Basic Information

Gene Symbol
MYB
Assembly
GCA_961205885.1
Location
OY540804.1:24109527-24117406[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 3 9e-16 6.1e-13 48.3 1.1 2 45 50 93 49 94 0.97
2 3 1.6e-21 1.1e-18 66.7 1.6 1 46 100 146 100 146 0.98
3 3 1.3e-20 9.1e-18 63.8 0.9 1 44 152 195 152 197 0.96

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGCAACGACAAGTAGAAAGCTGTCAAGtattccAACATATGATAGTGAATCACCCGATGAAGAGGATTTATCAGAGCTATCGGATTCTGGCCAGGTGGATGgtgaaagtaataataaaagtgatgATAAAAGAGCTTTTAATAATGGACGATGGACACGACATGAGgatGCCGCCCTTAAACATCTTGTTGAACAATATGGTGAACGTTGGGATAATATAGCACGGTTTTTAAAAGATCGTACAGATGTGCAGTGTCATCAAAGATGGACAAAAGTTGTAAATCCAGAATTAATAAAAGGTCCATGGACAAAAGAAGAGGATGATAAAGTCATTGAATTGGTTGCTCGATATGGTCCAAAGAAATGGACACTGATTGCACGTCATTTAAAGGGGCGTATTGGTAAACAGTGTCGTGAACGATGGCACAATCATTTAAatccaaatattaaaaaaactgcATGGACTGATGAAGAGGATGGTATTATATATCAAGCACACAAACAATGGGGTAACCAGTGGgcaaaaatagcaaaattatTACCTGGTCGTACCGATAAtgctataaaaaatcattggaaCTCAACAATGCGTCGTAAATATGAAACCGGTGATAATAGTCAACGTCGGAGTGGTAAAACATTAGTACGTAAATCAATGCCTGCCTTTTTACCACCAAGTAAACTTAAAATAGATCCTAGTGTTACTACACCTGCaactacaacaacaaccacaacaaatgCAACAACAATTGGAAACTCTAAAAATTCACTGAAAAATTTATTGGCAAATCAACGGAAATCAACATCGAtacttgaaaataataaaaagaaaatgaaacaaGAATTACAGAATGCATGGATAAATTCAGATTCAAATTCAAACAGTAATTCCCAAATagcaataacaacagaaaaaggTGATTTCTTGCTGGaaccaataaaaacaaaagattcATCAAGTTATCTACTATcaccaattaataataaaattaatgatggATATATATTATCACCGATTAAACagaattcaaataattataactcaaCAAATTTAAAAGGTATTGATTCACCGATTAAACTGGTGCCTTTAACGTATGGTAATGGAATAGGATTCAGTTTGCATGATATTTTACAATCGCCAAAAAGGAATAATGAGAAACGTTCAAGTGGTGGTGTCGTACCGAATATATTGCGGCGAGCAAGGAAGCAACGTTTAACAATTGAAAATCGTGAGAATTTAATCGGCAATGGTTGTGATTCGaaTAAACATATTAACAGTAgtaatataatgttttcaacaACAGCACCGGCATTAAGTCCATCCTTTAATTCGTCATTATCGTCATCGATAACAGGAAATAGTAgtggttttaataattcaatgaatagtacaaatataacaaataataatagtttaaattcaaatataaataataattcaataaatacattaatagctggtataaatatattatcacCAAATGTAACACCAATTAAACCATTACCATTTTCCCCAAGTCAATTTTTGAATTCACCAAATATGAATTTATCATTTGATATAACATTACCAGCTAGTACACCTgtaagaaaaaacataaataagGATGATAAAAAGAGTCCTTTATCAACGCCAACGTCAACAAGATTATTTTCACATCATCATCAacggcagcagcagcaacatcatCAACACCAACAATCAGGAGATAGTGATAATGTTATTTATCCAAATGAACCacttatacaaataaaaacggaAGAGGATGATGAtacattaacaaatataaaatctaCTGAGAAACAATCTGCTTATATATCACCAGTAAATATTGCGAAATTAACATCAAGTATTGATACACCGATGAAATTTAAGGGATTAGCGGGTACGCCACGTACGCCAACACcatttaaaaaagctttagcTGAATTAGGGAAATTACGacagaataaatatataccATCATCGCCTGGTCGTTTAGATGAAGATATTGTTGAAATGATGCATAAAGAACGTTTACAAGATTCAACAAGTGATTCTGTTTATGAAACAGATTCAAGTATTGTACAGCAAGGTGGTGATACATCAATTAATTCAGGgacaagtaataataataataataatacgagtAACAccagtaatattaataaaaggcGTGGAAATGAGGATGATGAAAGTTATGAAAAGGATAAACCGTCACAAATAGAGTTAACATCAAAAAAAGTACGAAAATCACTTGGAAATAATTGGGATGAGAATAATGATATTGCATATTTGGCTGAAACACCGAGTAAATCATTGGCAACAGAttcaggatttttattttcaccacCAAGTATTGTTAAAGATACATTTGGTGATTCTGGTTTATTACTTGATTCCgttgataagaaaaataattcaatattaaGTAATTGTAGTGGTAGTAGCAATGGCAGTGGCAACAGTACACagCAacttcatcaacaacaacaacagcatttatctaatgatttattaagtataaaagagaatttaaataatatttatgcatatAATCCATTTGCTgatgaaaatgataaattattaaaatttcaattatcaaaatcaatatttacaaatagtcaaaataataatcgtaatagtaataaattattattacaacaaaaccaacaatcAGCAACAACATTTGGTTTTGATCGTACTAATTTAATTGGTAATagtcaaatatttaatgagaAATCACAAATTTATAGTAAtcaaaaacagcagcagcaacaatcaCAACATCAAAatgaacaaatttataataaaaatttttataatatttttaataataacaataatagtttaatagcaaatcaaaataattcgtattataatagaaataataataataatttagtaacATCAACAGTGACTAGTTTAGAAtcgcaacagcaacaattattaaagaataatactTGTTTGTcagttgttaataataattataataatagtaatactGGTGAttatatgaattattatagaacatcatcatcagcaacaacgacaacaacatcaacaccaTTGAATAGTGATAATAGTAATGATATGctgattgataataataatgatggtgGTGGTTCACAACATaagacaaattataattatataaatgatgaaaatttatcaaatttaacatctgcaacaacagcatcattaaataatgcatttctattaaatgattttttataa
Protein Sequence
MATTSRKLSSIPTYDSESPDEEDLSELSDSGQVDGESNNKSDDKRAFNNGRWTRHEDAALKHLVEQYGERWDNIARFLKDRTDVQCHQRWTKVVNPELIKGPWTKEEDDKVIELVARYGPKKWTLIARHLKGRIGKQCRERWHNHLNPNIKKTAWTDEEDGIIYQAHKQWGNQWAKIAKLLPGRTDNAIKNHWNSTMRRKYETGDNSQRRSGKTLVRKSMPAFLPPSKLKIDPSVTTPATTTTTTTNATTIGNSKNSLKNLLANQRKSTSILENNKKKMKQELQNAWINSDSNSNSNSQIAITTEKGDFLLEPIKTKDSSSYLLSPINNKINDGYILSPIKQNSNNYNSTNLKGIDSPIKLVPLTYGNGIGFSLHDILQSPKRNNEKRSSGGVVPNILRRARKQRLTIENRENLIGNGCDSNKHINSSNIMFSTTAPALSPSFNSSLSSSITGNSSGFNNSMNSTNITNNNSLNSNINNNSINTLIAGINILSPNVTPIKPLPFSPSQFLNSPNMNLSFDITLPASTPVRKNINKDDKKSPLSTPTSTRLFSHHHQRQQQQHHQHQQSGDSDNVIYPNEPLIQIKTEEDDDTLTNIKSTEKQSAYISPVNIAKLTSSIDTPMKFKGLAGTPRTPTPFKKALAELGKLRQNKYIPSSPGRLDEDIVEMMHKERLQDSTSDSVYETDSSIVQQGGDTSINSGTSNNNNNNTSNTSNINKRRGNEDDESYEKDKPSQIELTSKKVRKSLGNNWDENNDIAYLAETPSKSLATDSGFLFSPPSIVKDTFGDSGLLLDSVDKKNNSILSNCSGSSNGSGNSTQQLHQQQQQHLSNDLLSIKENLNNIYAYNPFADENDKLLKFQLSKSIFTNSQNNNRNSNKLLLQQNQQSATTFGFDRTNLIGNSQIFNEKSQIYSNQKQQQQQSQHQNEQIYNKNFYNIFNNNNNSLIANQNNSYYNRNNNNNLVTSTVTSLESQQQQLLKNNTCLSVVNNNYNNSNTGDYMNYYRTSSSATTTTTSTPLNSDNSNDMLIDNNNDGGGSQHKTNYNYINDENLSNLTSATTASLNNAFLLNDFL

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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