Pnob055525.1
Basic Information
- Insect
- Poecilobothrus nobilitatus
- Gene Symbol
- Zmiz1_1
- Assembly
- GCA_947095535.1
- Location
- OX352774.1:64929747-64934174[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-MIZ
- Domain
- zf-MIZ domain
- PFAM
- PF02891
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 0.39 1.3e+04 -2.1 0.9 4 24 622 642 619 646 0.86 2 2 2.5e-24 8.7e-20 72.1 3.8 1 49 705 753 705 754 0.97
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGAATGCTCAGGGCGGCTCTTCCAGGGCTCCAGCCTTAGAGAGCCAATTATCACCCCAAGGAGCATATTTatcaccttctaattcatcatatgatacaggattacttcatcatcaacaacaacagcaacaacaacatcaacaacaatttcatcataataataattttgaagaaaattataataacagtaataataatattaattttaatgggaattatggtggaaattataataatagtgacagtTTAAATAGTTTAAAAAATTCATTTGGGCCAAATTCTGAATTTACATCAAATATTAATTGTGATACAAGTAATAATTTATTAGGTACGAATAATAGCAATACTAATAATTTAAATACTGGTGGTAATAATAATTATCATCAGCCAAGTGGTTTAATGAATGGAAACATGGTAGCTGCGACTGGTACACAACAAACCATGGATGGAATGAGTTTTAATTCACAAATGACCAATATGCCAATGCATACTGGTGCAAATACCAATAATAATGGCATGGGAAGCCATCATCCTCATCAATATATAAATGGAATGAATAGTATGGGATCAAATAGTATGAATGCAAATACAGGAATGAGTAATATGAATAGCATAAATGCAATGTCACCAAATGGTATTGGTCCTATGACCAATATGAATGGAATGCAAAATAATGGTATGAGTGGTATAAATACTAATCAAATGATGAGTGGAAATGGTGGTAATGGAATGCAAATGAGTCACATGAACAGTATGAACTATAATATGGCAAGACATCATAATATGTCTCCAATGAATCAAATGCAAAATATGACCATGGGAATGGGTCCTATGGGTCCGAATCCAATGGGAAGTGGTAGTAGTATGGCACAACATCATCCTTCAATGGCAGTTCATCATCATCATCAACAGCAAATGAATGCAATGAATCCTATGGCTAAAATGCAAGGTATGGCTAACGGAGGTTATCCACAACAAAGACGAATAGCTCCTTATCCAAATCCACAAATGCATGCAGCACAAAAACGACATGCAGCAGCTGCAGCTGCTGCAGTTGCGAACATGCATCCAAGTATGGCAAACTATCAAAATCCTAATGTTCCTCCTCATGCAGCACCACAACAACATCCCGGGCAAATGCAATTTTCTCATCATCAGTCAGCGAATGGTGTTCCAGTTCCTATGCAACCATCTGGTTATGGTCGATCAATGCCGATTAATCCATATGCTGGTAGTAGAGCCGGTGCAATGGGTACTGCTGGAATGGGTGGAGCTATGGGGGGTAATGCCAGTATGATGGGTCCTCAACAAAGGCAAACAACACCACCATATACAAACCCAATGCAACATCAACCATTTTATGCTGGCGGTAATGTTAATCCAACTAGCAATAATGGCATGGTTAGCAGTAGCTATTCTAACGCTCAAGGTTTCCAACAAGATGTACGAATGAATATGAACACCTATCAACATAGCCCAGTTCCAGGAAATCCTACACCACCTTTAACACCTGCTTGTTCAATTCCTTATGTTAGTCCTAATCCAGATATTAAGCCACAAATCGATCACAATGAAGAAATGCGATTGACTTTCCCAGTACGAGATGGTATTATATTGGCACCTTTCAGATTATTACATAATTTATCAGTTAGCAATCATGTATTCAATTTAAAAACAACTGTTTATAATACATTAATGAGCAGGAGTGATCTTGAACTTCAATTAAAATGCTTCCATCAAGAAGATCGACAAATGAATACAAATTGGCCACATACAGTAACGGTTTCTGCAAACGCTACGCCTTTAGTTATAGAAAGATCAGAAAAAACTGGTCAAGCGCTTCGGCCTCTCTACTTAAAGCAAGTTTGCCAGCCAGGACGTAATACTTTACAGTTAACGGCCAGTTCTTGCTGTTGTTCTCATTTATTCGTCCTACAATTAGTTCATCGTCCATCTGTGAGGCAAGTTTTAAATAGTTTGCATAGACGAAATTTACTGCCAGTTGAACATAGTGTTGCCAAAATTAAAAGATATTTTGCAATGGGTCTAGCTGGACAACAAAGTTCACCTACAGCTGATGTTCCATCAACCGCAAATCCAGAATTTATTAAAATATCACTTAAATGTCCAATTACAAAGAATCGAATACGACTCCCAGCTCGTGGACATGAATGTAAACATATTCAGTGTTTTGATTTGGAAAGTTATTTATTATTAAATTGTGAACGAGGCAGTTGGAGATGCCCGGAATGCAGTAATCCAGCGTTAACTGAAGGTTTAGAAATTGATCAATATATGTGGGCAATTTTAAATAGTCAGTCTTTAGATGTTGATGAAGTGACGATAGATCAATTTGCAAATTGGCAAAAAATAATGAAAAATGTTCCTGGACAAATGCATCAACAACAACAACAACAGCATTTACAACAAAGTGGAAATATGCAAGGTAATGCAAATGCTGTGAATGAAGGAAATGTTAATGGAAATAATTTACCACAAATAAAACAAGAAAATCCTGAAGTTGATGATTTGAAAAATTTAGCTAAAGTTATGTCGCCAGGATCAACTGCATTACCAACATGGGATAATTCTCAAGCAATGAGTCCATACATGTGTCACGATATGAACTCAATTGCAAGTGGCAATATGATGGGAGGTTGCAACAATTCTCGAAATTCATATGATTCATTTGGTACTGTTAATCAGAACGATAACAATTCTGCAACAGATTCATTATCACATCTGAATGATTCAGTAAATTCTTTGGATCCATTGAATGCTATGGAAAAATCATTAAATGATCAAATGCCTCATACACCTCATACACCACATACACCAGGAGGAAATTCTAGTCATCCTTTAACACCAGGTGGACCACCAAGTGTTAGTTCAGCGCacaatgaaaatattggcaatccaaattccaataataataataataatacaacaaataataataacagtaataacagtaaaaataatcaaaataataataacagtaataatggtaaccagaatagccaaaatagtaatagttgccataattcacctcaacatcaacaacaacatcaaaatcatccttctccagtaaacaatacaaatagtaatgggagtagtaatcaacaaaatagtcagcaacaatcacaacaacaacaacaacaacaacatcatcaacaacagcaacagcaacaacaacaacaaaatcaatgtacatcatctacgccaaacaaaaataatgttaataataataacaataatacaaataatagtaataatagtaatattgataacagtagtattagtacacaacaacaacatcaaattattaattcacttattaattcacaaaATGATAATTTAATTAATTTAAATGATACTGATTTAAATGCCGATTTAAATTTTGATCCTACAGCTGTTATTGATAGTGATCCAACAAATGATTTAAATTTATTATCAGATAGTGTAGTTGATCCAATGGAAATATTAAATTATTTAGATCCTCAACCAGATTTAAATACACCACCATCAAGTGGTTCAAGTAATAATCCAAATCAAGATGATATATTAGCATCATTATTTGATTGA
- Protein Sequence
- MNAQGGSSRAPALESQLSPQGAYLSPSNSSYDTGLLHHQQQQQQQHQQQFHHNNNFEENYNNSNNNINFNGNYGGNYNNSDSLNSLKNSFGPNSEFTSNINCDTSNNLLGTNNSNTNNLNTGGNNNYHQPSGLMNGNMVAATGTQQTMDGMSFNSQMTNMPMHTGANTNNNGMGSHHPHQYINGMNSMGSNSMNANTGMSNMNSINAMSPNGIGPMTNMNGMQNNGMSGINTNQMMSGNGGNGMQMSHMNSMNYNMARHHNMSPMNQMQNMTMGMGPMGPNPMGSGSSMAQHHPSMAVHHHHQQQMNAMNPMAKMQGMANGGYPQQRRIAPYPNPQMHAAQKRHAAAAAAAVANMHPSMANYQNPNVPPHAAPQQHPGQMQFSHHQSANGVPVPMQPSGYGRSMPINPYAGSRAGAMGTAGMGGAMGGNASMMGPQQRQTTPPYTNPMQHQPFYAGGNVNPTSNNGMVSSSYSNAQGFQQDVRMNMNTYQHSPVPGNPTPPLTPACSIPYVSPNPDIKPQIDHNEEMRLTFPVRDGIILAPFRLLHNLSVSNHVFNLKTTVYNTLMSRSDLELQLKCFHQEDRQMNTNWPHTVTVSANATPLVIERSEKTGQALRPLYLKQVCQPGRNTLQLTASSCCCSHLFVLQLVHRPSVRQVLNSLHRRNLLPVEHSVAKIKRYFAMGLAGQQSSPTADVPSTANPEFIKISLKCPITKNRIRLPARGHECKHIQCFDLESYLLLNCERGSWRCPECSNPALTEGLEIDQYMWAILNSQSLDVDEVTIDQFANWQKIMKNVPGQMHQQQQQQHLQQSGNMQGNANAVNEGNVNGNNLPQIKQENPEVDDLKNLAKVMSPGSTALPTWDNSQAMSPYMCHDMNSIASGNMMGGCNNSRNSYDSFGTVNQNDNNSATDSLSHLNDSVNSLDPLNAMEKSLNDQMPHTPHTPHTPGGNSSHPLTPGGPPSVSSAHNENIGNPNSNNNNNNTTNNNNSNNSKNNQNNNNSNNGNQNSQNSNSCHNSPQHQQQHQNHPSPVNNTNSNGSSNQQNSQQQSQQQQQQQHHQQQQQQQQQQNQCTSSTPNKNNVNNNNNNTNNSNNSNIDNSSISTQQQHQIINSLINSQNDNLINLNDTDLNADLNFDPTAVIDSDPTNDLNLLSDSVVDPMEILNYLDPQPDLNTPPSSGSSNNPNQDDILASLFD
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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