Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_932273785.1
Location
CAKNZW010000094.1:1511163-1560809[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 35 10 2.1e+04 -9.8 8.3 18 40 42 64 22 100 0.64
2 35 7.9e-16 1.7e-12 48.2 0.6 1 86 839 911 839 912 0.84
3 35 2.3e-15 4.9e-12 46.7 4.7 1 87 939 1008 939 1008 0.80
4 35 1.3e-15 2.8e-12 47.5 0.3 1 87 1029 1101 1029 1101 0.83
5 35 1.9e-14 4.1e-11 43.7 3.1 1 86 1183 1251 1183 1252 0.78
6 35 6.5e-16 1.4e-12 48.5 5.7 1 87 1276 1348 1276 1348 0.81
7 35 2.4e-12 5.1e-09 37.0 0.8 1 87 1383 1451 1383 1451 0.81
8 35 1.3e-11 2.7e-08 34.7 2.6 1 86 1492 1561 1492 1567 0.74
9 35 1.1e-14 2.3e-11 44.5 0.1 1 87 1589 1659 1589 1659 0.80
10 35 3.2e-15 6.9e-12 46.2 1.6 1 86 1681 1750 1681 1751 0.80
11 35 2.5e-13 5.4e-10 40.1 2.5 1 87 1779 1851 1779 1851 0.86
12 35 1.1e-06 0.0024 18.8 0.3 1 79 1919 1992 1919 1995 0.73
13 35 1.6e-11 3.5e-08 34.3 0.8 1 87 2016 2088 2016 2088 0.79
14 35 2.1e-14 4.4e-11 43.6 2.6 1 87 2119 2190 2119 2190 0.80
15 35 4e-15 8.4e-12 45.9 5.3 1 87 2235 2308 2235 2308 0.84
16 35 1.3e-13 2.8e-10 41.0 0.6 1 87 2330 2398 2330 2398 0.80
17 35 1.4e-14 2.9e-11 44.2 0.2 1 87 2688 2757 2688 2757 0.80
18 35 6.7e-13 1.4e-09 38.8 4.6 1 86 2815 2897 2815 2898 0.78
19 35 1.7e-11 3.7e-08 34.2 0.9 1 87 2928 3001 2928 3001 0.78
20 35 8.3e-13 1.8e-09 38.5 1.7 1 87 3029 3098 3029 3098 0.82
21 35 5.3e-14 1.1e-10 42.3 1.5 1 87 3118 3188 3118 3188 0.82
22 35 7.2e-14 1.5e-10 41.9 2.7 1 87 3211 3282 3211 3282 0.80
23 35 1.3e-05 0.029 15.4 0.3 1 59 3298 3345 3298 3371 0.77
24 35 5.2e-13 1.1e-09 39.1 3.7 1 87 3386 3456 3386 3456 0.83
25 35 2.7e-11 5.7e-08 33.6 3.1 1 86 3481 3552 3481 3553 0.75
26 35 2.6e-13 5.5e-10 40.1 3.3 1 86 3573 3645 3573 3646 0.78
27 35 4.9e-11 1e-07 32.8 8.0 1 86 3666 3735 3666 3736 0.79
28 35 4.8e-12 1e-08 36.0 0.2 1 86 4282 4358 4282 4359 0.80
29 35 6.9e-07 0.0015 19.5 0.7 1 86 4378 4447 4378 4448 0.73
30 35 1e-12 2.1e-09 38.2 2.9 1 86 4467 4537 4467 4538 0.78
31 35 0.0058 12 6.9 0.2 1 58 4581 4641 4581 4665 0.77
32 35 2.3e-12 5e-09 37.0 2.0 1 87 4686 4760 4686 4760 0.84
33 35 1.3e-14 2.7e-11 44.3 0.6 1 86 4783 4855 4783 4856 0.81
34 35 2e-12 4.3e-09 37.2 5.6 1 87 5036 5109 5036 5109 0.78
35 35 7.1e-13 1.5e-09 38.7 0.4 1 86 5134 5203 5134 5204 0.80

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCACAAAATAATCAACGTAAACATTATCACATACATGCTCCCTATCAACACCCCCAACAGCAGCAGCATCAACAACAGCAGCAGGCTCAACATCATCATCACCATTTAACATCCTCGTCACAACAACTCCATCATCAGCAACAACAGCAACAACAGCACCAGCAATGGTACTCACAGCAGCAACATTATCAACATGGTCTTCATTTAAGAGAATCCCGCCATATGCAACATGCTCAACATCATCATGCTGCTGCTCATCATCATCAGACGCAACACCAGCAACCACATCATAATCATGCTATATCGGCACCACATATGTTTACAAGTGGTTATGTTGGTATGACAGCATCATCCTCAGGAGGAAGTGTTAATAATGCAAGTAGTGGGGTGGCACACTCGGCAACAGCAACAATGGGTACAACACATAATATGCCGGTTTCTTCTTCATCATCATCGTCGTCTGTTCATCATCATTATTCTGCTACTGCTTTGGCTGCTTCGAGTGCGAGTAACACAGCAAGTGCTGCTACTGGTGGTGCTGGTGGTAGTGCAGCCTATGCTGCTGGTCGTAATCGTATGTTTGACCTTGAAATGTTAACACCACAACAACAGCAACAACATATTACAGCATCTGCTACACATGCACACTCTATGCTACCAAGTGGCAGTACAAGTGGACGTTCTGGATTTGATGCCTACTCCCATAGCTCTTTGTATGCCCAACAAAATCAGCGTCATCATACTACTCCCAGCTCTTCACATCATCATCTGGCAGCTACACATCATTCCTTACATTCTCATCACTCGCAACATCATCCCCAATCAACAGCAGCAGCACCACCACCACCACCACTTCATCATCCACACCAACAACATCCGCAAACTTCGTCTCTTCATCATCATCAACAGCATCCCCATCACCACCAGCAACAACATTATTATCACCATACTCAACAAACTTCTCTTCACCGACCACATACTCAAGTTATGGGTCCTATGTTGCAACATATTAAATCTGAGCCAGTAGAGCAAATAACCGTAACACCATCAATACAAACCGAGGAAGTTATCATAAAATCCGAACCTGTGGATGATAGTGGTTATCACAAAAGTGCGCCACAAATTGAAAACAATTCTTTTCACATGGAAGAAAAACGTAAACAACATGAATTCCATCAACAACAACTATTACAACAAAAACAGCAGGAGCAACAACGTGTTCAACAACAACAAAAATTACATGAACAGCGACAACAACAACTACTTCAACACCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAGATACAAATAAAAGAAGAACCACATGATTATCCTGAACATCATCGTCATGAGTATCAACAAAGTGAACATACTCATAATGAAGATATTTCCCAACAAACACAAAAGCGCACAAATTCCGAGAATTCTACTACGATACAACCAGCAGTAGTAGAGCAAAAAACAGAACAGCAGCAACAACAACAACCAGAACAACAACAGCAGCAGCAAATATCCTTGACAAATATAAAAACAGAGGCAAAGCCCCTTAACTTTCCTCGCCGCAAATTACAAACAGAGCGTTCCTCTACGCTGCCCATATGCCAACGATGTAAACAAGTTTTTTTGAAACGTCAAAACTATACACAACATGTTGCTCTCTCCAGTTGTAATATTGTTGAATACGACTTTAAGTGTTCCGTATGTCCCATGTCCTTTATGTCCAATGAGGAATTACAAACGCACGAACAATTACATCGTTCACATCGATATTTTTGTCAGAAATATTGTGGCAAATTCTATGAAACCATCGATGAGTGTGAACAACATGAATATGGACAGCATGAATATGAAATGTATAAATGTAATATTTGTTGTATAAGTGTAACCCAACGTGAACAATTATTTACGCATCTACATGAACATAAATATCAGCCACGTTTTGATTGTTGTATATGTCGTTTATGTTTTCAATCTTCTTTGGAATTGCATGATCATTATATGGCCAATGAAGATTTTTGTGGAAAATTTTATGATAAAGAAGCCTTTAAAAAATCAATTACCTCCTTGACAACAACACCTTATTTCGGTAAACCGGAAAGTTCGAATTTGGAAATTTCTCACACTTTCTCGTTAAAAGATATACCTCCTGCTAATAGTCACCAATTGGAACCTTTACATACAAAACTCAATACATCAAAATCCTCCATGGACCCACCAACAACACCAACAACACCCTTATCCTCGACATTTAGCTTAGAAACTCATGAGTTTCCTTTGGAACCCCAGGTAGAGGTAAAAACTGAAATTAAAGTAGAACCTGATTTTTATCCACCAATGGATCAATCGGATTATTCGAGTTATGAACAAGATTACAATACTACAGATTACAACTCGGGGTCTAATCAAAGCTTAGCTTTTCTACAAGATTATCAAGATAATGCTTCCAGTTCGACAAATTCATCATTTTCGTTTAGCAATAATAACGATGCCATACAAGATGAAGATGCTATGTGTTGCGTACCCAAATGTGGTGTTAGCAAATATTCTTCACCTTCCCTACAATTCTTTGGATTCCCGCGTGATGAAAAGTATTTAGCCCAATGGCTGCATAATTTAAAAATGATTTATGATCCTAATGTTAATTATTCAGCGTATCGTATTTGTAGTTTACATTTTCCTAAACGTTGTATAGCTAAGTATTCTTTAAGTTATTGGGCTGTGCCCACGTTTAATTTGGGTCACGATGATGTGGGTAATTTATATCAGAATAGAGAAAGTTCAGGGGGGTTTCCAGCTGGTGAAATGGCTAAATGTAGTATGCCTGGTTGTCCGTCACAGCGGGGAGAAACTAATGTAAAATTTCATGTATTTCCTAGGGATTTAAAGACCTTAATCAAATGGTGCCAGAATTCTCGTTTGCCCGTGCATAGTAAAGATAATAGATTTTTCTGTTCTAGGCATTTTGAAGAGAAATGTTTTGGTAAATTTAGGTTAAAACCCTGGGCTATACCTACTCTTAATTTAGGTACTGTTTATGGCAAAATACACGATAATCCTAATATCTATCAAGAGGAAAAAAAATGTTTTTTACCTTTTTGTCGACGCAGTCGTTCGTATGATTGTAATTTATCTTTGTATAGATTTCCAAGAGATGAAACTTTATTAAGACGTTGGTGTTATAATTTAAGATTAGATCCTAATATGTATAGGGGTAAGAATCATAAAATTTGTTCTTCTCATTTTATTAAAGAAGCCTTGGGCTTAAGAAAACTAAATCCAGGGGCCGTGCCCACTTTAAATTTAGGTCATAACGATAGATTTAATATATATGAAAATGAATTATATACACCACCGCCACCACCTCCTCCACCTCAACCTTCAACATCGTCTAAGGCTCACAAGTTCGAGAGAATGTTTAAACAAGAAATGGGAGGTGGTACGGGATCTCATATATACGACAATGTTTTTATGAATTCTATGGCACAAAAATACTCTTCCTCGTCTTCTTCTAACAGTGGTAATAATTTAGATTTGGGTGATGTTTGTTTGGTGCCCTCTTGTAAGAGAACTCGCCATTCTGCTGACATAACTTTGCACACGGTACCCAAACGTCCCGAGCAGTTAAAGAAATGGTGCCATAATTTAAAAATGGATTTGGAAAAATTACACAAAAGTGTTAGAATTTGTAGTGCCCATTTCGAAAAATATTGTATAGGTGGCTGTATGCGCCCCTTTGCCGTGCCTACTTTGGAACTGGGTCATGATGATCCCAATATCTATCGTAATCCTGATGTTATTAAGAAACTCAATATAAGAGAAACTTGTTGCGTACAATCCTGCAAAAGAAATCGTGATCGTGATCATGCCAATCTGCATAGATTCCCTACCCATCCAGAATTGTTGCAAAAATGGTGTGAGAATCTACAGAAACCCATACCAGATGGTACTAAACTTTTTAATGATGCTGTTTGCGAAGTTCATTTCGAAGACAGATGTTTGCGCAATAAACGTTTGGAGAAATGGGCCATACCCACTTTAAATTTGGGTTGGGATGATGCTCCTCACAATTTGCCTTCAGAGGAGGAAATAAATGAAAACTGGGTTAAACCTTTTGCACCCAATAATGGTGATGAACAGGGTGAATGCTGTGTAGCCTCCTGCAAACGTAATCCTCAAATTGATGATGTTAAATTGTACAGACCCCCTGAAGATGCCGAACAATTGGTTAAATGGGCTCATAACCTACAAGTGGATGTGGCAGAATTACCTAATCTTAAAATTTGTAATCTACACTTCGAACAGCATTGCATAGGCAAGAGGTTACTGAATTGGGCTATGCCCACCTTAAATTTGGGTGCTAAAGTGGAACATCTATTTGAAAATCCTCCTCCCATGCCGACTGTTTACAAAAAGAAAATCAAACCTGAAAGACTTTTATCCAATCAAGAAGCCATTAAATGGTCTCCAAGATGTTGTCTGCCTCATTGTCGTAAAATGCGTTCTTTGGACAAGGTACATCTGTTTCGTTTTCCCTATAATAATCGTCAAACTTTGGCCAAATGGTGTCACAATTTACAGCTACCCTTAGTGGGTTCCTCACATCGCCGTATATGTTCTTCGCACTTTGAATCTTCGGTCCTAACCAAACGTTGTCCCATGTCTTTGGCAGTACCCACTTTGGATTTGAATGCTCCTCCGGGTTATAAAATCTATCAAAATCCTGCCCGCTTAAAACAAATAAAACCAGGAGCTCAAAGACAATGTATTATAGAATCTTGCCGTAAGACTAAACTAGATGGTGTCTCTCTCTACCGCTTCCCTAATAATCGCTCTATTTTATATAAATGGCGTCATAATATTAAAAATTGGCCTAAAGGTAAATTAAGCTCTCAACTGAGAATTTGCGGAGAACATTTTGAACCTCATTCGGTGGGTGAGAAAAAACTATCACCCGGTGCCATACCTACTTTAAATCTGGGCCATGACTCTAAAGATTT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Protein Sequence
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