Sinc002881.1
Basic Information
- Insect
- Scirpophaga incertulas
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_036419045.1
- Location
- CM071626.1:43250821-43252281[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-MIZ
- Domain
- zf-MIZ domain
- PFAM
- PF02891
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 13 0.0031 40 5.5 0.1 20 39 19 38 8 40 0.81 2 13 0.0023 30 6.0 0.0 19 39 57 77 47 79 0.81 3 13 0.0028 36 5.7 0.0 19 39 99 119 88 121 0.80 4 13 0.0033 42 5.5 0.0 20 39 139 158 128 160 0.81 5 13 0.0041 52 5.2 0.0 19 38 189 208 179 210 0.80 6 13 0.0043 55 5.1 0.1 22 39 207 224 204 226 0.87 7 13 0.0029 37 5.6 0.0 19 39 243 263 233 265 0.81 8 13 0.011 1.4e+02 3.8 0.0 20 36 283 299 272 306 0.80 9 13 0.011 1.4e+02 3.8 0.0 20 36 310 326 299 333 0.80 10 13 0.0026 33 5.8 0.0 20 39 337 356 326 359 0.81 11 13 0.0025 32 5.8 0.1 19 40 363 384 354 388 0.81 12 13 0.0025 32 5.8 0.1 19 40 390 411 381 415 0.81 13 13 0.008 1e+02 4.2 0.0 17 36 415 434 407 439 0.77
Sequence Information
- Coding Sequence
- atgtatgtgtatgtagaGAATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGCAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATATAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGCAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATATAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATATAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATATAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGCAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGTGTATGTAGAGCATGTAGAGTGTATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAAAGTATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGAGTATGTAGAGCATATAGAGTATGCGGAGTATGTAGACTATATAAAGTATCCGGAGTATGTAAAGTGTAAAGAGTATGCGGAGTATTTAGAGTATGTTGTGTATGCGGAGTATGTAGACTATATAGAGTAA
- Protein Sequence
- MYVYVENVECIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVEHIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYVEHVECIEYAQYVEYVEHIEYAEYVEYVEHVKYIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVEHIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYIEHVECIEYAEYVEYVEHIEYAEYVEYVEHIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVEHVECIEYAQYVEYVEHIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVEHIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYIEHVECIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYIEHVECIEYAEYVEYVKYIEYAEYVVYIEHVECIEYAQYVEYVEHIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVEHIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVEHIEYAEYVVYVEHVECIEYAEYVEYVKYIEYAEYVEYVEHIEYAEYVDYIKYPEYVKCKEYAEYLEYVVYAEYVDYIE
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -