Pmel005161.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Phyto melanocephala
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_941918875.1
Location
CALNXE010000481.1:49089-64182[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 34 1.4e-14 7.4e-12 46.5 0.9 1 86 465 537 465 538 0.85
2 34 1.9e-14 1e-11 46.1 5.0 1 87 565 634 565 634 0.80
3 34 6.1e-15 3.2e-12 47.6 0.3 1 87 655 727 655 727 0.83
4 34 2.6e-13 1.4e-10 42.4 3.7 1 86 809 877 809 878 0.79
5 34 4.9e-15 2.6e-12 47.9 5.7 1 87 902 974 902 974 0.81
6 34 1.3e-11 7e-09 36.9 0.8 1 87 1009 1077 1009 1077 0.81
7 34 6.5e-11 3.4e-08 34.7 3.0 1 86 1118 1187 1118 1193 0.73
8 34 1.5e-14 8e-12 46.4 0.3 1 86 1215 1284 1215 1285 0.81
9 34 2.2e-14 1.2e-11 45.9 1.4 1 86 1307 1376 1307 1377 0.79
10 34 9.8e-13 5.1e-10 40.6 3.1 1 87 1405 1477 1405 1477 0.86
11 34 0.00019 0.1 14.0 0.0 1 70 1544 1608 1544 1620 0.69
12 34 7.9e-10 4.1e-07 31.3 0.3 1 87 1641 1713 1641 1713 0.78
13 34 5.8e-14 3e-11 44.5 3.6 1 87 1744 1815 1744 1815 0.80
14 34 1.5e-13 8e-11 43.2 3.5 1 86 1860 1932 1860 1933 0.83
15 34 7.2e-13 3.8e-10 41.0 1.4 1 87 1955 2023 1954 2023 0.80
16 34 7.6e-15 4e-12 47.3 0.4 1 87 2323 2392 2323 2392 0.81
17 34 1.5e-12 7.8e-10 40.0 4.3 1 86 2450 2536 2450 2537 0.77
18 34 5.6e-10 2.9e-07 31.7 3.3 1 87 2576 2648 2576 2648 0.76
19 34 2.1e-12 1.1e-09 39.5 1.5 1 87 2676 2745 2676 2745 0.82
20 34 3e-14 1.6e-11 45.4 2.2 1 87 2765 2835 2765 2835 0.81
21 34 8.7e-14 4.6e-11 43.9 2.0 1 87 2858 2929 2858 2929 0.80
22 34 0.00024 0.13 13.7 0.1 1 62 2945 2999 2945 3029 0.68
23 34 5.3e-11 2.8e-08 35.0 5.6 1 87 3033 3103 3033 3103 0.83
24 34 1.1e-10 5.6e-08 34.1 3.4 1 86 3128 3198 3128 3199 0.78
25 34 3.2e-14 1.7e-11 45.4 2.8 1 86 3219 3291 3219 3292 0.79
26 34 8.1e-09 4.2e-06 28.0 6.2 1 86 3311 3380 3311 3381 0.77
27 34 9.1e-14 4.8e-11 43.9 2.8 1 86 3740 3816 3740 3817 0.81
28 34 5.6e-07 0.00029 22.1 3.5 1 86 3836 3905 3836 3906 0.74
29 34 1.1e-14 5.7e-12 46.8 1.2 1 87 3927 3996 3927 3996 0.81
30 34 0.19 1e+02 4.4 4.1 1 81 4041 4126 4041 4131 0.56
31 34 1.3e-12 6.9e-10 40.2 2.6 1 87 4145 4219 4145 4219 0.84
32 34 3e-11 1.6e-08 35.8 2.2 1 85 4242 4314 4242 4316 0.80
33 34 2e-12 1e-09 39.6 3.3 1 87 4438 4511 4438 4511 0.77
34 34 8.3e-13 4.4e-10 40.8 0.5 1 86 4536 4606 4536 4607 0.85

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGATGATACTGGCTATCACAAAAGTGCGCCACAAATTGAAAACAATTCCTTTCACATGGAGGAAAAACGTAAACAATATGAGCTACTGCAGCAGCAACAACAAAGGCAACGTACTCATCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAATTACAAGTGCAACAACTTCATCAACACCAATTACAACAAATAAAACAAGAACCTCAAGAACATCATCATCATCAACAACAGCAACAACAACAGCAGAATGAATATACCCATAATAAAGATGTTACCCAACAAACACAACAAAGTATAAATTCCGAGAATTCTACTACAATACAAACAGTAGAACGAAAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCATCCAGAACAACAACAACAAACACAGCCAGAACAACAACAAATATCCTTGACTAGTATAAAAACAGAAGCAAAGCCCCTTAATTTTCCTCGTCGCAAATTACAAACAGAACGTTCTTCAACTCTGCCCATATGCCAACGATGTAAACAAGTTTTTTTGAAACGTCAGAACTATGCACAACATGTTGCTCTATCCACTTGTAATATCGTTGAGTACGACTTCAAATGCTCTGTATGTCCCATGTCCTTTATGTCGAATGAGGAACTACAGACGCACGAACAATTTCATCGTTCACATCGATATTTTTGTCAAAAGTATTGTGGCAAATTTTATGAAACCATTGCAGAGTGTGAACAACATGAGTATGGACAGCATGAATACGAAATGTATAAATGTAATATTTGTTGTATAAGTGTAACACAACGTGATCAATTATTTTCGCATCTAAATGAGCACAAATATCAGTCACGCTTCGATTGCTGCATATGTCGATTATGTTTTCCATCTTCTTTGGAACTACATGACCATTATATTGCCAATGAAGATTTTTGTGGTAAATTTTATAATAAAGACGCCTTTAAAAAACCAATTACCTCGTCGACATCACCTTATCTGGGCAAACCGGAAAGTTCTCAACTGGAAATTTCACATACATTTTCGTTAAAAGATATACCTTCTTCAAAAAGTCACCACTTGGAACCTTTATACACAAAACCAACCACCTCAAAACCTTCAATGGAGCCACCTAAGACACCAACAACACCATCCACAACACCATTTGACGTCACAAATGAATTTATTTTAGAGCCTCATGTTGAGGTGAAAACTGAAATTAAAGTTGAACCTGACTTTTATCCACCCATGGATCAATCTGACTTCTCAGGCTATGACAACGATTATACCACCTCTGATTACACTTCAAGCTCCAATCAGAGTTTAGCATTTTTGCATGATTATCAAGATAATGCTTCCAGCTCAACTAATTCATCGTATTCTTTTAATACAAACGATGCCATACAAGATGAAGATGCAATTTGTTGTGTACCCAAATGCGGTGTTCGAAAATTTTCTTCGCCCACTTTGCAATTCTTTGGTTTCCCGCGTGACGATAAGTATCTGGCGCAATGGTTGCACAATTTGAAAATGATCTATGATCCTAATGTTAATTATTCCATGTATCGTATTTGTAGTTTACATTTTCCAAAACGTTGTGTAGCCAAATATTCTTTAAGTTATTGGGCTGTGCCTACTTTCAACCTGGGCCACGATGATGTGGGAAATTTATATCAGAACAGGGAAAGTTCTGGGGGGTTTCCTGGGGGTGAAATGGCTAAATGTAGTATGCCTGGCTGCCCGTCCCAGCGGGGTGAAACTAATGTAAAATTTCATGTATTTCCAAGAGATTTAAAAACCTTAATTAAATGGTGCCAGAATTCCCGTTTGCCGGTTCACAGTAAGGACAATAGATTTTTCTGTTCTCGACATTTTGAGGAAAAATGTTTCGGTAAGTTCCGTTTAAAGCCTTGGGCTATACCTACAGTTAATTTAGGCACTGTTTATGGGAAAATACACGATAATCCTAATATTTATCAAGAAGAGAAAAAGTGTTTTTTGCCATTTTGTCGGCGCAGTAGATCTTATGATTGTAATTTGTCTTTATATAGATTTCCAAGAGATGAGACCTTGTTAAGACGTTGGTGTTATAATCTAAGATTAGATCCCAACATGTATAGAGGTAAAAATCATAAAATTTGTTCTTCCCATTTTATTAAAGAGGCTTTGGGATTGAGGAAACTTAATCCCGGAGCTGTGCCCACTTTAAATTTGGGCCACAATGATAGATTTAATATATATGAAAATGAACTGTACACACCACCGCCGCCGCCTCCACCCCAACCTACAATGTCGTCCAAGGCACATAAATATGCCCAAATGTTGAAACAAGAAATGAGTGGATCTTCCGCATCCCATTTATATGATGGTGTTTTTATGAATTCAATGGTCAAAAAAATTCCTTCTTCATCTTCGTCGGTTAATAACTCCAACAATTTGGACTTGGGAGATGTTTGCCTGGTGCCCTCCTGTAAAAGAACCCGCCATTCCCATGATGTTACTTTACATACCGTACCCAAACGTCCAGAACAGTTAACGAAATGGTGTCATAATCTTAAAATGGATTTAGAGAAGCTACACAAAAGTGTTCGGATATGTAGTGCTCATTTTGAAAAGTATTGCATAGGAGGTTGCATGAGGCCTTTTGCCGTACCCACTTTAGAACTGGGTCATGATGACACTAATATATACCGCAATCCAGATGTTATTAAGAAACTTAACATAAGAGAAACTTGTTGCGTACAATCGTGTAAGAGAAATCGCGATCGTGATCATGCCAATCTGCATAGATTTCCCACACATCCGGAATTGCTGCAGAAATGGTGTGAAAATTTACAAAAGCCAATTCCAGATGGTACTAAACTCTTTAATGATGCTGTTTGTGAAATACATTTTGAGGAAAGATGTTTGCGCAACAAGCGCTTAGAGAAATGGGCAATACCCACCCTAAATTTGGGTTGGGATGAAGCTCCTCATAGTTTGCCTTCTGAGGAGGAGATAAATGAAAACTGGGTGAAACCTTTTGCTCCTAATAATGGTGATGAACATGGTGAATGTTGTGTTGAAAGCTGCAAACGTAATCCGCAAATTGATGATGTTAAATTGTATCGTCCTCCAGAAGATGCTGAGCAATTGGTTAAATGGGCTCATAACTTGCAGGTAGATGTCGCAGAGTTGCCTAGTTTAAAGATTTGCAACTTACACTTCGAGCAGCATTGCATCGGCAAACGATTATTGAATTGGGCCATGCCTACTTTAAATTTGGGCGGTAAGGTAAAACATCTATTTGAAAATCCCCCTCCCATGCCTGCTATTTACAAGAAAAAAATAAAACCAGAGAGACTTCTTAGCAACCAAGAGGCCATAAAATGGTCTCCCCGTTGTTGCCTGCCTCACTGTCGTAAAATGCGTTCGGTAGACAAGGTTCACCTTTTCCGATTTCCCTATAACAATCGTCAGACTTTGTCAAAATGGTGTCACAATTTGCAATTGCCCCTGGTGGGTAGTTCACACAGACGTATCTGTTCCAGTCATTTTGAAACTTCTGTGTTAACCAAACGTTGTCCCATGTCATTAGCTGTACCAACTCTAGATCTAAATGCTCCCCCTGGATATAAGATTTATCAAAATCCTGCACGTTTGAAGCAAATCAAACCGGGATCTCAAAGACAATGTATTATCGAGTCCTGTCGCAAGACTAAGCTCGACGGTGTATCTGTGTTCCGTTTCCCCAACAATCGATCCATATTATATAAATGGCGTCATAATATTAAAAATTGGCCTAAGGGTAAATTGAGTTCTCAACTACGGATTTGTTCAGAACACTTCGAACCACATTCGGTGGGAGTAAAAAAGTTGTCTCCAGGTGCAATACCCACCTTAAAACTTGGACACGAGTCTAAAGATCTGTACCCCAATGAAACTAGATCATTTTTCGATTTGGAAAAATGTGCGGTAAGTGGCTGTGATTCTCGTAAAGAAATGGAGGATATTAGACTATTCCGTTTTCCACGAGACGATGAAGACTTACTAAAGAAATGGTGCAATAATCTTAAAATGAATACCAATGATTGTGTAGGTATTAAAATCTGCAGTAAGCATTTTGAAAACGAATGTATGGGCCCGCGTCAGCTATACAAATGGTCTATACCCACCTTAAAGTTAGGCCACCAGGAAGATGATCTAGTTGAAATAATACCTAATCCTCCGCCAGAACAGAGAACGGGAGAATTTCTTTTTAAATGTTGTGTACCCACTTGTGGTAAGACTCGCAAATATGATGACGCCCAAATGAATAGTTTTCCCAAGCACTTAAAGTTATTCCGTAAATGGAAACACAATTTAAAACTGGAATTTTTGAATTTCAAAGAAAGAGAAAAATATAAAATTTGCAATGATCATTTCGAATCGGTGTGTGTGGGAAAAACTCGTCTTAATTTTGGGGCCTTGCCTACTTTAAATTTGGGTCATGATGATGTTGATGATTTGTATCAAATTAATCCCGATAGGATCAGACCAAATTTGTTTATTAAACAGAAAGATGCGGAGAGACTGGTAAGGAGAAACATTTTAAGAGAAGAGAATCAAGAACAATATGATTGTGAGGACCAGCAAGAAGATGTTGCAGATCCATTAAGTTTAGAGCCAGGAGACATTAAATGTTGTGTCACAGAGTGTGTGGTTCCCAAATCCATAATGAGAGAACCCTATGAACTGCCAGAAACTCAAGATCTTAAAGAAATATGGCTTAAGGAGTTAAACGTAGACATTGAAGAAGAATTGCTTCCAGAATCTAAGTTGTGTGGTCTTCATTTTCAATTATTATTCACCAAACTTAGAGAGCAAATGCTGAAAATGAGTGTAGATAAACCTGATATAAAACAGGATTTGAATACACTGCAGTACAATTATCAGAAGTCTAACATATCTTTGGTGGTAAATAGTTACCAGTGTAGAGTAGCGGAATGTCCTACCAATTTGTTGAATTCATCTATGAGACTGTATTTTTTCCCATATGGCAAACAATTGGT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Protein Sequence
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