Rlae023208.3
Basic Information
- Insect
- Rhamphomyia laevipes
- Gene Symbol
- MYT1L_1
- Assembly
- GCA_963920725.1
- Location
- OY987256.1:38249001-38275327[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2HC
- Domain
- zf-C2HC domain
- PFAM
- PF01530
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This is a DNA binding zinc finger domain.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 6 2.9e-14 2.8e-10 41.1 10.4 1 27 436 462 436 464 0.98 2 6 1.3e-15 1.2e-11 45.5 5.7 1 29 480 508 480 508 0.96 3 6 1.5e-18 1.4e-14 54.8 8.3 1 29 1259 1287 1259 1287 0.98 4 6 2.5e-16 2.4e-12 47.7 6.0 1 29 1304 1332 1304 1332 0.97 5 6 1.5e-17 1.4e-13 51.7 6.5 1 29 1365 1393 1365 1393 0.97 6 6 4 3.8e+04 -8.2 6.3 12 22 1614 1624 1613 1625 0.74
Sequence Information
- Coding Sequence
- atggCATTATCAAAAAGACCACTTTCTAAAGATGGtggtattattgaaaatattaaaaacgaaGATCAAGAAATTGCTGTGAAACGTAAAAAACGTTCAAGTCGTGAAGATGAAATGCTTAATAAATCACAATCAATTGCCGATGAAAAAAGTTCATTACCACAAAAGAAACGATCAATTGTTACATCTagtggtaatataattaatggtcgaacaacaacaacaaatttaataaaatcaaattcagATGACCAAGATGATGAAACATTAATCCGTGAAACACAAGCAGCATTAAAAAGTTTATCGGGTAGTTGGACATCAGATACAAAAGGTTCAATTTATCGTTTAAATGATCAAGATGATAATCCACCATTTCAGAATTTATtcgatgaaaaattaaaagattcatATAGTTCACATCATCATCAAATGCAAAAATactcaacaacaacaaaGCAAAAAGAAAATGATCAGGCTCGTTTAAattcacaatatataaaatttgctccaccaccaccaccgccaccatCATCAACAGCAAATTGTGGTGAATATAATAATGATCATTGTTCATCAGTTGATGATATTGGTCgcaaaaaaataccattttCACAAGCATCTGCTTTTAAACCACCTACAGATACGAAACGTacaaatggtaataataatggtaTTGGCAGCGGCGGCACAATGCAATATTCATCTGGGCCTTTAGGTTATAGTACTGAGACAACATATCTCAGTTATCCACCACCAACATCAGCACAATTATCATCACTTGGTTTAACAATGAATAATTGTATTCCACCAATAGTACCACCCCaaccaccaccaccaacaacaacaacaactggtCCACCAACATTATCACATTCCATTGATGAGAAActgattaataataatcatagtaaaaatttaaaagattcttCATCTGAAACAGTAATTCCATCAACAACACCTGCCACATCAAATGACGATGAATGCAATAAACCAAACAATGAAACATCACCGGACACAAAACATTATACAATACTTCAACCGGCTGGTGTTGGAAGTCGAGCAGCATCTGTAATGCAAGATATAGCACGTGAAGGTGTATTAACTGTATCAGCGGTTAGTAgtagtaataacaataataataatacagttGGTAGTACTGGCAGTCCTTCAGGTTTGGGTAATGTTACATCAACAACACAAAATGAGAAACTATTtgatcataatcatcatcatcatcataatcatcatcacaATACAACACAACCACCAGCCTTTTCACCTGGAAGTTTGAATCgagataatgcAAAATGCCCAACGCCTGGTTGTACTGGCCAAGGACACTCAACAGGATTATATTCACATCATAGaagTTTATCAGGATGTCCGAAAAAGGATAAATTATCATCGGAAAtatTGGCGATGCatgaaacaatattaaaatgtccGACATCTGGTTGTAATGGCAGAGGTCATGTTAGCTCAAATCGTAATTCACATCGAAGTTTATCTGGTTGTCCAGCAGCAGCTGCTAAAAAAGCAGCTGCACGTGAAGCTAAATAtcatgctaataataataatggatttatagcatttcatcaacaaaattcGACAACAGCAGCAATTATACAAGCAGCCGCCGCTGCAGCAGttcttcATTCACAAAGTCTAAACAATGAATCACGTAAATCATTAGCTGAACTTAAAGCTATGTATCCACAATctgaaaattttgatgaaattaatcgTCGACATTTAGATAAAGAACCAACTGACAAACTTGCATTAGTAACAAATCGTTtagatatacataataataataactgcACCATCAACGAACAAACTAAACAGCATTCATCAACTACatcatttctattaaataacaacaatacaaattgtattaataataatataaataatagcaataataataataataactcaaaatgtcataataataatatgccATCAATAATAAAATCGGAAATAAGTCCATCTTCAATTAAATCTGAATCAATTGGATACGCAAAAAGTCCAAATGCACCAGTAGTTCATCATCAACCgtcatatttacataataatgatTCAAGTAATTCTAGTACGTATACAaatgttgataataataatcatacaaAAGGATTATCTAgtgtaaatatttcaaatggccATCAATCGtcaacaacaaattcaacatTATCAtcgaataataatcaaaataatacagATATTAATATGCATCAGTCGTCACATTTATCAAATAGGAATAGTGATATGTTACGAAATTCCAATAACAATATCAATAATACACAAATGATTTCAACGACTGCCAGCAACAATCAATCAATGAATGGTTTTGTTAATATTCAACATGAACAGCAAAATTCTCAAGAGACATCAAGAGGTCAATATGAAAATTCAGCAAGTACTTTAatgatgaataataataatagtacgaCAAGTACAAATCCAGGAACAGATGGTAATGGTTCTGTTATATCAAATGGTATGTCAATTGATGATCCTTATCTACGAGCAGCCGAACAGCAAATGCGTTATTCACAAATGGTTAGCAGTGGTGATTTGGGATCATTAACAAAACCATCTGTATCATATGCAAGTGATATGTTAAATGGTAGTCGACCACCAGTACCTTACGATACAATAAATTCACATCGATTATCTTACGACCCAAATACGATATCGACAACAGCATTCGAACGGTATGATCCAAACTGTACTGGCCAACGTCCAcctaatatgtatacatatctTCATCAGCCAACAGCCGAAGACATGAATagtcaacaacaaaaatttttacaagAACAACAGATGGTTCATGCTAGTATGCTAAAAGCAGAGCATGATGAAAACAATGGTCCTATATATCCGCGACCAATGTATCATTATGATCCAACTGTTGGTCCATTACCACCCGGTTTTTCTGCTATAAATTTATCTGTAAAAGTTGCAGCTGCACAAGCTGCTGCTGCTGCAGCTGCATATAAAAGTGGTGCTGCATCGCCATCACCAAATGGTCCCGTTATTGATTTGTCAACATCATCGGTGACTTCATCCAGTCCGCATGGTTTTAATTCACCGCATCATTATAGTCATCGGTTAGCTGGCGCTGGTAGTCCACAACCAGGTTCAAGTCCACATCACTTAGCCAACAGTCCACAAGTGCCAAGTCCACAAGGTCAAACATTGGATTTAAGTGTAACACGCTTACCACACAGtACTGTAATATCACATAGTCCACAATATGGTTTACATCCGGATGGATTGCATCCACATGGGTTTGTAAGTAGTGGTGCTGGGGGTCCTGGTAGTACACCTCGTTCACCACAAACAGAACCGGTTGATTTTAGTGGCCCACCAAGACCATTAGGATTTGGAATAGTTGGACATATCGGAGGACCAGGTCCTTATAGTAGAGAATCAACACCAGATAGTGGTGGTTCACATTATATAGATAGTTATCGGGATCCAAgtgGTTATAGCCCTCATCCTGGTTATGGTATGGTTGTACAATCTGATTATCCACCGGCCGGTTATCATGGTTATGGACCAGCAGCATATCAGTGTGGTAATCCATATGCAACAGCCGTCGGACCTGGCGGATATCCGACACCGGTTTCAGGTGGATATTCACCAAGTCCTGCATCTTGTTATGCTATGCCACCACCACAACATATACCACAACATGATAAATCAAAAGATGGttTGTGTCCACGTAACGATAGAAATCATCTGCAATCACATTCACAAGAACTTAAATGTCCGACACCAGGTTGTGATGGTTCTGGTCACGTAACTGGTAACTATTCATCGCATCGAAGTTTATCTGGTTGTCCACGTGCAAATAAACCAAAAAGTAAACCACGCGATGGTCAGGATTCGGAACCATTaagatGTCCCATACCAGGATGTGATGGATCTGGACATTCAACAGGAAAATTTTTATCTCATAGAAGTGCTTCTGGTTGCCCAATTGCTAATCGTAATAAAATGAGGGTCCTTGAGAATGGTGGAACTGTTGAACAACATAAAGCtgctgttgctgctgctgctgctatGAAATTCGATGGAGTTAATTGCCCAACACCAGGTTGTGATGGTACAGGCCATATAAATGGCACATTTCTTACGCACAGATCACTTTCAGGCTGCCCGACTGCAGCGCAAGGAATAAAGAAACCAAAATTTGATGAAGTTGCAATGGTTTATCCAAAAGGATATACAGGTATGGAAATGATAATGAATTCAGTTGGATCAACATCATCTTTAACATCAGCAGCAACTTCATCATCTTCATCctctggtggtggtggtggactATCTGGACTACCGTTATCATCTACATCTCTATCAACTGGACCATTATCAACATCAGCACATGTCTCATCATCATCCAATTccaacaataatataaattcagcaaataataatgtttcaaataataataataataatagcagtaCTGGATCTAATCAACCAACTGGTGAGGATCTTGTTTCATTAGAAGCGGAAATATCTGAATTACAACGAGAAAATGCCCGAGTTGAATCACAAATGTTACGATTAAAATCTGATATTAATGCAATGGAAACACAATTGGGAAATGGCGAACGGGAAATTCCTATAATCACCAGTCAACGGGGGGGTTCTAACTTAAACAATTACTATGAAAGTTTACGTAACAATGTTATAACTTTATTAGAACATGTCCGAATACCAAATGGTGGAACAACTACCAATCATTCACATGGAAATATTGCCAGTATTACACCAACATCATCAATAGTTACATCATCAACTTCAGGCGGTCAAACAATTTCACATCATCATTCTGGTTTTATGACACACCATAGTTCAATACCGCCACCATTGCCACCAACACATTCAACAATGTGTGCAACATCAAGTCTGGGACCGATAATGGGATCTGTCGGAATGGGTACTGTTGTTGGCAATGAGAAAATTACCCATGAACATTTCgataattatatatcaaaattacaatCATTGTGTGCACCACCTGACATATATGGATTACCAGCAGATGAGAATCGGCCGATTTATGAAACTGTCAAATCACATTTACAAGATTATACAGTGTTGCCAAcaccaatataa
- Protein Sequence
- MALSKRPLSKDGGIIENIKNEDQEIAVKRKKRSSREDEMLNKSQSIADEKSSLPQKKRSIVTSSGNIINGRTTTTNLIKSNSDDQDDETLIRETQAALKSLSGSWTSDTKGSIYRLNDQDDNPPFQNLFDEKLKDSYSSHHHQMQKYSTTTKQKENDQARLNSQYIKFAPPPPPPPSSTANCGEYNNDHCSSVDDIGRKKIPFSQASAFKPPTDTKRTNGNNNGIGSGGTMQYSSGPLGYSTETTYLSYPPPTSAQLSSLGLTMNNCIPPIVPPQPPPPTTTTTGPPTLSHSIDEKLINNNHSKNLKDSSSETVIPSTTPATSNDDECNKPNNETSPDTKHYTILQPAGVGSRAASVMQDIAREGVLTVSAVSSSNNNNNNTVGSTGSPSGLGNVTSTTQNEKLFDHNHHHHHNHHHNTTQPPAFSPGSLNRDNAKCPTPGCTGQGHSTGLYSHHRSLSGCPKKDKLSSEILAMHETILKCPTSGCNGRGHVSSNRNSHRSLSGCPAAAAKKAAAREAKYHANNNNGFIAFHQQNSTTAAIIQAAAAAAVLHSQSLNNESRKSLAELKAMYPQSENFDEINRRHLDKEPTDKLALVTNRLDIHNNNNCTINEQTKQHSSTTSFLLNNNNTNCINNNINNSNNNNNNSKCHNNNMPSIIKSEISPSSIKSESIGYAKSPNAPVVHHQPSYLHNNDSSNSSTYTNVDNNNHTKGLSSVNISNGHQSSTTNSTLSSNNNQNNTDINMHQSSHLSNRNSDMLRNSNNNINNTQMISTTASNNQSMNGFVNIQHEQQNSQETSRGQYENSASTLMMNNNNSTTSTNPGTDGNGSVISNGMSIDDPYLRAAEQQMRYSQMVSSGDLGSLTKPSVSYASDMLNGSRPPVPYDTINSHRLSYDPNTISTTAFERYDPNCTGQRPPNMYTYLHQPTAEDMNSQQQKFLQEQQMVHASMLKAEHDENNGPIYPRPMYHYDPTVGPLPPGFSAINLSVKVAAAQAAAAAAAYKSGAASPSPNGPVIDLSTSSVTSSSPHGFNSPHHYSHRLAGAGSPQPGSSPHHLANSPQVPSPQGQTLDLSVTRLPHSTVISHSPQYGLHPDGLHPHGFVSSGAGGPGSTPRSPQTEPVDFSGPPRPLGFGIVGHIGGPGPYSRESTPDSGGSHYIDSYRDPSGYSPHPGYGMVVQSDYPPAGYHGYGPAAYQCGNPYATAVGPGGYPTPVSGGYSPSPASCYAMPPPQHIPQHDKSKDGLCPRNDRNHLQSHSQELKCPTPGCDGSGHVTGNYSSHRSLSGCPRANKPKSKPRDGQDSEPLRCPIPGCDGSGHSTGKFLSHRSASGCPIANRNKMRVLENGGTVEQHKAAVAAAAAMKFDGVNCPTPGCDGTGHINGTFLTHRSLSGCPTAAQGIKKPKFDEVAMVYPKGYTGMEMIMNSVGSTSSLTSAATSSSSSSGGGGGLSGLPLSSTSLSTGPLSTSAHVSSSSNSNNNINSANNNVSNNNNNNSSTGSNQPTGEDLVSLEAEISELQRENARVESQMLRLKSDINAMETQLGNGEREIPIITSQRGGSNLNNYYESLRNNVITLLEHVRIPNGGTTTNHSHGNIASITPTSSIVTSSTSGGQTISHHHSGFMTHHSSIPPPLPPTHSTMCATSSLGPIMGSVGMGTVVGNEKITHEHFDNYISKLQSLCAPPDIYGLPADENRPIYETVKSHLQDYTVLPTPI
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00643723;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
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