Pnob041814.2
Basic Information
- Insect
- Poecilobothrus nobilitatus
- Gene Symbol
- ct_1
- Assembly
- GCA_947095535.1
- Location
- OX352773.1:73300763-73311891[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CUT
- Domain
- Homeobox|CUT
- PFAM
- PF02376
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- The CUT domain is a DNA-binding motif which can bind independently or in cooperation with the homeodomain, often found downstream of the CUT domain. Multiple copies of the CUT domain can exist in one protein (eg Swiss:P10180).
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 3 6.9e-27 9.7e-23 81.9 0.0 3 75 679 752 677 756 0.94 2 3 8.4e-32 1.2e-27 97.6 0.0 3 77 1086 1161 1084 1163 0.96 3 3 1.5e-30 2.1e-26 93.6 0.0 3 76 1321 1395 1319 1398 0.96
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCAGCCATCTTCGCCTCAAGCAAACGGTGGAACTGCCGATATGGATTTAACGGCTGTTCAATCAATGGATTGGTTTTTAAAAAAAGAACGAATCTATTTATTAGCACAATTTTGGCAACAGAGAGCATCATTAGCTGAAAAAGAAGTTAGTAATTTAAAAGAACAATTATCATCAAATCCAGTAGTAACAACAACAACACCAAGTACAAATTCAGTAAATAATTCAACAAATTTAAAACAGCATTTAACAACAAATCCTGTTACAACAGATTTATCATCACGTATAAGTATATTAATTCCACCAACAACACCACAACAAAATAACGGTGCATTTATTGCTGAAGCACCATCACCATCACCACCTTTATCGGATACTGGTagtacaacaagtagtaataattgttcatcaaataatataattattaataataaaaaattattctctcttaataataataataataatattaatattaataataatattaataataataataataataataataacattaataataacgataatacaaacgttaatataaatttattaaataaaatggaagaaaattttgttgataaaatggcaccagacttaaaaattattgaacaagttaccagtgatgctagtaaaattagtttaaatgaaaattgtaaaactcaatcaaaatttaatgaaaataacaataataataataatagtaataataataataatagtaatgaaagtaataataatattggcaataaaaatagcaataataataacaatagtaataatttaaataataatattagtaataataataatattggtataaccgaaaaactacTTGATGAATTAGCTGCCAAAGATAAAGAAATTAAAATATTAGCAAATGAAGTATTACGTTTAAAAACATTAAGTGAAGAACAAACAAAGGAAATTGAAAAATTACAAGAAAATATTAAAGAAAAATTAGATATAATTTCAAAATTAGAAGCTAAAGAAATAGAACAAAATCAATTAAATAGTCAAAATGATTTAAAAGAAATAAATATTGATCATACAAATGAAGGAACAAGAACAACAACAACAACACCATTACCATTACCATCTATAACAAAAAGTTCATGTTCAATTTCTGTAACAGAAACAAATATAACCGAAAGAGAAACTGAAATAGAAACAGAAACTGAAAATTTATCAATACAAACGCCACAATTATCATTACCACAACAACCACCACCACCAACAGATATTGAAATTAAAAAAGAAAAAATAATTGATTCAACAACATCTGAAGATGGTGGTGATGTTGATGATGTAAATGATATTATATCAATGCAAACACTTCCACCACCGCTACCAATATCTTCAACTTCATTACCGTCATTACCGTCCGAGCCAAAAAATTTTCAAGAATTAATTTTTGAACGAACTAAAGCTCTTGTTgcagcccaacaacaacaacatcaacaacatcattcacaacatccaactcatcttccacatcaacatcaacatcatcatcatcatcatcttcattatcagtccaatgataAATTAAGTAGTTTAAGTAATTTTGTAGAAAATTCTGGTTTAAAACCAATTGACTTTGAAAACAAATCAAATAATAATTTAAGTGGTAATAATGGTGCTACAATTTCTGAATCAAAAGCTAGCACACCAAATTTACAAGATGATCGAAGATCAGATGATATTCTATCACAATCATCAAATAGCCAACAGCAACAAATACAGCAACAACGAAATAATGATATTTTAAATGGTGATGGTGGTGTTGGTCGTAATGATCCAATAACACAAAATTCCAATATTTTTAGTCCATTACAACATATGCCAGGCAGTTTTTTACGTGCATTACCATTTCCATTTCAAAATCGTCCAAATTTTCAATTTCCTGATGATTTACCAATGCATGGTTCAATGACATCACGTTTAGGTGAATCATTAATACCAAAAGCTGATCCATTAGAAGCAAAATTACAAGAAATGTTACGATATAATATTGATAAATTTGCTAATCAAAGTTTAGATACATTATATATATCGAGACGTGTACGTGAATTATTATCTGTTCATAATATAGGTCAAAGAATATTCGCAAAATATGTTTTAGGATTATCACAAGGTACTGTTTCAGAATTATTATCTAAACCAAAACCATGGGAAAAATTAACAGAAAAAGGTCGTGATAGTTATCGAAAAATGCATGCATGGGCATGTGATGAATCGGCTGTGTTAATGCTTAAAACAATGATACCGAAAAAAGATGATTTTCCACCTCCAGATACTGGACTTCCACAATATGATCCTGATGATCGAAGTCATAGTATTATGTCAGAATCTGTGGCTGCATCTGCTACAGCAGCTGCTCTAATGAATCGTGGAAATCATCAATCGTCTCATAGCGAACACAATTTAGATATGAATAAGGATATTGATTTGCAACAACGAAATGATGAATCACGATCACCATTATCGAATGCTTGTTCTTCGCCAGTCTATAAAGATAATATGAAATTTAATAAATCTGAAGAATTTTTGGCTCGTGATAAAATTGCAAGAAGTTATCAAGAAGAATTTGCTAAAATGATGATGAGATCTCAAAAAGAAGATTTTCAAAGTTCATTTTTTTCACAATTTCACAGCGGTGGGATGCCACCAAATCCACAACTTCACAACGAAAATATTCGTCTAGCTATTGAAAATTATCATCGTGAATTAGCAAAATTACAAAATTTTCCAAGTTTATTAGCATTACAACATCAAAATAATTTAGCTTTAAATGGTTCTATACAAGATTTATCCATATCGAAAGAAAAAGATTCTAATAAATCAATTAATGATAATCAATCAAAAGATTCATTTTCTATTAATGAGCAATCAAATCAAAAATCCGATGATCCAAATGATTTAAGTCGTGATTCATTTAAACACGACAATTCATTTAATTTATCATCTTCACAATCAAAACAACAACAACAACATGATTCTAATAAATCAAATAATAGTTTTACACGTAGTGATACACCAATGTCAGCACCCAGTCCATTAGTAAATTCAATATTACCACCAGCAATAACTCCCAATGATGATTTCTCAGCATCGGTTAGTCCACTTCAAAGAATGGCTTCTATAACAAATTCATTAATAACACAACCACCAATACCCCAACATCATCAACAACCACAACGACCAAAAACTGTTTTGCCACCAATAACACAACAACAGTTTGATTTATATAACAATCTTAATACTGAAGACATTGTTCGACGTGTTAAGGAAGCTTTATCACAATATTCAATAAGTCAACGTTTGTTTGGTGAATCAATATTGGGACTTTCTCAAGGTTCAGTATCTGATTTATTGGCTAGACCTAAACCCTGGCATATGTTAACTCAAAAAGGGCGTGAGCCTTTTATTCGAATGCAAATGTTCTTAGAAGATGATAATGCTGTTCATAAATTGGTTGCTAGTCAATACAAAATTGCCCCTGAAAAACTTATGCGTACCGGAAGTGCGTATAATACAAGTCCTCAAATACCAACTAATTTAGCACCGAAACTTGACGGTATTAATAATATGTCAATACCAAAAAGTTTCAATGATATGAAAAGTCCATCCGAATCACTTCCACATCATATAATGCAACAAATGCGTGCCTCAATAATGGCAAGATTTCCGGGACCTGCAGCTGCAGCAGCTGCTGCTGCTGCCGCAGCTTTAAGTGGAGGTCCTGGTAATCAAATGGGTGGAAATGGTGGTCCACATCAAGGTATGCTTTTAACATCACCTGGATTACCACCACAACACGCAATAAACTTGCAAAATAGTCAAGATAAGAAACCACTGCAACAAATGATGCCATCACATATACAGCAACAAGTAAATTCAATGCGACAAAGTCAACATGTTTCACCTACAGTTTATGAAATGGCAGCACTTACACAAGATCTAGATACACAAGTGATTACAACACGTATTAAAGAAGCTTTATTAGCTAATAATATAGGACAAAAAATTTTTGGAGAGGCCGTACTTGGTCTATCACAAGGATCCGTCTCAGAACTTCTTTCCAAACCGAAACCATGGCATATGTTGAGTATAAAAGGTCGAGAACCTTTCATTCGTATGCAATTATGGTTATCAGATGCAAATAATGTTGAACGTTTGCAAACATTAAAGACTGAAAAACGAGAGGCTAGTAAAAGACGACGATCAATTGGTATTGGCGGTAATCATGATAATAATTCTGATTCAAATAGTAATGATACAAATGATTTTTATACAAATAGTCCTGATCCAAATTCAATGGGTTCATCAAGTACACCACCAAATAAAAAACAACGTGTTTTATTTTCTGAAGAACAAAAAGAAGCTTTACGTTTAGCATTTGCACTTGATCCATATCCAAATGTTGCAACAATAGAATTTTTAGCAAATGAATTGGGTTTAGCAACAAGAACAATAACAAATTGGTTCCATAATCATAGAATGCGTTTAAAACAACAAATGCCACATGGTGCACCAAATGAACCGATACCAACACGTGAAAATCAAACTGGAGCTCCATTAAATCCAGTACAATTTAAAATATTATTAAGTCAAAGACTGTTGGAATTACAAAAAGAAAAATTAGGTTTAAGTGGTATGCCATTATTATATCCACCATATTTTGCTGCAAATCCAAATTTAGCTGCATTAATTGGTGGCGGTTTATTACCATCAAATGAAAATGAATTACAAGCCTTAAATGCTGCATTTAAAGAACAAATGAATTGTTTAGATCTTTCTATTAGTAATCCAACACAAACTGGTTTACCACAAATTAAAAAAGAAGAAGATTTAATtgatgatacttatgttgatgatgatagtaaaacagatattaatgataatgaaacaacatcaaatactgatataaatgaactaagtaataataataataataataacaataataatattgataataatttaaaatcacatgatattgataTATCACAAAAGAATTGTCAAGAAGAAGAATCTGGTAATGCATTAACATCAATTGATTTACAATCACAAAGATCATCAAGAAGAAAAACAAATGCACCACAATGGGTTAATCCAGATTGGCAAGATGATATAGGTGGGAGTGGATTAAAAAATCCATtagcaattataggacaaccattaattaataataataataataataataataataatagtagtaattatttagctcatgaaaaagattcaattataaataatagtaacaacaataataacaacaacaacaataataataataataataataatgaagaattagatgtacaaaataaatctatatgtgatgataatagtactgcggtgtcaaATGATAATTTAGAATCTTTATCTTTATCTAAAACTGATGATAAATCATTATCATCAATAATTGATACGAATGATGTTACAACTGATTAA
- Protein Sequence
- MQPSSPQANGGTADMDLTAVQSMDWFLKKERIYLLAQFWQQRASLAEKEVSNLKEQLSSNPVVTTTTPSTNSVNNSTNLKQHLTTNPVTTDLSSRISILIPPTTPQQNNGAFIAEAPSPSPPLSDTGSTTSSNNCSSNNIIINNKKLFSLNNNNNNININNNINNNNNNNNNINNNDNTNVNINLLNKMEENFVDKMAPDLKIIEQVTSDASKISLNENCKTQSKFNENNNNNNNSNNNNNSNESNNNIGNKNSNNNNNSNNLNNNISNNNNIGITEKLLDELAAKDKEIKILANEVLRLKTLSEEQTKEIEKLQENIKEKLDIISKLEAKEIEQNQLNSQNDLKEINIDHTNEGTRTTTTTPLPLPSITKSSCSISVTETNITERETEIETETENLSIQTPQLSLPQQPPPPTDIEIKKEKIIDSTTSEDGGDVDDVNDIISMQTLPPPLPISSTSLPSLPSEPKNFQELIFERTKALVAAQQQQHQQHHSQHPTHLPHQHQHHHHHHLHYQSNDKLSSLSNFVENSGLKPIDFENKSNNNLSGNNGATISESKASTPNLQDDRRSDDILSQSSNSQQQQIQQQRNNDILNGDGGVGRNDPITQNSNIFSPLQHMPGSFLRALPFPFQNRPNFQFPDDLPMHGSMTSRLGESLIPKADPLEAKLQEMLRYNIDKFANQSLDTLYISRRVRELLSVHNIGQRIFAKYVLGLSQGTVSELLSKPKPWEKLTEKGRDSYRKMHAWACDESAVLMLKTMIPKKDDFPPPDTGLPQYDPDDRSHSIMSESVAASATAAALMNRGNHQSSHSEHNLDMNKDIDLQQRNDESRSPLSNACSSPVYKDNMKFNKSEEFLARDKIARSYQEEFAKMMMRSQKEDFQSSFFSQFHSGGMPPNPQLHNENIRLAIENYHRELAKLQNFPSLLALQHQNNLALNGSIQDLSISKEKDSNKSINDNQSKDSFSINEQSNQKSDDPNDLSRDSFKHDNSFNLSSSQSKQQQQHDSNKSNNSFTRSDTPMSAPSPLVNSILPPAITPNDDFSASVSPLQRMASITNSLITQPPIPQHHQQPQRPKTVLPPITQQQFDLYNNLNTEDIVRRVKEALSQYSISQRLFGESILGLSQGSVSDLLARPKPWHMLTQKGREPFIRMQMFLEDDNAVHKLVASQYKIAPEKLMRTGSAYNTSPQIPTNLAPKLDGINNMSIPKSFNDMKSPSESLPHHIMQQMRASIMARFPGPAAAAAAAAAAALSGGPGNQMGGNGGPHQGMLLTSPGLPPQHAINLQNSQDKKPLQQMMPSHIQQQVNSMRQSQHVSPTVYEMAALTQDLDTQVITTRIKEALLANNIGQKIFGEAVLGLSQGSVSELLSKPKPWHMLSIKGREPFIRMQLWLSDANNVERLQTLKTEKREASKRRRSIGIGGNHDNNSDSNSNDTNDFYTNSPDPNSMGSSSTPPNKKQRVLFSEEQKEALRLAFALDPYPNVATIEFLANELGLATRTITNWFHNHRMRLKQQMPHGAPNEPIPTRENQTGAPLNPVQFKILLSQRLLELQKEKLGLSGMPLLYPPYFAANPNLAALIGGGLLPSNENELQALNAAFKEQMNCLDLSISNPTQTGLPQIKKEEDLIDDTYVDDDSKTDINDNETTSNTDINELSNNNNNNNNNNIDNNLKSHDIDISQKNCQEEESGNALTSIDLQSQRSSRRKTNAPQWVNPDWQDDIGGSGLKNPLAIIGQPLINNNNNNNNNNSSNYLAHEKDSIINNSNNNNNNNNNNNNNNNNEELDVQNKSICDDNSTAVSNDNLESLSLSKTDDKSLSSIIDTNDVTTD
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_01224104;
- 90% Identity
- iTF_01224104;
- 80% Identity
- iTF_01224104;