Basic Information

Insect: Poecilobothrus nobilitatus
Gene Symbol: zfh2_2
Assembly: GCA_947095535.1
Location: OX352775.1:852296-898216[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 16 0.52 85 5.8 0.7 2 23 79 101 78 101 0.95

2 16 0.00044 0.071 15.5 1.4 2 23 676 698 675 698 0.96

3 16 0.00011 0.018 17.4 0.7 1 23 730 754 730 754 0.92

4 16 0.034 5.6 9.5 0.4 1 22 917 938 917 941 0.91

5 16 4.3 6.9e+02 2.9 1.9 1 23 1223 1247 1223 1247 0.91

6 16 0.02 3.2 10.3 0.1 3 23 1668 1689 1666 1689 0.92

7 16 4.5 7.4e+02 2.8 1.9 1 23 1821 1846 1821 1846 0.89

8 16 0.0023 0.38 13.2 1.5 1 23 1859 1881 1859 1881 0.96

9 16 0.0041 0.67 12.4 1.9 2 23 1888 1910 1887 1910 0.94

10 16 1.5 2.4e+02 4.4 2.8 1 23 2061 2085 2061 2085 0.91

11 16 0.037 6.1 9.4 0.6 1 22 2106 2127 2106 2130 0.89

12 16 0.017 2.7 10.5 0.1 1 23 2220 2244 2220 2244 0.93

13 16 1.2 2e+02 4.6 4.2 1 19 2395 2413 2395 2418 0.91

14 16 0.00026 0.042 16.2 2.8 1 23 3173 3195 3173 3195 0.98

15 16 0.0025 0.41 13.1 2.4 1 23 3331 3353 3331 3353 0.96

16 16 0.00026 0.043 16.1 0.3 2 23 3898 3920 3897 3920 0.97

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	16	0.52	85	5.8	0.7	2	23	79	101	78	101	0.95
2	16	0.00044	0.071	15.5	1.4	2	23	676	698	675	698	0.96
3	16	0.00011	0.018	17.4	0.7	1	23	730	754	730	754	0.92
4	16	0.034	5.6	9.5	0.4	1	22	917	938	917	941	0.91
5	16	4.3	6.9e+02	2.9	1.9	1	23	1223	1247	1223	1247	0.91
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Sequence Information

Coding Sequence: ATGTCGTGTTCTGATGTTGAAAGTTTTCAAGGCAAGATAGTTTATAATCCAGATGGAAGTGCTTATATTATTGATTCTGAAAACGATTCATTATCAAATTTATCAGAAAATTGTTTAAGTAATCCCCCATCGACAAACAATCCAAAAATTCATTCATTTCGTGTTGTGACTGCACATGATGCAACACATCAATCAATTGAACCAAATAATATTAAAATACAAAAGCCAATATTAATGTGTTTTATATGTAAATTAAGTTTTGGTAATACAAAATCATTTAGCTTACATGCAAATACTGAGCATACATTAAATTTACAAGAATCTGAAAAATTATTATTAAATCGTGAATATTCTAGTGCCATAATACAGCGCAATGTTGATGAAAAACCTCAAATATCATTTCTGGAACCACTTGATTTACataataaacaacaattaatacatataagtgcaacaacatcagtacaagaacaacaacaacaatcattaaatgaaattttaacaacacaaccaacatcaacattacaattaaaaaataataatgttaatgaaaatattaatttaacaacaacaaccacaacaacaacaggaatatcatcaataacaacagcaacaacaacaacaacagcaacatcatctataattaccccaatattacaatcaacaaatagtatgaatattaacaataatattagtagtaataatagtaataaaactaataataataataataataatgcaaatgatgctattaataccagtaataataacaatagtacaattacatcaggggttaatttaaatataatatcctcaacatttccaaatgtatcgaaatcatcatcatcaacgttatcatcaacaatTTTAAATCCAATAAATACAATATCATTTTCATCGGCTACATCTCCATTATCATCGCCAGTTTTACCAACAACACCAACAACAACAACAACAACAGATAAAAGTCATCCTACTAACGATAATAGTAATATTTTATTGTCATCCTCAACTAATTTATTTCAACATGAATTAAAAGAAACGGGAGCTATGTCAACAaacaataataataataataataatagcagtaatattagtaataacagtatatcaaattctacaacatcatcaacactgactgctgttgaattaagtcatccaaataatagtaataataatattaataataataataataataatagtagtagtagtagtagtaataataatagttcaaaaacaccatcatcaacaacaacatcagcaacaacaacaatttcaacatcaacaaccagtaatataaatacaagtaatTTAAATGCAACGGATTTTCTACAACAACAGTTACAACAAATTCAGCATCAATTTCAAAAACATCAACAACAACGTAACTCAATTGTTAGCAGTATAAATCCTAGTAATAATATTAGTAATAGTAATACAAATTCAAATTTAGTAAGTGGAAGTTCCTCAATACAAGCATCATTAGCAGCAGCTGTTGCTGCAGCTGCTGCAGCTCAACATCAGCAACAACAAAATGATATTAATAGTAATAATAATAGTGCTAAATTATTAAATGATTTTCTTCAACAACAATTTCAACAACAACAACAACAACCATTAATAGCATGTCCTGAACATGCAATTACTGGAATGAAAGGAATAGATTGTAAAGCATGCGAATTAATAAATATTAATTTAAGTACACCAACAAAATCACCAACTAGTAGTTTGAgcttaccagcagcggcagcggcagcagcagcagcagctgcagctgtagcatcagcaaaacaattatcattgtctccagttagcggtggaaaCTGTCCAAATCCAAATAGTGGAAACAATAGTAGTGCATCACAATCAACGGCGCCACCAAGTTTTACAATTGGTGCATGTCCTGAGCATATTAGTGGGAGACCGTTAGGTGTTGATTGTGCAAGATGTGAAATGATATTGAATACAGCACGTTTAAATAGTGGTGTTCAGATTTCAACTAGAAATTCTTGTAAAACATTAAAATGTCCTCAATGTAATTGGCATTATAAATATCAAGAAACTCTTGAAATTCATATGAGAGAAAAGCATCCAGATGGTGAAAGTGCATGTGGTTATTGTTTAGCTGGTCAACAACATCCACGTCTGGCACGTGGTGAATCATATACCTGTGGTTACAAACCATATCGCTGTGAAATATGCAATTATTCAACAACAACAAAAGGAAATTTATCTATTCATATGCAAAGTGATAAGCACTTGAATAATATGCAAGAATTAAATAATTCACAAAATATTCAGAGCGCAGCTGCGGCGGTAGCAATCTCAGCTGCTGCAGCTGCATCGGCAGCTAATTCTGCTAATTCAAATAGTAATTTATTAGGAACAACATCGACACTAAGCAATAACAATAATACCAACAACAGCAGTAGTATGCCAGTTAATCCATCAAGCAGTAATAATTCTAGTGGATCCATTGGTGGTGGTAATGGTACTGGTAATACATGCCCGTCAATTGATCCAATACGTGATAGCCCAAAAATTTTAATGCCAAATATACATCcaggaagtacaacaagtattgttagcagtaacagtagcactggtacacaaatgttgtcatcacagtcgacacaacaatcaataggattagtacaacaacaacaacaacagcagcaacaaacacagcagcaacaacaacaaTCTCAATCATCTGGTTCTGGTTCTCAAAAACCAAAACCATCGTTTCGATGTGATGTTTGTTCATATGAAACATCAGTTGCACGAAATTTGAGAATACATATGACAAGCGAGAAACATACCCATAATATGGCTGTTTTACAAAATAATATGAAACATTTTCAAGCCCTATCGTTTTTACAATCTCAACAACAAAATTTAGCTGCAGCAAATTTACCAGCAAATCTAGTTGCAGCAGCTGCGGCAGCTCAACTTGGTCAAAATATACCAAATTTGCAAAATTTTCTACCTGAAGCAGCTTTAGCTGATTTAGCATATAATCAAGCATTAATGATACAATTACTTCATCAAAATTCTACAAGCGGAGCTCTTGGTgccgctgcagcggcagcagcagcagcagctcaacaatcaccaaatgctgcagcggcagcagctgcggtccatcaattacaacaacagcaacaacaagctgctgctgctgtggcagctctgtcagcagctagtggtaataatgcagcagctgctgctgcagccgcGTTAATTGGGACAAATAATGTACCAACAAGTGGTACTGTAACACCTGGTATTCAATCAAATCCAATACAAATAAGTAACAGTAGTAATAGTCCTCAAATTTCAATAAATAATCAACAACAAAATTCAGCAAATACTGCAGCAGCAGCTTTAGCTGCTAATGCATTAATGAATAGTGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCTGGTATTGAACCAGATCAAGGACTTAATCCAGATTCGTTTGAACCACCAATTGAAATTGATCAAAAACCATCAACAATATACAGCTGTTTAATATGTTCAAATTATAATACAAATAATTTAGATGAATTAAATACGCATATAATGTTGGATCGTTCACGTAATAATAATTGTAATAATAGTAATAATAGTAGTAATAATGGTGATATTATGCTTATTATTAATAATAATTATATATGCCGTTTATGTAATTATAAAACAAATTTAAAAGCTAATTTTCAATTACATAGTAAAACAGATAAACATATACAAAAATTAAATTATATTAATCATATCAAAGAAGGAGGTGCAAAAAATGAGTACAAATTGAAATATAATAATACAAATACAATTCAATTGAAATGTAATTGTTGTGATTTTTATACAAATTCAATACAAAAATTAAATATGCATGCTCAGCATATGCGTCATGATACTATGAAAATGATATTTCAACATTTATTGTATacgataaataattataattatgaacaacaacaacaattagaacaacaaaatgcatcttctgttgcttcaagacgtaacaTGTCAAATTTATTACAAATGATACAACATATAAAAAGTTTAAGGCATATGCAAGTTGAACAATTTATATGTTTACAAAGACGTAGTGAAAATATGGAACAATTAGAAATAAATGATGTTTTTAAATTATGTGATAATGATATTGTAAAAAACGAAAGACCAAGTCCATCAAGTAGTCCTATATTAAAATATGAATCATCATTATCAATATCCTCGAATCCATTTAATATAAATAATACAAATAGTCTTGAGTTGCATCATCAATTACAACAACATCAGCAACAACAGCAACAATTGTTACAACAACAATTTCAATCAACTGGCTATGACTTATCATTATCAAATCCTTTATCTTCCTTGTCAAATAATAATAATAATCAAACTGCAACAGCATCAGCCGCAACACCAACAACAGTTTATAAATGTAATAATTGTGAATATTTAACAGAAATGAAACATGATATTGATCGTCATATAGAACAAATGCATCCAAATAATTCATCAGATAATGATTATTTAATAATACCAACAAATACAGTTGCTTTACATGCATTTCAAGCTGCATTACAAGCTGCAGCAGCTGCAGCTGCTTCCCAATCTACTTCCATTACAGGAACGATAACTGCATCACCAAATAAAATTCAACAACAATCAGATTTTATTCAAACAAAATATCATCAACAACATCAACATCATCATCATTATCGTCAGCAAGAGCAACAACAACAACGTTCAATAACACCATTATCAGGCAATGTATCGAGTAGCGGCCTTGCTCCTGATACCGATATTGATATTAAAATTGAAAAACCCGATCAAATACCAGAAACTGAATCAATATGTGACGAACAAgatgacaatgaacgacaaagtgataatgatgataatattaatgatgaaagtattgacgatgatgacgaTTGTCAAAATGCAGCTGAAGAAGAAGAAAAAACTGATTATCAAAAAATAAATAACATTAT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