Basic Information

Gene Symbol
JARID2
Assembly
GCA_963971135.1
Location
OZ020185.1:2697800-2706795[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 5e-21 1.3e-17 65.3 0.0 8 89 1613 1692 1607 1692 0.92

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGTTTTTAGTCGCAAAAGAAAGGAAACGAAGTCTCCGAATTTTCTGCTAGATGATAGCCCGAAAAGaactaAAGTTCAAGCACAAAGGAAGTTTGCGCAAGGTTCAAACGTAAACAGTCCTGTATTAACTCCTGTACGAGATTTGGAACCGCAAGAAAAAATAATCCCTGAACCCATTGAATTGCTACCAAGTAAACGGCCAAATACTgaagattttttaacatttctttGCTTTCGTGGGACGCCAGTTTTGCCACCgactttgaattttttcaatactGCGTCGTCTATTAGTGATTCCAGACAACAGGTGGAATCTCCAGCTACGTCGCCTAAAAATGGCATCATTTTACCTTCGACGATTTCCAAAACCCAAGGTGAACGACCTTTTATTGCCTTTGGGGTTCGAAAAAGAGCAGATCCTATAATTGTGAGTAGACACATGGATAGGAAAAGGAGGCATGCTTTGGCCTTACAAGCGTTGAGGCGGAAATATCAGGAACAAAAAATGGCTAAAATTAGAGCCATTACCATATCTAAACTATCtgaaaaaGTACAAACACAGACAAATAAAACTCTAGTTCGTACAACTCGATCATTAACAAACACGAGCACCgtaacaaagaagaaaattgcACAGAAAACTAAAGTAACTGTTGTTGCTTCAAAACATGTAAAAGTTACTAATACGACTATTAAGCAGCCGGTATTGAAAACCAAAGGAGTTAAACCAAAAATGTGTTTGAGGAGTTATAGAGGTCGGTTTGTACAGCGCGAGTTAATAAATAAACCTGTTAAGAAACGAACAATAAGTAAAGTTAAGAGCGATACTAAAAGAGATGATTTGGAATTTTCTTCTGAAGATGATGAACCGTTATCAAGTAAATTGCAGGCTGAAGAACCTGAAGCAAatacttctttaaaaaaacctttaaaaagcGTGAAAAAGGATGATTTaagGGTTACGAGATCTAATGTTTTGAAGAGCAAATTAAAACCTGCAGTTAGAGCTCCACGGTTGTTAGCTcgaatacaaaataaattaatttcaccaCCGAATTCTCCTCAATTGCGCACGCGTTTAAAACGTAAGATCACAATTGTTAGAAATAAGCAGGTAACAGTACCTGTTAATAAAAAACGTGtggttattaaaaaagtagCTGTTAAGAAGAAAATTGTTACTGAAAACATTGGTAATAAATCAATGAATTTACGGAAACGTCAGGAGCAAGATGTTAAAACTAAATCCACCACTAAAACTTTACTACGTAATAGaaatattgatgataaaaaagAACGGAGACAAACTCGAGAATCAGTAAAGAAAGAAACTGAAAATACTactaaagttgataaaaaatgtaaatcagaaaatttgaaaaaggttatttctaaaaaagtagaagaaaaaattgaagCTGTGAAGGAGGATAAGAAAGTAGATAAAAGGACAACTCGTGAAGACTCTAAAAAAACTGAAGTAAACTCAAAAAAAGAAGATGtagttaaaaaacaaaatgtaaataaaaggattgaaaaaaataaaaactcagaaGCAAATAAGAAACATGAAAAAATTGAAGTAGATTTGAAAAAGGGCCATACAGAAGTGGAAACCAAAAAGAACACTGAACTTGATATAAAAATCGgagttaataagaaaaatattgaaaggGATAAATCAGTAGACACATgtaaaaatgatgaaataaaCCTAAAAAGTTTAGACAATCTTAAAATtgaggaaattaaaaatatcataggAACTTGTGTCAAgcaaaatgaaaacaaaaaaatttctcctaaaaaaattgaagaaaataatcgaaaaattgATGTAGatacaaaaaaagaagatattAAACCTTCTACTGTTGATATTAAACCTCATTCTGAAATAACTAATcctggtttaattaaaaaaagtaataatagtgTTGAACCAAAAATTGTggttaaaaaaagtataaatgtAGATACAAAAAAAGAAGACGTTAAATCTACTGTTGATATCAAACCTGATTCTGAAATAAGTAATAatcttgatttaattaaaaaaattaatagtgttgaaccaaaaattgcagttaaaaGAAGTAtaaatgaagataaaaatgaAGGCAAGGATAAAATTATTGAACCTTCCTTAGCAAtacttcaaaatcaaaatttggataaaaatatagttttatctTCGATAGAAAAGAATCCAGGAAgtaagaaaaaagttttgaaaactaTCAAAACTATTGAGAAACTTGAAAATACTGAAATTAATAACCCAAAAATGCAATCAAATGATCAATTAACATCGACAAttgttaaagaaataaaattagacTTATCAAAGAATGAAAAGAAGATTAATAAACCTGCAAGTCCTGTAATTAATacaataaacttaaataatccCGCAAGTACTATAATTGAAAGAATTGATGTTGctaaacctaaaattaaaaataagatagatgttgtggaaaataaaaatgagattttaattgataaaactCAGGTGAATCCTGTGACAAGCATAAAGATTCATGAAGATATTAAagatcttaaaaaacaaaatcaagaagtaaaatcaaatattttagaattaccGGTAATTCCAGTAAAAAAACCTATTAAAGATCCTTTGAGCTTACCACTGTTGGTTGAAAAAGCAAGACGTAGCTCATTGGAGGTAAAATTGGCAacagataataataaattattattggatAACAACAAATTACAAGAAGATAATAACAAATTAGTTgcagataataataaattattagcagataattcaaaattagtattggataataataaattggtatcagaaaaaaatctaattactgatgttgataaaaattctgAGGAATCGACTAAAAATCTGAATATTACTCCAGATAAAGTAGAGCCAGAAGTAAAACTAAccacaaaaaaatctaatctaaATCCAGCGACTAAAGAAAAAATAACCACAAATAAAAAAGATGACTCACAAGAAATAAAAGCTTCTCCCCAAAAAgataaaaaacctaaaaatcaaGTCAAAACTGTAGAAAGTATTAAAAAAGAAGAAGCTAGTGATCAATTAAAAGTTTCAGCAAGACCTAGCAGAAAAACTAAGGAAGCTGCCACTATTTACATGGAAATTTTAGGGCACAAGTTGGGAAATAATGATATCGATGATGATATATCCATCGATAGTTTTCCTGAATTACCAAATGTTCGAAAAACAGAACAAAGAGAAAATGAACTAAAAGCAAAAGCTaaacaaaaacttgaaaatagTCCCAAAAGCAGAACCTCGAAAACGCACgataaaaaaactagaaaatccTACAATGAATCAGATGATTCCGATGAATCATTTACAGCAGAAATCACaattataccagaaaaacgTAGCACTAGAGTTAAATctccaaaattatataaaagctTCAGTGATACTGATTCTGAACCTGAATTAATTCCTCTTAAAACAACAAAACGTAAATCCAATAAGTCTGCTCAAAGCTCTaagaaaattaagatttttgaaaattttaatgattccgATGAAGAACCACTTGTTAAGTTTAAAAAGGTTAAAGAAGAAACTCCTAAACAAACAGAAGTTGTTGGAAAACAAAAACGCGAATGTGCTAAaagaccacaaaattatttagccCAATTTTCTTCTTCTGATGAGGatgaaaaatatttccatggATTTGTTAAAAGTGATCCGGCACCAAAACCCACTCCTGAAGTTGAAGCTACAGTTGATGCTCTTTATACAAAAAGTGTTTCTCGAAGgTATGGTAAAGAAAGAGTAAACATGTCGAATGAACAAATAGAAAAGTGGTTAAATGATAGTGCTTTAGCTgggataaatttaattaaaaaagaaaatgatgaaatgcttaaatttggtgaaaaaataCCCTCGGAAAATGtttatgatgaaattaaaataagtgaaaCTATTGAAAAGAAGGAAATTGTTATTGATACTAGTCCTACAGAAAAGTTTCATaacaaaaactttattaataatgagaaaaagccaatttttagaaaagaaaaaatggaatcttcaaaaaatattaatgcatTTTCTGTTTGTAATGAAAGTAGTGTGTATGCTTTTGAAGCAGATAATGAAGATTCTGTTAGTACACCGTTTAGAAGACCTTCAAGAAGACCCTCTAGTACAACTACAAGTAAATCTGAAGATGATCCTGAATTAAAAGCAGCTGGTAAATTTCGACATCCAACTATTATACGCCCAGAACCTATCAAACCAAAACCAGAGACATCTCCTGAAGCCCCTATTATACCAAAACAAGAACCGAGCTCAATGTTCCCTCCTTCAAACACcactttgcaaaaaaataaatctgattcACGTTTAAATCGAGCAAGGTGCAGCCGAAGTTTCGATCGATTTTCTGAAGGATCAGAagatacaaaatataaaattcccaGCTCTCCAAGTGCTGCTAGTTCATCTTCCAgttcaaaattatataaaaaatcaaccGTGCAGAAGAAAAAACTTGCTGATTTTTACCATCCAGTCAACACATCTGAATTCCCAAGCCTGCAAAGTGAACCGAAAATTGTTGAAGCTCCAATTTATCGTCCAAATGAAAAGGAGTTTATTGATCCTCTTGAGTATATAGAAAAAATACGTCATAATGCAGAAAAATTCGGAATATGCAGGATTATTCCTCCTCCAAATTTTAAACCCGAATGTAAAGTATTGGATGAAATGCGATTTACTGCTTATAATCAATATGTACATAAGATGATGGATAGGTGGGGTCCAAATTTTAGAGAATTTGTAGCCATAAGAAAGTATTTATTGACtcaaaatattactttaaaacATCCTCCatggATTGGTGGAATGGAAATTGATCTTCCAAGATTATACCAAACTGTTCAAAGTTTAGGTGGACTTAAGGAAGTTATTGAAAAGAAAAAGTGGACTAAAGTGTCTGAATTGATGAGAATACCTAAATCTGCGCAAGATAGAGTTACTAAACTTGAtgatatttattgtaaatatcttCTGCCATATGATACTTTATCaccagacgaAAGAGATAAATTGTTTGATTCAGTGGAAACGGAATGGGCCAAACGAGAATCTAAGAATTTACTTAGAGCTCAGTCtagttctaaaaatattgaggaagaaGAGGAGGAATCTGATGAAGAAGAAGAGTCTGATATAGAGTGTATTATTAAAGGGAGAAGTATTGCTTTAAGTGCTTTTTATAGAATCGCCAGAAATACTATGGCAATGTGGTTTAAAAATTCCGAACCAACTGCTCAAGAggtGGAAGAAGAATTTTGGAAACATGTTATTGAGAAGCAGTACCATATTTGTGTACATTCAGGCTCGATTGATTCTGGTAACTGGGGTTATGGCTTTGCTGTTTCGAAAAATAGTCCTTTTGCAAGACATGCGTGGAATTTAAAAGTGCTCACGAATAATAGTGGATCAATTTTAAGATCTATGGGGCCTGTTATGGGTTTAACTGTGCCAACTTTGCATGTGGGTATGGTATTTAGTAGTTGCTGTTGGTATCGTGATCCTCACAGTCTTCCGTGGATAGAATATTTACATACAGGCGCTAATAAAATATGGTACAGCATTCCTGATTCGATGGGCGAAAAATTTCattcaactttattaaaacttgTTCCCAATTATTGTCTTAATAAATCTATATGGTTACCCTCAGATACAGCAATGTTACCACCTAATCTTCTAGTCGATAATGGAATTTCTGTTACAAAAACAATCCAGGAACCTGGCGAATTTGTAGTTATATTCCCCAAAGCTTTTACTTCAAATATTTGTACAGGCTATACAGTTTCTGAAAGTGTATTTTTCTCACCTCCACATTGGTTAAATTCAGCGCAAACTGTTTTTGAGGAATTACGAAATAGTTGTGAGCCATCAATGTTTTCTTACGAAAGATTACTTCTTAATATTGCATCTGATCCTCGAAGTGATATTAGTGTGTTAAACCACATCATACCTTCTGTAAGAAGATTGTGTGAAAGAGAAACTTTGGAAAGAGGAAAACTTAAATCTCTCGGAGTTACAACTGAAGAAAAATTACCAATGCCTGAAgttaagaaaaagaaaaaaatgaacgAAACTGAAACTGAGTACGCTTGTGAGGATTGTAGATGGAATTTGTTTTGCTCAATGGTTTGGGAAAATCAAGAAAGTGCAGTTTATTGCTTGGATCATGCTATTCAACATttggagaacaaaaaaattgaagcaGCTAATTGTAAACTTATGTTCACTTATGATTCTAATGAGATTAGCAATCTGATTGATAAACTGAAAGCTACAATTGAAGCTAAAATTCAGAAGAAGGCGAATAGCAAGTTTTCGGGAATGGCAACATTAttgaatcgataa
Protein Sequence
MVFSRKRKETKSPNFLLDDSPKRTKVQAQRKFAQGSNVNSPVLTPVRDLEPQEKIIPEPIELLPSKRPNTEDFLTFLCFRGTPVLPPTLNFFNTASSISDSRQQVESPATSPKNGIILPSTISKTQGERPFIAFGVRKRADPIIVSRHMDRKRRHALALQALRRKYQEQKMAKIRAITISKLSEKVQTQTNKTLVRTTRSLTNTSTVTKKKIAQKTKVTVVASKHVKVTNTTIKQPVLKTKGVKPKMCLRSYRGRFVQRELINKPVKKRTISKVKSDTKRDDLEFSSEDDEPLSSKLQAEEPEANTSLKKPLKSVKKDDLRVTRSNVLKSKLKPAVRAPRLLARIQNKLISPPNSPQLRTRLKRKITIVRNKQVTVPVNKKRVVIKKVAVKKKIVTENIGNKSMNLRKRQEQDVKTKSTTKTLLRNRNIDDKKERRQTRESVKKETENTTKVDKKCKSENLKKVISKKVEEKIEAVKEDKKVDKRTTREDSKKTEVNSKKEDVVKKQNVNKRIEKNKNSEANKKHEKIEVDLKKGHTEVETKKNTELDIKIGVNKKNIERDKSVDTCKNDEINLKSLDNLKIEEIKNIIGTCVKQNENKKISPKKIEENNRKIDVDTKKEDIKPSTVDIKPHSEITNPGLIKKSNNSVEPKIVVKKSINVDTKKEDVKSTVDIKPDSEISNNLDLIKKINSVEPKIAVKRSINEDKNEGKDKIIEPSLAILQNQNLDKNIVLSSIEKNPGSKKKVLKTIKTIEKLENTEINNPKMQSNDQLTSTIVKEIKLDLSKNEKKINKPASPVINTINLNNPASTIIERIDVAKPKIKNKIDVVENKNEILIDKTQVNPVTSIKIHEDIKDLKKQNQEVKSNILELPVIPVKKPIKDPLSLPLLVEKARRSSLEVKLATDNNKLLLDNNKLQEDNNKLVADNNKLLADNSKLVLDNNKLVSEKNLITDVDKNSEESTKNLNITPDKVEPEVKLTTKKSNLNPATKEKITTNKKDDSQEIKASPQKDKKPKNQVKTVESIKKEEASDQLKVSARPSRKTKEAATIYMEILGHKLGNNDIDDDISIDSFPELPNVRKTEQRENELKAKAKQKLENSPKSRTSKTHDKKTRKSYNESDDSDESFTAEITIIPEKRSTRVKSPKLYKSFSDTDSEPELIPLKTTKRKSNKSAQSSKKIKIFENFNDSDEEPLVKFKKVKEETPKQTEVVGKQKRECAKRPQNYLAQFSSSDEDEKYFHGFVKSDPAPKPTPEVEATVDALYTKSVSRRYGKERVNMSNEQIEKWLNDSALAGINLIKKENDEMLKFGEKIPSENVYDEIKISETIEKKEIVIDTSPTEKFHNKNFINNEKKPIFRKEKMESSKNINAFSVCNESSVYAFEADNEDSVSTPFRRPSRRPSSTTTSKSEDDPELKAAGKFRHPTIIRPEPIKPKPETSPEAPIIPKQEPSSMFPPSNTTLQKNKSDSRLNRARCSRSFDRFSEGSEDTKYKIPSSPSAASSSSSSKLYKKSTVQKKKLADFYHPVNTSEFPSLQSEPKIVEAPIYRPNEKEFIDPLEYIEKIRHNAEKFGICRIIPPPNFKPECKVLDEMRFTAYNQYVHKMMDRWGPNFREFVAIRKYLLTQNITLKHPPWIGGMEIDLPRLYQTVQSLGGLKEVIEKKKWTKVSELMRIPKSAQDRVTKLDDIYCKYLLPYDTLSPDERDKLFDSVETEWAKRESKNLLRAQSSSKNIEEEEEESDEEEESDIECIIKGRSIALSAFYRIARNTMAMWFKNSEPTAQEVEEEFWKHVIEKQYHICVHSGSIDSGNWGYGFAVSKNSPFARHAWNLKVLTNNSGSILRSMGPVMGLTVPTLHVGMVFSSCCWYRDPHSLPWIEYLHTGANKIWYSIPDSMGEKFHSTLLKLVPNYCLNKSIWLPSDTAMLPPNLLVDNGISVTKTIQEPGEFVVIFPKAFTSNICTGYTVSESVFFSPPHWLNSAQTVFEELRNSCEPSMFSYERLLLNIASDPRSDISVLNHIIPSVRRLCERETLERGKLKSLGVTTEEKLPMPEVKKKKKMNETETEYACEDCRWNLFCSMVWENQESAVYCLDHAIQHLENKKIEAANCKLMFTYDSNEISNLIDKLKATIEAKIQKKANSKFSGMATLLNR

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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