Basic Information

Gene Symbol
TRERF1
Assembly
GCA_932273785.1
Location
CAKNZW010000063.1:428079-444240[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 5.6e-10 5.5e-07 29.8 0.3 3 43 1583 1623 1583 1626 0.87

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTGTAGTGCGTCGGTGGGTACAGAAGCTTCGGTAACATTACAATTGCGCGATGTTAATTCCAATGACTCAATACAATCCAATCAATCATCATCAGAAGCAGCCGCGGCAGCAGCAACAATTATTACATCGCCAACAAATAATAACCATCATACAGCAGGCACAGGAACAACGACGACAACAACTTTGGATAATGCATTAACTATAGGTTATCCAGATCCAGAAATGTTGGCTGATGTTTTAGGTACATTACAAACAGCATCTCTTAAAAATACAAATCCCAGTGGTGAGAGTACAAAACAAAATTCCTCCaaactaacaaataccagcgatatttcaaataataatttaaatgttgctcgtagtataacaTCGTTGAGTCACGGTAGCCGAAAAGTTCCTGGTCCATTAACAACAAATCCACCGAAAATTTTAAAGAAAAGCCGTTCAAAAATATCATCACCCAGTCGTCACGGTCCACAGCAGTGTCAGATTTGTAATAAAATTTTTGGAAATGCATCAGCGCTGGCCAAACATAAACTGACACATAGTGATGAGCGGAAATATGTGTGTGTTATGTGCTCAAAGGCATTTAAGCGACAAGATCATTTAAATGGACATATGATGACACATAGAAATAAAAAACCATATGAATGTAAAGCTGAAGGTTGTGGCAAATCATATTGTGATGCTCGTTCATTAAGAAGACATACAGAAAATCATCACGCCGGTATTATAACACCACACAATCAACAACTCTCAATAAACAATAATAATTCCAATTCAAATTTAAGTTTATCACCAGCAACAGCAAATGGAGATGCCAGTTCACCAGATGGTGCCACCTGTTTAGGTACATATTTATCAAACGGTGGTACAGTGGTTGATGCAGCCACAGGTTTAGCTTTGACCGAAGAAGAATTTAAAGCCTTAAATATACCCCTTAAGACGGGAGTAACTTTATTATCACCCACATCTACTACATCTTCAATGTCCTCCTCCAGCAGTATGTCCAACGGTCCAGGAGCTACCATAACGCTTACCGATAATAGTGGTAATTTAGAGGGTGAAGGTTTGACAAGAGAACAATTGGATTTGATAAGTAAAATAATGAGACAAACTAAACAGACTACAGCTCAAGTGACAGTATCTTCGCCTACCAGTAGTCAATCGTATAAAATAGATACAAATCCCCCAGCTACGGCCCAGACACAAACACAAAATTCCCGACCCCGGACTTGGAATATGCAATTGTTGAATTCCTCTCAAAATGTAGCTATTACTGTTGATGAGGTCAATACGGATAATATCAATGATTCCTCTAACAATATTCAATCCAAAGTTAAAGAGGAAGAAATTGAAATTGATTTATCCAATGCCATCAATTCCAATCTTTTCAATTTAGTTAAAATTGATCAGAAACCTGTAGAGTGTAATTTATGTCATCGTAAATTTAAAAATGTACCCGCGCTAAATGGTCATATGCGTTTACATGGCGGCTATTTTAAAAAGGATCCAGAAACGAAAAAGAGTGAAAAGAAAGAAAATAGTGGTCCTCCTTTGCAGACCGCCAGTATAGGTGTAAGAGCCTTAATTGAAGAGAAAATAATAAGTAAAAGAAGCAAAGATTTAAATAAGGGTGCCTTTGTAGTCCCTGCACCGCCCTCGAATAGTACCCAAAATAATACCACTACCATACGTAGACCCATTAGTGATTTGGATAGTTTCCTTAATCCCAAGACACAACCAAATAGTGCAATTACTACAACAACAAATCAACAAAATTCCGCACAACAACAGCAGCAACAACAACAATTACCAGCGTCTAGCACCATTAAAAATAATCCCAAAACCAATATCAATGTACAAGATATAAACTTGCCACAAAGTATCGAAATATATAGTACTAAGCAACAACAACAACAGCATCAGCAGCAACAAAAGACAATGAATAATATAGGAGTGGGTACTACAACCGCCCCCTCCCTTAATGCCGAACGTAGTGCAACGAAAATAACTACTACAACAGCAGCAACGATTAATACAACGACAACACGAAGTACATCAACCGATCCAAAAGATTCAACGTTAATCGAATTATTAAAACGGGGTACACGCATTGCGGTAACCCAAAAACCGCCCAATAATAATACCCCTTTGGGTGGAGTAACCCGCCAGATTATAACAAATAAAAATAATTGTAGTGTCATTATACCCTCGGAAGTCCAGGTGGTATCGACAAAGGGAAAACTTAAAAAAGATGATCATATACAAATGTCAAATGCCACTAATGTTACCCTACCCGATGGCACTCCTTTATCTTTAACTATTGCACAAGGAGCGGATAGTAATAGTGAAGTGTATACGGTAACTTATACCAGTGATGGTTCGGCTTTATTTGGTGAAAATGAGGTTTATAATGTTAGTGAAGCCGAGATGTTGTTGCAAACTGTCGATACCATGCAGCTATTAAGTGATACTGGCAATAACTTAAAATCTGAACATTCCGAACAATTTGAGGTCATGGAAAGTAAAATTAAACTAGAAATTGAGCAGCAAAATTGTGTGGATCAACAGCAACAACACCAGCAGCAAAATCAACAGCAACAGCAAATGCAACAAAACTCAAATCAGTGCCAAACTACACAAACTTTACCAAACTTCCAACATTTCCATTCCAAAGAATTAATCATACAAAATCCAGCTTTGATCAATCACCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAAATTAGAACAAATACCTTGACCTTGCCACAAGATATGAAAAGTCAATTTTCCTCAAGCCTCAATTCACCCATACATTCTCCTCTAGCTTATCCCACACCTCCTTCCAGTCACGAAAATGTTACACAAACTTCTCCCTACATAGAGGACAATCATCATTTCAATGATACACCCAATATATTCTTTAGTGAGTCATTAATTTCCTCCAATAATACAGGAGAAAGTGATAATGACAAGATAATGAAATTAAAAAGTGTTCTTGAGGACAACTCATTTGATTCCAATATAAAGGTGGAAGATTTATTAAATGGCACAGATCCCGATACGGAATGTGATTTACGAGAATTTGCCGAAGCAAATCTTTCCTTCCTAGATGAAGATCAAGAATTTCTAAATGATTCTCGCAATGCCACCTCACCTTTATCGGAATCATTTTTCACAAGTGGCATAGGAACAGCCGAAGAGGTGAAAGAAGTGTTACGTGAAGTTTTAACCGAAGATCAACTAAATTTGAATTGTGAAAATCAAGGAGAAAATATTATAGATTTATATTATTTACCCGGTTTAAGTTTACAATCACAAATGATGCCCAATTCCGATGATCCCCTGTTGTCGTCTTCGCCCAGAGATTTTGGACAACAGCAAAAGTTGCAAAATCCAATGCCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAAACTCAGACACAACAACTGCAGCAGCAACAAACTCAAACACAACAAATCCAACACATTCCTCAACAACAAGAACAACAAAACCTAAATCAACAACACACTATACAATATAACAATCAACAGCAGCTTGCTCAACAAACTCAAACAGTTAAAATATCTTTGGATACTAATACACAAACTTCTACGGGTTCTACTACTTCCTCCTCAGAAATAAATCAATTGATTTTAAATATACCTTCAAACGTTATACAGAATTCCTGCAATCCAAATTCTGCTAATTCCTCTTCTTCCAATAATACAACTACAACTACTATACACTATAATGTACAAAATCTACCACAAGTACAAAATCAAactaataataatcacctacagcaagaacaacagcagccgcagcaaacacttcatatgcagcatcagcagcagacacagcaacaacatcaacagtcacaacagTTTTTAAATTCCACAAGTATAAACTCACTTAATGAGGCCTTAATGCAGCCTATAATCTACACTAGTGGTACCACCGATAAAATGGAAATCAAATTAGACAACAACCCTAATTCCAATAACACCCCACAATTGCAAAATATTATTAATCTTAATAAACCTTTGGAAATTGTAAAAAGTACTTCCTCTAGCCATATAATATTTCCGCCACAAAATTTTTCTTCAAATTCCATTTCCTCGAATTCATCTGTAAGCACTACTCTGCAGCCACTGTCAAATCAAACCAATTCTATTTTAAAAAGACGTTTAAAAGGTCATTCCTCTTTGGATTCTTCCTCATCACATTCTTCTTTTTCTAAATATCAAGCTTTATCACCCTACAAATCAAAACTGCGCAAACCTTCACGTACCCACTATACGCCAGCTCCTATATTGAATCCTGAACGTAAAGGTCATGGCTTATACTGTAATGTTTTGAAACAATTGGGTTGTTCATTGCTGAGCTTTGATAATTTTGATGATGATTTTGATGATCCAGTGGGTTTGGTTGACTTCTCTGATGAGTCTAAGGTCAATTTAGGTTCAGCTTATCAAGCTGCTATTCCTGCATTTAATGAAGTAGCCTGTTCAGAGGGTGGTGGTGCTGCTGTAGAGGAAACGATTGGTTGTGATCTTATGTGGAATCCGGAAGTGCAAAGGGATGATAAGATTTTAATGAGATTTATTGATTTAAGCAAATCTTCAGCCGTGCCCTTGGGTAGTCATTCCGAGGAGGTGGCCTTGGAGGCCTTGCTGAAGGCCCAGGGTAATACGGCATCAGCTGTTTTGAGTTTGTTACAAACCCAATCGAACTCATTCCAAATAAAGTGGTCATCGCAGGAGTTGGAGATATTTTTGAAGGGTTTGGAAAAGCACGGGAAGGAGTTTAGTAAAATATCAAAAGAGCTCGGTTCCAAAAAAACTGGTGAATGTGTACAAATGTATTATTTCTGGAAGAAATTATGTGTGGACTACAAGGTAACCCACCTAAAAACCGAAACACCACCACAAAATCATGCCAATGATCCCAAACCTTATGTATGCGAAATACCCGATTGTTCAGCGAGCTTTTCTTCTAAAGCAGCTCTGCATGGTCATACACGCATCCATACTTATGGGCGTAATTCCCACAATAATCAACACAATAATAATAACAATACAAATGCAACAGCAACTAATACCAATGCAAATTCCTCGCAAGGTTCTGCTATTAATAATAATAATAATCATTCCATGCATAGTAGTACCCAGTCTAGTCATGCCAACACGGCGAATCCAAATCAAAAAGATACCAATGCCAATAAAGACAATACCGAATTTCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAAGTATTCAATAAAATTAAAAGTCGTAGTGCCCATATGAAGACCCATCGTGCAACAGATAATGAAACAACTGTACAAATTACAAATAATCAAAATCAAATAATACAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAAACACAACAATTATAA
Protein Sequence
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Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_01374452;
90% Identity
iTF_01259519;
80% Identity
iTF_01259519;