Pcon005187.1
Basic Information
- Insect
- Ptychoptera contaminata
- Gene Symbol
- ARID5B
- Assembly
- GCA_963942525.1
- Location
- OZ012636.1:52283888-52296490[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 1.1e-19 1.9e-16 60.2 0.3 2 89 726 812 725 812 0.90 2 4 0.12 2.1e+02 2.3 0.0 5 52 1218 1265 1214 1297 0.66 3 4 10 1.7e+04 -4.8 2.1 8 14 1439 1445 1410 1467 0.53 4 4 8 1.3e+04 -3.5 0.4 63 82 1600 1621 1586 1623 0.53
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGTAGGAAATCTCATTCTATCGTTTCATATGGATCCATGGATGATGATGGGTCAGAGGGAtGTTATTGGTAATCCATGTGGATCTCATGGttcttatacattttataaagGCTTGCGTATTTTTACAATATCAGCAGCAAATACATCGTTTTCATCGTCACCCTCATCATCGAGTTTGGATAATCGGACGACAATACatgcagcagcaacaataacGCCATCCTCACCCCCAATtacactaaataataataacaataataataataataatatcaaaaatgaaataattatcgaAGAGAACTTAgttaatatgaataataattttatgagcaataaaattaatcgaaaattattaaatgaaaggaGACAGTCATCATCAGAAATCAGTTTAAACTCTGgtgatgataatttaataatggagagaaGTCGTAAATCAATAGTATTAGGATTAGGCGATTGTATACCAGTTCGACCATGGTCTGAACCAAAAATTTCATGTTTAGCTGAATTAAGAATGGTATGGAAGGATAGAAATGAGCAATGCTTATTGGTTAGTTTACGGTTGTATGTACTGCCAGAGAATACACCCGATGGAAAAAATGGTCATGGCGagcATGAGGTGCTTGCCATATCTGATAAAGTTGTAATACGAGCTGATGATTTATTAACTTGGTTATATGATGATCAAGAATGGCATTGGGGCCTAAAGGCAGCATATACAGCTAAACCGACAGCTAGACCAGCAACaccaacaacatcaacagaGTCAACTCCCATCAAAAGGGAAACGATTACGACAACAATGAAAACAACTACATCTCTAACAGTTGTATCATCATTAAAAACAACGACTACAAAACTTGAAttgaaaaatgagaaaaacgaCGATTTAGATGAATTTGATGATGCTGAAAATGAGAACATTGAAACTGTTAGAGATGATATTAAAgatacaaaaacaataaaaactttaaatataaataatgttattaaaaaattgaatgagaataatattaataataataataataacaataataataataatgataatattaatgataataataataataataataatattaatgagaatgaggataaaaaattaattaaaaataataagttggAAGATACAAATCGTGATGCTAAAGACAATAATGATGATGGTactgttaatttttgtaaagagGAAGTAGAAGATAAAACACTTGCAGTGccatctattttatttaataatcaggATAAAAGTGAAACGAAAACAAGTACAATAACACGTGGTGGCTTATTATATTCCCATTTAGATTTAACTGATATTGAGAAAGAGAAACAAAATgaAAGTACAACAAGACCAATTGTTGCTGTTTTAAGTTATTCACGGTATTGTCGTTATCGTGCAACAATGGTACGACTTGAGAGTGTTGAAGACGAATGGTTACGGAATCAATTAGTAGAAGCATTAAGTGGTTATGTAGCACCCTCAACAAATACCAGAGTTATGTTTTGCAAGGAAACATTTGATTATCCCGAACTAGAAACCCATGAGTTATTATGTAATCATTTGGCACCTAAATTAAAGGGTCGTCCTCGTGGGCGCCGTCAAAAGACAATTTCAAGTTCTGAGACTATAACATCTATAAAACGCACTGGTTCACCTTTAAGTGATTCAAATGATTCTGATTTATCATTAGATAGCTCAAATATAAGTGATAAAATGTTAACCCCAATTATAATACCATTAATAAAtccaagaaataattttaacaaattaaataaaatacggcCGCAATTGCGTTATAATCATCGTCCGGCTAGATCAACAAACGATAAGCCATTTATAAATGATAGTAAGAGATTATTAAGAAAGTATATAAGTGATACAGAGACTGATGTTGACGATGATGATagcgatgatgatgattattatacaTCTGATGAGGATatggcaaataataaaatgagattattacaacaacagcaacaacaatacaatcatcatcatcaacaacatcaaCGCAACAAACTGTATAAtagcaataacaacaataatattaatttaaataataataataataatcaacaacaaatgCAAGAAagatatttgaataaaaatataaactctaATCATAATCAACTACaatcgttaaataatttaatggatGATAAACAGAACGAACGTTTATTCTTAAAGAAATTGCATGAATTTATGAATGAGCGACAAACACCAATACCCAAAGTTATATGGCTATCCCTACGAAacgtcaATCTATACGCGATCTACAATCAAGTTAAAAAATTGGGAGGCTACGAAACTGTTTGTGCgaataaaaaatggaaaaatttgttcaatataaacattaatggTAAAACGAATggcgaaaatttaaatacaataaccCAAAAACATTATGAGCGCATATTGCTGCcattagaaaattatgaacgcaaaattgaattgttacataaatttaatatgcatagtcataacattaataatctgTTGATGATGAAAAATGATTATGAATTAACAATTGAAGAGATGACTGAGATACagaataaaatcaaagaaaacgaaaataatgatacaaacataaataatgatgGTTCGCAGTTGAATATGTCAACAAGCAATTTCCCAGTAACAGTTATTGTTGGTGAAGAATCAAATGTTAATTCAaagaTGGCATCTTCCTCTTCACAAATTCATATTAAAGAACCACATACAATAACGGTGCATCAAACAACAATACACTCAAAACAttccacaaataataatagttctgCTAATTCACTTGGAagtacaacaaataataatagtcaagaaaatcattcaaattcaacaaaaataccAAATCAAATACAAGTgacaacattaaataataacaatgatagTGATATTATAAATTCAGCTAATAATAACGTAACATCGCCAGTACGTTATTTACGCGTTAAAGCAGATAACAATttgttaacaaatataaatattgaaaatcaagaaaaggaaaattgtaataatttaaatattaataatagtaataataataatgaaaagacaACAGAAATTATAGAACTAATTGATAGTGACAGTGATAATAGTAATTCAGTGGTTACAAACAATAATGGTACTAACTGTAAGATAATGCCaccaatgaaaaaaagaaaattagacATATTAAAGGAAGGTGGCCTTGAAGTAACACcaattaattctaataatgttaatattattaacaacaatacaaatactaacattgtaaataataataataatagtaataataataataatagtaatagtaacaataataatattgatatacatttaaataatagtttatcTAATGTCAGTAGtggtaataaaataagtgGCAAATTTTATTCACCAGCAAGTATAAGTCCAGTTGTTAATAACActagtaataatataaataatttaactaataataataattcaaatggaCAAACTGGTTTAAGTAGCATAAATAgtcatacaaataataataattccaaaataataagtaatacaaataaaacagtTAATAACAATGCAAGTAATAAGCGAAAATTAAGTAAGCCATATCATTCATTATTTCAACAATATCCAAGTAAtggtattattaaaaaaccaaaatatcaAAGTTATTGCATGTTttcaaagcaaataaaaatatttggtaATCCTAAAGATGTTATACCAAATATGCCGATGCCAAATAATGATTGTAATCCATTAGATTTAAGGAAATTACATGCAAGCATTACTAATGGTAATAATAgtactataataaataataatctaaataatatacacagtaaaaattcaattattagtaatattaataataataataataataatatgattagtaaaaatagtattagtaatagtaatagtaataataataaccatagtaataatgatataaaaaatccAATTGATTATAGTAaagcaaatattataaatgtaaatgacagtaaaaaaattatgaatattacCTCGTTGATTGataagcaacaacagcaacaccaTCAGctgcaacatcaacaacaacagcagtatCAATCACAAAATTCACCAACCTATGTTCAAAATGTACATAATTcacaaaatcataatttaaccACAAAAAAATCACGCTTATATAATAATGAGTATAATTTGTTGAtacaacagcaacatcaacaattacaacagcaacaatacaataaacacaataatagtgaaaagaaaaaatataatgcatTATTGCATCAACAGCagaaacagcaacaacaacatcaacagcaacaaattcATCAGCAACAATTGTTACAATTGCAGCAGCagcatcaacagcaacaacaacagcagcagaaaCAACAATCTTTGAGTACATCGTCACAACATTACAAAAACGAAACAGCAACCGCATCTGTATCATTAACTAAAACAACGACTACTGCAACCAATGCAACATCCTCGCCGACAAGGGAAACGACAACACAAATGATACGTAATCATCAAGAATCGCAAAAAATATCAATGGCGAAAAGCTATGCTGAGACTTTAACAAAATCATCCGCTTCAAAATATTCAATGTCATCGTATATGcggcaacaacagcaacactTACAGCAacgacaacagcaacaaactaGTTCATCACAACAAACAAAAGCACAAGCGGAAGCACAGGCACACGTTGAAGCCCAAGTTCAAGCACatttattgaatgaaaaattatttgcatcACAACACTCATTACTATATCAAACACCGCAAAATCTACACGAGGTCATTCAACAGCAGCAACGTCAgcaccaacaacaacagcacctTCAACAATTACAATTACAACAACAATTATCGCCGCATTATGCGGCAAATGCATATCTAACaagtagtagtagtaataaTGCAAATCGCGACAGCCGAGATAGTCGCGAGACAGCCACTAATATATTAACTCAGCATTTAGCgaatcaacaacagcaatcatCACTGATAGCACCGCCACC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- Protein Sequence
- MVGNLILSFHMDPWMMMGQRDVIGNPCGSHGSYTFYKGLRIFTISAANTSFSSSPSSSSLDNRTTIHAAATITPSSPPITLNNNNNNNNNNIKNEIIIEENLVNMNNNFMSNKINRKLLNERRQSSSEISLNSGDDNLIMERSRKSIVLGLGDCIPVRPWSEPKISCLAELRMVWKDRNEQCLLVSLRLYVLPENTPDGKNGHGEHEVLAISDKVVIRADDLLTWLYDDQEWHWGLKAAYTAKPTARPATPTTSTESTPIKRETITTTMKTTTSLTVVSSLKTTTTKLELKNEKNDDLDEFDDAENENIETVRDDIKDTKTIKTLNINNVIKKLNENNINNNNNNNNNNNDNINDNNNNNNNINENEDKKLIKNNKLEDTNRDAKDNNDDGTVNFCKEEVEDKTLAVPSILFNNQDKSETKTSTITRGGLLYSHLDLTDIEKEKQNESTTRPIVAVLSYSRYCRYRATMVRLESVEDEWLRNQLVEALSGYVAPSTNTRVMFCKETFDYPELETHELLCNHLAPKLKGRPRGRRQKTISSSETITSIKRTGSPLSDSNDSDLSLDSSNISDKMLTPIIIPLINPRNNFNKLNKIRPQLRYNHRPARSTNDKPFINDSKRLLRKYISDTETDVDDDDSDDDDYYTSDEDMANNKMRLLQQQQQQYNHHHQQHQRNKLYNSNNNNNINLNNNNNNQQQMQERYLNKNINSNHNQLQSLNNLMDDKQNERLFLKKLHEFMNERQTPIPKVIWLSLRNVNLYAIYNQVKKLGGYETVCANKKWKNLFNININGKTNGENLNTITQKHYERILLPLENYERKIELLHKFNMHSHNINNLLMMKNDYELTIEEMTEIQNKIKENENNDTNINNDGSQLNMSTSNFPVTVIVGEESNVNSKMASSSSQIHIKEPHTITVHQTTIHSKHSTNNNSSANSLGSTTNNNSQENHSNSTKIPNQIQVTTLNNNNDSDIINSANNNVTSPVRYLRVKADNNLLTNINIENQEKENCNNLNINNSNNNNEKTTEIIELIDSDSDNSNSVVTNNNGTNCKIMPPMKKRKLDILKEGGLEVTPINSNNVNIINNNTNTNIVNNNNNSNNNNNSNSNNNNIDIHLNNSLSNVSSGNKISGKFYSPASISPVVNNTSNNINNLTNNNNSNGQTGLSSINSHTNNNNSKIISNTNKTVNNNASNKRKLSKPYHSLFQQYPSNGIIKKPKYQSYCMFSKQIKIFGNPKDVIPNMPMPNNDCNPLDLRKLHASITNGNNSTIINNNLNNIHSKNSIISNINNNNNNNMISKNSISNSNSNNNNHSNNDIKNPIDYSKANIINVNDSKKIMNITSLIDKQQQQHHQLQHQQQQQYQSQNSPTYVQNVHNSQNHNLTTKKSRLYNNEYNLLIQQQHQQLQQQQYNKHNNSEKKKYNALLHQQQKQQQQHQQQQIHQQQLLQLQQQHQQQQQQQQKQQSLSTSSQHYKNETATASVSLTKTTTTATNATSSPTRETTTQMIRNHQESQKISMAKSYAETLTKSSASKYSMSSYMRQQQQHLQQRQQQQTSSSQQTKAQAEAQAHVEAQVQAHLLNEKLFASQHSLLYQTPQNLHEVIQQQQRQHQQQQHLQQLQLQQQLSPHYAANAYLTSSSSNNANRDSRDSRETATNILTQHLANQQQQSSLIAPPPPHFYPMLDPIYLSSLYASQGLYLPPDLLQFYKTMPSKLAVPVSKG
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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