Pnig009544.1
Basic Information
- Insect
- Pterostichus niger
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_947425015.1
- Location
- OX380334.1:22706357-22711153[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 7 10 5.3e+04 -3.9 0.0 31 46 321 336 320 343 0.80 2 7 0.25 1.3e+03 1.3 0.0 26 45 504 524 469 536 0.76 3 7 0.0071 38 6.3 0.0 26 55 786 816 743 826 0.81 4 7 0.014 74 5.4 0.0 21 55 946 1003 927 1007 0.67 5 7 0.14 7.3e+02 2.2 0.0 25 55 1150 1190 1115 1193 0.67 6 7 0.012 65 5.5 0.0 25 50 1341 1366 1302 1375 0.76 7 7 0.2 1e+03 1.7 0.0 27 49 1526 1548 1482 1595 0.79
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCCAACTATTGATCACAACCTAATATTAAGGGTAATTTTGTGCATGAAGTCTAAAATAGCTCGTCAAGATAAAGTTAAACATTTTCTAGAAAAATTCGTTATTGATATAACAATAAATAATAAATTAAATAAAATACCTCCAAACTTCTTGCAATTAATTCTAAAATATCCGAATCTAGAGAATTATATTAATTATATTTTTCAACAGAATAACTTACCGATAACAAAAGTAAATCCACGCATAATAATTCTACTTCTTAAGTTAATTAACCAATGCAAACTAAATGAACTAATATCAAATATTCCTCAACGATTAATCGAATTAATTCTTAATTTAAAAGGAGCTCAAGCATTATCGCAAACTGTGCTCGTTTGGCTTCAAGGAAATGAAGAAGTTGACATGGTACAATTGTTTTTACAAATACTTTATGATAATGAAAATAACATCGTTCCTCGTAATCTTCGAATCTGGCTTTTAAAGTTTCCTAATGGCCAAAAGATTATAGATTATCTCGAGAAACCTGGTGAAATAAAGTGTACTGAAGTAAATAGTGGCAATATTCATTGCTTTAAAATTATATTAGAAGTTATAAAACCAAGAGTTACAATAAAATCTCCAGATATAAGAATTTCAGCAGACATAGTTGAAGAATTGTATAAAATAATAATAGGTATAACTAATAAACGCCTAATTAATGTGTCTCCGAAACTTTTCAATTATATTTTCAATAGTTCCGATTTACACAATCTTGTCTTAAAAATTTTCAAAAACTATCAAATTCCGTTTACAAAAATTAATCCGTCGATTATAACACAATTATTGAAATTAATAATATCATACAAAATACACACACCAATACGTGATATATCTCCAGAATTAACGAAGTTAGTTCTAAACTTAAAAGGAGCTCAAGACTTGACGAATTTTATTCTCGTTTGGTATAAAGACATCTTACATATTGATATGTTGCAATTGTTCCTGCATATAATTAAAAACAATGGAGGTAACATTATTCCTCGAAATCTTCGTTTCTGGCTTTTACATGTTCCTAACGGCCTGCCACTTCTACAATTTCTCGAGAAACCAGGTGAAATAAAATGTACCGAGGAAGGTATTAACAATGTTCATTGCATGAAGATTATAATCGAATCTACAGAATCAACAGTTACGCTAGTAAAACCGAAACCTGAAATTTCAACTGATATTAAACTAGAATTATATAAATTCATTTTAAGTATAACTAATCATCAACTAATTCATATGTCCCCTAACTTATATAAATTTATTTTAAATTATTCCAATCTACATGATATTGTCATTAAAATTTTCAACGACTATAAAATTTCAAATACAAAAATAAAACCCAAAATAATAGTACAACTCATAAAATTGTTAATAAAACACAAAACGCACAAACCAATTAGAAATATATCTCAAGAATTAATTAAAATATTAATCAATTTAAAGGGTGCCGAAGAGTTAATACGACCAGTGATTACTTATATTACACAGCACAAGAATATTGACATAATACAGTTGTTTCTTCAAATAGTTCAAGAAAATGGAGGTAAGATTATACCATCAAATCTACGTTTCTGGCTATTACAGTTTCCTAAAGGTCTGCAGATTTTGCAATATCTCGAGCAACCTGGTGAAATAAAATGTACCAATCAAGATAATGGCAATGTTAATTGCGTTAAAATATTTGTTATACTTAAACCTATAGTTCCGATAGAACAGCCATTAGCAATGCAACCTATAGTTCCGATAAGACCTATAGTTCCGATAAGATCTATAGTTCCAATAGATCAAACATTGATGATTCAACCTGCAGTTCCGATAGAACCTATAACTTTTATAGAACCTGTAGTTCCAATAGAACCTATAGGTCCGATTGAATATATAATTCCAACAGAACCTATAATGCCAATAAAATCTATAATTCCGATAGAAACCATAGCTCCAAAAGAACCTATAGTTTCAATAGTACCTGTAGTTCCGAAAGAACCTATACTTACGATAGAAGCACCAAAAACAGAAGTTTCGATAGATATAAAACAAGAACTATATAAATTAATTTTAGGCGTAACAAATTATCAACTGAATCATATCTCTCAAAATTTATTTCAATTTATTTTAAAATATACACATTTACAAGAACTTGTTATTAACATTTTTCATGAACACAAGATTCCATCTACAAAAATAAGTCCAACAATAATAGTGCAACTTATAAAATTACTAATTAAACACAAAACACACAAACCAATAGAAGAAATACCTCCAGAATTAATCAAAATATTGATAAACTTGAAAGGTGCTGAAGAGTTAATACAACCATTAGTTACTTACACGAACTACAGGCACATCGATATGATGCAGTTATTCCTTCAAGTAATTGAAGAGAATGGTGGTAAAATGATTTCATCAAATCTTCGTATGTGGCTTTTGCAATTTCCTAACGGCTTGCAAATTCTAGAATATTTAGAGAAACCTGGTGAAATAAAATGTACCAAGAATGAAAATAACGAGATTCATTGCTTTAAAACTGTGGTCGAAACTGAAAAATCTATTGTTACGCAAGAATCATCAAAAATAGAAGTTTCGAGAGATGTAAGACAAGAATTACATAAATTAATTGTTGGCATAACTAATCATGAACTAATTCACATGTCTCCTAACTTTTATCATTTTATTTTAAATCACTCTCATCTACAAGAATTTGTCGTTAAAGTTTTTAATGAATACAATATTCCAAGTACAAAAGTAAACCCGACGATTATAGTACAACTGATTAAATTGTTAATTAAACACAAAACTCAGAAGCCAATTGACGAAATACCTCAAGAATTAATCAAAATATTGATAAACTTGAAGGGTGCTGAAGAGTTTATACAACCATTAGTTACTTACATAGAGCACAAGCATATCGATATGATGCAATTTTTTCTGCAAGTAATTGAAGAGAATGGTGGTAAAATTATTCCATCAAATCTTCGAATGTGGCTTTTACAGTTTCCTAACGGCCTGCAGATTCTAGAATTCTTAGAGAAACCTGGTGAAATAAAATGTAGCAAACAAGATAATGGTAATGTTAATTGCGTTAAGATTGTAGTTGTAACTGAAAAACTTACTGTTACAAAAGAATCATTGCAAACAGAAGTTTCGATAGATATAAAACAAGAATTACATAATCTAATTGTCGGCATATCTAATCATGAACTAATTCATATGTCTCCTAACTTTTATCATTTTATTTTAAATCACAGCCATCTACAGGAATTTGTCATTAAAATTTTTAATGAATACAATATTCCAAACACAAAAGTAAATCCGACTATAATAGTTCAACTTATAAAATTGTTAATTAAACACAAAACTCAGAAGCCAATTGATGAAATACCTCAAGAATTAATTAAAATATTGATAAACTTGAAGGGCGCTGAAGAGTTTATACAACCATTAGTTACTTACACGGAGCACAAACAAATCGATATGATGCAGTTCTTCCTACAAATAATTAATGAGAATGGTGGTAAGATGATTCCATCAAACCTTCGAATGTGGATTTTAAAATTTCCTAACGGCCTGCAGATTTTAGAATTTTTAGAGAAACCTGGTGAAATAAAATGCAGCAAGCAAGATGATGGCAATATACATTGCGTTAAGATGGTAGTCGAAAGTGAAAAATCATCGAAAATAGAAGTTTCCGTAGATATAGAAAAAGAATTACATAATTTAATTGTCGGTGTAACTAATCATGAATTAATCCACATGTCTCCTAACTTTTTAAATTTTGTTTTAAATTACTCTAATCTACAAGAATTTGTCTTAAAAATATTTAATGAATATAATATTCCAAGTACAAAAATAAATCCAACTATAATCGTACAACTTATTAAATTGTTAATTCAGTACAAAACGCATAAACCAATAGAAGAAATACCTCCAGAATTAATAAAAATCTTGATAAATTTGAAGGGTACTGAAGAGTTAAACCAACAGTTGATTATTTATGTCACACAAAACAAAAAACTTGACATGATGCAATTATTTCTGCAAGTAATTAAAGACAATGGAGGTAAAATTATTCCTTCAAATCTTCGTCTTTGGATTTTACAGCTTCCTAATGGGCAGGATATACTACAATATCTCGAGAAACCTGGTGAAATAAAGTGTGATGAGCATGGTATTGATGGCATTCATTGCGTTAAAATTATAATTGGAGCTGAACAACCAACTCAATTAACAGGAATTTCTTCAGATATAAGTCAAGAATTATACAAAATTATTATAGGTGTAACCAATAATCAACTAATTGAAATGTCTCCAAAATTATTCCAGTTTATATTTAATTGCTCCGATCTACAGGAACAAATTATAAACATTTTCAATAAATACAAGATTCCACTTAAAAAAATTAATCCGAAAATTATAACGCAATTATTCCAATTAATAATAAAATACAAAACAAAGACAACAATCCGTGACGTACCCTCAGAATTAATTAAGTTAGTTGTAAACTTAACTGGAGCTAAAGAGTTAGCGCAAACTCTGCTCGGATGGGTGCAAGGAAACGAAAAACTGGATATGATGCAGCTCTTCCTGCAAATAATTAAAGAAAATGGAGGTAAGGTTATTCCTCTAAATCTTCGTATCTGGCTTATGAATTTTCCGAATGGCCAGGAGATACTAAAGTTTCTAGAGAAACCTGGAGAAATAAAATGTGTACAAGATAATGACACTGTCCAGTGTATTAAAACTTTATACACAAAGACTGTTGTCATGGGCTGA
- Protein Sequence
- MPTIDHNLILRVILCMKSKIARQDKVKHFLEKFVIDITINNKLNKIPPNFLQLILKYPNLENYINYIFQQNNLPITKVNPRIIILLLKLINQCKLNELISNIPQRLIELILNLKGAQALSQTVLVWLQGNEEVDMVQLFLQILYDNENNIVPRNLRIWLLKFPNGQKIIDYLEKPGEIKCTEVNSGNIHCFKIILEVIKPRVTIKSPDIRISADIVEELYKIIIGITNKRLINVSPKLFNYIFNSSDLHNLVLKIFKNYQIPFTKINPSIITQLLKLIISYKIHTPIRDISPELTKLVLNLKGAQDLTNFILVWYKDILHIDMLQLFLHIIKNNGGNIIPRNLRFWLLHVPNGLPLLQFLEKPGEIKCTEEGINNVHCMKIIIESTESTVTLVKPKPEISTDIKLELYKFILSITNHQLIHMSPNLYKFILNYSNLHDIVIKIFNDYKISNTKIKPKIIVQLIKLLIKHKTHKPIRNISQELIKILINLKGAEELIRPVITYITQHKNIDIIQLFLQIVQENGGKIIPSNLRFWLLQFPKGLQILQYLEQPGEIKCTNQDNGNVNCVKIFVILKPIVPIEQPLAMQPIVPIRPIVPIRSIVPIDQTLMIQPAVPIEPITFIEPVVPIEPIGPIEYIIPTEPIMPIKSIIPIETIAPKEPIVSIVPVVPKEPILTIEAPKTEVSIDIKQELYKLILGVTNYQLNHISQNLFQFILKYTHLQELVINIFHEHKIPSTKISPTIIVQLIKLLIKHKTHKPIEEIPPELIKILINLKGAEELIQPLVTYTNYRHIDMMQLFLQVIEENGGKMISSNLRMWLLQFPNGLQILEYLEKPGEIKCTKNENNEIHCFKTVVETEKSIVTQESSKIEVSRDVRQELHKLIVGITNHELIHMSPNFYHFILNHSHLQEFVVKVFNEYNIPSTKVNPTIIVQLIKLLIKHKTQKPIDEIPQELIKILINLKGAEEFIQPLVTYIEHKHIDMMQFFLQVIEENGGKIIPSNLRMWLLQFPNGLQILEFLEKPGEIKCSKQDNGNVNCVKIVVVTEKLTVTKESLQTEVSIDIKQELHNLIVGISNHELIHMSPNFYHFILNHSHLQEFVIKIFNEYNIPNTKVNPTIIVQLIKLLIKHKTQKPIDEIPQELIKILINLKGAEEFIQPLVTYTEHKQIDMMQFFLQIINENGGKMIPSNLRMWILKFPNGLQILEFLEKPGEIKCSKQDDGNIHCVKMVVESEKSSKIEVSVDIEKELHNLIVGVTNHELIHMSPNFLNFVLNYSNLQEFVLKIFNEYNIPSTKINPTIIVQLIKLLIQYKTHKPIEEIPPELIKILINLKGTEELNQQLIIYVTQNKKLDMMQLFLQVIKDNGGKIIPSNLRLWILQLPNGQDILQYLEKPGEIKCDEHGIDGIHCVKIIIGAEQPTQLTGISSDISQELYKIIIGVTNNQLIEMSPKLFQFIFNCSDLQEQIINIFNKYKIPLKKINPKIITQLFQLIIKYKTKTTIRDVPSELIKLVVNLTGAKELAQTLLGWVQGNEKLDMMQLFLQIIKENGGKVIPLNLRIWLMNFPNGQEILKFLEKPGEIKCVQDNDTVQCIKTLYTKTVVMG
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -