Palb008731.2


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Ptychoptera albimana
Gene Symbol
JARID2
Assembly
GCA_961205885.1
Location
OY540804.1:13022518-13029340[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 5.8e-22 8.3e-19 67.5 0.0 6 89 1607 1688 1602 1688 0.93

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGTAATTTCTAAAGACGGAAAACGTAAACGCAaagaaatcaatttaattgattCATCACCAGAAGTACCAAAACGCATTAAAGTTCATGCACAACGAAAGTTTGCTCAGGGACAAGGAACTTCATCAACATATGCATTAGGCTTACCAACATTACCGCAACCATCAGAACCAATTAAAGATACTCGTGATCCTCCACCCgagttaataacaaataaaagaccTAATACAGaagattttttaacttttttatgcTTCCGAGGAACATCTATCTTACCTccaaatttagatttttttaattcgcaaAACcgaacaacaacatcatcttCAGTATCTCCTAATACAACAAATACAGTTAATACTGAAATTGCTGCTACAGCAAATgcagaaacaacaaataatgataataaaaccgaagctgtaaaagatgaaaaaaatgtggaaaaaagcaaagaaaaagagCCACCAGGTTTCATTCCCTTTGGAGTGCGTAAAAGAGCTGAGCAAATACCAGAGCCTAATTGTCGTCAAACTGTTCAAgcattgaagaaaaaatatcacGAACAAAGAATGGCTAAGTTGAAAACATTAAGTAAGGCCAATAAACAGCAGAATATAATGAGGACAAGATCGAATAAAGTGGTTGAAGCTATATctaaacgtaataaaaatgacgCAAAATTACTTGAAGGTACTAAGCAGAAAAAAGAGATTAAAACTCCAATAGCAACAACCCCAATAAGTAAAACTGCtccaaataaaagaaaaatcgatcTTCGAAGTGCATCATCAACAAATAGTTTAGATCAAAGtgtacaagaaaaacaaacaaaacaagttAAGGTAGATAAATtagaaaagacaaaaattcaaaatgaaaTTGAAGTTAAAAAGCAACCAAAAGATGTTTTTgtgaaaaaagattttaatataaataataaaaataaagagattGTTAAAAGTgtagttaagaaaaaaataaatgtgctTAATAAAGATGCTTCATTGCATTTTaacttaagaaataaaaataaactaataagaaatttaaaaataaataaaaccaaacaagTTTCGGCAGTTGCAGCAGCTAAAGTGATACGGGTTACAAGACTAATGAAAACGTTAAATCGCGTAACAGATGATACTAAAAGTGAAACAAATACGGGAAACAAAATATCGGATACTGATTTAAAAGAATCTGAAACAGAAGAAGAATTCTCAACTGACGATGACCAACCTTTGGCCATAAGTAAGAAACCTGATAAATCAAATTCAAGTTCGAAAAATGCTCTAAAAACGGCTCCACCTATTAAAGCAAAGAAATCTTTCGAAAAACCTATACCTAAAATATTACCAAACAGAAAGAATGTATTTCGCCGATCTGTAATGACACCTCCGCCAGAATCGATACCAAGCCCACCTCCTAAATCAGTAACACCTGTAGTCGAATCAGAATCTAAAATTTTCGTTGGTCGTTCTAAAACCCGATTATCAAAACGTAATACGAGACAAAGATCGGAATCAAAAACTAAAGATTCCGATGATAGTTCAAAAATATCTAGTAAAAgtttgaaattaaaagaagttatgaaaaaagataaaactaaattagatgaaaaatgTATAAGTTCGGTTGtcaacagaaatattttagaAAGCAAggtaaatgataaaattattgaaacaaaaaatccaTTTTCTGATGATTTAGATACGACACCTAGCAAATCAGACAatgattcatttattaaagctGCAAAGgtgacaaaaaagaaaaaagcatatgttccaaataaaaatgcatcaaATTCACCGGATAAATTAAACGATTCGTCACAAGCAAATTTAACTGATCTGAGTGAAAATGAAAACCGAACCAGGCCAACTAGAAAGACAAAGGAAGCAGCTACAATATATATGGAATTGATTggtagaaaattaaatcttcAAGATGATTTAGATGAGGATGACACATCAATCGACAGTTTTCCTGAATTACCAAATGTGCGTAAAACCGAACAAATGGAAAATGAATTGAAAGCTAATgttggaaaagaaaaaatcattggtaaagaaaaaataatcattaaaaagaaactaaaaacgGAATACGATTTATTAgatgaaaaagtaaaagaaattgatgttaaaaaagctaatacaaaacaacaacagtcaAAGGCAAAGTGTAAAACggaagaaatgacaagaatgGTACAAGcaaaaaaggtaataaaaaatgaaaacattaaatgtaaaaccgaaaaattagaaaaaagttttagtGATTCCGACGAGGAACCTTTAGCAACAAAATTAGTTAACTACAAAGTAAAGCCAGGtgaaaatttcaacaaaaaactatTGCTATCAAATGAAGATGTTAAACCAGTACCAAGTCTATTAGAAACATCCAAATGCGTAGAGAAAGACAATTTAACAACTAAACAAACACCGGAAGAGTCACACGtaagtgaattaaataatgttgttTCTATAACACTGGacgataaaataattgaatcagATTTAAATGTGAATGACAAATCTTCCACTATCAACATGCAACCAGATTcctcaaaattaaataaatcaaaaacgtCAGTAGCCAAAAATATATCTCGAACAGACactaatgcaataaaaaataaaataattcatttaacagATTCAAAACTTGAAATGCCTCTTCATATGGCAGTTCAGTGGTATAATCAACAAATGACGCCACGTTCACCTGCACATCCTAATCAATATGGTACTTCTTCTTTACGAAGTTTAATGAATCCATTGCCAAGTAAAGAAGAGTCTGGCAAAATATTTGGTATTGCTAGTGTAACATTAGCTCAAAGCAGTGGTCCCATGGACACAAAATGTACCTTAGGCAAATGTGGTTCCATTCATAAACCGCCTTTAGGACCTGTATTTCCAACGGAAACTCTTCTTATTGATAGTTTATCTACAAAAGAACGACGTCGTGCAAAAGTTAATATGACTCAAgaacaaattgaaaaatggTTAATTGACTGTTCTTCAGAACCAGAAGAAATACAGGATGATTTAGAAATAGatgaaattgatttaaaatcaaCACCAAAACCAATTAACTATTTACAAGCACCATCTCCAACTAGAGAAGTTATACTGCCAGCagcaagaaataataaagcacGAGAAAAAATATCACAAGCTACAAAGGGGCCAACAATAAAAGCAATGGCTATTGCTGCTAAAAACAATGCTGTTGTAGATGATGTCATTATTATGCcgacaaaaaacaacaagaataataaaaatccaaaaacGTTTTCACCTCATAAAGAAATTAACCAtccaataaaagaaaaatcgatcATCAGAAAGGCAACAAATTCTAGAGAGATTGAGAATAAAATATCTCCATTGTCTACCGCATCGACTCCAATACCAACTGTGTCTCCAGCTGCTGGACATACTTCAAATGAAACAACAATATCACAAAAAGCTAAATCACCACAtcaacaaaaagcaaaaacaccGCAGCAACAAAAAACTCCATCAAAATTAACCAATGTTGTAACTACTCCAAAACCAGGAACTCTTGACCGCAAACCAATATTTAATCAACGCCGTACGCCAGTTTATagcaacaaacaacaagaatTGATTAAATCTAAAGCAAAAGGAATTGTAAATACATTTGGTGCATTCTCACCAGAAAATGAGCACAGTATCTATTCATTTGACAAAGAGGATGATTTTATTCCTGCTGCGACACCATTTAGAAGACAAAGTCATAAAGAATCAAAagatgaaatagaaaaaactccTGTTAAAAAGGAACAACCAAACACAGTAACAAGCACATCTCCTTCACAAATATGTCCAGGAGTATCTGGAATGATAACACCAACAAAATCAACTGCGCAAGATCAGCAACAAGTGTCCTTAACACTTAGTCCAGAAGATAATAGTAAGTCAGCTTCAATAACAGTGCACGTTAACTTAGATTCTGAATTAGCagataaatcaaatatttcaaacaaacaattaacgACAGATATAACGaacgataaaaaattaagtaatgatGGAAATGAATCTGATACTGATGGTCACACATTTTATATTCCTTTACAAGGTACAAATATGGCAGGTAGCAAAACTGATCAATTGATTCAGGGAGTTGCTGTTAAATTGGGTACCGAAGGTCCTGAAGGACCTAATCAACGAGTAATAATGCATGCAAAGTTAGTTACCAAGGCACAAATGGGACAGAATCCTACACCAATGCCAGAGTCAATGGCAAATGTTCAAGAAATTGTTAAAAGTCTAATAGCTAGTAAAGAAGCCAATGGTTGCAAATCTGTTCCTATAGGAACTGTACAACCCAGATTTAAATCTGGCGATATTATAGCGAGTGGTTCCTCCAAAAATCAGCCAGGTACTTCAAATACTACGCAAAAAGgtacaaatgaattaaaaagagTAAATTCAAGTTCTTCATTAATATCGCAAAAGTCGAAACCTTCAAAGGcagccaaaataaaaaatgatactccAATTCAACCTAGCAATAACACTGCATTTCCTTGGCTCGAAGACCCTACGCAAATGGTTGAAGCGCCTACATTTACACCGACTGATAAAGAATTTCAAGATCCTATTGAGTTTATCGAAAGAATTACACCAATTGCTGCACGTTTTGGCATTTGCAGAATAATTCCTCCAGCAAGTTTTAAACCGGAGTGTCGGGTATCTGATGATATGCGTTTTACAGCATACAATCAATATGTACATAAAATGTTGCACCGTTGGGGTCCGAGTGCTAAAGAACTGagtgcaattaaaaaatacttagCTACCCAAAGCATTACTTTAACACATCCTCCATGGATAGGTGGTATGGAAGTTGATTTGCCTCGTATGTATCACACAGTTCAAGAACTCGGTGGACTTAGTGAAgttattgagaaaaaaaagtggTCTCGTGTGGCGGAAGAGATGTGCATTCCAAAATCAGCACAGGATAGGGTTACAAAACTAGAtgatatttattgtaaatatttgctACCCTACGATACACTTTCCCCGGCCGAgagacaaaaattattcgatgAAGTTGAAGCTGACTGGGCCAAACGGGAGGCAAAAGCGCGACGTAATGCTGACAAACGAATTAATCTTGATAGTAATAGTATTGAAGAGTCAGAAGAAGAGGATGAGGATTCCGAGTCTGAGGATGGTGATAGTGGTTCAATGGAATGCATTGTAAAAGGTCGCAGTATGgcattaaatgcatttttccGTATTGCACGAAATACAATGGCCTTATGGTTTAAAAACACTGAACCTACACCAGCTGAGGTTGAAGCTGAATTTTGGCGTCACGTTGCAGTACGTGACAGTCATGTGTGTGTGCATTCTGGTTCGATAGATTCAAGTGGCTGGGGTTATGGATTTCCTACACCTGGACCTAAAGGAAAAATGTCACCTTGTTCAAAGCATCCTTGGAATTTAAAAGTATTCACAAATAACAGTGGCTCCGTATTGAGGTCATTAGGTCCTGTTATGGGAGTAACTGTACCAACACTTTATGTTGGTATGTTGTTCAGCGCTTGTTGCTGGTATCGAGACCCCCATGGTTTGCCATGGATTGAATATTTACATACTGGTGCAAACAAAATATGGTACGGCGTGCCAGATGAGCAAAGTTCAAATTTCCGTGCCGCATTAACATCATTAGTACCGACTCACtgtcagaataaaaaaatatggttACCTTGTGATACAGCAATGGTGCCGCCACATATGCTTACAGATCGTGGCGTATCATTGTGTCGAACTGAACAACAACCTGgacaatttgttgttgtttttcctAGAGCATACACATCTAGCATATCAACAGGCTATGTCGTCTCTGAAAGTGTATCATTTGCTACAAACAAATGGTTGGAGTCAGCTGAGCAAGATTTTAgggACATTCAAGCCAGTTGTGAACCAACGACATTTTCATtggaacaattattatttgcaattgCATCAGATCAAAGGTCTAATAACGAGACATTATCAGAAATTTTACCAATGATAACTGAAGTTTATGAGAAGGAAGTCAAATATAGACAAGATTTAACagtgGCTGGAgtgttaataaatgaaaaattacaaacaaaaggtaaaaaacaaatattagagGAAAACGAATGTGAATTGTGCCGTACAAATctatttatttcaatgttaaaaactgatgatgatttaatatattgtttaaaacatGGATTACAATCAATTgagaataaacaattaaaagttacacaattaaaactaatttatacATATAGTATTGATgatattcaattattaataaaacgtttaaaagaaagattaaatattcaacaaagtaatagtaataatagtaataataataatcaacaccaacatcaacaacaacaacaaccaaataataataataataaaaattcaaaaaaaataaatacgtcGATAATTAGTTGTaacaacagtaataataatagtaattcaaataaaaagaaataa
Protein Sequence
MVISKDGKRKRKEINLIDSSPEVPKRIKVHAQRKFAQGQGTSSTYALGLPTLPQPSEPIKDTRDPPPELITNKRPNTEDFLTFLCFRGTSILPPNLDFFNSQNRTTTSSSVSPNTTNTVNTEIAATANAETTNNDNKTEAVKDEKNVEKSKEKEPPGFIPFGVRKRAEQIPEPNCRQTVQALKKKYHEQRMAKLKTLSKANKQQNIMRTRSNKVVEAISKRNKNDAKLLEGTKQKKEIKTPIATTPISKTAPNKRKIDLRSASSTNSLDQSVQEKQTKQVKVDKLEKTKIQNEIEVKKQPKDVFVKKDFNINNKNKEIVKSVVKKKINVLNKDASLHFNLRNKNKLIRNLKINKTKQVSAVAAAKVIRVTRLMKTLNRVTDDTKSETNTGNKISDTDLKESETEEEFSTDDDQPLAISKKPDKSNSSSKNALKTAPPIKAKKSFEKPIPKILPNRKNVFRRSVMTPPPESIPSPPPKSVTPVVESESKIFVGRSKTRLSKRNTRQRSESKTKDSDDSSKISSKSLKLKEVMKKDKTKLDEKCISSVVNRNILESKVNDKIIETKNPFSDDLDTTPSKSDNDSFIKAAKVTKKKKAYVPNKNASNSPDKLNDSSQANLTDLSENENRTRPTRKTKEAATIYMELIGRKLNLQDDLDEDDTSIDSFPELPNVRKTEQMENELKANVGKEKIIGKEKIIIKKKLKTEYDLLDEKVKEIDVKKANTKQQQSKAKCKTEEMTRMVQAKKVIKNENIKCKTEKLEKSFSDSDEEPLATKLVNYKVKPGENFNKKLLLSNEDVKPVPSLLETSKCVEKDNLTTKQTPEESHVSELNNVVSITLDDKIIESDLNVNDKSSTINMQPDSSKLNKSKTSVAKNISRTDTNAIKNKIIHLTDSKLEMPLHMAVQWYNQQMTPRSPAHPNQYGTSSLRSLMNPLPSKEESGKIFGIASVTLAQSSGPMDTKCTLGKCGSIHKPPLGPVFPTETLLIDSLSTKERRRAKVNMTQEQIEKWLIDCSSEPEEIQDDLEIDEIDLKSTPKPINYLQAPSPTREVILPAARNNKAREKISQATKGPTIKAMAIAAKNNAVVDDVIIMPTKNNKNNKNPKTFSPHKEINHPIKEKSIIRKATNSREIENKISPLSTASTPIPTVSPAAGHTSNETTISQKAKSPHQQKAKTPQQQKTPSKLTNVVTTPKPGTLDRKPIFNQRRTPVYSNKQQELIKSKAKGIVNTFGAFSPENEHSIYSFDKEDDFIPAATPFRRQSHKESKDEIEKTPVKKEQPNTVTSTSPSQICPGVSGMITPTKSTAQDQQQVSLTLSPEDNSKSASITVHVNLDSELADKSNISNKQLTTDITNDKKLSNDGNESDTDGHTFYIPLQGTNMAGSKTDQLIQGVAVKLGTEGPEGPNQRVIMHAKLVTKAQMGQNPTPMPESMANVQEIVKSLIASKEANGCKSVPIGTVQPRFKSGDIIASGSSKNQPGTSNTTQKGTNELKRVNSSSSLISQKSKPSKAAKIKNDTPIQPSNNTAFPWLEDPTQMVEAPTFTPTDKEFQDPIEFIERITPIAARFGICRIIPPASFKPECRVSDDMRFTAYNQYVHKMLHRWGPSAKELSAIKKYLATQSITLTHPPWIGGMEVDLPRMYHTVQELGGLSEVIEKKKWSRVAEEMCIPKSAQDRVTKLDDIYCKYLLPYDTLSPAERQKLFDEVEADWAKREAKARRNADKRINLDSNSIEESEEEDEDSESEDGDSGSMECIVKGRSMALNAFFRIARNTMALWFKNTEPTPAEVEAEFWRHVAVRDSHVCVHSGSIDSSGWGYGFPTPGPKGKMSPCSKHPWNLKVFTNNSGSVLRSLGPVMGVTVPTLYVGMLFSACCWYRDPHGLPWIEYLHTGANKIWYGVPDEQSSNFRAALTSLVPTHCQNKKIWLPCDTAMVPPHMLTDRGVSLCRTEQQPGQFVVVFPRAYTSSISTGYVVSESVSFATNKWLESAEQDFRDIQASCEPTTFSLEQLLFAIASDQRSNNETLSEILPMITEVYEKEVKYRQDLTVAGVLINEKLQTKGKKQILEENECELCRTNLFISMLKTDDDLIYCLKHGLQSIENKQLKVTQLKLIYTYSIDDIQLLIKRLKERLNIQQSNSNNSNNNNQHQHQQQQQPNNNNNKNSKKINTSIISCNNSNNNSNSNKKK

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01276749;
90% Identity
-
80% Identity
-