Tsal019129.1
Basic Information
- Insect
- Tuberolachnus salignus
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_956483605.1
- Location
- OY101437.1:18954120-18957587[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 6 2.4 2.8e+03 -1.1 0.0 23 43 139 160 133 163 0.85 2 6 0.038 44 4.6 0.0 23 44 238 260 212 262 0.86 3 6 0.0049 5.7 7.5 0.0 22 41 591 612 586 617 0.85 4 6 0.29 3.4e+02 1.8 0.0 22 42 660 683 636 685 0.76 5 6 1.5 1.8e+03 -0.5 0.0 23 31 850 858 823 879 0.80 6 6 1.4 1.7e+03 -0.4 0.0 10 44 1021 1070 1018 1072 0.64
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTCTTCAAGAAGCATTTTTAAAACTGTGGAAGatatgaatacatttaaaaaccaatCAACTACTAAACTTATTAATTCGTCTACTTTGACCAAGATTTCTGAGAAAACTACATTAGTACCGTCTACATCATCCGTCCAGTCGAATCAAATATTGGTAATTAATAATGCTGAAGGTCAAACCATGTCCGGCATATTGTTACCTCTTAATCATTTCATGGTGAAATTGAATCAAAATCAATCACAAACTGCACCAGATACAGATGATTACATTGAGCGTGAATCtacttcaaaatatttttcaatgaataAGATCGAAAAGAAAATGTTTCGAGAAACATTTTTTCATACGCTCCTTGATTTTATGCATCAAATTATAAAGGATGGTCGTATTGTAAGCTCCTCTGACCCTATTTGGGATCATGTCGCTTCAAAGCTGGATAATATACTGAAGCCAAAAAGTATCTACAACCGTTTTGTTCTTAATAAACATTCTTGTAGAACTAGATTAATTGAAGTATATCTGTCAGATCCGAAAAGTCAAACAACAGATAAATCTGTGTTAAACCATATGATGGAAACAGATATGCATCACGAAGTAGTTGATAAAAGACCAGGTCATGTTGATAATGACACATTCTATGAagctttgtttttgtttaaagatagagttttaaaaaatggaGAGGTTGTCCCGAGTGTTGACTCTGTTTGGAATAATATTTCAGCACACTTGAACTATGCTTTAAAGccaaatagtatttatttgagATTCAAACGTAACACCCACAATTGCCATAAAAAGTTGCTTACACATTGCAAGCTGGATCCTTCCAAAGCTAAGACATATGATGTACCTAATCGAAAATGTGTACCATCAACagacaaatcaattaataaaataaaaaagaaaagtttaaaatttgaagattCTTCCAAATTTTTTAAAGCCTTATACACTCATAGACATAAGATCATACTAAATGGTTCCATagcaaaatacaataattctgTTTGGGGTGAAGTCTCAAGTATGTTAGATCAAGCTTTACAACCATCTGACGTCCACTCAaaatttattcgtaatcatgatTTATGCCAGACTAAACTCATCGAAGCGTGTAAAGAAGACGACAATTTTACTCCATTAGTTGTACCCAAGTTTAATAAGCCAAACTGTGTGTCTGATGAAACGTTTTTTAGTCTTTTATGTAAATATCGCAATGATATTTTACCAAATGGAAGTGAAATAGCCAAATTTTCTCATCCTGTTTGGACTCAAATTTCAAAAGATCTTAATGATACATTAAAACCGGCAACTGTATACTTTAGGGTGACAAGAAATGCACAGTTGTGTTTAAACAGACTAATTAAGCCTACTTCATTagtaaatactattaataatgataatttttttgaaataatttctttGTACAAATATTCAATAATGAACGGTGATCAAGTTGTAGATTTAAACGATCCAGTTTGGAATGAAATGTCTCTAAGATTAAACTCTTCGTTAACTCCTGAAGCTATCTATGAAGCTATTTCTCAAGATAAAGACTCGTGTAAGACAAAAATGATTGAAGCTTTAAAAACAGAACGTAGTGTATTTTCTGGTGAAAATCCTGAAATAACTGATAATATGACTGAATTAGCACCAATTGTTGAGtgtaaagtttttaatgaatcTATTAATgactttaatgaaatattaactaaatttaaaGACTCTATTTTAAAACCCAATGGACAAATAGCTTTAGAAAACGATCCTGTTTGGAAACAAGTATCTAgtcatttaaacaatttaacccCTGACGAAGTTTATTCACGTAtcgttaataattacaaaaattgtcgAACTCTACTTTTTGGCGTTGATAGTGTTGATACAGTTAATAATAACAAGTTATTTGAAGTAATATCTTCATACGGACATTTAGTTATGAATAATGATGTTATTGCACATGTTAATAATGAAGTCTGGACAAAAATCAGTGAAAAATTAAACCACTTATTGACACCGATGGAAATTTATATGCGATTTGTCAAAGACATTGATGGCTGTCGTACGAAATTGTTgaaatcttcaaaaaaaaaagacttgacTCGATCTCAAGGTATTGATAAAGACAAATTTTTAGATGTTATAATTAGCCATAAGagttctatatttaaaaatggatCACATGCTAAACCTAGTGATCCAATTTGGAGAGAAATGGCGtctaaacttaattttttagtaaaacctTTAACTTTGTATAATAACTTTATGTTAAATAGACATAATTGCCAACATAAACTTTTAGAAGCTTGTGAACAAGACAATGAAGAGGTAGTAACTTCACCAATTTCATCAAAAATAACTTCTCAGATGGACCATGACTATACAAAAGGAGAAGTAGATACAAGTTTTGAAGATTTAGTATCCATGAGACAAAAAGTTGGTTATGTACAAGAAAATGACTTTATTGAAGCttgtttaatgtttaaagacagattgttaaaaaataagaatatagtGCCTTCAACTGATAAAGTTTGGACTGATATAtcaaaacatcttaattatgcAATCAAAGCGAAAACAGCTTATTTGAGATTTAAACGTAACACTCATAATTGCCAGGAGAAATTGTTTCCAAGTTTTCAAGTAAATCAATTTACTTATGAGGGAGATGATACACTATGTTCCGAAGACCAATGCATTGAGAATGAAATGTTTTTTGATGCAATATCTATTTTCAAACATTCCATTATTAATAATGGCATTTTTGCTTTGGAAGCTAACCCAATTTGGTTAGATGTTTCAAATCTAATGAACAATTTACTTACTCCCGATGAAGCATTCTGgaaatttcgtcaaaatattgatttatgcCGAACAAAACTTATAAAGAAATGTATAACTGATTGGAGCCATGCACCTACCTCAGTTATTAAAAATCGGATTCACGTAATTAATTCCAAAGAATTATTATGGAAAGAATCTTTAGAAACTGAAAAACTTGCAAGAAAAAAGAATTGTCAAAAACCATTGGATGTGAATGATGATAATATATTCTATGATactatctataaatataaaaatgatatatttcacAATGACTTGATTGCAAGCTGTGCAAGTCCTGTATGGACAGCTATAgccaatgaattaaataatgaaattgacCCATCAAAAATTTActtgagatttacaaataatatgacTAAAAGCAACCAAAAATTTGCTGAAGCAGCTAAGAGACATAAtctctataaaataaaacaaaaccaaattcAAACACAATCACAAATTGAGAATTATAATGATTCTCATGACCAGGATATGGTGACTGATAATGAAAACGAAGAAGCTGTAGAATTAGATGTGGGAAAGTTTGATTACAGACAAAACAATCAAATGACTATTATGCAAATAGAATCTCAATTAAATCAACATGTGACTAaagggaaataa
- Protein Sequence
- MSSRSIFKTVEDMNTFKNQSTTKLINSSTLTKISEKTTLVPSTSSVQSNQILVINNAEGQTMSGILLPLNHFMVKLNQNQSQTAPDTDDYIERESTSKYFSMNKIEKKMFRETFFHTLLDFMHQIIKDGRIVSSSDPIWDHVASKLDNILKPKSIYNRFVLNKHSCRTRLIEVYLSDPKSQTTDKSVLNHMMETDMHHEVVDKRPGHVDNDTFYEALFLFKDRVLKNGEVVPSVDSVWNNISAHLNYALKPNSIYLRFKRNTHNCHKKLLTHCKLDPSKAKTYDVPNRKCVPSTDKSINKIKKKSLKFEDSSKFFKALYTHRHKIILNGSIAKYNNSVWGEVSSMLDQALQPSDVHSKFIRNHDLCQTKLIEACKEDDNFTPLVVPKFNKPNCVSDETFFSLLCKYRNDILPNGSEIAKFSHPVWTQISKDLNDTLKPATVYFRVTRNAQLCLNRLIKPTSLVNTINNDNFFEIISLYKYSIMNGDQVVDLNDPVWNEMSLRLNSSLTPEAIYEAISQDKDSCKTKMIEALKTERSVFSGENPEITDNMTELAPIVECKVFNESINDFNEILTKFKDSILKPNGQIALENDPVWKQVSSHLNNLTPDEVYSRIVNNYKNCRTLLFGVDSVDTVNNNKLFEVISSYGHLVMNNDVIAHVNNEVWTKISEKLNHLLTPMEIYMRFVKDIDGCRTKLLKSSKKKDLTRSQGIDKDKFLDVIISHKSSIFKNGSHAKPSDPIWREMASKLNFLVKPLTLYNNFMLNRHNCQHKLLEACEQDNEEVVTSPISSKITSQMDHDYTKGEVDTSFEDLVSMRQKVGYVQENDFIEACLMFKDRLLKNKNIVPSTDKVWTDISKHLNYAIKAKTAYLRFKRNTHNCQEKLFPSFQVNQFTYEGDDTLCSEDQCIENEMFFDAISIFKHSIINNGIFALEANPIWLDVSNLMNNLLTPDEAFWKFRQNIDLCRTKLIKKCITDWSHAPTSVIKNRIHVINSKELLWKESLETEKLARKKNCQKPLDVNDDNIFYDTIYKYKNDIFHNDLIASCASPVWTAIANELNNEIDPSKIYLRFTNNMTKSNQKFAEAAKRHNLYKIKQNQIQTQSQIENYNDSHDQDMVTDNENEEAVELDVGKFDYRQNNQMTIMQIESQLNQHVTKGK
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00340506;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -