Palb003333.1
Basic Information
- Insect
- Ptychoptera albimana
- Gene Symbol
- ARID5B
- Assembly
- GCA_961205885.1
- Location
- OY540802.1:14860515-14880650[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 5 10 1.4e+04 -4.4 0.8 54 85 697 727 673 728 0.60 2 5 5.7e-19 8.1e-16 57.9 0.3 2 89 749 835 748 835 0.89 3 5 1.3 1.8e+03 -1.0 0.0 19 41 1326 1348 1308 1367 0.77 4 5 10 1.4e+04 -23.7 26.8 7 68 1506 1567 1500 1608 0.44 5 5 10 1.4e+04 -5.2 1.3 4 25 1675 1693 1671 1698 0.47
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGTTGTTGGTAGTCCATGCGGATCACATGGTCCTTATACGTTTTATAAAGGTTTGCGAATCGTTACCATAAcagcagtaacaacaacatcatTGTCATCAGCATCCTCATCATCTTGTTTCGATAATAACAGGGCATcaataacagcagcaacaacaaccacaccACCTCCCCCAACATCACAAACagcaattataaataacaataataataattttaacataaataataacaatacacaaataaaattacaaaaccaatatgataataataatataaaaaatgaaataatgttaaatgatgaaaatttaattaatttaaataatgattttatgagtaataaaattaatcgaaaattattaaatgaaagaagGGAATCATTTTCCGAAATGAGTTCAATCTCTGgtgatgataatttaattattggaaatcGTAAATCGATAATATTAGGATTAGGCGATTGTATACCAGTTCGTCCATGGTCCGATTCACCAATTGCATGTTTAGCTGAGTTAAGAATGATATGGAAGGATAGAAATGAACAGTGTTTATTGGTTAGTTTGCGGTTATATTTTCTACCGGAAAATACACCAATGGGAAGAAATTGTCATGGCGaggatgAAGTTATTGCTATATCTGATAAAGTTGTTATACGAGCTGATGATTTATTAACATGGTTATATGATGATCTTGAATGGAATTGGGGTCTAAAAGCAGTATATACAGCAAAaccagcaacaataataacaccaACAACATCAAATGAATCGACAccaattaaaaaggaaatgattatagcaacaacaactacaacaacaacgacaacaacagtaATTTCATCATTAACATCAACtccaaaaattgaatttaaaaatgagCAAACTGAGGAGGATTCAGATGGTGCTGATGTCGATGATGCTAGTGCAGATTCTGTTAGAGAGGAtattaaagatataaaaacaataaaaacgttaaacataaataatgttattaaaaaattaaatgagaataattataataataataataacaacaatataaataacaataataatgataatgaggttaaactgttaattaaaagtaataataataaggaagaAAAGGATACAAATGAGGATAATATTCGTGATGATAAAGACAATATTAATGATGACGGTGCCGATGACTATAATGGGGATGAAGATGATAAAACTTTAGTAATGCCAtctattttgataaataataataatcaggaTATTAATGAAACTAAAACAAGTCCAATAACACGGGGTGGCCTATTAAATTCACATTTAGATTTCACTGATATTGATAAAGTGAAACAAAATGAGAGTTCAACAAGACCAATTGTTGCTGTATTAAGTTATTCACGTTATTGTCGTTATCGTGCAACAATGGTACGTCTTGAAAGTGTTGAAGATGAATGGCTACGAAATCAATTAGTAGAAGCTTTAAGTGGTTATGTAGCACCTACAGCAAATACAAAAGTTATGTTTTGCAAGgAAACATTTGATTATCCTGAATTAGAAACGCATGAGTTATTATGTAATCATTTGGCACCTAAGCTAAAAGGTCGCCCTCGTGGACGTCGTAAAAAGACTATTTCAAGTTCTGAGACAATAACATCATTAAAACGTACAGGCTCACCTTTAAGTGATTCAAATGATTCTGATTTATCACTAGATAGTTCAAATATAAGTGATAAAATGTTAACACCAATTAGAACACCATTAATAAATCCAAGaaataatcttaataaattgaataaaataatacggCCACAATTACGTTATAATCATCGTCCAGCAAGATCAACGAATGATAAGCCGTTTATAAATGATAGCAAGAGATTATTAAGAAAGTATATAAGTGATACAGAGactgatgttgatgatgatgatagtgatgatgatgattattatacGTCAGATGATGATGTGGCTAATAACAAAATGAGATTattacagcagcaacaacaacaatacaatcatcatcatcaacagcatcagagaaataaattgtataatagcaataataataaacgtgattatacaaaattaaaattatcgaaaaaagatACAGACGATGATTGGAATAGACGCTACATGCATACAagtaaacagcaacaacaagctaaacaacaccaacaacaattgCATCAAATGCAACAAcgttatttgaataaaaatttaaatacaaatcaattacaatctattaataatttgatagATGATAAACAGAATGAACGTTTgttcttaaaaaaattacatgaatTTATGAATGAGCGTCAAACACCGATTCCTAAAGTTTTATGGTTATCCTTAAGAAATGttaatctTTATGCAATCTATaatcaagtaaaaaaattgGGCGGCTATGAAACTGTGtgctcaaataaaaaatggaaaaatttgtttaatattaatataaatggaaaaattaatggcgataatttaaatacaataacaCAAAAGCACTATGAGCGCATATTGCTGCCATTAGAAAAGTATGAACGTaacattgaattaataaacaaatataatatgcATAATagtcataatataaataatatgctattaatgaaaaatgattatgAATTAACAATTGAAGAGATGACCGAGatacagaataaaattaaggaaaatgaaaaacatgatataaatataaacaatgatggtttacatttaaatatgtCATCCACAAGTAATTTGCCTGTAACAGTAATTGTCGGTGGTGCCTCCAATGTTGATTCAAAgatgacATCTCCATCGTCTCAAATTCATATTAAACAGCCACATACTACTATAACTGTGCATCAAACAACAATACATCCTAAACAttccacaaataataatataaataataatgttaattcgATAAATTCACTTGGAAATGCAGCaaatatgattaataataataccaataataataataatagtaataataatcaagaaaTTCATTcgaattctataaaaataacaaatcaaatacaaatacaacaaataacaacattgaataatagtaataataatgatagcaATGCTATAAATTcagcaaataataaagtaacatCACCACTACGTTATATACGTGTAAAACCagataaaaatttactaacaaatataaatattgaaaataaagaaaaggaaaattataataatataaatataaatcatagtagtggtaataataatagcaataatgaaaatataaatataaaaacaacagaaataattgaattaattgatAGTGACAGTGATAACAGTAATTCTatggttataaataataataataacggcAGTAACAGCAAGATAATGCCACCaatgaaaaagagaaaattagaTATATTAAAAGAAGGTGGTCTAGAAGTAACACCAATTAGTTCAATGAATAATCTAACTAATAATActataaataatagtaataataataacagtactattagtaacaataataataataatattaataataataataataataataataacaataatagcaatagtaatattattaataataataataataatgatataaatataagtaataatttatctaatattaataattttaataataatggtatTAAAATAACTGGTAAATCTTATTCACCAGCAAGTATAAGTCCAGTTGTTAGTaatagtaatattaataatactagCAATAAtgtaagtaatttaaataataataattcaagtgGACAAACTGGTCTAAGtggtataaattataatataaataataataataacaatactaataataatttaaaaataataaataatacaaataaaacagttagtagtaataataataataataatacaagtaataaacgtaaattaagtaaaacaaataattcattatttcaaCAATATCCAAGTAAtggtattattaaaaaaccaaaatatcaAAGTTATTGTATGTTTTCtacgcaaataaaaatatttggtaATCCTAAAGATGTTCTACCAATAATACTTATaccaaataatgataataatccattagatttaagaaaattacacCCAAGCATTACTAATATTAATAgtaatatcaataataacattattagtaataatttaaataatttacatagtaaaaattcaattattagtaataataatataaatagtaaaaatagtattagtaataataatagtaataatactaTAAATACAGCTGGtaataatgatattaaaaatccAATTGATTATAgtaaagcaaatataataaatgttaatgataataaaaaaataatgaatattgCATCGTTGATcgataaacaacaacagcaacaccatcagcagcaacaccaacagcaacaacaatcacaAAATTCGCCAACATATGTACAAAATGTGCACAATTctcaaaatcataatttaacaacaaaaaaagcacgattatataataatgaatatagtttattaatacaacagcaacatcaacaattgcaacaacaacagcaacaatataataaacataataatagtgagaagaaaaaatataatgcaTTATTGCAGcaacatcagcaacaacaaaaacaacagcagcaacagcaacaacaacaacttcaTCAGCAACAATTGTTACaattacaacaacagcatcaaaaacaacagcaacaacaacaacagcagcagcaacaacaacaacaacaacagcagcagcagcagcaacaacaacagcaacaacagcagcagcagcagcagcagcagcagcagcagcaacagcagcagcagcaacagcagcaacaactacagcagcaacagcagaaaCAACAATCTATGAATATGTCACAACATTATAAGTCTGCAGCAGCATCAACGTCATCGACTAAAACATCAACGACTGCAACAAATGCTACATCTTCGACAGTACCGGAAACTACAACACAAATGATACGCAATCATCAAGAGtcacaaaaattatcaatGGCTAAAAGTTATGCAGAATCCTTaacaaaatcatcatcatctaagTATTCAATGTC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- Protein Sequence
- MVVGSPCGSHGPYTFYKGLRIVTITAVTTTSLSSASSSSCFDNNRASITAATTTTPPPPTSQTAIINNNNNNFNINNNNTQIKLQNQYDNNNIKNEIMLNDENLINLNNDFMSNKINRKLLNERRESFSEMSSISGDDNLIIGNRKSIILGLGDCIPVRPWSDSPIACLAELRMIWKDRNEQCLLVSLRLYFLPENTPMGRNCHGEDEVIAISDKVVIRADDLLTWLYDDLEWNWGLKAVYTAKPATIITPTTSNESTPIKKEMIIATTTTTTTTTTVISSLTSTPKIEFKNEQTEEDSDGADVDDASADSVREDIKDIKTIKTLNINNVIKKLNENNYNNNNNNNINNNNNDNEVKLLIKSNNNKEEKDTNEDNIRDDKDNINDDGADDYNGDEDDKTLVMPSILINNNNQDINETKTSPITRGGLLNSHLDFTDIDKVKQNESSTRPIVAVLSYSRYCRYRATMVRLESVEDEWLRNQLVEALSGYVAPTANTKVMFCKETFDYPELETHELLCNHLAPKLKGRPRGRRKKTISSSETITSLKRTGSPLSDSNDSDLSLDSSNISDKMLTPIRTPLINPRNNLNKLNKIIRPQLRYNHRPARSTNDKPFINDSKRLLRKYISDTETDVDDDDSDDDDYYTSDDDVANNKMRLLQQQQQQYNHHHQQHQRNKLYNSNNNKRDYTKLKLSKKDTDDDWNRRYMHTSKQQQQAKQHQQQLHQMQQRYLNKNLNTNQLQSINNLIDDKQNERLFLKKLHEFMNERQTPIPKVLWLSLRNVNLYAIYNQVKKLGGYETVCSNKKWKNLFNININGKINGDNLNTITQKHYERILLPLEKYERNIELINKYNMHNSHNINNMLLMKNDYELTIEEMTEIQNKIKENEKHDININNDGLHLNMSSTSNLPVTVIVGGASNVDSKMTSPSSQIHIKQPHTTITVHQTTIHPKHSTNNNINNNVNSINSLGNAANMINNNTNNNNNSNNNQEIHSNSIKITNQIQIQQITTLNNSNNNDSNAINSANNKVTSPLRYIRVKPDKNLLTNINIENKEKENYNNININHSSGNNNSNNENINIKTTEIIELIDSDSDNSNSMVINNNNNGSNSKIMPPMKKRKLDILKEGGLEVTPISSMNNLTNNTINNSNNNNSTISNNNNNNINNNNNNNNNNNSNSNIINNNNNNDINISNNLSNINNFNNNGIKITGKSYSPASISPVVSNSNINNTSNNVSNLNNNNSSGQTGLSGINYNINNNNNNTNNNLKIINNTNKTVSSNNNNNNTSNKRKLSKTNNSLFQQYPSNGIIKKPKYQSYCMFSTQIKIFGNPKDVLPIILIPNNDNNPLDLRKLHPSITNINSNINNNIISNNLNNLHSKNSIISNNNINSKNSISNNNSNNTINTAGNNDIKNPIDYSKANIINVNDNKKIMNIASLIDKQQQQHHQQQHQQQQQSQNSPTYVQNVHNSQNHNLTTKKARLYNNEYSLLIQQQHQQLQQQQQQYNKHNNSEKKKYNALLQQHQQQQKQQQQQQQQQLHQQQLLQLQQQHQKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLQQQQQKQQSMNMSQHYKSAAASTSSTKTSTTATNATSSTVPETTTQMIRNHQESQKLSMAKSYAESLTKSSSSKYSMSSYMRQQQQQLQQLQQQQQQQQQQSPTSQQAKALAQAEAQAQVEAQVQAHLLNEKLFASQHSLLYQTPQSLHEVIQQQQRQHQQQQQLQQLQLQQQLSPHLLNAAANSANRDGRDSRDSRDSRDSRDANNLLTQHLANQQQQQQSSLIAPPPPHFYPMLDPIYLSSLYASQGLYLPPDLLQFYKTPKMAVPVSKG
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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