Tshe032207.1
Basic Information
- Insect
- Timema shepardi
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_902151425.1
- Location
- CABFVX010003253.1:72962-74672[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2HC
- Domain
- zf-C2HC domain
- PFAM
- PF01530
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This is a DNA binding zinc finger domain.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 12 0.0087 1.5e+02 5.0 0.0 18 28 16 26 15 27 0.87 2 12 0.01 1.8e+02 4.7 0.0 18 28 50 60 49 61 0.86 3 12 0.083 1.4e+03 1.8 0.1 19 27 85 93 83 95 0.81 4 12 0.01 1.8e+02 4.7 0.0 18 28 118 128 117 129 0.86 5 12 0.0087 1.5e+02 5.0 0.0 18 28 152 162 151 163 0.87 6 12 0.0096 1.6e+02 4.8 0.1 18 28 186 196 185 197 0.86 7 12 0.064 1.1e+03 2.2 0.1 18 28 209 219 208 220 0.86 8 12 0.0082 1.4e+02 5.1 0.0 18 28 243 253 242 254 0.87 9 12 0.0087 1.5e+02 5.0 0.0 18 28 277 287 276 288 0.87 10 12 0.0096 1.6e+02 4.8 0.1 18 28 322 332 321 333 0.86 11 12 0.068 1.1e+03 2.1 0.2 18 28 367 377 360 378 0.84 12 12 0.091 1.5e+03 1.7 0.1 18 28 401 411 400 412 0.86
Sequence Information
- Coding Sequence
- atgtcccttggtcttcctcacGCTCATCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCAGCTGTCCCTAGGTCTTCCTCACGCTCTTCATCCGgatgtcccttggtcttcctcacGCTCATCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCAGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCAAGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTCGTCTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCggctgtcccttggtcttcctcgcGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGGCTTCCTCACACTCTTCATCCggctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTAGTCATCCTCACGCTCTATCATCCggctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATACAGTTGTCCCTTGATCTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGATCTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCATCATCCGGTTGTCCCTTGATCTTCCTCACGCTCTTCATCCGGTTGTCCCTTGATCTTCCTCACGCTCTTCATCCGGCTGTTCCTTGGACTTCCTCACGCTCATCATCCGGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCATCATCCggctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCGctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCagctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCGGCTGTCCCTTAGTCACCCTCACGCTCATAATCCGGTTGTCCCTTGATCTTCCTCACGCTCTTCATCCggctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCCGATACCCTTGGTCTTCCTCACGCTCTTCATCCcgctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCagctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTTATCCggctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCCGCTGTCCCTTGGACTTCCTCACGCTCTTCATCCggctgtcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCGGCtatcccttggtcttcctcacGCTCTTCATCCGGCTATCCCTTGGACTTCCTCACGCTCATCATCGAGCTGACCCTTGGCCTTCCTCACGGCCTTATACTTCTCACCGTCATATACAACATCCGCGGTGCAGGAGCCCTGAAACATGGTGGCTGGAGCATGGGGTTCTGGGGGAACTACGATAAGCTACTCAAGCCAGAAGTggattttttataa
- Protein Sequence
- MSLGLPHAHHPAVPWTSSRSSSGCPLDFLTLFIQLSLGLPHALHPDVPWSSSRSSSGCPLDFLTLFIQLSLGLPHALHPAVPWTSSSSSSGCPFVFLTLFIRLSLGLPHALHPAVPWSSSRSSSGCPLDFLTLFIRLSLGLPHALHPAVPWTSSRSSSGCPLDFLTLFIRLSLGLPHTLHPAVPWSSSRSSSGCPLVILTLYHPAVPWSSSRSSYSCPLIFLTLFIRLSLDLPHALHPAVPWTSSRSSSGCPLIFLTLFIRLSLDLPHALHPAVPWTSSRSSSGCPLDFLTLIIRLSLGLPHALHPLSLGLPHALHPAVPWSSSRSSSGCPLVTLTLIIRLSLDLPHALHPAVPWSSSRSSSRYPWSSSRSSSRCPLVFLTLFIQLSLGLPHALYPAVPWSSSRSSSRCPLDFLTLFIRLSLGLPHALHPAIPWSSSRSSSGYPLDFLTLIIELTLGLPHGLILLTVIYNIRGAGALKHGGWSMGFWGNYDKLLKPEVDFL*
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -