Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_963971135.1
Location
OZ020184.1:20754148-20760960[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 4.4e-24 1.1e-20 75.1 0.0 2 89 112 195 111 195 0.95

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCTATTAAGGATGGATGTGAGGTTCCAAATGGAATACCAATTGTGGATTTATCTGTTGATAGTAATCCACCTGTTTTATCCAAAGCTGCAAGACAAGATCTATTTGAATTTGTGATACCCCCAGAAGCTCCAGTATTTACACCAACTGAAGTAGAATTTGCTGATCCTTTACTTTATATTGATAAGATCAGACCTGTTGCCGAAAGATTTggtatatgtaaaataaaaccACCTCCTaattggCAACCACCATTCGCAGTTGATGttgataaacttaaatttacacCAAGAATACAAAGGTTAAATGAGTTGGAGgcCAAGACTAGGATTAAACTAAATTTCTTGgatcaaattgcaaaattctgGGAGTTGCAAGGTTCTTCTTTAAAAATTCCTATGGTTGAAAAACGTGCTCTTGATTTATATACATTGCATCGACTTGTAGAAAATGAAGGAGGATTTAATACAGTAAGTAGAGAAAGAAAGTGGGCAAAAATTGCTGTTTTTATGGGGTATCCTAATGGGAAAGGTTTAGGTACAATACTAAAAACCCACTATGAACGGTTGTTATATCCATTTGAAGTTTTTACGAATGAAAAAAAATTGATTCCAAGTGAAACCAAAAGCGAACCAGAAGATGACAAAgaatataaaatcaataaaaataaaatactgtcTTTATCTAATAGTGTGTTAAATAGGAAAAGTAATTATAATAGACGAACAAAAGCAAAATCTGAGAAGTTTAGTGATGATGATGGACATGAAACAGCTGGATCTGACATATCTGAAGCTGAAAGTGAACataataaagaactaaaaagaCTTCAATTTTATGGACCTGGACCAAAAATGGCAGGATTTAATAGCAAGAGGAAGGAtgaagcaaaattaaaaaaggttaaAAATTCAGGTTCTGAATATGACCcactAGCAAAATATATTTGCCACAACTGCCAAAGAGGAGATTCCGAAGAACACATGCTTCTTTGTGATGGATGTGACGATAGCTATCATACTTTTTGCCTAATGCCTCCCCTCGCAGAAATACCCAAAGGGGATTGGTGTTGTCCTAAATGTGTTGCTGAGGAAGTTTCAAAACCCATGGAAGCTTTTGGGTTTGAGCAAGCTCAACGGGAATACAACCTACAACAGTTTGGTGAAATGGCAGACACCTTTAAGTCTGAATACTTCAATATGCCTGTTCATCTGGTTCcaacaaaaatggttgaaaaagAGTTTTGGAGAATAGTTTCTTCAATTGATGAAGACGTGACTGTTGAATATGGAGCTGATCTTCACACAATGGATCATGGTTCTGGctttcctacaaaaaattcGATAAATCTATTAGCAGGTGATCAAGAATATGCATTATCCGGTTGGAATTTGAACAATTTGCCTGTTCTTGAGGGCTCTGTCTTGGGATACATAAATGCTGACATTTCTGGAATGAAAgttCCATGGATGTATGTTGGGATGTGTTTTGCAACATTCTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGAGTTATTCAATTAACTATCTTCATTGGGGTGAACCAAAAACATGGTATGGTGTAAGCGGTAAAAAGGCAGAGGTGTTTGAAGAAACAATGAAATCTGCTGCCCCTGAATTATTTCAAACCCAACCCGACCTTTTGCACCAATTGGTTACTATTATGAATCCCAATATTTTAATGAACGCTGGAGTACCAGTTTTCAGAACTGATCAACATGCAGGAGAGTTTGTTATAACATTCCCCAGAGCATATCATGCTGGCTTTAATCAAGGATATAACTTCGCAGAAGCTGTTAATTTTGCTCCAGCTGATTGGGTACAACTAGGAAGAGAATGTGTATTGCATTATTCACAGCTAAGGAGATATTGTGTATTTTCACATGATGAATTAGTTTGTAAGATGGCGACTAATGCTGATAAACTTGATATTACTGTAGCAGCAGCAACCTACACTGACATGTTAAGAATGGTCGAAACAGAGAAGAAATTAAGGAAGTCTCTTTTAGACTGGgGAGTTACCAATGCTGAAAGAGAAGCATTTGAATTATTACCTGATGACGAGAGGCAATGTGAGGTCTGTAAAACTACTTGCTTCATGTCTGCGCTAACATGTGATTGCACAGCAGACAACTTAGTCTGTTTAAGGCACTACTCGTCTCTTTGTAAATGTCCTCCAAAATCACATACATTACGTTATAGATATACCCTTGATGAGTTGCTTCCATTATTACGTAACCTAAAACAAAAAGCGGAATCTTTTGATAAGTGGGCCGATCAAGTAAAAGAAGTATTGGATCGTAAAAATCCTAAAACAATTAGTTTAACCGAACTAAAAGCTTTATTGTCAGAAgcaaatggtaaaaattttcccaaatcAGATTTGCTTCAGACGTTGGCAAATGCAATAGAAGATGCAGAAAAATGTGCGAGTGTAATTCGTCAATTGGatcttaataaaattcgaacaaGGCATTCTTTTGACAATAAAAGTAAACTAACCTTTGAAGAATTAAGGCTGTTTTGTGAGGAAATTGATAGTTTAGCATGTGttttagaagaggaaaaaatcatgaaagattTATTAGAAAAGACCAAACAATTTGAGGACGaagctaaaaaatttttaacacagGATTTAAAAGATTGTCCTCTCAAAGAGATAGATGATTTAATAGATTCAAGCAATGGCCTTTGCATTGACCTgccttctttaaaaaatttaaagaataggTCCCTCCAGGTAAAATGGATAAAGGACGTTTATGATGCGAGGAAAAAAGGTTCAGATATAGCAGACATTGAtactttaaaagaaatattaagaaaaGGAATGAGTTTGCCAGGCGATATTTTGATTGAAAATATGTTAACAGATGTGCAAGGAATAATAACTGAGGCCGAAGATTGGGAGGAACAAGCTCGtgcactttttaaaaagacTGGTCCTGATGTGATTCCTGAAGCAGaacatttaattaaacttgCTGATGATATTGATGTATACCTTCCAACTGAAAATATACTGGTTGATtgtgtaaataatgcaaatGACTGGTTCAAGCAATTGCAAGAATTAAATTCCTTAGAATTTTATCCATATTTGTCAGCTATCGAAGAATTAGTGAAGAAAagtaaaaactttttgtttcaATTAGATGAAGTTGAGCGTTTAAAATCATATATTTCTGCAGCTAATGGCTGGAAGGACAAAACTTCTAAAACATTTCTTAAGAGAAATACCCTTTATACATTAATGGAATCTTTATCACCTAGAACACAAATGGTTCCACAAAAGGGTAGAAAACGTAATAATGATGATTGCATTCGCCTTGGTGAAAATATGGATCCTGCTTCGGTGGTGGCTGCATTTAAAGATGCTGAAATTCGCGAATTGCGATTTATTAAAGGTTTACGGAAAACCAATCTGGCAAAGATCTTAAAAAAGGATTCAGATTCTGTTTTTTGTGTTTGTCAAAAGGGGGCATCAGGATTAATGATGCAATGTGATTTATGTAAAGACTGGTTTCATTCTTCTTGCGTTCAGTTACCAAAGTTAAGTGCTATTCGCCATAGGAAAAATATTAAGTCATTTGCCTTACATGTAGGTTTCAAAGAATGCAAATATTTATGTACAAATTGCGTCAGAACAAGACGTCCTAGGCTTGAAACAATTCTAGGTTTATTAATGTCATTACAGAAATTACATAGTCGCTTACCAGAAGGAGAGGCTTTACAGTGTTTAACTGAAAGATCAATGAACTGGCAAGATAGAGCTAGGCAATTATGGCATACTCCAGAATTATCTGcatgtatttcaaaaatggttaatatGACTCAAAAAAATACAGAGGCTAATGCTCGaatgaaaactgaaaaaattattacttctgAATTAAAAAAGGCTGCCACTAACCCTGAATTGCATAAAAGAGTTCAAGAAATAACACCACTAAGTGGAATTAATAGCGAGGACGATTCTGTTTGTGTATCTTCAGATGACGACGATTTTAAGGATGAGCATGCATATTCCATgaacttttccaaaaatgatGAAGAAGCATGTTCTCTTCAAATTCATTCGGATAATAGAGCTTCTTTAACAGAGCTCATTATGGAAGGTGATTTGCTTGAGGTATCTTTAGATGAAAACTGTCAACTTTGGCAATTATTGTTTCTGTCGAGAGATTTTGAAAAGGAACCTcttattattgattttgatGACGTAGCTGTTATAACTAAGAAACCAAGGAAAAGACGTTCAGAAGAGAAAGAAATaggaactaaaattaaaaaagattttccaATGAAAAGGGGCAGAAGAATTcggaaaattaaagaaacaccTGGTAAAGAAGTAAAACCTGGAAGGAAACGAAAGGAAAGGGGCCAAAATAATTCAACTTTAAGTGATGATGATGTTGACGAAGATGCCACATGTGCCGTGTCAACATGCTTACAACCTACTGGAGAAGAAGTAGACTGGGTACAATGTGACGGTGGATGTGAACAGTGGTTTCATATGGCTTGTGTTGGATTATCGGTAAAAGACATTAATGAAGATGAAGATTATATTTGTTCTGCCTGTTCACCAGATACAGTGAAACAAAGACTAAATGGAGCGAATACAAGTGAATTGgtaatagaaatttaa
Protein Sequence
MSIKDGCEVPNGIPIVDLSVDSNPPVLSKAARQDLFEFVIPPEAPVFTPTEVEFADPLLYIDKIRPVAERFGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKLKFTPRIQRLNELEAKTRIKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPMVEKRALDLYTLHRLVENEGGFNTVSRERKWAKIAVFMGYPNGKGLGTILKTHYERLLYPFEVFTNEKKLIPSETKSEPEDDKEYKINKNKILSLSNSVLNRKSNYNRRTKAKSEKFSDDDGHETAGSDISEAESEHNKELKRLQFYGPGPKMAGFNSKRKDEAKLKKVKNSGSEYDPLAKYICHNCQRGDSEEHMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLAEIPKGDWCCPKCVAEEVSKPMEAFGFEQAQREYNLQQFGEMADTFKSEYFNMPVHLVPTKMVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKNSINLLAGDQEYALSGWNLNNLPVLEGSVLGYINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVSGKKAEVFEETMKSAAPELFQTQPDLLHQLVTIMNPNILMNAGVPVFRTDQHAGEFVITFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWVQLGRECVLHYSQLRRYCVFSHDELVCKMATNADKLDITVAAATYTDMLRMVETEKKLRKSLLDWGVTNAEREAFELLPDDERQCEVCKTTCFMSALTCDCTADNLVCLRHYSSLCKCPPKSHTLRYRYTLDELLPLLRNLKQKAESFDKWADQVKEVLDRKNPKTISLTELKALLSEANGKNFPKSDLLQTLANAIEDAEKCASVIRQLDLNKIRTRHSFDNKSKLTFEELRLFCEEIDSLACVLEEEKIMKDLLEKTKQFEDEAKKFLTQDLKDCPLKEIDDLIDSSNGLCIDLPSLKNLKNRSLQVKWIKDVYDARKKGSDIADIDTLKEILRKGMSLPGDILIENMLTDVQGIITEAEDWEEQARALFKKTGPDVIPEAEHLIKLADDIDVYLPTENILVDCVNNANDWFKQLQELNSLEFYPYLSAIEELVKKSKNFLFQLDEVERLKSYISAANGWKDKTSKTFLKRNTLYTLMESLSPRTQMVPQKGRKRNNDDCIRLGENMDPASVVAAFKDAEIRELRFIKGLRKTNLAKILKKDSDSVFCVCQKGASGLMMQCDLCKDWFHSSCVQLPKLSAIRHRKNIKSFALHVGFKECKYLCTNCVRTRRPRLETILGLLMSLQKLHSRLPEGEALQCLTERSMNWQDRARQLWHTPELSACISKMVNMTQKNTEANARMKTEKIITSELKKAATNPELHKRVQEITPLSGINSEDDSVCVSSDDDDFKDEHAYSMNFSKNDEEACSLQIHSDNRASLTELIMEGDLLEVSLDENCQLWQLLFLSRDFEKEPLIIDFDDVAVITKKPRKRRSEEKEIGTKIKKDFPMKRGRRIRKIKETPGKEVKPGRKRKERGQNNSTLSDDDVDEDATCAVSTCLQPTGEEVDWVQCDGGCEQWFHMACVGLSVKDINEDEDYICSACSPDTVKQRLNGANTSELVIEI

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01370808;
90% Identity
iTF_01370809;
80% Identity
-