Pnob041811.1
Basic Information
- Insect
- Poecilobothrus nobilitatus
- Gene Symbol
- ct_2
- Assembly
- GCA_947095535.1
- Location
- OX352773.1:72014945-72052253[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CUT
- Domain
- Homeobox|CUT
- PFAM
- PF02376
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- The CUT domain is a DNA-binding motif which can bind independently or in cooperation with the homeodomain, often found downstream of the CUT domain. Multiple copies of the CUT domain can exist in one protein (eg Swiss:P10180).
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 3 2.1e-26 3e-22 80.3 0.0 3 70 847 915 845 922 0.94 2 3 5.1e-31 7.2e-27 95.1 0.0 3 76 1254 1328 1252 1331 0.96 3 3 1.1e-29 1.6e-25 90.8 0.1 3 76 1489 1563 1487 1566 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCTTCCAACTGCTGTATCTACAACAACAACCACAACAACAACTGGTGGTATTGATGGTAGTCCAATTCCTGATTTAGATTTAAGAACAGCTGCTTCGGCAGCAGTTCATCAACCTATGGATTGGTTATTTAAAAAAGAACGTATTTATTGGTTAGCACAATTTTGGCAACAGAAAGCTATATTAGCTGAAAAAGAAATTTCAACATTAAAAGGACAATTAACATCAAATACAGATACAACAACAACAACAACATCTACAACAACAACAACAGATTCAAAAATGATTGAACAACAATTAAATAAATCATCAATTGATTTATTAAGAGCAAAATCATCATCACCATCAACATTACAAATATCACATTCAAATGATACATCATTATCAATATTATCATCTATACAACCAAATTCAACAACATCAATTTTAAATGCATTACCATCATTATTAAATGGTTCAACAACAAATTCTTTAAATGGTATAATATCAACAACTATTGCACCAATAACAACAACAATAACAGCGACAACTAATTTACCAGGATTATTTACATCAAATTTTAATTTAAACGGTAATTTTATTGCAACAGTTCCATCACCATCACCACCACTTTCCGATAATGAAAGTATAACAAGTATTAACAATCATAATCATAATCATGAAAATAATACAGATATTATTGATAATAATATAATAGTTAAAGATAATAATAACGAATCAATTGAAAATAATAAAAATATAATAGATAACAATATAGAAAAAATAGAAGATGAAGACGAACACGAAGAAAAAGAAGAAGTAGTACAAGAAAAGGAAAATGAAAAAAAAAATAAAGTTGAAAATGATGAAAGAGGTCATCAATTAGAAATGGATCATTTGAAAGAGGCGGAGAAATATAATATAACACCTTCATTATTTTTAAAAAATAACAAAGAAAAAAATTATGAAataaataatgatgatcttataaataaaagtaatgataataaaataatagataataatacaaataataatgataataatgataatgatgatgatgatattaaaaaaaaattttataatagactgattagcaataatcaaatagaagataataatttaagaaaaatagaattaaaaaagctttcaaataataatgaagaaatcattaaaataacaaaacaagataacaataatcataataatgataatgatgatgatgatgatgatgatattctaatgaaagatatagaattagaaaataaagatgatcataagaataaaaataatattgaaatatcaaatataatatcatcatcagttgttacacctattattgttgaagatgatgatgatgacaaagatgataaaaattattgtaatagaaaaaattttgaaaatattgatgatgatgatgatgatgatgtgaatgagaatacaaaaaaaaaagaGAAAGCAAAAGAAATTGATTCAAAAAATAAAAAAGAAAATGAAAAAATTGATGAACCAATAGAAATTAAAGATGAAAATATTATTTGTGATCTTACAAATGCTAATTTAAAAAAAGAATTAGATTTTAAACAAAAAGAGATAAAAATTTTAACAGATGAAGTGACACGACTAAAAATTTTATATGAACAACAAATTTTACATAATCAACGTCTTCAAGATGAATTAGAAGAAAAATTAAATATAATTTTAAGATTAGAATCACGAATAAATAATAATAATGCATTAACAATATTAAATAGTAATAATAATGTTAAAAATAGTGAAATAATTCAATCAATACCAAAATTAAATCAAGATGATATTCATATAAAAAAAGAAAAAAGTGATAACAGTCCTTTAGTAAGTCCttcaattcaaataaatgatgataatgacgttgatgatgatgatgatcatgaaaatgttgatgatgttgaaaattTAAAATCAAAtaatttaaaaatggataatCAATTAATAGAAAAGCAATCCGATAAAATTGAATCAACAAATTCCGTCCGTAATGACAGAGATAAATTCGATATAAATTATAATTCAGATGAAAATTCAACGACAATATTAAATGATTCACGTAATTCACAATATAATAATAATAATAACAATAAAATATCATATTATGATTCACGTGAATCAAATTGTAGTACACCAAATCATCAATCATATTATCAAGATGAACGACGATCAAATGATTCTAATCATTTTTTATCACCATTTTCAGGAAAATTAGATTTAACTGAAAATGCTGCAAATAATTTACAGCAAATGGCAGCAATAGGACCATTTGGTAATTCACAAATGCCAAATCCATTTCAAGCTGGATTACAATTTGCATTTGCAACAACAGCAACACAATCAGATCGTTCATTATTTTCAAGATTTTCAGATGATTTACAATTATCTGGTGGTGGTGGTGGATCAAATAATGTTGGTGGTTCAAATTCATTATCTGGTCGTTATAATTCTGATTTATTAATACCAAAAAGTGATCCAATGGAAGCTAAATTACAAGAAATGTTACGTTATGGTTTAGATAAATTTGCAAATCATAATTTAGATACATTATATATATCAAGAAGAGTACGTGAATTACTTTCGGTTCATAATATTGGACAGAGAATTTTTGCAAAATATGTACTCGGTTTGTCACAAGGAACTGTTTCAGAATTATTATCAAAACCAAAACCATGGGATAAATTAACTGAAAAAGGTCGTGATAGTTATCGTAAAATGCATGCATGGGCATGTGATGATGCTGCAATATTACTATTAAAAACATTAATTCCAAAAAAAGATTCTTCAAATATATCACAATTTGGTTATTCTGATGAACGATTATCAGATGATCGGATATCATCACATATATTATCAGATTCTTCCTCACCAATGTTATCAAAATCAAATCTTCATATTTCAAATTCTCTCAGTCAATCTTTTCTTAATAATTCAAAATCAATGCATACCAAAGATGAAGATTCGCGTTCAAATGACGATCTTAAATCACCAATTAATTTAAATAGATGTCCATCTCCTGCATCTTTAACAAATAAGGAACCAAAAATTACAATTAATCCTATCACTCAAGAACATTCATCAAATAGATTAGATTATACAGAAGATTTAAGTAAAATGTCTATAAATGAAAATGAAATTCCTCCAACATTTCCAGGTTTTCTATTCCCTCAATTGTATAATAATAGTAATGGAAATGGTAGTCTTCCACCAAATATGGCTAATTTTGAAATGGCTTTAGAAACATATCATCGTGAATTAGCGAAATTACAAAATAGAAATGGAACTAATTTTCCAAATTTTACTGATATACTTGCTTTACAACAACATCAAGTAAATTTAGCTTTAAATGGTTCAGTACAAGATTTATCAATTAATAAAGAAAAACGGGAATCACCCGTTATTGATGATAATCAATTAAGTAATAAAGATGATTTTGAAAAGTGTAAACAACTAGAAAGAGATTCAGATGTTAATTCAATGTCAAATATTTCAACACTAAATCAAGAAAAACAAATTTTAAATAACTCTTCACGCAGTCAAACTCCAACAAAACTTTCAAGTACAATGACAAGTTCAATTTTAACACCAAACTCTGATGATTTTGCTACAGTTTCAATAAATCCTTTACAAAGAATGGCTTCTATTACAAATTCTCTTATTACACAACCACCACTTCCTCCTCTTCATTCACAATCACCCAGACCATTAAAAGCGGTACTGCCACCAATAACTCAACAACAATTTGATCTCTACAATAATCTTAATACCGAGGAAATTGTTCGTAACATTAAAGAATCATTGTCACAGTATTCTATAAGCCAAAGATTATTCGGTGAAAATGTTTTGGGTTTATCACAGGGCTCAGTATCAGATTTATTAGCTAGACCAAAACCATGGCATATGCTTACACAAAAAGGTAGAGAGCCATTTATTCGAATGAAAATGTACTTAGAAGATGATAGTGCTGTTCATAAGTTGGTTGCAAGTCAATATAAAATTGCACCAGAAAAATTAATGCGTACTGGAAATTATACAGGAACTCCACAAATTCCGACAAGTTTAGCATCTAAATTAGATGATATACAGAATTCTTCAATGCAAAAAATTATTAATGATTTAAAACTTAAACAAGAATCTCAACAACAGCATTTAGTACAAAAAATGCGTGCTGTTAATGCTTTAGCAAATTTACCGCAGCATCAAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGGAATGTTATTATCTCAGCCAGGTTTAATGCCACATTATCCTGTATCTCAAACGTCACCTGCTGGAGGAATACCTAATCTTAACAGGAAAACTCCTAATCCAGAAGGAAATTTGGTACTTGAGAAAAAATCTCCATTAACCATTGTTCCAGTTTCGTCTCCTCAAACCGGAAATACCATGAGAAATGGTCATAATCAACATATGTCACCAACTGTTTATGAAATGGCAGCCTTAACTCAAGACTTAGACACACAAATAATTACAACGAAAGTGAAAGAAGTTCTATTATCAAACAATATTGGACAGAAAATTTTTGGAGAAGCTGTTTTAGGTCTGTCACAAGGATCTGTTTCTGAATTATTGTCAAAACCTAAACCATGGCATATGTTAAGCATTAAAGGACGCGAACCATTTATTAGAATGCAGTTATGGTTATCCGATATCAATAATGTAGAAAGATTACAAACTTTGAAGAATGAACAAAGAGAAGCAAGTAAAAGACGCCGTTCAATCGGTCCCGGCGGTAATCATGATAATTCAGATACAAGTAGTAACGATACAAATGATTTTTACACAACAAGTCCAGGACCCGGATCAGTTGGTTCAACTGGAGTTCCACCAAATAAAAAACAAAGAGTTCTATTTTCTGAAGAACAAAAAGAAGCTTTACGACTTGCATTTACTTTAGATCCATATCCAAATGTAACAACAATAGAATTTTTGGCTAATGAATTAGGTTTAGCTACCAGAACAATAACAAATTGGTTCCATAATCATAGAATGCGTTTAAAACAACAAATGCCGCATGGTCAACCAGCTGAACCGATTCCAACACGTGAAAATCAAACAGGTCCACCACTTGATCCAGTTCAATTTAAAATTTTATTAAATCAACGTCTTATGGAAATGCAAAAAGATCGAATGGGTTTAAGTACCGTTCCATTAATGTATCCACCATATTTTGGTAATAATCCAAATTTAGCTGCTTTAATTGCTGGTCGAAGTATATTTTCATCCAGTGAAATTGATTTACAAACATTAAATTCAGCTTTTAAGGGACATTTTAATGGTATGGATCTATCAATGAATATAAATAATAATGATGAAAATGATAACAATAATGTAAAACAAGAACATGATCAAGATGAAGAAAATGATTTAATGAAAAATGATGGTGATGGTGGTTGTGGTGATTTATCTGATTCCGAATCAATTAATAATAAATCTGATGGAATTTGTGAAAATGGTGAATTAAATAATAGAAATATTGATGATAATAATCCTTTATCAGCATTATTAAATAGTAATATATTAAGATCATCACGAAGAAAAGCTATTGCTCCACAATGGGTTAATCCTGATTGGCAACCTAGATCATTATTTACAAAACCAATTAATAATTGTACATTAAATGATGAAATGCAAGAACAAGCAGCTGATTTTAGTCGAACAGCTGTTAGTGGTAGTGATAGTGTTGGCAATAATGAAAATGATGGACGAATAAAAGTAATTAAACCTGATAAATTATTACGTAAATGTACATCACCAATTACAACAACAAGTGATATTAGTATTAAAACAGAAAAAATTGATTCAAAAAATAATGAATCTGACGATGAAGAAAGTGGGCCGCCGCCGCCGCCATCTTTAAATTTAACAACATAA
- Protein Sequence
- MLPTAVSTTTTTTTTGGIDGSPIPDLDLRTAASAAVHQPMDWLFKKERIYWLAQFWQQKAILAEKEISTLKGQLTSNTDTTTTTTSTTTTTDSKMIEQQLNKSSIDLLRAKSSSPSTLQISHSNDTSLSILSSIQPNSTTSILNALPSLLNGSTTNSLNGIISTTIAPITTTITATTNLPGLFTSNFNLNGNFIATVPSPSPPLSDNESITSINNHNHNHENNTDIIDNNIIVKDNNNESIENNKNIIDNNIEKIEDEDEHEEKEEVVQEKENEKKNKVENDERGHQLEMDHLKEAEKYNITPSLFLKNNKEKNYEINNDDLINKSNDNKIIDNNTNNNDNNDNDDDDIKKKFYNRLISNNQIEDNNLRKIELKKLSNNNEEIIKITKQDNNNHNNDNDDDDDDDILMKDIELENKDDHKNKNNIEISNIISSSVVTPIIVEDDDDDKDDKNYCNRKNFENIDDDDDDDVNENTKKKEKAKEIDSKNKKENEKIDEPIEIKDENIICDLTNANLKKELDFKQKEIKILTDEVTRLKILYEQQILHNQRLQDELEEKLNIILRLESRINNNNALTILNSNNNVKNSEIIQSIPKLNQDDIHIKKEKSDNSPLVSPSIQINDDNDVDDDDDHENVDDVENLKSNNLKMDNQLIEKQSDKIESTNSVRNDRDKFDINYNSDENSTTILNDSRNSQYNNNNNNKISYYDSRESNCSTPNHQSYYQDERRSNDSNHFLSPFSGKLDLTENAANNLQQMAAIGPFGNSQMPNPFQAGLQFAFATTATQSDRSLFSRFSDDLQLSGGGGGSNNVGGSNSLSGRYNSDLLIPKSDPMEAKLQEMLRYGLDKFANHNLDTLYISRRVRELLSVHNIGQRIFAKYVLGLSQGTVSELLSKPKPWDKLTEKGRDSYRKMHAWACDDAAILLLKTLIPKKDSSNISQFGYSDERLSDDRISSHILSDSSSPMLSKSNLHISNSLSQSFLNNSKSMHTKDEDSRSNDDLKSPINLNRCPSPASLTNKEPKITINPITQEHSSNRLDYTEDLSKMSINENEIPPTFPGFLFPQLYNNSNGNGSLPPNMANFEMALETYHRELAKLQNRNGTNFPNFTDILALQQHQVNLALNGSVQDLSINKEKRESPVIDDNQLSNKDDFEKCKQLERDSDVNSMSNISTLNQEKQILNNSSRSQTPTKLSSTMTSSILTPNSDDFATVSINPLQRMASITNSLITQPPLPPLHSQSPRPLKAVLPPITQQQFDLYNNLNTEEIVRNIKESLSQYSISQRLFGENVLGLSQGSVSDLLARPKPWHMLTQKGREPFIRMKMYLEDDSAVHKLVASQYKIAPEKLMRTGNYTGTPQIPTSLASKLDDIQNSSMQKIINDLKLKQESQQQHLVQKMRAVNALANLPQHQAAAAAAGMLLSQPGLMPHYPVSQTSPAGGIPNLNRKTPNPEGNLVLEKKSPLTIVPVSSPQTGNTMRNGHNQHMSPTVYEMAALTQDLDTQIITTKVKEVLLSNNIGQKIFGEAVLGLSQGSVSELLSKPKPWHMLSIKGREPFIRMQLWLSDINNVERLQTLKNEQREASKRRRSIGPGGNHDNSDTSSNDTNDFYTTSPGPGSVGSTGVPPNKKQRVLFSEEQKEALRLAFTLDPYPNVTTIEFLANELGLATRTITNWFHNHRMRLKQQMPHGQPAEPIPTRENQTGPPLDPVQFKILLNQRLMEMQKDRMGLSTVPLMYPPYFGNNPNLAALIAGRSIFSSSEIDLQTLNSAFKGHFNGMDLSMNINNNDENDNNNVKQEHDQDEENDLMKNDGDGGCGDLSDSESINNKSDGICENGELNNRNIDDNNPLSALLNSNILRSSRRKAIAPQWVNPDWQPRSLFTKPINNCTLNDEMQEQAADFSRTAVSGSDSVGNNENDGRIKVIKPDKLLRKCTSPITTTSDISIKTEKIDSKNNESDDEESGPPPPPSLNLTT
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01224105;
- 90% Identity
- iTF_01224105;
- 80% Identity
- iTF_01224105;