Pcha015240.1
Basic Information
- Insect
- Pogonus chalceus
- Gene Symbol
- mysm1
- Assembly
- GCA_002278615.1
- Location
- NEEE01004403.1:18243-21150[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 2.6e-07 0.00028 21.2 0.0 4 44 103 143 100 145 0.94 2 2 3.3 3.6e+03 -1.6 0.1 33 44 419 430 415 432 0.82
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCGGACGAAGACGAAATTGACGTTTTAGGTGACTTCTCTTTAGACAATTTGTTATCTAAGAATGAATCGGGAATATCGTCATGTTACgataattcagttttaaattcacaaaattcTGAGTTATTAAGTTGTGATTATTCGTTAAACTCTCAGTGGTTGCTAGAGAACCCAACTTCAAATACTGATTGTTGGTACACCGGTTCAGGTAATGATTTCAATACAGAAGATGGTAATTCTACAAATACAAGTTTAGGTTTTGATGAAGTGATTTGTTCGGAAAATAAAACTACTGATGAATCTGGTTGGACAGAGGAAGAAAAATCATCGTTGCTTAAAGGCTTGgaaATATTTGGTAAAAACTCGACTAATTTGTCCCAATTTATTGgatcaaaaactccgactcaagttaaatattatttaaaacattattacacgaaaaatgtttttagtaatatttataatactgttgaaataaatactaaacaaGCTAATAACGTTGATTCTAACTCTGGAGTTACTACGGTATTCCAGATGGGTGATATTATAGAAGATGCACAGATTCCAGCGTCGATAGAAGAAGTAATTGCAGCTGTAAGTACAGCAACGCCTACTATTcaaaatatctacaaaaaacctattaacaacaaaaagaaaattaatattaaaaatagtcccttaaaaaaattaaaacgtcAACAATCGCtattaaataactttcatAGAAAACAAACAGTTCGccctaatttttcattaaaaacacatAAAGTTGCTGAAAGAAAACGACTTAAATCAGATCGAAGTATTCTTAAATCTAATGATGAAACAACTTCAGTAAAAGTACCACCAGCTGTTTTACCTATTTCATCAGGCGAAGAAgttattaaaataaaaaaagaaactgaCTCAGAGTCGGACACAGAAATTGATATAGATATTGATGaagatgttaaaaatattcctaaaatagaaaataaattacaaacagaaataaatgattcatttattaaaaatgaagaaattgtaattaaagaagaaataaaaaatatacctaaagaaaataaagatgttactaatgaaatattaaatcgtcgattaaaaagtattagtgaaagtgttttaaaaattttaacaagcaACGATATTCCAAATAAAGAATGTATTCttgaagaaaatgaaataactgAAGTAGAAAAATGCATTCACGCGGAGTTTTTTGAAGGAAGAGTTACGAAAACACCTAGTCGatatttaaagaTAAGAAACCATATAATTGATTATTGGTTGGATAATAAACCACAGTATTGTACAAAAACTTCTGTTAGACaaggtttaaaaaattgtggTGATGTTAATTGCATTGGACGTATACATCAATATTTGGAACAAATTGGCGCTATAAATTTTGGCTGTGaacAAACTAATTATATACGACCGTTAATGAATATGATAACAGCAGTTGCACAGCCGAAAGAAAAATCTGCACCCCTTCCACCCCCGAAATTAGAAACAGTTCGACCTCGgatgaagaaaaaatataataatgatGGCGAAGGTGGTTATACAATGATGCATGATGAAAATGGTGAAATTATTGATACAACTGTTGTAAATCAGGATAAACAATCAAAACCGCGGAATAGacgacaaaatataaaattagtttattgtaAAGGTTTTACGGACGAAAATCcgGCGCCCTATTCCGTAACTATGCATTTAAgtgctttattattaattgacatGCATGCCCATTCAGCTTTAATTGAAGTAATGGGTTTATTAGGTGGATATTATGACCatgaaaatcaaatattacatattacacAATATAAACCATGTTTAGGTACCGATCATAGTAATACACATTGTGATATGTGTCCAGtttCTCAAAGCGAAGCATCTGAGGCGCTTCACGCCGAAGGTGTTGAAGTGATCGGTTGGTTTCATTCGCACCCGACATTTTATCCAAACCCTTCGCTACAAGATATCGACACTCAATTAAATATGcagttatatttaagtaataaatacaaaccgTTTGTTGGGGTTATTTTATCGCCGTTTCGTGCATTAGCAACCGCGTTAGTTTCTGAATACCGGTGtttaattgttgataaaaatgaaCCTACTAAAGATGGAATCGGGGCTCcgtataaatttcaaacaaacttAGCGTCGTGTGATTTTaatgttgatttatttttgaagtttgcTAGTGATATGTTTTCagcgaaaaataatataccgaaagaatttattgttgattttaataaaccgTATTTTCAAGATACATCGANTCGACTTaagtaa
- Protein Sequence
- MADEDEIDVLGDFSLDNLLSKNESGISSCYDNSVLNSQNSELLSCDYSLNSQWLLENPTSNTDCWYTGSGNDFNTEDGNSTNTSLGFDEVICSENKTTDESGWTEEEKSSLLKGLEIFGKNSTNLSQFIGSKTPTQVKYYLKHYYTKNVFSNIYNTVEINTKQANNVDSNSGVTTVFQMGDIIEDAQIPASIEEVIAAVSTATPTIQNIYKKPINNKKKINIKNSPLKKLKRQQSLLNNFHRKQTVRPNFSLKTHKVAERKRLKSDRSILKSNDETTSVKVPPAVLPISSGEEVIKIKKETDSESDTEIDIDIDEDVKNIPKIENKLQTEINDSFIKNEEIVIKEEIKNIPKENKDVTNEILNRRLKSISESVLKILTSNDIPNKECILEENEITEVEKCIHAEFFEGRVTKTPSRYLKIRNHIIDYWLDNKPQYCTKTSVRQGLKNCGDVNCIGRIHQYLEQIGAINFGCEQTNYIRPLMNMITAVAQPKEKSAPLPPPKLETVRPRMKKKYNNDGEGGYTMMHDENGEIIDTTVVNQDKQSKPRNRRQNIKLVYCKGFTDENPAPYSVTMHLSALLLIDMHAHSALIEVMGLLGGYYDHENQILHITQYKPCLGTDHSNTHCDMCPVSQSEASEALHAEGVEVIGWFHSHPTFYPNPSLQDIDTQLNMQLYLSNKYKPFVGVILSPFRALATALVSEYRCLIVDKNEPTKDGIGAPYKFQTNLASCDFNVDLFLKFASDMFSAKNNIPKEFIVDFNKPYFQDTSXRLK
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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