Basic Information

Gene Symbol
ARID2
Assembly
GCA_002237135.5
Location
CM026971.3:162704188-162718987[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 3.7e-24 2.4e-20 74.0 0.0 2 89 1202 1288 1201 1288 0.92

Sequence Information

Coding Sequence
atgccgAACTTTCGCGACATAAATATTGACACGCTTAGAGAAAAGTGCCGAAAACTAGCCTTGTCGACCGTCGGTAGTAAGACAGAGCTAATAAAAAGGATCGTAAACGCGGAACTCAGTACTGAAAATCAAACGGCGACATTGGATAGTTCGAATGGTGTATTTTATGGGTGCGACAGCTGTATGACTCAGGATTGCTCATCATCACCAATTCCGGAAGGTTCTGTGCATGTTCCGACTAACATGTGCAGCCGACAACCTTCGGGTGATGCCGTAACGAGCACTGCTCTGCCGATTACTAATAATGCATACACGCATACACCAATGGTAACGACTCCACCGTTTGTGTATTTTACACCGCATGCAGCAATACCAAATAGTTCAATACCAATTTGTTCGTCAATTTCACAAAATGCAACGATGTCAATCGCAAATTCACGAACGCCGACATGTTCATTTGCGCCGCAGCTTGTAACAACAAATTCGATATCTACGCATCAAcgaaatatagataaaaattattcaaatacgCACGTTTCGTCAGCAACTCTAATGCCCAAATTGGCATATTCAaacgcttcatttccaccgcaacAATATTTGTATCAACATAATGTTCGcgatataattgaaattctaCCGAAGTTTAACCCACTTGATAATGAAGGCTTAACAGCGCAGCAATTTGTAAACcgcataaatatgttaaaaagcgCATACCAATGGGATGATCGTTTGTTGTTGTACAGTGTACAATCGAAATTGAAAGGACCAGCAAAGATGTGGAACGATAGTTTACCATGTGTTTTTTCTAATTGGATGGAATTTTGTAATCAGATAGTGTTTGATTTTCCATCTACGGACACCGATGCTGACGTACACATGAAGTTAATGAATTATTCCAGAATGACGAATGAAAGTCACGAAGAATTTTACTATCGATTGTTGGCAATAGGTCGTAGAGGTTTTATGCAAGagaattcaattaatcaatatattctCAAAGGACTAAACGACTATGGAATGCAGCAGTCGCTGGCCAGCAATTTGTATGTGACATCAAATGATCTTCTAGTTGCAATACGAAGGCATTTAGCAAATGCGCCACTGCGAGTTCAACAGAGAAtggataaaaatattgctaGGCAACCGATTTTTAAACCTCCAACGTCAAATACAAAAGGCGAAAATGCACGGATAAGATGTTATAAATGCAACGAGGAAGGACACGTTTCTATAAATTGCAAACAACCACAAAAACGCTCACGATGTAAAAACTGCCAGAAAGTAGGTCACACCGAAGCAAATTGTAGATTTGGAAAAGAGCCGGTAAAGAAAATTAACAAGAATAAAATTTCTCCGTTATCTGGAATCATTAAAGCAGTACAACTAAATGGTGTGTTCTTAACAGCATTTATAGATCCAGGCAGTTCAGTGTCCTTAATTAGAAAAAGTTATGCTACAATGTTTCGTGGTGAAATACCGTATACAGGACGTGCATTGCAAGGGATGTTTGGCGGCGGTTATGAATGTACAACACAGTTAAATGTAACTTTACGGATAGACGCAATAGAATTTTCGGTATCTCTATTGATTATCGAGGACGAATTCATGAATGAGCCAATTTTGGTGGGTAACGACGTGCTGTGCCAACCAGGGGTACGATTTGTTATAGAAGATGGTTCCAGTAGAATAGAGAAAATTGAACTAACCAATTTGAGCGTTGATcccaatataaatgaaaattccaAAGATGAGTTAAATAAGTTGTTGGTAAGCTACGCTGACTGTTTTGCTTCCAAAATGTCAGAGCTGGGTAAATATaccaaaaagaaattaacaatTCGCCTAAAGTCAGACGTGCCAGTTAGTAGACGACCATATCGACTCCCTTTTGCAAAACGTGAATGTGTAAAGGAAATTATAAACGAACTTCTTTCAAACAACATTATTCGTCGAAGTGAGTCATCCTTTGCGTCACCAATAGTCCTGGTGAAAAAAAAGAATGGAGAAGATCGCCTATGTGTGGACTACCGGGAGCTGAATAAAATCACAGTCAAAGAACCTTTTCCTATGCCGGTCATGGAAGAGCTGTTTTCTTCGTTAGCTGGTAACCGATATTTTACCATGCTCGATCTCATGTCTGGTTATCATCAAATCGCCGTAGAAGAAGGCAGTAAGCAGTACACTGCGTTCATGACTTACGATGGCCACTTCGAGTATAACTACATGCCATTTGGTTTGGTAAACGCGCCAGCTGTTTTTCAGTCAGTAATGAATTCAGTGGTTAGCAAAATGCCAGCAGGtcaaattattacatatttagatGATGTTGTTATACCAAGCAAAACAATATCAGAAGGTTTACAGCGGTTACAAAAATTCTTGAATATTCTACGTGACGAGGGGCTAAAGCTGAAACTAACGAAATGTAGTTTTCtgtcaaaagaaattaatttccttGGCCACCgaataaatgaaaatggaatATGTCCAGGCGAAAGAaacatatttgcaattaaaaattttgaacgaCCGAAAAACGTTACGGAGGTGCGCCGATTTCTTGGTCTCACAGGTTTTTTTCGTAAGTTTGTGAAAAACTATTCGCTTATTTCGAAACCGCTCACAACGTTGCTGAAAAAGGATAATGTTGAATTCATATGGGACAAATCACAAGAAGAAGTATTTTGTAAACTAAAAGAACAGTTATGCTCCGAACCAACTCTTGCGATTTATGATCAGCGGAAAGAGCATGAAGTACACACTGATGCCAGCGCTATTGGTCTAGCTGGTATATTATTTCAACGATCTGACGACAACATTTTACAGCCTGTATGTTACTACAGTCGCCATTGTAACAGTTCGGAAGAAAAATACCATAGTTACGAACTAGAGGTGTTAGCTATCGTTGAGTCACTAGAGcgttttcgattttatttagtGGGAAAGCATTTTAGAGTAGTAACCGACTGCTCAGCTATAACAATGCTAAAAACGTCCACTCCGTTAATTGCACGAGTTTCCAGATGGTGGCTGAAACTACAAGATTTTGATTTCGAGACTGTTCATCGCACTGGGATACGTATGTCCCACGTGGATGCCCTTAGTAGGAATCCGTCTGAAACTGCCCGAGAACCTGAAACTGTTGCCGACAGAATTTTACGTATAGAAATTTCAACAGACGATTGGTTAGCCGCTATGCAGATTCAAGATCCGAAATTGAAAACGATCATTGCTATACTTCAACGTAAACTCGAGTCCAGTCAGAGGAAGCAAATCGAAAATGATTACATAGTCAAAAATTCCCGATTATATCGAAAACTAAACCATCAAGAACTATGGGTCGTACCGAAGGGAGTACGTTGGATAATAGTAAACTCTTGCCACGATAAAGCAGTAGATATGTCGGTCCATGAACTTGTTAAGGCATTGCAGCCTTTGCCCGCTATAGAAAACACTATAAGCTCACCGgcaaaatcacaaaataatgCTACACCAGCTAGAGGCAGACCGCCTGCTTCGTCTCGggatatatttgtaaataatgaaaaactgGAAAATGTTACACATTCCGTTAAAGGTAAAATGCCTATCAAAGCGCCGGATGAGTTCTATAAAGACTTACAACAGTTCCATGATCGCAGGGGcacTCCTATTATGCATACGCCAAAAATAAGTGGCCgtgaaataaatttgcatatgttatatactGAAGTAATTGAGAGAGGTGGTTTCTCAAAAGTAAATTTACGTGACGAATGGGAAGACGTTTTACCTATAGTTAGTAAACTTCATGATAAATGCGTTAATGCTACTGCTGCTCTAAAGCACATTTATAGAAGATTTCTTGAGAAATATGAACGACTTAATTACTTTGGCGAAGATCCAGATAAAATTGAAGCCTTAGAAGCGACTGATTTACTCGACAGTGGCCGTTCAAGATCTCGATATCCCTCGATCTTTCAAAACTCAAGCGGGTATAACACTGTTCCCATGTCATATAACTATCGGCAACATATAGTTAATATGGAAAGGCGTCGTGTGCATAAGTTATCAACTAATCTATATAAATCTTCACCATATGAAAAACTTATGCTATCATTATTATCACCGTTACCAAATGAACAAGACTTTGCTATAAATGCTTGTACGCTAATGGCGAATGAAATGAAACATACCttaaaagtaaatgaatttCCTAAGTTAATAGATGCATTAATTGCACATACAGGAGTGTATCCTGACTACTCTATgcgtaaattatttcaatttgtgtACATGGATGTTAGAAGACATTCATTATTCAATTTTTGGCAAGATTTGCTTTATGAAAAACCAcaaatattagaattatatagAGATGAGAACACACTTCGACAAGCTGGCATAATTGGCGAAGAAGATGACATTGAGTTGCTCAAGACAACTGCAGCGTTGGAAGAAAATCTTTCCATGGACTTCCTTAACTTAGGTCGTGGACTTGGTACACAAGATTACGTTGGTCAACgtgtattacaaatattatctatattacgaaatttaagttttcatgaggaaaatttatttattttcgccAAAAATCGTACTTTATTGCGTTTTCTTGTTATGTGTGCAAATACGCGATGGGgTAATATACATAGCCAAGCGCTTGATATAGCCGGCAATATAGCTTCTGAACTTGATTTAATTGACCCTTCGTTAGATGATTTATCTCGTAGTTTAATGGAAACACTTTCCGAAGGTATAGAAAGTGATGATCGTTGCGTTATTATAAGTAGTTTggaaatactttataaattatgtcacaatgataataatgaggattatatacataaatgtcttaatataaatttttatgagaaATTGTGCATGCTTTTGTGCCTTAATGATATTATGATGTTGATATTTACGCTGGAAGCAATATATGCATTGACATCACTTGGTGTTCGATCATGTCATTTAATAATGCAAGTGAAAGGCCTTGTCGATCAACTTGT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Protein Sequence
MPNFRDINIDTLREKCRKLALSTVGSKTELIKRIVNAELSTENQTATLDSSNGVFYGCDSCMTQDCSSSPIPEGSVHVPTNMCSRQPSGDAVTSTALPITNNAYTHTPMVTTPPFVYFTPHAAIPNSSIPICSSISQNATMSIANSRTPTCSFAPQLVTTNSISTHQRNIDKNYSNTHVSSATLMPKLAYSNASFPPQQYLYQHNVRDIIEILPKFNPLDNEGLTAQQFVNRINMLKSAYQWDDRLLLYSVQSKLKGPAKMWNDSLPCVFSNWMEFCNQIVFDFPSTDTDADVHMKLMNYSRMTNESHEEFYYRLLAIGRRGFMQENSINQYILKGLNDYGMQQSLASNLYVTSNDLLVAIRRHLANAPLRVQQRMDKNIARQPIFKPPTSNTKGENARIRCYKCNEEGHVSINCKQPQKRSRCKNCQKVGHTEANCRFGKEPVKKINKNKISPLSGIIKAVQLNGVFLTAFIDPGSSVSLIRKSYATMFRGEIPYTGRALQGMFGGGYECTTQLNVTLRIDAIEFSVSLLIIEDEFMNEPILVGNDVLCQPGVRFVIEDGSSRIEKIELTNLSVDPNINENSKDELNKLLVSYADCFASKMSELGKYTKKKLTIRLKSDVPVSRRPYRLPFAKRECVKEIINELLSNNIIRRSESSFASPIVLVKKKNGEDRLCVDYRELNKITVKEPFPMPVMEELFSSLAGNRYFTMLDLMSGYHQIAVEEGSKQYTAFMTYDGHFEYNYMPFGLVNAPAVFQSVMNSVVSKMPAGQIITYLDDVVIPSKTISEGLQRLQKFLNILRDEGLKLKLTKCSFLSKEINFLGHRINENGICPGERNIFAIKNFERPKNVTEVRRFLGLTGFFRKFVKNYSLISKPLTTLLKKDNVEFIWDKSQEEVFCKLKEQLCSEPTLAIYDQRKEHEVHTDASAIGLAGILFQRSDDNILQPVCYYSRHCNSSEEKYHSYELEVLAIVESLERFRFYLVGKHFRVVTDCSAITMLKTSTPLIARVSRWWLKLQDFDFETVHRTGIRMSHVDALSRNPSETAREPETVADRILRIEISTDDWLAAMQIQDPKLKTIIAILQRKLESSQRKQIENDYIVKNSRLYRKLNHQELWVVPKGVRWIIVNSCHDKAVDMSVHELVKALQPLPAIENTISSPAKSQNNATPARGRPPASSRDIFVNNEKLENVTHSVKGKMPIKAPDEFYKDLQQFHDRRGTPIMHTPKISGREINLHMLYTEVIERGGFSKVNLRDEWEDVLPIVSKLHDKCVNATAALKHIYRRFLEKYERLNYFGEDPDKIEALEATDLLDSGRSRSRYPSIFQNSSGYNTVPMSYNYRQHIVNMERRRVHKLSTNLYKSSPYEKLMLSLLSPLPNEQDFAINACTLMANEMKHTLKVNEFPKLIDALIAHTGVYPDYSMRKLFQFVYMDVRRHSLFNFWQDLLYEKPQILELYRDENTLRQAGIIGEEDDIELLKTTAALEENLSMDFLNLGRGLGTQDYVGQRVLQILSILRNLSFHEENLFIFAKNRTLLRFLVMCANTRWGNIHSQALDIAGNIASELDLIDPSLDDLSRSLMETLSEGIESDDRCVIISSLEILYKLCHNDNNEDYIHKCLNINFYEKLCMLLCLNDIMMLIFTLEAIYALTSLGVRSCHLIMQVKGLVDQLVSLITVEAQSYGAGGCILMRVVETVPGNMLPLVAQNIANLQNAAIQKQQIHHITPLQTKPQLLVSDQVQQQIVPDTQQVQPQIIQNFTQDDEQYALAWLSATFERAGTNDSRVEQQELYRMYVSHCQKAGKNSVVGHVQFPRLVRLIFTNTVGPAIVRRSDGSELPGFYYISIRVRAQPLPIQNKVTQTPPKSTDKNKNELSSGRKIKKKLKIQDQPLLIQQQEIKSPIKAEEEQLNVGFETAFAVSTTAVATKVNNTISTVSTGDQNSVNSAILPSNNIVKIEESNTLPSSLKSETIMQDSMNATSTESIAKQTDEITSKQPNSNIVSTIHQTIVKEEVPTTTIQTSNAQPSSSLIKSLLANKVNQRQQKQKELTATNGVQISSQMPTTAASTSQQPIKVTSTAISQLVNNPLMQNTPVKVGQTTIKPLNPQVSLEKKTITDSVPPPLAPLSGNNVAKDSSGRSVIIANQMLVEILDKKLLDPPIPTTIIKRKIEDTSNIGHEQAKRLALDSSESARDEIQNVTPSKNAANLYAEMAASILEDEELDDIPPFLPQPQGQQQLPEQNTQPSLIVPAKVQHTSLQTVQRQLMFQNQPPQLKLTQATPQHMPTAMATIKTEQGLQTVPVILQQKPIEQPPPQIIQQVMQQTTPHSTPPTQYVLATNPNGQTYLVAQQAQPAHPPTTPTQTVLVTQTAQQQSTGTKTIIILQQQPISSSASQQQQQIITATTANAPKMIMTTHQGQQVIVTQRGHGQIGTPTQQQIFINPQTGATTHIQHLPPGATQTQSNNNIIQRQIIQTAPAQQATTTSQQAGQISPSLLNQLNHIPATIKLHQPQVTVQSQQLTHQPATISRIGKSVSIVQNTTPPPPIQIPQLQQHQSIIQQHIISGPAEKRQVILGGGRAIEIKETLITQTQPSMQQTQLNSQTIITTQPQTQQQQQIRTVIEQQQQHPSIIQQKITLPLTHTGMQSNSTIITQKINENSSLMQGTLQSKSAPQQQTPIQSVVSQIGSTSATITTIKKPILPQGTTQIQKQSSSVIQIQQTQSIANTLKQTSLIPPPPLAVNSTNSNITTTKTPTTIATTATIKTSNVSVSDAEFINQLKPDESNLIAEQNQTSGVIHSTPNTSNTTAVNNTVLTPVASTVINSQTANSTPISAPLPSMSSVDINWLYVCDWRNCPRKKFKSLNDLQHHACTVHCPDHLDAGAEIFCQWGIGPSLCDGVPRKRYSLMTHIIDRHLTQESLRNAVQRRIATGSINVQSTQSPVTIVRNLDQTQRGNTASPALSTSSTSSLPSTGSSAMQAIKRHTADFVNSKELMDENEGPVTKSIRLTAALILRNLTTYTSTAKRSLRRYESHLANIALSNVESSGTISCILHELNN

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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