Rlae028292.1
Basic Information
- Insect
- Rhamphomyia laevipes
- Gene Symbol
- TRERF1
- Assembly
- GCA_963920725.1
- Location
- OY987257.1:60496510-60517105[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 3.3e-09 1e-05 26.6 0.1 3 45 1515 1557 1513 1558 0.94
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTGTAGTGCCTCAATGGGTGCTGAAGGTTCAGTAACATTACAATTACGTGAAGCTGTTCAAGCTCCAGATTCAAATAATTCACTTGATACAGCTTTAACAATTGGTTATCCGGATCCAGAAATGTTAGCAGATGTCTTAGGTACATTACAAGCTGCAGccttaaataataataataacagtagCTCATTAGTTACTTCAAATAATAATCCATCATGTACTACTACAgtaaatggaaaattacaaaataacatttcaACCAGAATAAGTAATAGCAGTAGTAGTGGCGGTAACAGTAACAGTAGcagcagcaacagcaacaataatataaataatatcaataacaataataataataatacaatttgtaatcaaataaataataatataaattgtagcaGTAGTGGTAACAGTAATAGCAGTACAACAAGCAGTAGTAGTAATGTTAGTGAAAATTCTGGTAATTCTGTTACAGTGTCACAGAATCCAATAATTGTTGTTAGAAAACCAAGACCGAAAACATCATCTCCAACACGACATGGTCCACAACAATGTCAGGTATGCAGTAAGATATTTGGAAACGCATCAGCTCTGGCTAAACATAAATTAACTCATAGCGATGAAAGGAAATATGTTTGTGCAATGTGTTCAAAAGCTTTTAAGAGACAGGATCATTTGAATGGTCATATGCTGAcacatagaaataaaaaaccatATGAATGTAAAGCAGAAGGATGTGGTAAATCATATTGTGATGCTAGATCATTAAGACGACATACAGAAAATCATCATAGCACTTTAGCAATGACAGCAACAACACCATCAAATCAATCATTATCACCTTCCACTGGACCACCAACTGGTCTTAGTTTATCTCCAGCAACCGCAAgtggtGATGCTAGTTCACCTCATGGTGCTACCTGTGtacaatatatttcaaattgtgGTGATGGTGGTAATAATTCAAAACCATCATCACCAAGTTCACCTGCTGGTTCTGGTAATGAGGGTCTTACTAGACAACAATTGGATCTCATTAGTCAAATTATGCAACAGACTAAACAAGCTAGTGCACAAGTAACCGTTTCAACAAATCATAATGGTTTGAAACATCAACAGcatcaacaaaatcaacagcaactactacaacaacaacaacaacaatcacagAGACCTAGAACATGGAATATGCAGACACAATTACAACAAACCCAAACAAAATCACCAAATTCCCTTGAAAATTTCACAACATTAAATGGTGCAACAATAACAAGTGGTGGAATAACAATAAATGGAGCTAATATTACATCATCAGGTGCAATTACATCTACAACATTATCTAATCAGCAACAGAATCAACAACAAAACCATCAAAATCAAACTGTTattcaacaaaatcaaattggtcaaactataaatattgttaaaattgaacAGAAACCAGTTGAATGTAATTTATGTcataggaaatttaaaaatgtaccaGCATTAAATGGTCATATGAGATTGCATGgtggatattttaaaaaagaaaatgaaacgaaaaaatgtgaaaaaaaagaATCAATTGGACCACCATTACAAACAGCCAGTATTGGTGTAAGAGcattaattgaagaaaaaataattagtaaaagaaCAAAAGATTTAAAGggtGCCTTTGTAGTACCTGCCCCACCCTTAACTACAACCCGTCGTATTAgtgatatagaaaattttttaacaCCAAAAACACCGGGAACACCATCATTACAAACAATaacattacaacaacaaaatcaatcaaatttgagttcatcatcatcatcaactggTACAGTatcaacaacaactacaaataataataatggtcaATTAGCAACTACAATTGGTTCAACAACAttacaattaaatcaaaaacaaactattcaaaaaattacaaatattagtaCAATTAGTCAGGGTACATCAACTGATTCAAAAGATGCTacattaatagaattattaaaacgTGGTACAAAAGTTGCTGTTAAAAGAACATGCTCTGATACTGGCCAATTATTTAGTACAACTGGAACAGTAATATTACCATCAGATCATCATCAATCGTTATCATCACCAAATACACCAAATCCAACACCACCGTTATCAATATCATTACAAAATGGTGAAACAACACCATTAGCATTAACAATATCCCAAGCACCAAATGGTACTGGTGATGTATATACACTAACATATTCAACAGATTCAACATCAACATATTTTGGTGATAATGATGTTTATAGTGTTTCTGATACAGCAATGCTTTTACAAGCAGTTGATTCCATGCAATTACTTAATGATTCCGCAACAAATCAATTGGTGGATGATACAGCAACAATTAATGATTATACactaaaagataataataattcaacacaaattacaaaatcaaatttaacaaataataataataataatataaataataataataataatgatggtaGACAAGAGTTTACACCAACATCTAAACAATTACAAGATGTTTTAAATTCACCATTACCAGATAATTTAGCTGAATTTGGTACATTTCATTCCAAGGATTTTATCCTATATAATTGTGGTGGTAATAATACACAAAATACAATAACATCATCACCATCTCAATCAACATCAATACAATCATCATCTGTATCACCACTGCCATCACCATTAGCATATCCAACCCCACCAGCAAGTCATGAGGCTGTAACAGAATCTTCACCATTTTTGGACGATTCCCACCATTTTCCTGATGCAAGTGCATTCTTTGATGATAAAACCACCGTTAATTTTATTCATGATAATAGTgatcatcatcaattttttaaagacaCAACTGTTATAAATGATGATTGTAATTtaactgaaaatgaaaaaatattaaaattaaaaaatgaattatttaatgatagTAAAAGTGTATTCGTTAATAATGAACatcatgaattttttaaatgtaatgatAATAGTTCTGATGATGTTTTTGATAATCAAGTTAAAGTTgaagatttattaaatgaaaatagtgGTGAAGAATgtgatttaaaagattttaatgatcaaaatttatcatttttagatGAACCACAAAATTTTTTAGATGATTCACGTAATCCAAGTTCACCATTATCAGAATCATTTTTTACAAGTGGTATTGGTACAGCTGAAGAAGTTAAAGAAGTACTTAAAGATGTACtaccaaatgaaaatttaacatgTGATAATCAATGTgaaaatgatattgatttatattatttaccagGGTTAACATTACAATCACAAATGATGCCTAATTCAGATGAtccattattatcatcatcaccaAAAGATTTTGGTCATAACAGAATATTGctacaacagcaacaaaatcaacaacagcaacagcaacaattgcaaatacaaaaatttgatcCTGTccaattttttagtaataacaataataataataataacaatacaacaaatattaaaagacCGAGaacaaatgataatatttttattaataattcaaatataaatggtATAACTGCCGGCAGTAATACTGctatacatacaaatattaatgGAGCACTAACAATGACAGTACAATCattacatcatcaacaacaacatcaaatacAAGAACAACagtatatacaacaacaacagcaacaacaaaaagacAACAATAATACTACAGTAGACTCATTCATCAATCCGACATTaccaacaataattaatatcagTTCAACAAATGGCTGCCATCAatcaagaataaataatttcataaataatgaaaCTATACAACAACCAAcatcaccaccaccaccacaacCACAACCACTAGCAATCCAACAATGTTCATCATCAGTAACATCATTTGTTTCAGTTACTTCACATCATACCACACCAACATCAACAACCCAAATAACTAGTTCAATTTTAAAACGTAGACTACGTCAAGGtagtaccaataataataataataattttataccaaaaaaacatgaaatttatcGATCTAAATTACGAAAACCATCAACAACACATTATACACCATCACCATTACTAAATCCAGATCGAAAAGCATCtggtttatatacaaatttaccaAAATCATTACTTCAAGATACAATTAGTTTTGGTGATGAATTTGATGATACTGCTAGTTTAGTAGCATTTTTAGATGATTCCAAAGTAAATATTGGTACAGCTTATCAAGCTACAATACCaccaattttaattgataataatattgataatattaataatttattaataattaaaaataatgattccacaattaataataataataataattatgataacaatgatgatgatgatgaattaatGTGGGATCCAAAAATGATATCAAAAAGTCttaatgatgatgaaaaatcattaatacgTTTTATTGAATTAAGTAAATCATCAGCTGTTCCATTGGGCTTTCATTCTGAAGAAGTTGCATTAAAAGCATTATTACAAGCACAAGGTGATACACATATAGctgttttaaatttacttcaatCACCATCAAATTCAGTACATTTAAAATGGACTGGTACAgaagtagaaatatttttaaaaggtcTTGAAAAATATGGTAAAGATTTTTATCGAATTTCAGCTGAGattacaacaaaaacaaccaGTGATtgcattcaattatattatttttggaagAAACTTTGTATTGATTATAAAACAACACATTTGAAACAAGATTCATATGATGCAACAGGAAATgataatcataataatcatcataatcaaaataatacatCACATAGTGAACCACGACCACATGTTTGTGAAATGCCAGATTGTTCAGCTAGTTTCACATCAAAAGCTGCTTTGCATGGTCATATACGAATTCATTGTAtcggaaacacaacaatacaaaatggaATAACGAATACcagtaattgtaatatatttacatttcctgcaaataatagtaataacaatACTACGGTgcaaaattcaaataacaagGATGATTTTCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAAGTATTTAATAAAGTGAAAAGTCGTAGTGCACATATGAAATCACATCGGCCTCAGGATAATGATCAATTggctcaaaataataataataataatatcaataatttaaacaacaatcaacaaacaattattttaaccaGTAAttaa
- Protein Sequence
- MCSASMGAEGSVTLQLREAVQAPDSNNSLDTALTIGYPDPEMLADVLGTLQAAALNNNNNSSSLVTSNNNPSCTTTVNGKLQNNISTRISNSSSSGGNSNSSSSNSNNNINNINNNNNNNTICNQINNNINCSSSGNSNSSTTSSSSNVSENSGNSVTVSQNPIIVVRKPRPKTSSPTRHGPQQCQVCSKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCAMCSKAFKRQDHLNGHMLTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHSTLAMTATTPSNQSLSPSTGPPTGLSLSPATASGDASSPHGATCVQYISNCGDGGNNSKPSSPSSPAGSGNEGLTRQQLDLISQIMQQTKQASAQVTVSTNHNGLKHQQHQQNQQQLLQQQQQQSQRPRTWNMQTQLQQTQTKSPNSLENFTTLNGATITSGGITINGANITSSGAITSTTLSNQQQNQQQNHQNQTVIQQNQIGQTINIVKIEQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKENETKKCEKKESIGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRTKDLKGAFVVPAPPLTTTRRISDIENFLTPKTPGTPSLQTITLQQQNQSNLSSSSSSTGTVSTTTTNNNNGQLATTIGSTTLQLNQKQTIQKITNISTISQGTSTDSKDATLIELLKRGTKVAVKRTCSDTGQLFSTTGTVILPSDHHQSLSSPNTPNPTPPLSISLQNGETTPLALTISQAPNGTGDVYTLTYSTDSTSTYFGDNDVYSVSDTAMLLQAVDSMQLLNDSATNQLVDDTATINDYTLKDNNNSTQITKSNLTNNNNNNINNNNNNDGRQEFTPTSKQLQDVLNSPLPDNLAEFGTFHSKDFILYNCGGNNTQNTITSSPSQSTSIQSSSVSPLPSPLAYPTPPASHEAVTESSPFLDDSHHFPDASAFFDDKTTVNFIHDNSDHHQFFKDTTVINDDCNLTENEKILKLKNELFNDSKSVFVNNEHHEFFKCNDNSSDDVFDNQVKVEDLLNENSGEECDLKDFNDQNLSFLDEPQNFLDDSRNPSSPLSESFFTSGIGTAEEVKEVLKDVLPNENLTCDNQCENDIDLYYLPGLTLQSQMMPNSDDPLLSSSPKDFGHNRILLQQQQNQQQQQQQLQIQKFDPVQFFSNNNNNNNNNTTNIKRPRTNDNIFINNSNINGITAGSNTAIHTNINGALTMTVQSLHHQQQHQIQEQQYIQQQQQQQKDNNNTTVDSFINPTLPTIINISSTNGCHQSRINNFINNETIQQPTSPPPPQPQPLAIQQCSSSVTSFVSVTSHHTTPTSTTQITSSILKRRLRQGSTNNNNNNFIPKKHEIYRSKLRKPSTTHYTPSPLLNPDRKASGLYTNLPKSLLQDTISFGDEFDDTASLVAFLDDSKVNIGTAYQATIPPILIDNNIDNINNLLIIKNNDSTINNNNNNYDNNDDDDELMWDPKMISKSLNDDEKSLIRFIELSKSSAVPLGFHSEEVALKALLQAQGDTHIAVLNLLQSPSNSVHLKWTGTEVEIFLKGLEKYGKDFYRISAEITTKTTSDCIQLYYFWKKLCIDYKTTHLKQDSYDATGNDNHNNHHNQNNTSHSEPRPHVCEMPDCSASFTSKAALHGHIRIHCIGNTTIQNGITNTSNCNIFTFPANNSNNNTTVQNSNNKDDFPCKVCGKVFNKVKSRSAHMKSHRPQDNDQLAQNNNNNNINNLNNNQQTIILTSN
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01297901;
- 90% Identity
- iTF_01297901;
- 80% Identity
- iTF_01297901;