Basic Information

Gene Symbol
TRERF1
Assembly
GCA_963920725.1
Location
OY987257.1:60496510-60517105[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 3.3e-09 1e-05 26.6 0.1 3 45 1515 1557 1513 1558 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTGTAGTGCCTCAATGGGTGCTGAAGGTTCAGTAACATTACAATTACGTGAAGCTGTTCAAGCTCCAGATTCAAATAATTCACTTGATACAGCTTTAACAATTGGTTATCCGGATCCAGAAATGTTAGCAGATGTCTTAGGTACATTACAAGCTGCAGccttaaataataataataacagtagCTCATTAGTTACTTCAAATAATAATCCATCATGTACTACTACAgtaaatggaaaattacaaaataacatttcaACCAGAATAAGTAATAGCAGTAGTAGTGGCGGTAACAGTAACAGTAGcagcagcaacagcaacaataatataaataatatcaataacaataataataataatacaatttgtaatcaaataaataataatataaattgtagcaGTAGTGGTAACAGTAATAGCAGTACAACAAGCAGTAGTAGTAATGTTAGTGAAAATTCTGGTAATTCTGTTACAGTGTCACAGAATCCAATAATTGTTGTTAGAAAACCAAGACCGAAAACATCATCTCCAACACGACATGGTCCACAACAATGTCAGGTATGCAGTAAGATATTTGGAAACGCATCAGCTCTGGCTAAACATAAATTAACTCATAGCGATGAAAGGAAATATGTTTGTGCAATGTGTTCAAAAGCTTTTAAGAGACAGGATCATTTGAATGGTCATATGCTGAcacatagaaataaaaaaccatATGAATGTAAAGCAGAAGGATGTGGTAAATCATATTGTGATGCTAGATCATTAAGACGACATACAGAAAATCATCATAGCACTTTAGCAATGACAGCAACAACACCATCAAATCAATCATTATCACCTTCCACTGGACCACCAACTGGTCTTAGTTTATCTCCAGCAACCGCAAgtggtGATGCTAGTTCACCTCATGGTGCTACCTGTGtacaatatatttcaaattgtgGTGATGGTGGTAATAATTCAAAACCATCATCACCAAGTTCACCTGCTGGTTCTGGTAATGAGGGTCTTACTAGACAACAATTGGATCTCATTAGTCAAATTATGCAACAGACTAAACAAGCTAGTGCACAAGTAACCGTTTCAACAAATCATAATGGTTTGAAACATCAACAGcatcaacaaaatcaacagcaactactacaacaacaacaacaacaatcacagAGACCTAGAACATGGAATATGCAGACACAATTACAACAAACCCAAACAAAATCACCAAATTCCCTTGAAAATTTCACAACATTAAATGGTGCAACAATAACAAGTGGTGGAATAACAATAAATGGAGCTAATATTACATCATCAGGTGCAATTACATCTACAACATTATCTAATCAGCAACAGAATCAACAACAAAACCATCAAAATCAAACTGTTattcaacaaaatcaaattggtcaaactataaatattgttaaaattgaacAGAAACCAGTTGAATGTAATTTATGTcataggaaatttaaaaatgtaccaGCATTAAATGGTCATATGAGATTGCATGgtggatattttaaaaaagaaaatgaaacgaaaaaatgtgaaaaaaaagaATCAATTGGACCACCATTACAAACAGCCAGTATTGGTGTAAGAGcattaattgaagaaaaaataattagtaaaagaaCAAAAGATTTAAAGggtGCCTTTGTAGTACCTGCCCCACCCTTAACTACAACCCGTCGTATTAgtgatatagaaaattttttaacaCCAAAAACACCGGGAACACCATCATTACAAACAATaacattacaacaacaaaatcaatcaaatttgagttcatcatcatcatcaactggTACAGTatcaacaacaactacaaataataataatggtcaATTAGCAACTACAATTGGTTCAACAACAttacaattaaatcaaaaacaaactattcaaaaaattacaaatattagtaCAATTAGTCAGGGTACATCAACTGATTCAAAAGATGCTacattaatagaattattaaaacgTGGTACAAAAGTTGCTGTTAAAAGAACATGCTCTGATACTGGCCAATTATTTAGTACAACTGGAACAGTAATATTACCATCAGATCATCATCAATCGTTATCATCACCAAATACACCAAATCCAACACCACCGTTATCAATATCATTACAAAATGGTGAAACAACACCATTAGCATTAACAATATCCCAAGCACCAAATGGTACTGGTGATGTATATACACTAACATATTCAACAGATTCAACATCAACATATTTTGGTGATAATGATGTTTATAGTGTTTCTGATACAGCAATGCTTTTACAAGCAGTTGATTCCATGCAATTACTTAATGATTCCGCAACAAATCAATTGGTGGATGATACAGCAACAATTAATGATTATACactaaaagataataataattcaacacaaattacaaaatcaaatttaacaaataataataataataatataaataataataataataatgatggtaGACAAGAGTTTACACCAACATCTAAACAATTACAAGATGTTTTAAATTCACCATTACCAGATAATTTAGCTGAATTTGGTACATTTCATTCCAAGGATTTTATCCTATATAATTGTGGTGGTAATAATACACAAAATACAATAACATCATCACCATCTCAATCAACATCAATACAATCATCATCTGTATCACCACTGCCATCACCATTAGCATATCCAACCCCACCAGCAAGTCATGAGGCTGTAACAGAATCTTCACCATTTTTGGACGATTCCCACCATTTTCCTGATGCAAGTGCATTCTTTGATGATAAAACCACCGTTAATTTTATTCATGATAATAGTgatcatcatcaattttttaaagacaCAACTGTTATAAATGATGATTGTAATTtaactgaaaatgaaaaaatattaaaattaaaaaatgaattatttaatgatagTAAAAGTGTATTCGTTAATAATGAACatcatgaattttttaaatgtaatgatAATAGTTCTGATGATGTTTTTGATAATCAAGTTAAAGTTgaagatttattaaatgaaaatagtgGTGAAGAATgtgatttaaaagattttaatgatcaaaatttatcatttttagatGAACCACAAAATTTTTTAGATGATTCACGTAATCCAAGTTCACCATTATCAGAATCATTTTTTACAAGTGGTATTGGTACAGCTGAAGAAGTTAAAGAAGTACTTAAAGATGTACtaccaaatgaaaatttaacatgTGATAATCAATGTgaaaatgatattgatttatattatttaccagGGTTAACATTACAATCACAAATGATGCCTAATTCAGATGAtccattattatcatcatcaccaAAAGATTTTGGTCATAACAGAATATTGctacaacagcaacaaaatcaacaacagcaacagcaacaattgcaaatacaaaaatttgatcCTGTccaattttttagtaataacaataataataataataacaatacaacaaatattaaaagacCGAGaacaaatgataatatttttattaataattcaaatataaatggtATAACTGCCGGCAGTAATACTGctatacatacaaatattaatgGAGCACTAACAATGACAGTACAATCattacatcatcaacaacaacatcaaatacAAGAACAACagtatatacaacaacaacagcaacaacaaaaagacAACAATAATACTACAGTAGACTCATTCATCAATCCGACATTaccaacaataattaatatcagTTCAACAAATGGCTGCCATCAatcaagaataaataatttcataaataatgaaaCTATACAACAACCAAcatcaccaccaccaccacaacCACAACCACTAGCAATCCAACAATGTTCATCATCAGTAACATCATTTGTTTCAGTTACTTCACATCATACCACACCAACATCAACAACCCAAATAACTAGTTCAATTTTAAAACGTAGACTACGTCAAGGtagtaccaataataataataataattttataccaaaaaaacatgaaatttatcGATCTAAATTACGAAAACCATCAACAACACATTATACACCATCACCATTACTAAATCCAGATCGAAAAGCATCtggtttatatacaaatttaccaAAATCATTACTTCAAGATACAATTAGTTTTGGTGATGAATTTGATGATACTGCTAGTTTAGTAGCATTTTTAGATGATTCCAAAGTAAATATTGGTACAGCTTATCAAGCTACAATACCaccaattttaattgataataatattgataatattaataatttattaataattaaaaataatgattccacaattaataataataataataattatgataacaatgatgatgatgatgaattaatGTGGGATCCAAAAATGATATCAAAAAGTCttaatgatgatgaaaaatcattaatacgTTTTATTGAATTAAGTAAATCATCAGCTGTTCCATTGGGCTTTCATTCTGAAGAAGTTGCATTAAAAGCATTATTACAAGCACAAGGTGATACACATATAGctgttttaaatttacttcaatCACCATCAAATTCAGTACATTTAAAATGGACTGGTACAgaagtagaaatatttttaaaaggtcTTGAAAAATATGGTAAAGATTTTTATCGAATTTCAGCTGAGattacaacaaaaacaaccaGTGATtgcattcaattatattatttttggaagAAACTTTGTATTGATTATAAAACAACACATTTGAAACAAGATTCATATGATGCAACAGGAAATgataatcataataatcatcataatcaaaataatacatCACATAGTGAACCACGACCACATGTTTGTGAAATGCCAGATTGTTCAGCTAGTTTCACATCAAAAGCTGCTTTGCATGGTCATATACGAATTCATTGTAtcggaaacacaacaatacaaaatggaATAACGAATACcagtaattgtaatatatttacatttcctgcaaataatagtaataacaatACTACGGTgcaaaattcaaataacaagGATGATTTTCCCTG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Protein Sequence
MCSASMGAEGSVTLQLREAVQAPDSNNSLDTALTIGYPDPEMLADVLGTLQAAALNNNNNSSSLVTSNNNPSCTTTVNGKLQNNISTRISNSSSSGGNSNSSSSNSNNNINNINNNNNNNTICNQINNNINCSSSGNSNSSTTSSSSNVSENSGNSVTVSQNPIIVVRKPRPKTSSPTRHGPQQCQVCSKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCAMCSKAFKRQDHLNGHMLTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHSTLAMTATTPSNQSLSPSTGPPTGLSLSPATASGDASSPHGATCVQYISNCGDGGNNSKPSSPSSPAGSGNEGLTRQQLDLISQIMQQTKQASAQVTVSTNHNGLKHQQHQQNQQQLLQQQQQQSQRPRTWNMQTQLQQTQTKSPNSLENFTTLNGATITSGGITINGANITSSGAITSTTLSNQQQNQQQNHQNQTVIQQNQIGQTINIVKIEQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKENETKKCEKKESIGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRTKDLKGAFVVPAPPLTTTRRISDIENFLTPKTPGTPSLQTITLQQQNQSNLSSSSSSTGTVSTTTTNNNNGQLATTIGSTTLQLNQKQTIQKITNISTISQGTSTDSKDATLIELLKRGTKVAVKRTCSDTGQLFSTTGTVILPSDHHQSLSSPNTPNPTPPLSISLQNGETTPLALTISQAPNGTGDVYTLTYSTDSTSTYFGDNDVYSVSDTAMLLQAVDSMQLLNDSATNQLVDDTATINDYTLKDNNNSTQITKSNLTNNNNNNINNNNNNDGRQEFTPTSKQLQDVLNSPLPDNLAEFGTFHSKDFILYNCGGNNTQNTITSSPSQSTSIQSSSVSPLPSPLAYPTPPASHEAVTESSPFLDDSHHFPDASAFFDDKTTVNFIHDNSDHHQFFKDTTVINDDCNLTENEKILKLKNELFNDSKSVFVNNEHHEFFKCNDNSSDDVFDNQVKVEDLLNENSGEECDLKDFNDQNLSFLDEPQNFLDDSRNPSSPLSESFFTSGIGTAEEVKEVLKDVLPNENLTCDNQCENDIDLYYLPGLTLQSQMMPNSDDPLLSSSPKDFGHNRILLQQQQNQQQQQQQLQIQKFDPVQFFSNNNNNNNNNTTNIKRPRTNDNIFINNSNINGITAGSNTAIHTNINGALTMTVQSLHHQQQHQIQEQQYIQQQQQQQKDNNNTTVDSFINPTLPTIINISSTNGCHQSRINNFINNETIQQPTSPPPPQPQPLAIQQCSSSVTSFVSVTSHHTTPTSTTQITSSILKRRLRQGSTNNNNNNFIPKKHEIYRSKLRKPSTTHYTPSPLLNPDRKASGLYTNLPKSLLQDTISFGDEFDDTASLVAFLDDSKVNIGTAYQATIPPILIDNNIDNINNLLIIKNNDSTINNNNNNYDNNDDDDELMWDPKMISKSLNDDEKSLIRFIELSKSSAVPLGFHSEEVALKALLQAQGDTHIAVLNLLQSPSNSVHLKWTGTEVEIFLKGLEKYGKDFYRISAEITTKTTSDCIQLYYFWKKLCIDYKTTHLKQDSYDATGNDNHNNHHNQNNTSHSEPRPHVCEMPDCSASFTSKAALHGHIRIHCIGNTTIQNGITNTSNCNIFTFPANNSNNNTTVQNSNNKDDFPCKVCGKVFNKVKSRSAHMKSHRPQDNDQLAQNNNNNNINNLNNNQQTIILTSN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01297901;
90% Identity
iTF_01297901;
80% Identity
iTF_01297901;