Pnob003143.1
Basic Information
- Insect
- Poecilobothrus nobilitatus
- Gene Symbol
- MYT1L_1
- Assembly
- GCA_947095535.1
- Location
- OX352772.1:77886998-77925755[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2HC
- Domain
- zf-C2HC domain
- PFAM
- PF01530
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This is a DNA binding zinc finger domain.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 5 1.2e-15 4e-11 44.6 7.2 1 27 427 453 427 455 0.98 2 5 6.5e-17 2.3e-12 48.6 6.2 1 29 471 499 471 499 0.96 3 5 6.4e-19 2.2e-14 55.1 8.3 1 29 1289 1317 1289 1317 0.98 4 5 1e-16 3.7e-12 48.0 6.0 1 29 1334 1362 1334 1362 0.97 5 5 6.1e-18 2.1e-13 51.9 6.5 1 29 1395 1423 1395 1423 0.97
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCATTATCAAAACGTCCACCTTCAAAAGATAATATTTTAGATACAGTAAAATCTGAGGGAGATGATATAACATTAAAACGTAGAAAGCTTTGCTCAAATCGTGACGAAGATTTTACTTTTAAAACATTTGATGATAAAAATATTACATTACCTCAAAAAAAACGTTCAATTGTTACTTCAAATTGTATACTAGTAAATAGTAAAATTACACCAACATTAAATAATAATAATTCAATTACTAATTTTAATAGTAACAATAATAATTTACTAAAATCATATTCTTCTGCTGATGATCAAGATGATGAAACATTAATACGTGAAACTCAAGCAGCATTAAAAAGTTTATCTGGTAATTGGACAAACGATCAATATAAAGGATCAATATATAATAAAAACGATCAAGACGAAAATCCACCATTTCAAAATTTATTTGATGAAAAATTAAAGGATTCATATAATAATCAAATGCAAAAATATTCAACAAAGCAAAAAGAGAACAATCAAGCTCGTATTAATTCACAATATAATTATATAAGTAGTACATTGGATTTGGATGATCGTAGAACAAAAATTCCATTTTCTCAGGCATCAGCATTTAAACCACCAATTATTGATGCTAAAAGAATGATAAATGGTGTTTCATTATTAGCAGCAAATTATTCAACAGGAACATTAAGTGCATACACTAGTGATACAACAACACCTTATTTAAGTTATCAAGAAACAACACCATCAATATCATTAATAACAAATAATACACATCATAATACAACAACAACAAATTTAGGTATAACGgaaaatttaactgcagtcggaataacgacaataacaacagcaacaacaccaacaacagtagcagtatcatcaaaactaacaactataataccatcaacatcagaacaaacaaattctgaagaatATAATAAATCTATAAACGAAACATCACCAGATACTAAACAATATACAATTTTACAACCAGCTGGAATTGGTAGTCGTGCGGCATCTGTTATGCAAGATATTTCAAgagaaggtgtattaactgtatcagcgatacacagtaataataataataataataatattaataacaataataataatactaataatagtaatggtaataattgtttaataatatcagaaaattctgcaaatattatatcatcaacaacatcaACACATACTGATAAAATGTCGTATTCAGATCATCATACGCATAATGGTGATTCAATACAACAACCATTTTCACCAGGAAATTTAAATAGAGATAATTCTAAATGCCCAACAATGGGATGTAATGGGCAAGGTCATGTGACAGGATTATATACACATCATAGGAGTTTGTCCGGATGTCCGAAAAAGGATAAGTTTTCTGCAGAATTATTGGCGATGCATGAACAAATTTTAAAATGTCCGACACCTGGATGTAATGGTAGAGGTCATGTTAGTTCAAATCGTAATACACATCGAAGTTTATCTGGTTGTCcagctgcagcagctaaaaaagctgcagcacgtgaagctaaatttaatactgggacaggattactattacatcatcatagaacggcaaccgcagcagcaattttatcagcagcagcagctgcagcagTATTGCATAACCAAAATTTATCAACTGATGAATTAAATAGACGTCACCAATTAGTAAAAGATACAGATAAATTAAATGAAAATTCAAACAATATTACAAGTGCATTTCTTAACAATAATAGCGTAAATTGTATTAATAATAATACAACAAAATGCAATAATAATAATAATAATAATAATAATATGCCAATTATAAAATCTGAAATTAGCCCAACAAATATAAAAACAGAATCATCAATCAGTTATGCTAGAAGTCCAAGTACCAATCATAATCAACAACAACAACAACAGCCACAGCATTCATCAGTATTTTTACATAATGACTCAAGTAATTCGAGTACTTATACCAATGTAGATAACCATTCAAAACAAACAAAtcaaatatctaatggaaatacaacaacaacacaacatcaatcacaatcgcagcaacagcaacaacagcatcaaccacaacaacaacaacagcagcaacaacatcaacaacaacaacatcaacaaactagtaatacatcatcgaaccatccaaatgatattcaatcaaattgttcaagtacagatgcgatgcatcaatcacatcaGTTATCGAATCGTAATAATGGTACTACAGTTGGGCAAAATATAGTATCAACGAATGTTGGAGGTAGTAATAATAATAACAATTCTATTACAACAGGGCATCAGTCAATAAATTCATTTGTCAATATAAATGAACAACAAAATTCTCAAGAGAGATCAAGACAATATGAAACAGCATCTAGTTTAATGTTGAACAATAACCAAAATATATCTAGTGTTAATGGTATATCAGACAATATTAATGGCACATCATCTATTAGTAATATGACATCTATGGGCGATCCATATATAAGAGCAGCTGCTGAACAACAAATGAGATATTCTCATATgaatgcagcagcagctgctgctgctgctgccgctgctgctgtatcaaatagtgatattacAAAACTTTCAACAGTTGCATATTCAACAAGCGATATTTTGAGTAATAACCGCCCAACATATGATGCATCAAGATTAATTTATGATACAAATACAATGTCATCTGCTACAGCATTTGAACGGTATGATCCAAATTGTACATCGCAACGAGCCACTAATATGTATACTTATTTGCCAACAACTGATGATATTAATAGTCAACAACAGAAATTCTTACAAGAGCAACAAATGGTTCATGCTACTATGTTGAAAGCAGAACATGACGAAAATAATGGTCCGATTTATCCAAGACCAATGTATCATTATGATCCGACAATGGGTCCATTACCACCTGGATTTTCTGCTATTAATCTCTCAGTAAAAGTTGCAGCAGCTCAAGCTGCCGCAGCAGCAGCTGGATATAAAAATAGTAATGGTGATGTTAGTTCGCCATCACCAACATCTGGTCCCAGACCTGGTGTTCCAATTATTGATTTATCATCTTCAAGTGTTACTTCATCCAGTCCGCATGGATTTAATTCACAACAATATCGTATTTTAGGTGTTAATGGTGGTGGTGTAACTAGCGGTACTACTGGTACTGCAAATAGTGGCAATGAAGGAAATTGTGCTACAAGTCCTCAACCAGGTTCAAGCCCACATCAATTAGCTAGTCCACAAGTGCCAAGCCCACAAGGTCAAACGTTGGATTTAAGTGTGACCCGATTACACCATCATAGTATAATACTAAATTCGTCAAGTCCACAATATGGTGTTCATAATGAAGTATTACCTCCTCATGGTTTTGTAACTGGTGCTACAACAGGAGAAACTGGAACAAATGGTTCTTCTGGTGTACCTAAATCACCACAAAGTGAACCAGTTGATTTTAGTGGTCCACCACGTCCATTAGGTTTCGGTTTAGTTGGACATATCGGTGGACCAGTTGGTCCATATAGTAGAGAATCTACACCAGATAGCGGTGGTTCCCATTATATAGATAATTATAGAGATCCTAGTGGATATAGTCCACATCCTGGTTATGGTATGGTTGTTCAATCTGATTATCCACCAACCGGTTACCATGGATATGGACCAGCAGCATATCAATGTAGTCCGTATGCATCAGCAGTTGGTCCAGGCGGATATCCTACACCAGTTTCGGGTGGTTATTCACCAAATCCAGCATCTTGTTATGCAATGCCACCACCTCAACATATACCACAACATGATAAAACAAAAGACGGATTAACGGGTTGCCCACGTACAGATAGAAATCATTTACAATCTCATTCACAAGAATTAAAATGCCCGACACCAGGTTGTGATGGTTCTGGTCACGTAACGGGCAACTATTCATCTCATCGAAGTTTGTCTGGTTGTCCAAGAGCGAATAAACCAAAAAGTAAACCACGAGATGGTCAGGATTCTGAGCCACTTAGATGCCCAATACCAGGATGTGACGGTTCCGGTCATTCAACAGGAAAATTCTTATCCCATAGAAGTGCATCAGGATGTCCCATTGCAAATCGTAACAAGATGAGAGTACTTGAAAATGGTGGTACAGTGGAACAACACAAAGCAGCGGTTGCTGTTGCAGCCGCAATGAAATTCGATGGAGTTAATTGCCCAACACCAGGTTGTGATGGTACTGGCCATATAAATGGAACATTCTTAACGCACAGATCACTTTCAGGCTGCCCGACTGCAGCGCAGGGAATCAAAAAGCCGAAATTTGATGAAGTTGCTATGGTTTATCCAAAAGGATATACCGATTATGCGACGTTTTGTTTCGGTGCCGAATATTTGCTGTAA
- Protein Sequence
- MALSKRPPSKDNILDTVKSEGDDITLKRRKLCSNRDEDFTFKTFDDKNITLPQKKRSIVTSNCILVNSKITPTLNNNNSITNFNSNNNNLLKSYSSADDQDDETLIRETQAALKSLSGNWTNDQYKGSIYNKNDQDENPPFQNLFDEKLKDSYNNQMQKYSTKQKENNQARINSQYNYISSTLDLDDRRTKIPFSQASAFKPPIIDAKRMINGVSLLAANYSTGTLSAYTSDTTTPYLSYQETTPSISLITNNTHHNTTTTNLGITENLTAVGITTITTATTPTTVAVSSKLTTIIPSTSEQTNSEEYNKSINETSPDTKQYTILQPAGIGSRAASVMQDISREGVLTVSAIHSNNNNNNNINNNNNNTNNSNGNNCLIISENSANIISSTTSTHTDKMSYSDHHTHNGDSIQQPFSPGNLNRDNSKCPTMGCNGQGHVTGLYTHHRSLSGCPKKDKFSAELLAMHEQILKCPTPGCNGRGHVSSNRNTHRSLSGCPAAAAKKAAAREAKFNTGTGLLLHHHRTATAAAILSAAAAAAVLHNQNLSTDELNRRHQLVKDTDKLNENSNNITSAFLNNNSVNCINNNTTKCNNNNNNNNNMPIIKSEISPTNIKTESSISYARSPSTNHNQQQQQQPQHSSVFLHNDSSNSSTYTNVDNHSKQTNQISNGNTTTTQHQSQSQQQQQQHQPQQQQQQQQHQQQQHQQTSNTSSNHPNDIQSNCSSTDAMHQSHQLSNRNNGTTVGQNIVSTNVGGSNNNNNSITTGHQSINSFVNINEQQNSQERSRQYETASSLMLNNNQNISSVNGISDNINGTSSISNMTSMGDPYIRAAAEQQMRYSHMNAAAAAAAAAAAAVSNSDITKLSTVAYSTSDILSNNRPTYDASRLIYDTNTMSSATAFERYDPNCTSQRATNMYTYLPTTDDINSQQQKFLQEQQMVHATMLKAEHDENNGPIYPRPMYHYDPTMGPLPPGFSAINLSVKVAAAQAAAAAAGYKNSNGDVSSPSPTSGPRPGVPIIDLSSSSVTSSSPHGFNSQQYRILGVNGGGVTSGTTGTANSGNEGNCATSPQPGSSPHQLASPQVPSPQGQTLDLSVTRLHHHSIILNSSSPQYGVHNEVLPPHGFVTGATTGETGTNGSSGVPKSPQSEPVDFSGPPRPLGFGLVGHIGGPVGPYSRESTPDSGGSHYIDNYRDPSGYSPHPGYGMVVQSDYPPTGYHGYGPAAYQCSPYASAVGPGGYPTPVSGGYSPNPASCYAMPPPQHIPQHDKTKDGLTGCPRTDRNHLQSHSQELKCPTPGCDGSGHVTGNYSSHRSLSGCPRANKPKSKPRDGQDSEPLRCPIPGCDGSGHSTGKFLSHRSASGCPIANRNKMRVLENGGTVEQHKAAVAVAAAMKFDGVNCPTPGCDGTGHINGTFLTHRSLSGCPTAAQGIKKPKFDEVAMVYPKGYTDYATFCFGAEYLL
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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