTCAAGTAAATCAATTTACTTATGAGGGAGATGATACACTATGTTCCGAAGACCAATGCATTGAGAATGAAATGTTTTTTGATGCAATATCTATTTTCAAACATTCCATTATTAATAATGGCATTTTTGCTTTGGAAGCTAACCCAATTTGGTTAGATGTTTCAAATCTAATGAACAATTTACTTACTCCCGATGAAGCATTCTGgaaatttcgtcaaaatattgatttatgcCGAACAAAACTTATAAAGAAATGTATAACTGATTGGAGCCATGCACCTACCTCAGTTATTAAAAATCGGATTCACGTAATTAATTCCAAAGAATTATTATGGAAAGAATCTTTAGAAACTGAAAAACTTGCAAGAAAAAAGAATTGTCAAAAACCATTGGATGTGAATGATGATAATATATTCTATGATactatctataaatataaaaatgatatatttcacAATGACTTGATTGCAAGCTGTGCAAGTCCTGTATGGACAGCTATAgccaatgaattaaataatgaaattgacCCATCAAAAATTTActtgagatttacaaataatatgacTAAAAGCAACCAAAAATTTGCTGAAGCAGCTAAGAGACATAAtctctataaaataaaacaaaaccaaattcAAACACAATCACAAATTGAGAATTATAATGATTCTCATGACCAGGATATGGTGACTGATAATGAAAACGAAGAAGCTGTAGAATTAGATGTGGGAAAGTTTGATTACAGACAAAACAATCAAATGACTATTATGCAAATAGAATCTCAATTAAATCAACATGTGACTAaagggaaataa
Protein Sequence
MSSRSIFKTVEDMNTFKNQSTTKLINSSTLTKISEKTTLVPSTSSVQSNQILVINNAEGQTMSGILLPLNHFMVKLNQNQSQTAPDTDDYIERESTSKYFSMNKIEKKMFRETFFHTLLDFMHQIIKDGRIVSSSDPIWDHVASKLDNILKPKSIYNRFVLNKHSCRTRLIEVYLSDPKSQTTDKSVLNHMMETDMHHEVVDKRPGHVDNDTFYEALFLFKDRVLKNGEVVPSVDSVWNNISAHLNYALKPNSIYLRFKRNTHNCHKKLLTHCKLDPSKAKTYDVPNRKCVPSTDKSINKIKKKSLKFEDSSKFFKALYTHRHKIILNGSIAKYNNSVWGEVSSMLDQALQPSDVHSKFIRNHDLCQTKLIEACKEDDNFTPLVVPKFNKPNCVSDETFFSLLCKYRNDILPNGSEIAKFSHPVWTQISKDLNDTLKPATVYFRVTRNAQLCLNRLIKPTSLVNTINNDNFFEIISLYKYSIMNGDQVVDLNDPVWNEMSLRLNSSLTPEAIYEAISQDKDSCKTKMIEALKTERSVFSGENPEITDNMTELAPIVECKVFNESINDFNEILTKFKDSILKPNGQIALENDPVWKQVSSHLNNLTPDEVYSRIVNNYKNCRTLLFGVDSVDTVNNNKLFEVISSYGHLVMNNDVIAHVNNEVWTKISEKLNHLLTPMEIYMRFVKDIDGCRTKLLKSSKKKDLTRSQGIDKDKFLDVIISHKSSIFKNGSHAKPSDPIWREMASKLNFLVKPLTLYNNFMLNRHNCQHKLLEACEQDNEEVVTSPISSKITSQMDHDYTKGEVDTSFEDLVSMRQKVGYVQENDFIEACLMFKDRLLKNKNIVPSTDKVWTDISKHLNYAIKAKTAYLRFKRNTHNCQEKLFPSFQVNQFTYEGDDTLCSEDQCIENEMFFDAISIFKHSIINNGIFALEANPIWLDVSNLMNNLLTPDEAFWKFRQNIDLCRTKLIKKCITDWSHAPTSVIKNRIHVINSKELLWKESLETEKLARKKNCQKPLDVNDDNIFYDTIYKYKNDIFHNDLIASCASPVWTAIANELNNEIDPSKIYLRFTNNMTKSNQKFAEAAKRHNLYKIKQNQIQTQSQIENYNDSHDQDMVTDNENEEAVELDVGKFDYRQNNQMTIMQIESQLNQHVTKGK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00340506;
90% Identity
-
80% Identity
-