Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_001932985.1
Location
MNCL01000312.1:43729-53772[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 4.8e-24 1.6e-20 73.8 0.0 2 89 495 578 494 578 0.95
2 2 6.8 2.3e+04 -3.6 0.0 54 65 1369 1379 1365 1388 0.70

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGTACATAAACTAGAAAGACAGTATTTAGGCGATTTTACTGCTGTAAGTGATATTAGTGAttgtgggaaaaaaataacaaggaAAACGAATAAATTACGACGTTCTTGCGATCAAGATTACAACAATAGGGCTCGTATTACAAAAGAGCTACTGATTGGGGGTGGTAACGATGGAAATGGtagtaataataacaacaataaacgTCGACGATCGAGTAGTACAGATGttgatgattttgaaaaattctgcacaaatttcaatcaaaGTGGAACAACAATAGGTTTAAAATTGGGAAATTCAACAGCATCAGCttcatcaacaacaacaacaacaatatcaCAAACATCAAAGGGTAATAGTACGACGATACCgtgcaataataaaagtgaactTTTTGGTataacatcatcatcatctaaTACATCGGGTAGTGATAATTGTGAAGTGTTTAAAAGACCCCAAAGGGTAAGACGAAGGACAACAGCATTGGGGGTAGGTGGgtcatcgtcgtcatcatcatcatcatcatcattacaACATGAAGAACAATCTGGTTCATCATCGATCCCATATGTTTCAACAATAACATCAGGACAACAAAATGATTTAAGTTCAAAAAGTGATAGTGATTTAACGATTATTTCAATATCTGGAGGAGGAAAATTATCGAacgttataaataataaaataactacagGTATTATAAGtgaaacaataacaacaactaGAGAAACTAGAGCCAAAACgattaattatgataaaaatattatgtccGGTTGTAATCAACCAAATTCTGTGATCGATAATCCATTGATATCAACAATATCTGGATCATCGTCTGCATCTACATCcgtatcatcatcatcaggaACAACAATACTCCCACCATTATCACCACCACAacccttaaatattttgggcacaagaaaatttaatgaacattacaataataataataataaacaacaaaatgtaTCACCAAAAAAATCAGCCTTAAATAATAcgaataacaacaacaacaataattgTCCTATAGTGACTAATAATGGAACAGGTAGTACAACAATTACGACAGCTGGTAACACTTCCAGTGGATATGCGGGTAATACAACAACGGGTAATAACCAAAGGGGTCATCAGCAGAgccagcaacaacaacaacaaaatcacAATACTACCAATCCGCCTACCGGTGGTAGCCATAATTATTGTCATACGACTACCACATTCTCTCTTGATAAAAATGAAGAGTTCCATTTTGTAAAACCCCCCGAATGTCCCGTCTTTAAACCTAATGATGAAGAGTTCAAAAATCCTCTCGCTTATATTAGTAAAATACGACCAATTGCAGAAAAGTATGGAATATGTAAGATAAAGCCACCAAAGACATGGACACCACCATTTACTGTCGATGTGGATAAATTACGATTTACACCACGTGTCCAACGTTTAAATGAATTAGAAGCTAAAACacgtgtaaaattaaattttttggatcaAATTGCTAAATTTTGGGAATTACAAGGttcatcattaaaaattccaatggTAGAAAGAAAGGCCCTAGATTTATATACATTACATCGTATTGTACAAGATGAGGGTGGTATGGAATTGGCAACAAAAGATCGTAAATGGTCTAAAATAGCACAACGTATGGGTTATCCAGCTGGTAAAAGTATCGGTACAATACTTAAAGGGCATTATGAACGTATATTAAATCcatttgatatatttacaTCCGGTAAAGCTGTTGatctaaaattagaaacagaAAGTGATGATCAAGATTATAAACCCCATGGTATTGTATCTAGACAACAGATAACACCCCCGAATGAGACAACAGCTAGAAGATCAAAACGTTTTGCTAATAGTAATGCATCATGTGGTTTAGGTACTGctattaaatgtgaaaaagatataaaaaaagaaaaagatgaTGAAGATTATGGTCGTATTCATTATTATGGTTCTAGATCAAAAATATCTAGCGGTTATgctacaacaacaacaacatcgGGAAGGAGTGGAAGATCCCGAATGATGGCAAATATTAATAcgattaatagtaataataataataagaaaaaatcaaaagaaattgatcCATTGGCTAAATATATATGCCATATTTGTAATCGTGGTGATGCTGAAGAGGCTATGCTCTTATGCGATGGATGTGATGATAGTTATCATACATTCTGTTTAATGCCACCACTTAATGATATACCAAAAGGTGATTGGAGATGTCCAAAATGTGTTGTTGAAGAAGTTAGTAAACCACAAGAAGCATTCGGTTTTGAACAAGCATCCCGTGAATATACTTTACAACAATTTGGTGAAATGGCTGATCAATTTAAAgcagattattttaatatgtctGTTCATTTAGTACCAACAGATTTAGTTGAAAGAGAATTTTGGCGTATTGTATCATCAATTGATGAAGATGTAACTGTAGAATATGGTGCAGATTTACATACAATGGATCATGGTTCTGGTTTtccaacaaaaaattcattatatttattaccaGGGGATCAAGAATATGCTGAATCATCATGGAATCTCAATAATCTTCCATTATTAGAAGAATCAATATTAGGTCATATAAATGCTGATATAAGTGGAATGAAAGTACCATGGATGTATGTTGGAATGTGTTTTGCAACATTCTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaattaattatatgcATTGGGGTGAAGCTAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTAATAAAGCTGAAGCATTTGAAGCTACTATGAAAAGTGCAGCACCAGAATTATTTCAATCACAACCAGATTTATTACATCAATTGGTTACTATTATGAATCCAAATATTCTTATGAATTCTGGTGTACCAGTTTATAGAACAGATCAACATGCTGGAGAATTTGTTATAACATTCCCTAGAGCATATCATGCTGGATTTAATCAAGGTTATAATTTTGCTGAAGCTGTTAATTTTGCTCCAGCTGATTGgatGAAAATGGGTCGTGAATGTATAAATCATTATTCAACCCTTAGACGTTTCTGTGTTTTTTCACATGATGAACTTGTTTGTAAAATGGCCCTTGATCCGGACCGTTTAAATTTGGGTATAGCAACTGCTTGTTATTTAGATATGGCTGAAATGGTCGATTCCGAAAAGAAATTACGTAAATCTCTTCTAGAATGGgGTGTCACACAGGCAGAACGTGAACCATTCGAATTAATACCTGATGATGAACGACAGTGTGATTCTTGTAAGACTACATGCTTTTTATCGGCTGTTGCATGCTCTTGCACACAGGCGATTGTGTGCCTTCGACACTATACAGAATTATGTGAGTGTCCATCAGAAAAGCATATACTTAAATATCGTTATACATTAGATGAGCTACCATTaatgctaaaaaaattaaaagttaaagcagaaagttttgaaaattggttATCTAAAGTACGTGATGTACTTGATCCTAATACACCAACAACAATAACACTTGAAGAATTACAAGATTTAGCACAAGAGgctgatgaaaaaaaatttccaagttCTGTATTATTAGAACGTTTAAATTCTGCTGTATTAGAAGCAGAAAAATGTGTTACAGTTATACAACAATtggatattaataaaatgcgtACACGTacaagaaattcaaatgaatcagctaaatataaattaacattagATGAACTTGAATTATTTGTACAAGAAATTGATAATCTTTGTTGTATTATACAAGAAGGACAAAGTGTAAGAGAATTACGTACATTGGGTAAAGAATTTGTTGAATCagcaaaattacaattatcaaAACCGATTAATAAAGCTgatgaaaaatcaattgaacGTTTAATTGAAGAAGGTAGCTCTTTATGTATTGAATTACATGaaattaaagcattaaaaGATCGTTTACTTCAAGTTAATTGGTATAATCgtgtaaaacaatttcgaaattcgaatgAAAAGAAACCAATACAAGATATTAAAGCTCTTATTAAAGAGGGTCTCAGTATTACACCGGATacaatattagaaaaacaattagtAATActacaagaaattattttatctgtaGAAGAATGGGAACAGGTtgcagaaaaatgttttaaaagtagtacACAACATGAATTAcctgaaattgaattattattagaacGTGCTGAAGAAATTCAAGGTATATTACCAAgtcaacaaatattaaaagatgcATTAAAAAAGGCCAAAGAATGGTTaacaattgttgaaaatttacaatcaaATGAAACATACCCATATTTTCATACATTAGAAAATGTTGTTAATCGTGGTAAAAATATACCATTTCAATTAGAAGAACTTAAAAGAATGGAAGATCATTTAAATGCAGCAAGATTATGGAAAGAACGTACATCacgtacatttttaaaaaaagaaacaacattTACATTAATGGATGTATTATCACCACGTTCAGATGCTGTAATGTTAGGTTctaaattacgtaaaaaatcTCTTGAAGATCAATTTACTGAAGATACTGGTCCAGCACAAATggtaaatgcatttaaaaatgctgaagaaaaagaattacgTGAAATGCGTGATTtaagacaattaaatttatcaaaaaatccCCAAGAAGATAAATATTGTATATGTAAACGTAAATTTCAAGGGCATATGTATCATTGTCAATTATGTAAAGATTGGTTCCATGATAATTGTGTCCCACCACCAAAAAATACGGTACGTCCACGTTCATCGAATACGGCTACACCATCTGGTACAACTTTTGTACCACAATTAAATGTACGTGAAAAAGATCgtgaatcaaaatatttatgccaATCATGTATGAGATCTCGCCGGCCACGTCTAGAAACAATCCTATCATTATTAGTTTCTTTACAACGTTTACCTATACGACTACCTGAAGGTGAGGCATTACAATGTTTAACCGAAAGGGCTATGAATTGGCAAGATAGAGCTAGACA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Protein Sequence
MVHKLERQYLGDFTAVSDISDCGKKITRKTNKLRRSCDQDYNNRARITKELLIGGGNDGNGSNNNNNKRRRSSSTDVDDFEKFCTNFNQSGTTIGLKLGNSTASASSTTTTTISQTSKGNSTTIPCNNKSELFGITSSSSNTSGSDNCEVFKRPQRVRRRTTALGVGGSSSSSSSSSSLQHEEQSGSSSIPYVSTITSGQQNDLSSKSDSDLTIISISGGGKLSNVINNKITTGIISETITTTRETRAKTINYDKNIMSGCNQPNSVIDNPLISTISGSSSASTSVSSSSGTTILPPLSPPQPLNILGTRKFNEHYNNNNNKQQNVSPKKSALNNTNNNNNNNCPIVTNNGTGSTTITTAGNTSSGYAGNTTTGNNQRGHQQSQQQQQQNHNTTNPPTGGSHNYCHTTTTFSLDKNEEFHFVKPPECPVFKPNDEEFKNPLAYISKIRPIAEKYGICKIKPPKTWTPPFTVDVDKLRFTPRVQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPMVERKALDLYTLHRIVQDEGGMELATKDRKWSKIAQRMGYPAGKSIGTILKGHYERILNPFDIFTSGKAVDLKLETESDDQDYKPHGIVSRQQITPPNETTARRSKRFANSNASCGLGTAIKCEKDIKKEKDDEDYGRIHYYGSRSKISSGYATTTTTSGRSGRSRMMANINTINSNNNNKKKSKEIDPLAKYICHICNRGDAEEAMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLNDIPKGDWRCPKCVVEEVSKPQEAFGFEQASREYTLQQFGEMADQFKADYFNMSVHLVPTDLVEREFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKNSLYLLPGDQEYAESSWNLNNLPLLEESILGHINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYMHWGEAKTWYGVPGNKAEAFEATMKSAAPELFQSQPDLLHQLVTIMNPNILMNSGVPVYRTDQHAGEFVITFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWMKMGRECINHYSTLRRFCVFSHDELVCKMALDPDRLNLGIATACYLDMAEMVDSEKKLRKSLLEWGVTQAEREPFELIPDDERQCDSCKTTCFLSAVACSCTQAIVCLRHYTELCECPSEKHILKYRYTLDELPLMLKKLKVKAESFENWLSKVRDVLDPNTPTTITLEELQDLAQEADEKKFPSSVLLERLNSAVLEAEKCVTVIQQLDINKMRTRTRNSNESAKYKLTLDELELFVQEIDNLCCIIQEGQSVRELRTLGKEFVESAKLQLSKPINKADEKSIERLIEEGSSLCIELHEIKALKDRLLQVNWYNRVKQFRNSNEKKPIQDIKALIKEGLSITPDTILEKQLVILQEIILSVEEWEQVAEKCFKSSTQHELPEIELLLERAEEIQGILPSQQILKDALKKAKEWLTIVENLQSNETYPYFHTLENVVNRGKNIPFQLEELKRMEDHLNAARLWKERTSRTFLKKETTFTLMDVLSPRSDAVMLGSKLRKKSLEDQFTEDTGPAQMVNAFKNAEEKELREMRDLRQLNLSKNPQEDKYCICKRKFQGHMYHCQLCKDWFHDNCVPPPKNTVRPRSSNTATPSGTTFVPQLNVREKDRESKYLCQSCMRSRRPRLETILSLLVSLQRLPIRLPEGEALQCLTERAMNWQDRARQAFATEDVASALAALSIISQKMTDSMAAGGGVGSGGGAGGGCSNNGGGSGTGGRGDKILSDIIRKGGTKSPQKWRSQTSEDDGPATSSEDEEFRSLQINEDVASGGDSSPSSPTKIEHAYSVPPLSASTISGYGKVSSPVHKSDMPLIQLSKTTRETLEDLMMEGDLLEVSLDETLHIWRILNAAKPSVSDLAYIQYRYNIVSSSNDALVNNVKKRRSDESGGPQAKRSSKVSTTTATTTTTTTVTVGSSEKSPTKMKRGRKMKLVAKNNDHSSSTVGVVGENKKRKRGKKIQQQQQQQQQQEQTVTTASTSDDDEECSAVSCARPSGREVDWVQCDGWCNKWFHMFCVGLDKHSIKPDDDYICKRCKKSSPNSGKETVSSPPPPVTTSAQSPLRSGLGGGTGGGGGGAGGGGGGGAGGGGGGETVSSSLSTTRLDSTVTSTTPTKGSSSPLNTSPMSPPIATSTTISTVSADTITTKMDGSSSPTASGVAGYGSESEPGSPRLPTSSSTTTKS

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
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