Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_002237135.5
Location
CM026972.3:49621113-49674099[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 30 5.2e-13 1e-09 40.3 6.9 1 86 756 828 756 829 0.81
2 30 1.3e-11 2.7e-08 35.8 5.9 1 87 856 925 856 925 0.82
3 30 2.5e-14 5.1e-11 44.5 0.1 1 85 947 1015 947 1017 0.84
4 30 3.6e-14 7.1e-11 44.0 2.1 1 86 1090 1158 1090 1159 0.81
5 30 3.1e-12 6.3e-09 37.8 5.1 1 86 1183 1254 1183 1255 0.80
6 30 1.5e-12 3e-09 38.8 0.5 1 87 1291 1360 1291 1360 0.79
7 30 9.9e-11 2e-07 33.0 2.3 1 64 1400 1458 1400 1472 0.74
8 30 1.9e-15 3.7e-12 48.1 2.9 1 87 1497 1568 1497 1568 0.79
9 30 2e-12 4.1e-09 38.4 0.7 1 85 1600 1670 1600 1672 0.83
10 30 1.6e-05 0.031 16.3 0.1 1 58 1838 1887 1838 1909 0.80
11 30 2.1e-14 4.1e-11 44.8 0.9 1 87 1933 2005 1933 2005 0.84
12 30 3.1e-16 6.2e-13 50.6 0.9 1 87 2035 2105 2035 2105 0.80
13 30 7.9e-11 1.6e-07 33.3 7.7 1 87 2144 2214 2144 2214 0.81
14 30 4e-13 8e-10 40.7 0.2 1 87 2236 2305 2236 2305 0.80
15 30 3.7e-14 7.3e-11 44.0 0.6 1 87 2475 2544 2475 2544 0.79
16 30 1.1e-11 2.1e-08 36.1 2.4 1 86 2597 2665 2597 2666 0.81
17 30 1e-10 2.1e-07 32.9 2.1 1 87 2692 2761 2692 2761 0.75
18 30 2.7e-14 5.4e-11 44.4 3.1 1 86 2807 2877 2807 2878 0.83
19 30 2.5e-13 4.9e-10 41.3 2.7 1 86 2901 2969 2901 2970 0.79
20 30 6e-12 1.2e-08 36.9 1.0 1 87 3003 3070 3003 3070 0.82
21 30 7e-14 1.4e-10 43.1 0.9 1 87 3100 3170 3100 3170 0.81
22 30 1.2e-12 2.4e-09 39.1 5.8 1 87 3198 3267 3198 3267 0.80
23 30 4.1e-15 8.3e-12 47.0 2.6 1 87 3291 3363 3291 3363 0.82
24 30 8.5e-06 0.017 17.2 2.6 1 82 3400 3469 3400 3473 0.75
25 30 5.1e-13 1e-09 40.3 1.9 1 86 3501 3576 3501 3577 0.81
26 30 9.6e-12 1.9e-08 36.2 0.1 1 87 3892 3964 3892 3964 0.77
27 30 7.6e-11 1.5e-07 33.4 0.1 1 86 4002 4072 4002 4073 0.77
28 30 3.1e-14 6.2e-11 44.2 0.3 1 87 4092 4165 4092 4165 0.81
29 30 1.4e-14 2.8e-11 45.3 4.7 1 87 4211 4286 4211 4286 0.82
30 30 8.1e-12 1.6e-08 36.5 0.2 1 87 4410 4480 4410 4480 0.82

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCGCaccacaataataacaacaggcATGCACAGTGGCACACACATGTTGTAAACGCAAATCAAAGCACCGCAAATTTGTTTACTGGTGGACATATGGTTGGAAATATGGTCGAGCCTAGTGGCTATGTAGGCGGTGGTAATTTCGGCAACAACAGCGCCGTTCCAACCTATGACAACAGCAGTGGTGTTGGTTACGGACAACAACCCATTGGAAATTACCACCTGCAAATGCAACATGGTTACAATAACTACAATAATGGCTATAACTATGTTATGCCACAGGCACCTCCGAATCCAGTAACCCAAACCAATGTAACTTCAACTCAAAATTACTATCCAAATTATACACATCAATTGAACCAGGCTATTAATCCACCTACTATTCCAACTGTTCCACATCATACTACGTCTATTTTGAATAACATACAAACACATTCAATGCCAGCCAGTGATTTGAATATGCAAAtAGACGCCGAAGATATCGTTCCTACAGTTGCTGAGTTGTATAAACAACATCCCATAATTCCAGCCATGCCAAACACAACAATTCAAGCAACTACTACATTATTAAATCCAGCAACAGCTGCTTTGTCATCAAATATTGCAGCTGCGGTAACACCAGCAGCAACTGTACCAGCTTCAGTTGCTCCAGTAACGAATTATATGCAACCAACTGTAAATTCAATGGATTCAGCTGTACAATTTATACAAACAATACCAACTACAAATGCCACAGCAACAAATTTATTAGCATCAGCAACAAATTTGATTGCACCATCTATATCTACAAATGCATCAGCATCAAGCTTAATCCAATCTGCCATAGTACCGACTTTAGCATCGGGTTTAACTCCAGAATCAACATCAACATTAATAATAGAACCAGCACCAGTATCAGCTGATACTTCAATGAATCCATTAACTGGTTCAATAGTTCCTTCAACTACTTCCATGGTAGCCACAACAATTAAAGAAGTACCATCACCAGCACCTTCAACAGCTATAAtagcaccagcactagcacCAGCAACAACTGTAATAGTACCAGCCACAACTATAATTGCACCAGCAACAACTTCAGAATTATTTGCACAAGCCGATATGAATCTACCTGTGACAACTACAACAGTTTCAGTTGGCACAGATGTTACTACGGCAAATTCAGCACATGCTATAACCTCAACTGAATCTTATAATGCTGCAGCTTCTACAATTGCAAATACTGCAACTACAACCATATTTGCAACTGAAATTCCAGCCATTTCAACAATTGCAGCTGCAACAGAAACCAAACCAATAATAACTTCGTCTTCACTGATTGGAGCAAGTACAAGTTCGTCACATATTTTCACTGGACCTGGGTCATCCAATAAAAagACTATTAATTTTCCTCGTCGTAAATTACAAACGGAGAAGTCCGATACACTTCCGATTTGTCAACGCTGCAAAGCTATATTCTTcaagaaacaaatttttgtaaaacatattGCACAGAGTTCCTGCAAAATGTTAGAATTTGATATCAAATGTGGTATATGCCCAATGTCGTTTATGTCCAACGAAGAACTTCAGAACCATGAGAAGttgcataaaacaaataaatttttctgccAAAAATATTGTGGCaaatattttgatgaaattgaAGCATGTGAAAATCATGAATATACCCAACATGAATATATGACATTCGTCTGTAATGTTTGTTCTGCAACTTATGGAGTACGTGAACATTTTCTCGCTCATTTAGCACAACATAAGAATCAAAAACGTTTCGATTGTCCTGTCTGCAGATTATCATTCAGTTTACCCCAAGAATTATATGAACATCGGCTCGGTGAGCCTTTCTTCTGTGGTAAATATTATGATGGTAGCAGTTGCTTTGATATAAAGAAATCCAATGATCCTATGCCAAATTATAGTCCAGATacctataatttaaatacattagaaGaacCATCTACTTCCAGTCAAGTCTTACTAAATAATTCCatgaaaaaaccaaattttaatcaagagcataaaattatttctaccgGTTCAGGTATTGTTGATAATATTTTGGAATCCTTTCATATGCAAACATCGCAAACTATTAAAATGGAAATTGATCCTGATAATGATTATTTCAATACACATAATATACCCTTTAATACAGAACAATCCATGTCGTCATACACAAACAAGTTCAGCGTTGAAGCACTCAATGTGTATTCTTCTCATCAAAACTCTGAAGCTATTGGTGAGAATGAGAATTCATTTTGTTGTGTGCCTAAATGTGGTGTAAGCAAAAGCACCAGTCCTTCATTGCAATTTTTTCCGTtcccaaaaactgaaaaatatttgttgcaatGGTTTCACAATTTAAGAATGGATTTTAAATCCCAAGTGAAATGTCGTACATACCGTATTTGCAGTTTGCATTTTCCAAAACGTTGCATTAATCGGTATTCGCTATGTTATTGGGCGGTACCCACATTTAATCTGGGGCATGATAATGTTGCTAATCTCTATCAAAACCGTGAGGTTACCAAAATCTATACTAGTGGTCCGAATGCGCAATGTAGCATGCCTGAATGTGAAAACACTCGTGGTGTGtgtaatctaaaattttataattttcctaCGCATACGAACATTTTGATTAAATGGTGTCAAAATGCTCGTTTACCCGTTAACGCAAGGGAGCCTAGGCACTTTTGTGGTAAACATTTTGAAGATCATTGTTTTGGTAAGTTTCGTTTAAAACCTTGGGCAGTTCCAACGCTGCACTTGGGAAATCAATTTGGCAGAATACATGATAATCCGGTTGTAACTAATGTTGAAgagaaaaaatgttgtttacCACACTGTAAACGTACGCGTTCATCTAATTTGTCGCTTTATCGATTTCCAAGAGATCATGGCATGTTAGAACGTTGGTGCTATAACCTAGGGTTAGATGCAGAAGCATATCGtggaaaaaaccaaaaaatttgtaGCATGCATTTCGTAAAAGAAGCATTGGGCTTGCGTAAACTTACTTcaggtgCTGTACCAACAGAAAATCTTGGACACAATGATAAAAAGGAATTATACAAATGTGAAACATATATTCCACCtgcaccaccaccaccaccggCTGCACCAATAGTTAAACCGCTCCCAGAAGCAGCCATAGCACCACATCCATATcagtttataaatgaaaattcgCAACCATCGCCACCCAACGATGAAACATGTCCAACATCGTCATCGTCGCTATATGACGTAGCCGATATTTGTTTAGTACACAGTTGCAAAAACACTCGTAAAACAAAGAGTATTACTTTACATACAATACCGCGTCGTTTAGAACAACGTAGAAAATGGCTACATAACTTAAGACTTTCATCAAAACAAATACACAAGGGAATGCGTATCTGCAGTGTACATTTTGAACCTTATTGTATTGGCGGTTGCATGCGACCTTTTGCAGTACCAACTTTAAAATTGGGTCATAATGACACGAACATATATAGAAATCCAAAAGTAATAAAGAAACTAAACATACGCGAAACATGTTGTGTAGAAACCTGCAAACGTAACCGCGATCGTGATCATGCTAATTTACACCGTTTCCCGTGGAATTTGCCACAATTGCAAAAATGGTGCGAAAATTTGCACAAACCAGTACCAGatggtattaaattatttaatgatgcCATTTGCGAAGTTCATTTTGAAGCACGTTGTTTACGCGGTAAGCGGTTAGAAAAATGGTCGATACCCACACTTAAATTGGGACATAATGATGTTGTTACTCATCAACTACCCTCAGACGTGGAAATAGCTGAACAATGGCCAAAAATATCCGTTCCTAATGTGAATGTTGAAGAAGGCGAATGCTGTGTGGAAACATGTAAACGGAATCCAGCAGTTGACGATATTAAATTGTATCGCACACCTGATCAGGATGAAGTGATACAAAAATGGTCACACAATTTGCAGATCGATTTATCCGAGTTGCGTAATATGCTAATTTGCAATCTTCACTTCGAATCCATTTGCATAGGCAAACGACGCTTATTTCCTTGGGCTATACCTACATTAAATTTTACACGAAAAGTTGAGCAAATATACGAAAATCCAGTTGATCGTATGGAATTCTTACATAAACATAAGGCGATCAAAGTAGTCAAAGCAAAAAAAGCCACACCTTGGACACCACGTTGTTGCTTATCGCATTGCCGTAAGATGCGTGCAACTGACAATGTACAATTGTACCGTTTTCCACATCTAAATCGCAATATGTTAGCAAAATGGTGTCATAATTTACAATTGCCTTTAACGGGTAATAATCATCGTCGCTTATGCTCAACACATTTTGAGCCAGaggttttaactaaaaaatgtcCCATGGTCATGTCCGTACCGACTATTGATTTAAATACACCGCCaggttataaaatttatcaaaatccaGCTCGTCTTAAATATGCTAAAATGCGCCTACAAGTTGTATGTATTATACCTACTTGCCGTCAAACCAGAGAGGATGGCGTACAACTATTTCGTTTTCCTCATAGTCGTCGTGCATTGTTGCGCAAATGGTGTCATAATACGCGTCAAAAAGCTTCTGATGCTGTTAAAGGCCACTATCGTGTGTGCTCGAAACATTTCGAATCTCATTCATTCGGTTCGAAAAGACTTTGTCCTGGTGCTATACCTACATTACATTTAGGTCATGACGATACAGATATTTTTGGCAATGAAGCAGAAGCTACACAAATAATTACCACCGAAGAGCGACCCAATGAGATTGTTTTAAAATGCTGCGTACCAACTTGTGGAAAGAGTCGCAAATACGATGAAGTTCAATTGAACAGTTTTCCCAAAAATATACGTTCATTTAAGCAatggaaatataatttaaagctaGATTATCTAGACTTCAAGGAAAGAGcgaaatacaaaatttgtaacGATCATTTCGAAGATATTTGCTTAGGAAAGTTACGATTACGTATTGGTGCATTGCCCACTAAAAATCTTGGCCATAATAATTTAGATGATATCTTCCAAGTAAATCCGAAAGAACTTCAATATAATCAGTTTTCTAAACCATTGCTAGATAGATACGATGAATTGGACGCAACTGAAACAGATGCAAATGAATTGGATGCCAATGAATTGGATACAAATGAATTGGATGCAAATGAATTGGATACAAATGAAATAGATACAAATGAAATAGATACAAATGAATTGGATAGAAGTGAAACGGATACAAATGAATTGGATGGAACTGAATTGGATACAAATGAATCGGATAGAACTGAATTGGATACAAATGAATCGGataaaagtgaattaaataGAACTGAATTAAATACAACTGAATTGGATAGAATTGAATCTACGGCTGTAATTGATGATGATAGTAATATTGCTATAAGTGAGCTTGCTAATATGTATGCCAATGAAGAACCCACTGAAGAATTAATAGTTCCCGATAATACTATTCTCAGTGAACAGCTGGAAAAGTGTGCTTATCCTGCATGTAAAGCATCTAAGACATTGCTAAAGGAGACATTTTCTTTACCTAAAAATGAGCAACTGCTCAATATGTGGTGTACACATATGCATATCGATCAAGATACTCTAAATACAGATCAATTGTGCGGCTTGCACTACATAGAACTTTATCAGTCTACAATAGCTGCCATGAATGAATTGCATTCTGATGAATCAAACCTTAAATTTGAATTACAAGTACTAGCACATTATTACAATCGTTGCAGTAACTCTTTAATTGTTTGCAGTGCACAATGCAGCGTTTCAGGGTGTAGTATAAACCAACTAAATCACGCAGAAAAACTCTTCCAATTTCCATACAGCCGTGAACTGATTAAAAAATGGGTTTTCAACACAGGCATTGAGATTGATGAAAATCGTCGTTACTTACATAAAGTATGTTCACAGCATTTTGAACCTTATTGCTTAACTGAGACTCATCGTTTGCGACCGTGGGCTATACCAACTTTAAATTTACAACATCCAGAACCtgataaaatgtataaaaatccAGATTTAATTGCTATTGAACGTCGTTTACTGGGTCCAGTTGCTCTGAAATGCTGTGTTAGCAGTTGCCAACTCGAGCGCAATGACGATGGTTTGCTAAAGTTCTTCAATTTTCCACATGATGGTGAATTATTGCAAATTTGGgtggaaaatttaaaactggAGAAAGAAAAGTCACCATTATATAAGATTTGTGAACAACATTTTGAGAAGCATTGCTTTGGAAATGCACGTTTGCGTGCCTGGGCTATACCTACCATAAATTTAGGACATGACGATCCGAATATACATCAGAATCCAGTTACCAATACCAACACGGAAAATGAAGCCACAGATATGGCACATGCTAAGATGAAAAATTCATTAGATATGGTCAAGTGTTGTGTGGTCACTTGTCAAAAATGCCGATTAAAACATGGCGTGCAATTGTTTGGTTTTCCTAATAGTATCATAATGCAAAAAAAGTGGGCACATAATCTTTGCATGCCACACAGTGCAGTTAACAAACAAGTTCGTATATGTAGCTTGCATTTCCATCGAAGATGTATTGATGAGAAGCATCTACGTTCATGGGCAGTGCCCACCTTGCATTTGGGTCATGGTAACAGTATATTTGAAAATCCTAAAAATATACCTGGTTTCTTTTTGCCACTTTGCCGTCTCAGTCATTGCGGTAATCGTCGTACTTTAGATAATAATTTGCGCACTTTTGCATTTCCTAAAAACCCAGAAATGTTGCAGAAATGGTCTATAAATTTGAAGCTAACTATAAGTGATTGTAGAGGTCGTTTATGCGCTGAACACTTTGAAGCAGAAGTAATGGGAAACCGTAAATTAAGAAATGGCGCTGTGCCAACACTTAATCTGGGTCACGATGATGAACTTGCGTAtacaaattatgcattaatacaAAGTATTAAACAAAATGGTGCTAATTTGATGGATTCTCTAGATTTTGATGTAAGCGAAGTAATGCAATTTTCTACCACTCAAGCTGATACTAGCGGAGAAGTCGACACCACTGGATCTGAATTACATAACACCGATGCTGAAAGTACACATTACAGAGCAACAATGGATACTTATAGTGACGATTATGGCGCTTACGACGATGAACATCATTATACAAGTAATGATGAACAAAACATCTCTACTACAATGcctaaaaatgataattttactGATGGGAGCTATGAAAATTACGGAACTAAAACTGTACACGCACAGAACTCCACAAATGGATTGAATACAAgtggtaataatatatttgcgaACCCGAATAATACTTCTTCTAGTAATGCTGCCAGTGAAAATAATGATAATCTGCGTTCAAAGTTTAGCAGACGTtctgttaataatatatcaccCATTTGTTGTTTATTGCATTGTGGCAAACAGAAAACTCCTGAGCAACATCTAACAACTTTCGGTTTTCCTAAAGAcaagaatttattgttaaaatggtGCGAAAATCTAAAATTAGATCCTGAGAACTGCATTGGACGAGTTTGTATTGATCATTTTGAGTTACGCATGATAGGAAAACGTAAATTAAAAGCTGGTGCAGTGCCTACATTAAATTTAGGCCACAATGATCCTATAAAACACACAAACTTCGGCAGTAATGAACAACATAATATAGCAGTAAATCGTGCAATCGCTTTATCAGTGCCCGCGTCGCTAACACAAAGCATGGAAGACGATGTGGATAATTCAGATCCGTCATTTTCCTTGCAATGTTGTCTCAAGCATTGTAAGCGCAAGAAAACAAACGAAACTTTATTATATCACTTTCCTAACGATgaagtttgtaaaaaaaaatggtaccACAACTTACAGATGGGAGCACATGAGTATAAGAGTGATATGCGTGTTTGTGGTAAGCATTTTGTACCGTGCTTGAAAATGGGTCCGGTACTAAAAGATGGAACAGTACCAACAATTGACTTGGGTCACACAAGTAaacgcatttataaaaattatagagctGGAATAAACAATACAGTACAAACCGGCAACGTTTGTTGTATGCCCCATTGTGAAAACGCTTATAAGGTGTCAAGCGTTAATTTGTTTCCATTTCCAAATCCAAGAATGCTGCAGGCTCGCAAATGGTGCCAAAATACACGATTACCAATGAATTATATACAGCGCCACATTTGTGCTAATCATTTTGATAACAATGCTATAGTTGACGGTAAACTACATCCAAGTGCATTGCCTACACtcaatttaaatcataataatccAATATTTCCGTCTCCTATCCCAGTTgaagaaaatacaaaacataCGACAGAAGTTAAAACGAAAGaagttaataatactaaaaaattattacgtgCTGATGGTAAAGGTAGTAAATTTTGCTGTGTGGAAGCATGTATAAGcagattggaaaataaaaataatgtaatatattataaatttccgactaatgaaaaacttttaagaaagtGGTGCCataatttagaaatgaaaacttttaagcCAAACatcaaaaagttattaatatgtGAACTTCACTTTAAACCATATTGTCTTGGCAAACGCTTAAGATCGTGGGCAGTGCCAACTGTTTATTTAAATCGTTCAAAAGAGGGCACTTCCATATATCACAATCCAAGAAGTGAAGTACTGTTCCACACATGCTGCATTAAAACATGTGGACAAGTACGCGATAAGGAGGCTGGTATCAGACTTTTCACATTTCCCACACGTGATAAACTCTTCCAAAAATGGGTGCACAATGTACATAAAGATGAAGCCACTTGTCGTATTGCACGCATTTGTAACTTGCACTTCGAAAGTAAATGCATTGGTAAAACTCTAGCAAAATGGGCCATACCTACTTTGGATTTGGGGCATAATGACGATCATATTTTCAAGAATACAAAAACTGATAGTGATAGCGAAAAATCTGTGTCAAGCGAATCTGATCAACAAATTAATGAATGCTGCATACCTAGTTGTGAAAGCAATCCCACCCCTGAGCAGTTATTCACTTTTCCAAAAACTGCTTGGCTTTATACAAAATGGTGTGAGAACATAAATTTACCAGATGAAGAATtaggaaacaaaaaattatgtgtCGCACATTTTGAAGATTATGCTATGGGCAGGAATAGACCCCAGCCTTGGGCGTTGCCAACACTTAATCTAGGACACAATGTTATAATGCATCAAAATCCAACACAAGTAGCTAGACGCACAAGTGAGGACAGTGAATCTAGTGAAGAAAAACATTGTGCTATTTCCACATGTAAGAAACCAAAAACTGAAGATGTGCAGTTCTTTAAGTACCCGAGCAAGGTTAATTTGATGCGTAAATGGGCTGAAAACTGTAATCACAATGCAGATGAAGCAGCACGTAAAGGTTATCGTATATGTAGTAATCATTTCGATCCTAAATCCATAAAAGGAAAGCGTTTATTACGCGGCTCCTTGCCTACATTAAATTTGGGACACAATCGAGAAAAAATACATCGTGACAAATGGTGTGATAGCCGACTCAAACcggaacaattaaaaaaatttaactgtaaTGCACCGAATTGTGgacgtaataaaataaatgatcaaGTGAAATTGTGTAAATTTCCACGTGACAACGAAATGCGAAATAAATGGTGTACAAATTTGAAGTTGAATCCAGATGCTTGCGAAAATCTAAAAATCTGCGAAGTGCACTTTGAGGAACGTTGTATACAACACGAACGCTTATTGAAGCTAGCAGTGCCTACATTACACTTAGGGCATAATGATGAAAATATAATTCCGAATCCAACATCTTTTAAAAAACCTGAAGCAATTATACGCTGCTGTGTAACGAGTTGTGgtaatattaaaagcaataatcaaaatattatgttCAGTGCGTTTCCCAAATTGCgctcattatttataaaatggacCAGAAATTTGCAGTTGCAGCCTACATCGGAAGTAT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Protein Sequence
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