Basic Information

Gene Symbol
TRERF1
Assembly
GCA_951394005.1
Location
OX596073.1:181921801-181939652[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 3.2e-11 6e-08 33.8 0.2 3 45 1769 1811 1769 1812 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTGTAGTGCGTCAGTGGGTACAGAAGCTTCGGTAACATTACAATTACGCGATGTTAATTCCAATGACTCAATACAATCCAATCAATCATCATCAGAAGCAGCCGCGGCAGCAGCAACAATTATTACATCGTCAACAAATAATAACCATCATACAGCCGGCACaggaacaacaacaacattggaTAATGCATTAACTATAGGTTATCCAGATCCAGAAATGTTGGCTGATGTTTTAGGTACATTACAAACAGCATctttaaaaaatacaaatccCAGTGGTGAGAGTACAAAACAAAATTCCTCCAAATTAACAAATACCAGCGATAtttcaaataacaatttaaatggTACGATTAAAAATCGTATAACAATTAGTAAACGCTCCTCGAATATAATCAATAATTCCCAAAATAccagcaataacaacaacaacaataataataacaatatcattaacaacaataataacaattgtTTTCGTGATATAACCAAAACGACTACCACATCAGCGGTACAAACCGTATCGACATCAACAAATACTACAACCTctgttaataaaacaaatagttatattaaaaattgtctaataCGTAGCAGCAGTTGCAGTAATACTACCAACATAACATCTCTCGCTCAGATAATGAGCAATAGTAGTAATAGCAGCAACAAtaccaacaacaacagcaacggTCATAACAATAGCAATAATCAActcaataacaataataataactcATCGATTAACTGTAACGGTATTAGTAATAtcagcaataacaacaataataacaatttaagtcaacttaataacaacaatacaaccagcaacaacaacagcagcaacaatagTTGCAATAGCAATTTCAGTTCTAGTAGCAACGATAGCTGTTTCAGTTATAGCAGTAATAGCAGTAGCGGTAATTCAGTTGCTCGTAGTATAACATCGTTGAGTCACGGTAGCCGAAAAGTTCCTGGTCCATTAACAACAAATCCACCGAAAATCTTAAAGAAAAGCCGTTCAAAAATATCATCACCCAGTCGTCACGGACCTCAGCAGTGTCAGatttgtaataaaatttttggaaatgcATCAGCGCTGGCCAAACATAAACTGACACATAGTGATGAACGGAAATATGTGTGTGTTATGTGCTCAAAGGCATTTAAGCGACAAGATCATTTAAATGGGCATATGATGACacatagaaataaaaaaccATATGAATGTAAAGCTGAAGGTTGTGGAAAATCATATTGTGATGCACGTTCATTAAGAAGACATACAGAAAATCATCACGCCGGTATTATTACACCACACAATCAACAACTCtcaataaacaataataattccaattcaaatttaagtttatcaccagCCACAGCAAATGGAGATGCCAGTTCACCAGATGGTGCCACCTGTTTAGGTACATATCTATCAAACGGTGGTACAGTGGTTGATGCagctactggtttagctttaaccGAAGAAGAATTGAAAGCCTTAAATGTACCCCTTAAGACAGGCGTAACTTTATTATCACCAACTTCGACTACATCCTCCATGTCCTCCTCCAGCAGTATGTCGAACGGCCCCGGTGCTACCATAACGTTAACCGATAATAGTGGTAATTTAGAAGGTGAAGGTTTGACAAGAGAACAATTGGATTTGATAAGTAAAATAATGAGACAAACTAAACAAACCACAGCTCAAGTGACAGTATCTTCACCTACCAGTAGTCAATCGTATAAAATTGATACAAATCCCCCAGCTACAGCCCAGACACAAACACAAAATTCCCGACCTCGAACCTGGAATATGCAATTGctaaATTCCTCACAAAATGTTGCCATAACTGTTGATGAAGTCAATACGGATAATAACAATGATTCTTCTAATCAAAATCAATCTAAAGTTAAAGAGGAAGAAATTGAAATTGATTTATCCAATGCCATTAATTCCAATCTTTTCAATTTGGTTAAAATTGATCAGAAACCTGTAGAGTGTAATTTATGTcatcgtaaatttaaaaatgtaccCGCCCTTAATGGTCATATGCGTTTACATGGTGGCTATTTTAAAAAGGATCCAGAAACGAAAAAGAgtgaaaagaaagaaaatagtGGTCCTCCCTTACAGACAGCTAGTATAGGTGTAAGAGCCTTGATTGAGGagaaaataataagtaaaagaAGTAAAGATTTAAATAAGgGTGCCTTTGTAGTCCCTGCACCACCCTCGAATAGTAGCCAAAATAATACCACCACCATACGTAGATCCATTAGTGATTTGGATAGTTTCCTTAATCCCAAGACACAACCAAACAGTACAACTATTACAACAAATCAACAAAATTCcacacaacaacaacagcagcaacaacaattaCCAGCTActactattaaaaataataccaaaACAAATATCAATGTACAAGATATAAACTTGCCACAAAGTATCGAAATCTATAGTActaagcaacaacaacaacagcagcaacaacaaaagaCAATGAATAATATAGGAGTGGGTACTACAACCGTCCCCTCCTTAAATGCCGAACGTAGTGCAACGAAAATAACAACTACTACAACAGCAGCAACGATTAATACAACGACAACACGAAGTACATCAACCGATCCAAAAGATTCAACGCTAATCGAATTACTAAAACGGGGTACACGCATAGCGGTAACCCAAAAACCGCCCAATAATAATACCCCCTTGGGTGGAGTAACCCGCCagataataacaaataaaaataattgtagtGTCATTATACCCTCAGAAGTCCAGGTGGTATCGACAAAAGGAAAACTTAAGAAAGATGATCATAATATACAAATGTCGAATGCCACTAATGTTACCTTACCCGATGGCACTCCTTTGTCCTTGACTATTGCCCAAGGAGCAGATAGTAATAGTGAAGTGTATACGGTCACCTATACCAGTGATGGTTCGGCTTTATTTGGTGAAAATGAGGTTTATAATGTAAGTGAAGCTGAAATGTTGTTGCAAACTGTCGATACCATGCAGCTATTAAATGATGCTggcaataatttaaaatctgaACATTCCGAACAATTTGAGGTCatggataataaaattaaactggAAATTGAGCAGCAAAATTGTGTGGAtcaacagcaacagcaacaacaccAGCAGCAGCAACACCAGCAATTGCAACAAAACTCAAATCAGTGTCAAACTACTCAAACTTTACCAAACTTCCAACATTTCCATTCCAAAGAATTAATCATACAAAATCCAGCTTTGATCAATCATcatcagcagcagcaacaacagcagcagttAAGAACAAATACCTTGTCCTTGCCACAAGATATGAAAAATCAATTTGCTTCCAGTCTCAATTCACCCATACATTCTCCTCTAGCTTATCCCACACCTCCTTCTAGTCATGAAAATGTTACACAAACTTCTCCCTACATAGAGGACAATCATCATTTCAACGATACACCCAATATATTCTTTAGTGAATCATTAATTTCCTCCAATAATTCGGGAGAAAGTGATAATGATAagataatgaaattgaaaagtGTACTTGAAGACAATTCCTTTGATTCCAATATTAAGGTAGAAGATTTATTAAACGGCACAGATCCCGATACGGAATGTGATTTACGAGAATTTGCCGAAGCAAATCTTTCCTTCCTAGATGAAGATCAAGAATTTCTAAATGATTCTCGCAATGCCACCTCACCTTTATCGGAATCATTTTTCACCAGTGGCATAGGCACAGCCGAAGAGGTGAAAGAAGTGTTACGTGAAGTATTAACTGAAGATcaactaaatttaaattgtgaaaATCAAGGAGAGAATATTAtagatttatattatttacccGGTTTAAGTTTACAATCACAAATGATGCCCAATTCTGAAGATCCGCTGTTGTCGTCTTCGCCTAGAGATTTTGGTCAACAGCAAAAGATGCAAAATCCTATGCCTCAACAACAGCAAACTCAGacacaacagcagcagcagcaacagaCACAAACACAACAAATCCAACACATTcctcaacaacaacaacaaaacctTAATCAGCAACATACTATACAATATAATAATCAACAGCAAGTTGCTCCACAAACTCAAGCAGTTAAAATATCTTTAGATACCAACACACAAACGTCTACGGGTTCTTCAACTTCCTCCCCCTCCGAAATAAAtcaattgattttaaatatacccTCAAATGTAATACAGAATTCCTGTAATCCAAATTCGGCAAATTCCTCTTCCTCCCATAATACTGCAACAACTACTACTATACACTATAATGTACAAAATTTACCACAAGTACAAAATCAgcaaactaataataataaccagatacagcaacaacaacaacagcagcagcaaacACTTCATatgcaacagcagcagcagcagcagacacagcaacaacatcaacagTCCCCACAGTTTTTAAACTCCACAAGTATAAACTCATTAAATGAGGCCTTAATGCAGCCTATAATCTACTCAAGTGGTACCACcgataaaatggaaataaaattaGACAACAACAATCCCAATtccaacaacatcaacaacacacaattacaaaatattattaatctTAATAAACCCTtggaaattgttaaaaatacttCCAATAGCCATATAATATTTCCAACACAAAATCTTTCTTCAAATTCCATTTCCTCGAACACAACTGTAAGCACTTCTTTGCAGCCATTATCAAATCAAACCAACTCTATTTTAAAAAGACGTTTAAAAGGTCATTCCTCATTGGACTCATCCTCATCACATTCTTCTTTTTCCAAATATCAAGCTTTATCACCCTACAAATCAAAATTACGTAAACCTTCACGTACCCACTATACACCAGCTCCTATATTAAATCCTGAACGTAAGGGACATGGTTTAtattgtaatgttttaaaacaattgGGTTGTTCATTACTGAGTTTTGATAATTTTGATGATGATTTCGATGATCCAGTGGGTTTGGTTGATTTCTCCGATGAATCCAAAGTCAATTTAGGTTCAGCTTATCAAGCTGCTATACCTGCATTTAATGAAGGTGCTGCTGTAGAAGAAACAATTGGTTGTGATCTTATGTGGGATCCAGAAGTGCAAAAggatgataaaattttaatgagatttattgatttaagtAAATCTTCAGCCGTACCCTTGGGTAGTCATTCCGAGGAAGTAGCCTTGGAGGCTTTACTGAAGGCCCAGGGTAATACGGCAACGGCTGTTTTGAGTTTATTACAAACCCAATCGAACTCATTCCAAATAAAATGGTCATCACAAGAGTTGGAGATATTTTTAAAGGGTTTGGAAAAGCACGGGAAAGAGTTTAGTAAAATATCCAAAGAGcTCGGTTCCAAAACAACTGGCGAATGTGTACAAATGTATTATTTCTGGAAGAAATTATGTGTGGACTATAAGGTAACCCACCTAAAAACCGAAACACCACCACAAAATCATGCTAATGATCCCAAACCTTATGTATGCGAAATACCAGATTGTTCAGCGAGCTTTTCTTCTAAAGCAGCTCTGCATGGTCATACCCGCATCCATACTTATGGCCGTAATTCCCACAATAATcaacataataataataataataacaatacaAATGCTACAACTACTAATACCAATGCAAATTCCTCGCAAGGTTCTGCTACCAATAGTAATAATCATCCCATGCATAGTAATACCCAGTCTAGTCATGCCAATACGGCGAATCCAAATCAAAAAGATACCAATGCCAATAAAGACAATACCGAATTTCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAagtatttaataaaattaaaagtcgTAGTGCCCATATGAAGACCCATCGTGCAACAGATAATGAAACAACTGTACAAATTACAAATAATCAAAATCAaataatacaacaacaacagcagcagcaacaacagcagcaaacACAACAattataa
Protein Sequence
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Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00921633;
90% Identity
iTF_01261360;
80% Identity
iTF_01261360;