Sbis056167.1
Basic Information
- Insect
- Stictocephala bisonia
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_035578905.1
- Location
- JAQJVL010000285.1:720581-721834[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CSRNP_N
- Domain
- CSRNP_N domain
- PFAM
- PF16019
- TF Group
- Unclassified Structure
- Description
- This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 10 0.031 2.3e+03 1.3 0.0 127 155 18 46 8 50 0.87 2 10 0.011 8.6e+02 2.7 0.0 117 154 47 84 45 89 0.85 3 10 0.0081 6.1e+02 3.2 0.0 117 155 86 124 84 130 0.84 4 10 0.11 8e+03 -0.5 0.2 118 153 126 163 123 168 0.67 5 10 0.0049 3.7e+02 3.9 0.2 117 154 164 201 145 205 0.83 6 10 0.011 8.5e+02 2.7 0.0 117 154 203 240 201 245 0.85 7 10 0.0088 6.6e+02 3.0 0.0 117 154 242 279 240 283 0.84 8 10 0.0085 6.4e+02 3.1 0.0 117 154 281 318 279 323 0.84 9 10 0.0089 6.7e+02 3.0 0.0 117 154 320 357 318 361 0.84 10 10 0.0088 6.6e+02 3.1 0.0 117 154 359 396 357 400 0.84
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTGAACAAGGAATGCTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGAATGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTGAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGCTTGAGATGTATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGAATGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTGAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGGTGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTAAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTCGACTTGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAGAGAGACTGATGACGTGCTCAGGTGGAGTTGGATGAGATGTGGATGTGGTGTAAGTGAGCGAGGAAGACTGATGTGGGTTGACGTCAGGAGTTATGTTTATCGGTGGAAGGGCTAG
- Protein Sequence
- MRCGCGVSEQGMLMWVDLSGVMFIGGRARENDDVLRWSWMRCGCGVSERGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLRWSWMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLRWSWMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLSLRCMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARENDDVLRWSWMRCGCGVSERGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLRWSWMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARETGDVLRWSWMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLRWSWMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLRWSWMRCGCGVSKRGRLMWVDLSGVMFIGGRARETDDVLRWSWMRCGCGVSERGRLMWVDVRSYVYRWKG
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -