Basic Information

Insect: Rhamphomyia laevipes
Gene Symbol: TY3B-I
Assembly: GCA_963920725.1
Location: OY987255.1:124555176-124568180[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: HTH
Domain: HTH_psq domain
PFAM: PF05225
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 3.6e-12 2.6e-09 37.7 0.0 4 41 1396 1433 1393 1435 0.95

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	3.6e-12	2.6e-09	37.7	0.0	4	41	1396	1433	1393	1435	0.95

Sequence Information

Coding Sequence: ATGAGCGATAACGAACATAGTGATGATAGTCAAAAAGACAATtcacatattaattcaaaaattaatgacaaaaataaaaataataatttacaattggcTGGTTCGTCAAATAGTAAATCTGGTTCTGGTTCTGATTGTCGTATTGAAAGGGTGGCAATAAAACCACCACCTTTTTGGCGCGATAATCCTAAACTTTGGTTTACACATCTGGAAGCACAATTTGTTACTAGTAATATATTGACTGatgaaactaaatattattatgttgtggCGTCTTTAGATGAACAAATGCTGAAATTAGTTAGCGATGTAGTGGAAAAACCACCGGCGAATAACAAATACAATACTCTTCGTGATACATTAATACAAAGTTTATCGCAATCTGAAAATCAgcgtttacaaaatttattaaaaggaaTGGAATTAGGTGATCAAAAGCCAAGCCAGTTATTGCGTCAAATGCGTTCGGgaaatgattttcaattattagatccggtattaaaaaatttatggctTCAAAGGTTGCCTCAACAAGCTCAGTTCGTTTTAGCTGCCAGTCCGGGAAATCTCGATGAGTTAGCTGGGTTAGCTGACAAAATTTTGGAAACGTTTAATCCTAATTCAATTTGGTCGATTACAAACGACAGtattagtagtaataataatagtaatcgCCAAGTTATACCAACCAATCCatcatttaatttagaaaataaaattaatgaaatagcAAATCGtttaaatgaattagaaaattacaATTCGTCTGTTAGGGGACGTGCAATTAACCGTAGTAATTCTAAAGATTGTTTTCGTTCGGGTTCAGCAAAATTCAAATCTAAATCACCAAACAAAAAAGAGCATCCATTTTGTTGGTATCATTTTAAATACGGTGCCAATGCAAAAAAATGTGTTCAACCGTttgataGTGGAGCTGATGTTTCGGTTATTCCACcaactttatttgaaaaatcaaaaccGTGTTCGAGTACTGTATTGTATGCAGCTAattcatctaaaattaaaacgttcggtaaaaaattattaagactGGAACTCGGATTACGTAGAAAATTTGATTGGTATTTTATTATAGCCGATGTTTCAAAACCGATTTTAGGTGCTGATTTTCTCAACACTTTCGGAATATTGGTCGACATTAAAAAAAAGAGATTAATTGATCCTCTCACACAAATCAATTCAATTGGTAAATTAGCATTTggttcattttcaaatattacaacAATTTCTTGTGACAACATTAATAGTGAAGTTCATAAACTTCTTCTTAAATACAAAGAAATTACTATCGAAAATTCTAATCTAAAACCAATTTTGCATAACGTTACTCACCACATTGAAACCAAAGGTCCACCGGTATCAGCAAAATCTCGTCGTCTTTCagctgaaaaattaaatatagctaAAAAAGAATTCGAGTACCTAATCGAACAGGGTTATTGCAAACCTTCAGATAGTCCTTGGTCTAGTCCGTTACATTTAGTACGTAAGAAAAGCGGTGATTGGCGACCGTGCGGGGATTATCGGGGATTAAATAGTAAATCATTACCAGATCGTTATCCGATACCTTATTTACAAGACTTTTCACATCAGTTAGATGGTTGTACAGTATTTTCAGTATTAGATCTAGTCAAAGCTTATCATCAAATACCAATTGAACCTTCCGATATACCTAAAACAGCAATCCGTACGCCTTTCGggttatttgaatttaatagaatGACATTCGGTTTGAGGAACGCCGCCCAAACCTTTCAAAGATTTATTCACGCTGTACTTCGCGgtttcaattttacatttccGTACATTGACGATGTATTGGTTGCATCTAAAACAAAGGAAGAACATTTTCAACATCTCGAACAAATTTTTCAGCGTTTCAAGGAAAACGGTCTTGTATTAAATGTTAGCAAGTGTATTTTTATGCAACCTATAGTTGAATTTTTAGGACACTCAGTAGATAGTAATGGTATTCGCCCATCAGCTGATCGCGTTAAAGCTATCAACGATTTCAAACAGCCTGAAACGGTACGTAGTTTACGGAGATTTTTAGGTATGATTAACTTTTATCGTAGATTTATTCCTAACGCAGCTGATAATCAGgcagtattaaataattttcttaaaggttcaaagaaaaatgataaaaccaTAATTAACTGGTCTGCTGAGGCATTAAATGCATTTACACAAGCAAAAACTCAATTAGCAAACGCATGCACATTAGTTCATCCATCTCTTAACGCGGAATTAGTAATCATGGTTGACGCGTCCGATACGGCTATAGGTGCTGTTGTTCAGCAAAAAGTCGAGGACATTTTCAAACCTTTAGGCTTTTTCtctgttaaattaaatgatactCAAAAACGGTATAGTGCATATGATAGAGAGTTGCTAGCAGCCTATGtttcaattaaacattttaaatatttattagaaggCCGGCAATTTGTACTTTATACCGACCATAAGCCGCTCACCTTTGCGTTTATTCAGAATCCGGAAAAAGCTTCACCGAGACAGTTAAGACACCTTGATTTTATAGGTCAGTTTACTACTGATATTAGGCATATTGCTGGTAAGGACAACATAGTCGCGGATTGTTTATCACGTGTGGATGAAATTTCAATACCTAGTTCAATAAACTATTCAGAGTTAGCAGACGCTCAATCAAATGATACTGAATGTAAACAATTAATTCAATCTGATACTTcacttaaaattgaaaaaataccaATTCCGTCAAcccaattcaaaatttattgcgATCTTTCTACTGGTATTGTTCGTCCATACGTTCCACATTCTTTTCGTAAACAAGTTTTTAATAGTGTGCATGGTTTAGCGCATTTGGGAATTAAAGCGACGGTTAAAGCggttaaaaaaagatttatttggaaatcaattaataaagatATTAGGCAATGGGCTCAAGCATGTTTAgcatgtcaaaaaaataaaatttcacgaCACGTTAAAATGCCAATCGGTAAATTTCCAATAGTTAGCAATAGATTTGAAGAGATTCACATGGATCTTATAGGACCACTTACAGTTTCTGAAGGACAGCGGTACTGTCTTACAATTATAGATCGTTATACACGTTGGCCGGAAGCCATACCCATTCCTGATATTCGAGCTCAAACGGTAGCATTTGCACTTTACAATGGTTGGGTTAGTCGTTTTGGAACACCGGTTACTATCGTTACAGATCAAGGCAGGCAGTTCGAAAGCGAACTTTACAAAGAGCTGTCAAAATTGTTAGGTTATAAAGCTAAACGTACCACGCCATACAACCCTCAAGCAAACGGTTTTATTGAAAGGTGGCATCGCACGGTTAAAACAGCTATTAAATGTCACAATAAAGTTGAATGGACACAAACCTTACCTACTGTTTTATTAGGTTTACGAGCTGCATTTCGTGAAGATTTTGGTACTTCAGCAGCTGAACTAGTTTATGGAGAATCAATTCGGTTACCAGGTGATTTTCTTGACCCAAGCAAATCAATAGAAcctcaaaatgaatttattagtagactaaaaaatcaaataaataatttaactccGTCACCACCAACTCGTCATAATAAAGAAAagtcaataattaataaagaatctGCACCACAAGTTAAACCACTTGTAATTACAAATAGTTATCAAAACCAGATGGTAAAAGATGATCCAAAATTTAACGTTCCAACAAATTCTAAAGTCAATATTCCAACGAAAAGAAAAGTATCAATTAATCCAGTACCACAAGTTAGGATTATTCCAGCAACCAGTACCAGAACCGATGAAGAAAGTTTTTCATTATCATCTTCGTTTCATGGATCAACACCACCAACACCATCAACATCTcgttctaataataaatttactgcTTTTGAAAAGCATGTCATTAAAAGAgacaaaaaaataaccaaaaacacTAGTGCATTAATGTCAGTTTTTGGTCAAGTTGTAAAAGAAGAACATCCAAATATTGACGTTAATGCACTAATTATTGcATCAGGTGAATCACTAACATTTTGGATttgttcatcatcatcagcattaAAAAATTCAACTTCAGCATTTAGTTATGCTTCCACTTCATCTGCTGGTCCAAAATCACCTCCTGACAcacaaatattatGTGAAATTCAAAGAAAGTACAGCGAAGTTTCCTTAGCAGCAGCTTTAGATCGGATTAGAAATGGATCTTATAGCCTCAGAAAAGCCAGTAAAGAATTTGGGGTTCCTGTAAGTACTCTTCACGACAGAATTCAAGGCAGAATGGGAGATGGAATTCCAAAAATGGGACCAGCAACTGTGCTTTCTGAAAACGAGGAACAAAAGATCGTGGACTGGCTCATAAATCTGGCTAAATGCGGCTTTCCAGTGAAACCCAATGAACTTTTAGATGTAGTCCAAAAAATCATGCAggatgaaaaaagaaaaaaccctTTTAAGGACGATATACCTGGCAAAAAATGGTATTATAGTTTTTTGAAGCGACATAAGGAGCTAAGCCTACATACTCCTGAAACTATAAGTAAAGCCAGAGCAGTAATTACTGAGGAAAGTATTCGAAAATGGGTTCGTGATTTGGTAGAATACTTAACGACAGAAAATTGCCACGATATTTTAGAAGATCCAACACGTATTTTTAATGGAGACGAAACTTCGTTTAGTTTAGCTCCTAAAACCGGATTAGTAATTGGTCCTAAAGGCTATAGAAataattaccaaataaaattttcaaacgaAAAAGACAACTTGACAGTGCTTCTGGTTTTTAATGCGAGTGGTCAAACTTTACCTCCTGAAATAGTATTTCCATATTTACGTCCGCCAGCAAATGTAGTAAAGAGTATGCCGGAGGATTGGATTGTTGGGCGCTCTGAAACTGGCTGGATGAGATCAGAAATCTTTTATGAATATGTTGCCAATGATTTCAATGAAtggttgaataaaaataatattaagagaCCAATATT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Protein Sequence: MSDNEHSDDSQKDNSHINSKINDKNKNNNLQLAGSSNSKSGSGSDCRIERVAIKPPPFWRDNPKLWFTHLEAQFVTSNILTDETKYYYVVASLDEQMLKLVSDVVEKPPANNKYNTLRDTLIQSLSQSENQRLQNLLKGMELGDQKPSQLLRQMRSGNDFQLLDPVLKNLWLQRLPQQAQFVLAASPGNLDELAGLADKILETFNPNSIWSITNDSISSNNNSNRQVIPTNPSFNLENKINEIANRLNELENYNSSVRGRAINRSNSKDCFRSGSAKFKSKSPNKKEHPFCWYHFKYGANAKKCVQPFDSGADVSVIPPTLFEKSKPCSSTVLYAANSSKIKTFGKKLLRLELGLRRKFDWYFIIADVSKPILGADFLNTFGILVDIKKKRLIDPLTQINSIGKLAFGSFSNITTISCDNINSEVHKLLLKYKEITIENSNLKPILHNVTHHIETKGPPVSAKSRRLSAEKLNIAKKEFEYLIEQGYCKPSDSPWSSPLHLVRKKSGDWRPCGDYRGLNSKSLPDRYPIPYLQDFSHQLDGCTVFSVLDLVKAYHQIPIEPSDIPKTAIRTPFGLFEFNRMTFGLRNAAQTFQRFIHAVLRGFNFTFPYIDDVLVASKTKEEHFQHLEQIFQRFKENGLVLNVSKCIFMQPIVEFLGHSVDSNGIRPSADRVKAINDFKQPETVRSLRRFLGMINFYRRFIPNAADNQAVLNNFLKGSKKNDKTIINWSAEALNAFTQAKTQLANACTLVHPSLNAELVIMVDASDTAIGAVVQQKVEDIFKPLGFFSVKLNDTQKRYSAYDRELLAAYVSIKHFKYLLEGRQFVLYTDHKPLTFAFIQNPEKASPRQLRHLDFIGQFTTDIRHIAGKDNIVADCLSRVDEISIPSSINYSELADAQSNDTECKQLIQSDTSLKIEKIPIPSTQFKIYCDLSTGIVRPYVPHSFRKQVFNSVHGLAHLGIKATVKAVKKRFIWKSINKDIRQWAQACLACQKNKISRHVKMPIGKFPIVSNRFEEIHMDLIGPLTVSEGQRYCLTIIDRYTRWPEAIPIPDIRAQTVAFALYNGWVSRFGTPVTIVTDQGRQFESELYKELSKLLGYKAKRTTPYNPQANGFIERWHRTVKTAIKCHNKVEWTQTLPTVLLGLRAAFREDFGTSAAELVYGESIRLPGDFLDPSKSIEPQNEFISRLKNQINNLTPSPPTRHNKEKSIINKESAPQVKPLVITNSYQNQMVKDDPKFNVPTNSKVNIPTKRKVSINPVPQVRIIPATSTRTDEESFSLSSSFHGSTPPTPSTSRSNNKFTAFEKHVIKRDKKITKNTSALMSVFGQVVKEEHPNIDVNALIIASGESLTFWICSSSSALKNSTSAFSYASTSSAGPKSPPDTQILCEIQRKYSEVSLAAALDRIRNGSYSLRKASKEFGVPVSTLHDRIQGRMGDGIPKMGPATVLSENEEQKIVDWLINLAKCGFPVKPNELLDVVQKIMQDEKRKNPFKDDIPGKKWYYSFLKRHKELSLHTPETISKARAVITEESIRKWVRDLVEYLTTENCHDILEDPTRIFNGDETSFSLAPKTGLVIGPKGYRNNYQIKFSNEKDNLTVLLVFNASGQTLPPEIVFPYLRPPANVVKSMPEDWIVGRSETGWMRSEIFYEYVANDFNEWLNKNNIKRPILFLVDGHKSHLSMQVSEFCSINNIMLYALPPNTTHIMQPADVGAFKGLKTDYKETVRKWNNLPENFGKSVTKSNFSQLLKLVLDKNDRSEILKISKHPNSRINTPTNTTPILSVINIPKDLMPCPNDNVLISCSPATPNSRNISCYIL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -