Rlae033501.1
Basic Information
- Insect
- Rhamphomyia laevipes
- Gene Symbol
- TFCP2
- Assembly
- GCA_963920725.1
- Location
- OY987259.1:40421634-40443699[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CP2
- Domain
- CP2 domain
- PFAM
- PF04516
- TF Group
- Beta-Scaffold Factors
- Description
- This family represents a conserved region in the CP2 transcription factor family.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 1.7e-54 2.2e-50 172.1 1.2 12 188 302 475 291 484 0.88 2 2 2.1e-13 2.7e-09 37.7 0.2 187 221 533 567 519 569 0.87
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCTCTATCGTTGTTATCACATCCTAGTTATACAGATTTACAAACATATTTTGATCAATCAATAATAAGGAATACTACAGCCACAatcaatactaataataattttattgattattattcattttctaatgatgatgaaatggaattcaattcaaattcaattaatgaacagAATTCATCAAATCATCACAatgccaataataataattataatgattatgaACAAGTTATAGATTTTGTTGATTCACCACCAAACTCAAAAGAATCTTGGCCCGGTGATTATacaaaagATAATCAACAAGGAGGACCAACTATTGTTAATGTTcaaacaatttattcaaataattcaaatcgAAAGAGGCGAATGGATTGGGAAGAATTGGATATTAATCAAACAGCAAATAATAATAGTGAACAATCACAAaatcataatacaaaaataccAAATCTTGGTGATAATAAGGAACGTGAAAAAAAGAAATCAACagGACGAGGAAGTTGGGCAGATGATATAGATTTTGATTTAAATGGAGAATTCAGTAATAATGGTTATTTgaataaTGCCGAAtcgtttttatcattttcaccaGCTTTAACAGTTTTAAAACAAGAAATACCATCACCAAGTTCTGATTTACCACAAAAAGGTAATAAAAGTccacatcaacaacaacaacagcaacaaaattTAACAACCGCTAAAATACAAccagaaaaagaaataattaatcaacCAGAGAATTCAATAAATGGATctccacaacaacaacaacagaaaccGGTGAGTCAACAACCAGGATCTCATCCAACATTAGATAATGGTCTTAATGGAACTGGTCTTGCTACCAATTTTCAACAACTTCTTCAACAagataatttagataataatagtgCTCGTAATAGTCCACATCATATAGAGAATATTAAAAGTGATACAGCATCTGATGATAATAAatttcaatatattttggcAGCAGCTACATCAATTGCAACTAAAAGTAACGAGGAAacattaacatatttaaatcagGGACAaagttatgaaattaaattaaagaaaattggtgatttatcattttatcgtgataaattattaaagagcgttataaaaatttgttttcatgAAAGACGTCTTCAGTATATGGAACGTGAACAAATGCAACAATGGCAATCAGCTAGACCAGGTGAACGTATTATTGAAGTTGATATACCATTATCATATGGTTTATGTCATGTAACACAATCATTaaatcaacaatatttaaatactgTTGAAATATTATGGGATCCAATGAAAGAAGTTGGtgtttatattaaagtaaattgtaTATCAACTGaatttacaccaaaaaaacacgGCGGCGAAAAGGGTGTACCCTTTAGAATACAAATAGAAACATATTTAGAAAATGGAACaaataatacaacaaatttaattagtaataataataataataataataatagtgcaacaacaccaacaacaacaacaacaattaatattaataataatacaaatacaaataataatattaataataataataattcgccTACAAATGCGAATAATGCAAatagtgataataatatttgtttggaTAAACCAATACATGCAGCTGCTTGCCAAATTAaggtatttaaattaaaaggagCTGATCGAAAACATAAACAAGATCGTGAAAAAATTCAAAGACGTCCACCATCCgaacaagaaaaatatcaaCCAAGTTACGAATGTACTATACTAAATGATATATCAGTGGATACGATTACATCAACTGTAGGATGTTATAGCCCCGAAtaTATGAAAATTTGGCCAAATTCACCAGTTCATATGCCAAAATATGAAGGTATATCACCATTTACAGCTACAACATCAGTTACAGCAAATATACCAAGTCCAATTGCAATAAATAGTGTAACatcaacaaatacaaataatataaaattaatggatcAAAATATGGTATCACCACAACAAGTTGACATGGATGATTATGCTGCACAAATTACAAAAGACTCAACACCAGTACAAGTATCACAATGGTTAACGTATCATCGATTAAGCACATATTTAGGAACATTTGCACATTTTTCTGGATCAGATATACTAAGaatgtcAAAAGAAGATTTAATACAAGTTTGTGGTTTAGCTGATGGTATTCGAATGTTTAATACGTTACATGCAAAaGCAATAACACCAcgtttaacaatttatattagttttgatgGTAGCAGTTATcatgcaatttatttaatatcgaatacaattaaagaattaacatataaaatatttaaattaccaggattttttgaattatgtgCTAATGGTGGTTCTAATATGAATggcatagaaaataataatggttATCCAGGATggggAATGCTTTCAAAATACTCAGGAAGTggatcaaatatttataatgatgcatcaaaattaaatatatatacaactgGTCCAGCTGGTATTCATGTTATGATTAATGATGAAGTTTTAAGTAATGCAATTAAAGATAATAGTTTATATTCATTGGAAATGCtcaatggaaaaatattaatgaaatcagttaataaaatggataatataaattga
- Protein Sequence
- MALSLLSHPSYTDLQTYFDQSIIRNTTATINTNNNFIDYYSFSNDDEMEFNSNSINEQNSSNHHNANNNNYNDYEQVIDFVDSPPNSKESWPGDYTKDNQQGGPTIVNVQTIYSNNSNRKRRMDWEELDINQTANNNSEQSQNHNTKIPNLGDNKEREKKKSTGRGSWADDIDFDLNGEFSNNGYLNNAESFLSFSPALTVLKQEIPSPSSDLPQKGNKSPHQQQQQQQNLTTAKIQPEKEIINQPENSINGSPQQQQQKPVSQQPGSHPTLDNGLNGTGLATNFQQLLQQDNLDNNSARNSPHHIENIKSDTASDDNKFQYILAAATSIATKSNEETLTYLNQGQSYEIKLKKIGDLSFYRDKLLKSVIKICFHERRLQYMEREQMQQWQSARPGERIIEVDIPLSYGLCHVTQSLNQQYLNTVEILWDPMKEVGVYIKVNCISTEFTPKKHGGEKGVPFRIQIETYLENGTNNTTNLISNNNNNNNNSATTPTTTTTININNNTNTNNNINNNNNSPTNANNANSDNNICLDKPIHAAACQIKVFKLKGADRKHKQDREKIQRRPPSEQEKYQPSYECTILNDISVDTITSTVGCYSPEYMKIWPNSPVHMPKYEGISPFTATTSVTANIPSPIAINSVTSTNTNNIKLMDQNMVSPQQVDMDDYAAQITKDSTPVQVSQWLTYHRLSTYLGTFAHFSGSDILRMSKEDLIQVCGLADGIRMFNTLHAKAITPRLTIYISFDGSSYHAIYLISNTIKELTYKIFKLPGFFELCANGGSNMNGIENNNGYPGWGMLSKYSGSGSNIYNDASKLNIYTTGPAGIHVMINDEVLSNAIKDNSLYSLEMLNGKILMKSVNKMDNIN
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00642974;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
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