Palb008373.1
Basic Information
- Insect
- Ptychoptera albimana
- Gene Symbol
- ARID2
- Assembly
- GCA_961205885.1
- Location
- OY540804.1:7898223-7906541[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 7.3e-25 1e-21 76.8 0.0 4 89 41 124 38 124 0.95 2 4 0.24 3.4e+02 1.4 0.0 20 63 733 777 725 791 0.66 3 4 10 1.4e+04 -3.8 1.9 70 85 1269 1285 1238 1302 0.62 4 4 10 1.4e+04 -9.7 8.9 52 67 1786 1801 1742 1834 0.51
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGATAATtatcaatcaaatttattatttgatggaGGTGGTGATGATTCTGTGAGCAATAATTGCAAATTAATgttgaataagaaaaacattctATTGAATGAAGAACGCGAAAGATTTGGGTTTTATAAAGATTTACATCATTTTCATGAAGTTCGAGGgacACCATATGCCAGAATTCCAAAAATTAGCGGAAAGGATATAGATCTATATCAACTTTACACTAATGTTATAAGTAGAGGCGGTTGGTTGAAggtaaatcataaaaacgaATGGGATGATCTTTTAACCGATTTTAAGTTGCCATCAAAATGTGTTAATGCTACAGTTGCTTTAAAACAGATATACATTCGATATTTGGATAGATATGAAAAAGTTCATTTTCACGGGGACGACAATGATCGAggagatgatgatgatgatgagagTCGGCATAAACGTTGGTCTTCGAAAGCTTTGCATTCAGTTTCAATGacatataattataatcagcACAATATAATTGAAACAAACCGAGCGCAACACAAGCTCTCCACCAGTTTATACCATGCTTCAGAAtatgacaaattattattatcactattGTCACCTTTACCTAATGAACAAGATTTCGGAATAAATGTATGCACATTGATGTCAAATGAGGGACAACAAATtctcaaaatagaaaaatgtccAAAACTTGTTGATACATTATTAGCTCATGCTGGAATATTTAACCATTATTCAACtcgtaatatattttttgaatacTATTCAAAAATCCGTAAGCATTCACTTCAAAAATTTTGGAATGATTGTTTACATGAGAAAATACACATATTAGAATTGTCTTATGATGACTTTTATTCTCCACCATTGACAAAAATGCAAGGCATTGATGAAACATTTGTACGACCTATGTCagacaaaataaattccattaaaGAGGCTAACGACATTAAAATAGACGAAGATGAAACACATTTAGATTTTCTGTGCTTAGGACGTGGATTAGGTACTCATGACTATGTTGGTCAAAGAGTTTTACAGGTAGCATCAATATTACGCAATTTAAGTTTCAATGATGACAATGTTGTTATGCTAGCAAAGAATAAAACGTTCGtaagatttttaataatgtgtTCAAATGCAAGATGGAATAATTTACATCATATGGCATTAGATATGTTAGGAAACATTGCGCCAGAGTTAGAATTAATAGACCCAGCATCTGACGAATTAACCCGTTGTTTATTTACTACTGTAAGTGAAGGATTAGAATCTCCAGATCGTGGTGTAATAATAAGTTGCTTagaagttttatataaaatgtgtcAAAAAGACGATAATGaagaatttattcataaatggaTGAACCAAAAAaTGTATAATCAAATATGCCTATATTTATGCTTAAGCGATATAATGCTGTTACTTTATACATTAGAATGTATTTACGCACTAAGTACTTTGGGAGAAAAACCGTGCAATGCAATTGTACAAGTGCGTGGTGTAATTGATACTTTAGTTTCTTTAGTTACAGTTGAAGCTCAAAGTTACGGACAAGATGCTTGCATATCAATGCGTGTTGTTGAAACTGTATCAACTAGTATGATGCAGCAAACGCAGCATAATATAACAGCTGCAAATGTTACACATCCACCAACACTTTCGACACCAAAACATACACCTATATTGAATGAGTCTCCTAAACCAGCGAGTCCAATTTCAACTTTAACAAGTGAAAATCAAAaaactCAAGCTACATTAGTTGTTCATCAACCAAACTCTCCTGTTGTTCGATCAAGTATTATAACAGCACCACAAATACAACAGCCAATATCCAGTCCCAATCAAACAGTTGTCCAATCTCCAACATCAGTTGTAGCAAAACATGCTCAACAACAAGTGAATCAGGAAAATGAACAATTTGCTCTCGTGTGGTTGCGTGCTACTTTTGAACCTGCAGCATCCTTATCGTGTAGAATTGAACAAcaagaattatataaaatgtatttagctGCAAGTAATAAAGTAGGAAGACGTGGTGTCGTCACAGCAGTTCATTTTCCAAGATGCGTTCGTTCTATATTTGGCGGTACAGTTGGACCAAATTTAGTTAAAACTGAACAAAATGGTATTGAGACGTCATTGTTTAGTTATGAAGGGATTCGTATACGTACAAATCCATTAACTTTAGTTCATAAAGGTGTCATTGTGtCACCGCCAACTCCACAAATAAAAACCGTTGATGTTATGCCAACCAAACAACAAGTACAAAATCAGAGTGGCgattttaaagtgtttaataaaaataacacatcgACAGTTATATCTTCAACAACGCAATCAACAATCAAGCAACAGCAAAAGCAAAGTCCTTGTATTAGTGGTGTTGGTAGTAGCGTTGGTGGATCTATGTTGGTGGCACAAATTTGTGGAAAAAATGTAGTCATTAATCATAATTCAccTCAACAATCACCAATTTTACAACAAGTCTTAACGAATAATCCGATGgatagtaataatttaataatatctcAACAACAAGTAATTCAAAATACAACACAAGGTATTGGAAATGTGCAACAACATCAAAAGCAACATATAATAccaaataatagtaatattatATCAACTAttggtaataataacaataatataataacttCAACAACATCAATACCATCTACATTaataacatcaacaacaacatcatcatcattaattaaaagtctACTAGCAAATAAGGTAACAACAAATGATGCTAATAATAGTACAACAACAGCTAGCAATTTACCCACATGTTTGATAGCCCCAAATATTAATATGCATCAgGTTGCACAGCGACaacaattacaaaaacaaaaagaattagCACAACAATTAGCTAATCaagcattaaataataataattcgtcaattataacaacagcaactacAGCAAATATTATGAGTCCTCAAAAATTAACCAATGTTATAACATCGATTAAATCTGGTACAATAATTCAAAATAGTATTAAACCGATAACCACAGtaattgagaaaaaaattgataatgataatagtaataagcatattataaataataactggGATCCAGTGCCACCTTTAGCACCATTAAGTTGTTCGCAAGGCACAATGACAATTAAGCATACAAATCAGCAGCATCCATCTGTAATTGTTACTAAAATTGACGATGATTCGAATCttacagGTAATAATTCTGGAACATCAAATTTGAATCAAAGTCTGTTTATTGAAGAAACTGTTGAAAATTCTTCAAACTTTGAAGGTTTAACTATTAAACGTAATCAAATGACAGAAGATGATAATAATTCTAAAGAATCGATTAAACAATCACAAGTTGTAACTGCAAATAAGATGTTAGCAGATTTATTGGAAAGAAAGTCTTCAGATCCGCCTCCATATACTTTAACAGGAGATCTTAAACGTAAAATAGATAATACAAATGATGCTCCTGCGGCTAAAAAATGTcagaaaggtaaaaaaaatgaaattaacggAGATGAATGTACTCAAAGGAATCAAGATGAAAATGAAACGAATCAAATGAAAGCATCTACAAATATTGCTAATTTGTATGCTGAACTAGCAGCATCAATGTTAGAAGACGAAGATTTagacgatgaaataaaaaatgaagctCAACAAATGATGGCGAAAGcagaaataattcaaaaaaagcCACAAATTAAAAGTGTAATACAACAAGTGGAGAATAAACCAAAAGTTGAAATAAAGCAAATAGTATCAATACAACAGCAaccacaacagcaacaacaacagcaacaacaacaacagcagctacaacaacagcagcagctacaacaacaacatcaaaaaataattcaacaagtagtacaacaacagcaacaagcaCCTCAGCaacttcaacaacaacaacaaacacagaATCCTCATCAACCACAACCAACATCTCAGCAACAAGTGATTTCAATGCCTGTCCCTCTTCAACGTCAAATTATTGTTACACCAAATAATCAAGCTCAAATGATATTGTCTCCAAGTAATTCAGGACAGCAACAAATAACAACACAAACTACAGCGACAATTAAAACGGACACAGGTTATCAAACCGTTCCAGTTATATTACAACATACACAGGCTCAAGCGCAAGCAATGCAGGCAAACATTCAAAATATGCAATTGCAAAAACAGATTAGTGCTAGTGGTCAATTAATGCAGCCAATTTTATCATCTCCACAAGGACAAACACAATATGTTTTAACGACAAATCAACAGGGTCAAACGGTTGTCGTTGCACAGCCACAACAACATCAGCCCATGCACCAAACTGTATTAGTAACGCAAACACCACAACAACAAGGCACTTCAGCCaaaactataattattttacaacagCAATCACCGGGAGGGGCACATAATCAAGTTCAGGCAAATAATAGTTTAATGAATGCGATGAATGCTATGAATCAATCAGGACAGCCacaaaaaatgataatgacTACACAACAAGGACAACAAGTTATTGTTACTCAGGTTCCCAGGCCATTGCATCATGTTTTAGTTAACAATCAATTACAACAAGGAAATGTGGTTGTCTCTAATGCAAATACGATGAATACAACAAATGcaataattcaatcaaaagcaatggaaaacaaacaaattattgtcAGTGGATCTTTAACGGGTGACAACCATTCACAATTATCACATTTGCAGATACAACAAATACAACAAAGtttacagcaacagcaacaacaacaccagcaacatcaacaaatCCAATTAACGGCACAACAATTGCAACAACTACAAGCCGGTCAACATATTCAATTTAATCATTCTCATCAACAAGCAACAATGCAAATACAACATATTCAACCAAATCAACAGATTCAATTGCAAGCTGGTCAACATGTTcaaattcaacaacaacagccgaATCAGCAAATTCAAGTTTTACAACATCAACCACAGATGCAATTGCAAATACAACAGccccaaca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- Protein Sequence
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Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01276747;
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -