Basic Information

Insect: Proctacanthus coquilletti
Gene Symbol: zfh2
Assembly: GCA_001932985.1
Location: MNCL01000238.1:124639-156682[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 16 0.54 67 4.8 0.6 2 23 429 451 428 451 0.94

2 16 0.00021 0.026 15.5 1.4 2 23 803 825 802 825 0.96

3 16 5.2e-05 0.0064 17.4 0.7 1 23 857 881 857 881 0.92

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9 16 0.0025 0.31 12.1 2.3 1 23 1748 1770 1748 1770 0.96

10 16 0.00019 0.024 15.6 2.1 2 23 1777 1799 1776 1799 0.94

11 16 0.031 3.9 8.7 5.4 1 23 1900 1924 1900 1924 0.94

12 16 0.018 2.2 9.4 0.6 1 22 1945 1966 1945 1969 0.89

13 16 0.008 0.99 10.5 0.1 1 23 2049 2073 2049 2073 0.93

14 16 1.5 1.8e+02 3.4 4.0 1 19 2181 2199 2181 2204 0.91

15 16 0.00012 0.015 16.2 2.8 1 23 2885 2907 2885 2907 0.98

16 16 0.00097 0.12 13.4 0.8 1 23 3055 3077 3055 3077 0.98

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
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Sequence Information

Coding Sequence: 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