Schi009410.1
Basic Information
- Insect
- Schlechtendalia chinensis
- Gene Symbol
- Arid4b
- Assembly
- GCA_019022885.1
- Location
- CM032346.1:2413217-2421794[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 1.8e-26 6.2e-23 81.4 0.3 1 89 294 376 294 376 0.93
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCATTTGGAAGAACCTCCTTTTCTTTCTATTGGTACAGAAGTCAGTGCTAAATGCAAGGGCGCTTTTTGTGAAGCAAAAATTAAAAACATATCAAAACTTGTAAAATGCAAGGTACAATATTCAAACGGATCAGTTGGTTTAGTCTCAGATGATTCAGTAAAAGGATCGTTAAAAGTTGGGAATACGGTTGAAGTAAAATGTAATGATAAAACAGAGTTTGTTGAAGCAGTTATTCAAAAAATTCAAGATTGTAGTCAGTACACAGTTGTATTCGATGATGGAGATATCTCATTATTAAAAAGAACTTCTTTATGCTTGAAAAGTGGTAGACATTTTGCAACGGGTGCAACTCTTGATCAATTACCATTGACTCATCCGGAACATGTTGGAATTACACAAATACGTACTAAAGTAGTAAATAATCGTAGAAGCCGAAAATATAAAAAAAATACTGGGGAAATGAAAGATATTTTGCATATAGAAGAAAAAGATATTGGAAAAGTAGTTTGTGTCAAATTAAATAATAATAAGAAAAAATTGAAAGACAACTGGTTCCCAGGTTTAATTGTATCTCCAACTGCACAAACAATAGTTAAAACTAATATAACTATTGATTATTTGGTTCGTTCTTTTAAGGATGGAAAATACTATACTGTACCAAAAAAAGAGATTGCAGAATTCACCAAAGAAATCGCTAGTCGTGTTGAAAATCCTACACTTAAAACTGCTGTTGAAAAAGCCATATTATATTTGGATAAGGATGAAATTCCACCTCACTGGGACCGTGATTTATTATTTGGTATAGATAAATGTTGTATGACTACAGATAGTGAAGGAACTTGTAATACTGACACTTCTGACGAAGAATCAATTGAAGAAAAAGATCATTTTGTTGCCCAGTTATTTAAATTTATGGACGATCGAGGAACACCTATAAATCAAGTTCCAGTGATTAATGACAAAGACGTTGATTTATATAAATTATTTAAAGTAGTGAATGACTTGGGCGGTTTTAACAAAGTAAATAAATTTAAACTATGGAAAACTATAGCTCAAAAAGTTGGACATGAGCAATCAGTAATATCTGTAAAACAATCTTATCAACAATATCTACATAGTTTTGAAGATTTCTACCGAAAATTAGGATGCACAATGTTGAGTCATCCTCGTGTAAGGTCACGTAATAGCAGATTTAGTAGAAGTATTATACGTGATATAGATAAAACACCTCTTACTACTGATAAGAATAGACAATCTATATTATCCAATGAAAAAAAAGATAAACGAGATGACACTTCCAAGAATTCATTTAAAAAAAATATTAAAAGTTCTAAAAATGAAGAAATTATTTCTTATAAAACTAGTGATAAGAAAAAAGATGACATTAATAATTGTACTTCAAATAATAAGTTGTCAGTCAAATGGGATCCTGATATTTTAGAAGCTACAGATTCTAAAATTAAAAAAGATGATTCGGTTGAAACAAAACAAATTGAAAATGTACCCATTGATGATAAAAAAGATAAGAAAAGAATATATACAAAAAATTTATTTGGAAAATCAACAAAGAAAACTGTAAAAAAAGAAAAAATTAAAAAGATAAAAACAGTAGATGTTGGATTATCGGGTTCAAGAAAAATTAGAGCTTTAAAAAATCGTATTAAAACCATTGTTAAAGTTATAACTCCATTCAAAAAGACAAAAAAATCTACATGTAATATCGAACAAGAAATTTTCAATAAAACAAATTTAGATGAAGACATGCAAAAATTAACACGGTCTAAATCCAAAGAAGATATACCTGTGATTAAAAGAAAATTATCATTATTAAACAATCATGATATTTCAGTTGAATCTACCCCATGTGGATTTAATTTAGAAAATCAAAATAAAATTAAAAATTTGGATAATGGAACCATATTGGAAAAAAAAAGAAAAAAAGATGAATCTAGTATTTCTACACTTTTGAGTGGTGACTTTGAAGCATTAACTGAAGATACTATAATTACTACAGGAGACAATTTAATTGTATACTATGGAGATACTCATACCACTACTTATGATGCAAAGGTTCTTAATGTTTGTAATATTGAAGACGAGATTAAATATTATGTCCATTATAAAGGATGGAATTCACGTTACGACGAATGGATTAATAAGACACGTATTGCTTTTAAATGTAATAATCTTGAATTGGATGATACTGAATCTCTAAAAAGCGAGAAGAAACCTATTGACCAGAAAAAAGTAGTAAAAACTATTAACAGAACTCGACGGTCAGTTACTCCAAGTTCGAATGTCTCTACTAACTCACTTAGAAAAAAATCTCCTTTTGCTATCAGTACTCGGCCAACTCGAACATGTACTTTGAATGATAAATCATTAGCATCCATTGATAATTCAGATTCTGAATCCGATTACTCAGAAAATTTAGTATTAGCCAAGAAGCCTAATAAAAAAAGTTATCCTTTGATAAAAAACATAAAGACAGAACCAGATGTTATTATAAAAACAGAACCTTCAGATATTGATCAAAAAAAAAAATTAAACCCTAAAACATATCTTACAAAAGAGATGCTTATTCAAAAGCTTACACCTAAAAAATTAAAATCTTGCGTTATGAAAGTTCATGATAGTACAACAGAAAAAATTGAAATTTCTGAACACGTTACTTTAAAAAAACCTTTTGATTTTAATTTTAAAACTGAAACATCAATATCTTCCAATACTACATCTAATTTAAATAGTCAACATGTAGAAACGCAAAATGATAATAAAAATGTCGATGGTATTCAAAACGAATTAAAAATTGCTCCAAATCATTACTTATCACCTAAAGAAAAATCTGAAAGACAAAATCAACTATTGTTGAATGAAAATATTGAAAAAAATACAGAAAAGTCAACGCCTGCAATAAAGTCTAAAATTACTGGTCTTGTCTATTCTAAATCTTCATCTGAATACAATGAATTTAAATTAAAAGAATATGATAAAATACCATTAGGTAATTTAGATAAATCTAAAATATTTGGTACTGATTTTGATCTTAATAAAATAAGATCTGAAATGAAAGGCCTTATAGTGAATAATACTGAATCATACATTTTAGACCAAAAAGCTAAAATTGATGATTTAAAATCTACTAAATCAACTGAAGAAGATATTTACGAATTTAAAGAACACGAACCTTGTGATTTTAAAACTATTCCATCTATCATTGAAGATAAACATCGTAGAATTATAAAACAAACTGAACCACTAAAATTATATAATTTTGAAAAATCCATTGAGCCACCAAAAGTTATTGAAAAAAGTGACTCTAATGAAAATAATGAAAAATTTACCAAAGTCCCAAATCTTGAAAAAAATTTGGTTATTACTGATAACGCTGAAAATTCTATTTCACATATCCAACTCGATGAAATGAAAGAAGATTCTTTAAGTGAGACTTGTAACATTAAAGTTAATGAATCTAATATTATGAAAGATGAAGTGTTAAATTTATGCATAAAAGCCAGAGATTTACTTCCAAATAATATTTTTAATATGTCAGTAAATGATACTGAACTTGATGATGATGACGATGATTCAAAACTTATTATAGCAGATATCGATAAAATGGAGACTAATTATCAAATAGATGTAGATGAACACAATTCTTCTAATGGTCAAACTGAAAATTTAGAAACACAACCATTAATATTATTACCACAAAGTATACATGAATTACCCAATACAGATTCAGAATTTCAAAGTTCAAATAATATGTCAAAAGATACTGATGATGAAAGCACAGTATCTTGTAGTGAAAGTATTCAAAATTTTCAATTGTGTTCAACTAATATTTATCAAACTTATGGTACTAAATCCGATTGTGAATCAAATTCAAAATCACCAACTGAATGCACAGATAATGTTAAACCAATTACAAAGATTTCCATTGATAAGTCTATGAATAAGCATAAAATGTATGATTATGAAAACAAAAAACCTAATTATATATCCAAAAATGAAAATGTAGTTTTTCCTGAATTACAATGTAAAGAAGAAATATTGGATGAAGATACATTGAACAATGCTTTAGTCATAAAATATAATCAAAAATCTATTGACCAAAATATTCACAAACCTAGTACCAGTAAAAATTTCTTTGATTCAATACACCAGTCTAACAAAGATGATGTTGAAACAGATCTTTCTAGCGACGGAAAAAATAATTTCATTGATATTGAACAAACTAATTTAATCAAAAATGTAATATTTGATACTACTGCACAAACAAATACTACAAACAAGAATATTACATTTTATGACAATAAGCCAAATAATAACAAAGATGGTCTTAATGATAACAGTTTAATTGATAAAAAAATAACCTATAGTTCAGATGAAGATATAAATAATGTATTGCTGTGTGAAGAAACTATTCCAGGCAGTCCAACTGGTATATCAGAAGATCATTATAATCAAGAAAAAGGAGAAACTTGTGTTGAACAATCTGTTACAGAAGTTGCTTCTATTATGTATGCTATTAAAAAATCATTCAATAAACCAATGGTTGCATTGATAGGTGCTACTAATGAGGAGATGAACCAATACACTGATATCATTCAAAACAATGGTATACTAGATCAAAGACATTTACAATTCTTGGCTGAAATTTCAAGTAGAAATGCTGATTTAATTATAAATGAATCACCAGAATTGGACTTGGAACCAGTTTTGGACCAAACAGTGAAAGATGTAACAAAAACTAAACGAAAAAATAGTCATGAACACCACTGCTCGATATCAAAACGGAATAAAACGTCATCTATTTCAACTACTGAAGATAATCCTGAAATACCTCAAAAAAATGGAAAGCCATTAGTTTCATTCACGCCAGATATGGATTCTGTTCAACGACAAGCATTAATTTCAGCCAAAATAAATGATTTACGAAAAGAATATTTATTAGTTAAAAGTCGTATAACTGTTGTTGATCGTAGAAGAAAAAAAATAAAAAAACGAAAAAAAGAATTAATAAAACTTTCTGCTATTGATAAAACACATATTACTGGCTAG
- Protein Sequence
- MHLEEPPFLSIGTEVSAKCKGAFCEAKIKNISKLVKCKVQYSNGSVGLVSDDSVKGSLKVGNTVEVKCNDKTEFVEAVIQKIQDCSQYTVVFDDGDISLLKRTSLCLKSGRHFATGATLDQLPLTHPEHVGITQIRTKVVNNRRSRKYKKNTGEMKDILHIEEKDIGKVVCVKLNNNKKKLKDNWFPGLIVSPTAQTIVKTNITIDYLVRSFKDGKYYTVPKKEIAEFTKEIASRVENPTLKTAVEKAILYLDKDEIPPHWDRDLLFGIDKCCMTTDSEGTCNTDTSDEESIEEKDHFVAQLFKFMDDRGTPINQVPVINDKDVDLYKLFKVVNDLGGFNKVNKFKLWKTIAQKVGHEQSVISVKQSYQQYLHSFEDFYRKLGCTMLSHPRVRSRNSRFSRSIIRDIDKTPLTTDKNRQSILSNEKKDKRDDTSKNSFKKNIKSSKNEEIISYKTSDKKKDDINNCTSNNKLSVKWDPDILEATDSKIKKDDSVETKQIENVPIDDKKDKKRIYTKNLFGKSTKKTVKKEKIKKIKTVDVGLSGSRKIRALKNRIKTIVKVITPFKKTKKSTCNIEQEIFNKTNLDEDMQKLTRSKSKEDIPVIKRKLSLLNNHDISVESTPCGFNLENQNKIKNLDNGTILEKKRKKDESSISTLLSGDFEALTEDTIITTGDNLIVYYGDTHTTTYDAKVLNVCNIEDEIKYYVHYKGWNSRYDEWINKTRIAFKCNNLELDDTESLKSEKKPIDQKKVVKTINRTRRSVTPSSNVSTNSLRKKSPFAISTRPTRTCTLNDKSLASIDNSDSESDYSENLVLAKKPNKKSYPLIKNIKTEPDVIIKTEPSDIDQKKKLNPKTYLTKEMLIQKLTPKKLKSCVMKVHDSTTEKIEISEHVTLKKPFDFNFKTETSISSNTTSNLNSQHVETQNDNKNVDGIQNELKIAPNHYLSPKEKSERQNQLLLNENIEKNTEKSTPAIKSKITGLVYSKSSSEYNEFKLKEYDKIPLGNLDKSKIFGTDFDLNKIRSEMKGLIVNNTESYILDQKAKIDDLKSTKSTEEDIYEFKEHEPCDFKTIPSIIEDKHRRIIKQTEPLKLYNFEKSIEPPKVIEKSDSNENNEKFTKVPNLEKNLVITDNAENSISHIQLDEMKEDSLSETCNIKVNESNIMKDEVLNLCIKARDLLPNNIFNMSVNDTELDDDDDDSKLIIADIDKMETNYQIDVDEHNSSNGQTENLETQPLILLPQSIHELPNTDSEFQSSNNMSKDTDDESTVSCSESIQNFQLCSTNIYQTYGTKSDCESNSKSPTECTDNVKPITKISIDKSMNKHKMYDYENKKPNYISKNENVVFPELQCKEEILDEDTLNNALVIKYNQKSIDQNIHKPSTSKNFFDSIHQSNKDDVETDLSSDGKNNFIDIEQTNLIKNVIFDTTAQTNTTNKNITFYDNKPNNNKDGLNDNSLIDKKITYSSDEDINNVLLCEETIPGSPTGISEDHYNQEKGETCVEQSVTEVASIMYAIKKSFNKPMVALIGATNEEMNQYTDIIQNNGILDQRHLQFLAEISSRNADLIINESPELDLEPVLDQTVKDVTKTKRKNSHEHHCSISKRNKTSSISTTEDNPEIPQKNGKPLVSFTPDMDSVQRQALISAKINDLRKEYLLVKSRITVVDRRRKKIKKRKKELIKLSAIDKTHITG
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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