Preg019183.1
Basic Information
- Insect
- Phormia regina
- Gene Symbol
- gata4
- Assembly
- GCA_001735585.1
- Location
- MINJ01182238.1:1954-18217[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-GATA
- Domain
- zf-GATA domain
- PFAM
- PF00320
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- This domain uses four cysteine residues to coordinate a zinc ion. This domain binds to DNA. Two GATA zinc fingers are found in the GATA transcription factors. However there are several proteins which only contain a single copy of the domain.
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 1.2e-16 2.8e-13 50.2 3.7 1 34 1048 1080 1048 1082 0.97 2 2 3.8e-19 8.7e-16 58.2 3.7 1 36 1102 1136 1102 1136 0.97
Sequence Information
- Coding Sequence
- atGAAATGTGCCAATAATCGAAATTTGCCATTATCCTCTAAattagctaaaaataaaaatcgtgtTAATTCATCTAATTCCTTATTGACAAATGCTGCCAATATGAAAATAACCAAGGCCATAGCGAATTCAAAGCAAAACcgtaaattaacaaataaaggATTAACTTCATTGACAACAGCTAGTCAAAtgtcattattaaataataatgacaataataccctacaacaacaacaacagcaaccgTACCAACAGCCTCTCCCTCAAATATCTTATGAAAGAgaaaatgagataaaaaataaaggatCTTTGTTACaggatcataaatttaacaagGAAACCTATATGTCtgaaaaactaacaacaaattcttcaaataataatttaatgcaGAAAGAGATGGACTATAGAAAAGAGCAAAATTCACCGTTAAACTCTAcacaaacaacaactacaacaaataacCTTACAAATACTACAATATCTGCGGATATACAAAGAAcggcaacaacaacagcaactactACTACAGCAAGGAGAAATTCACCAACTCAcgaacaagaacaacaacaacaaggaGTAACAATAACAGAAAGAGAGCAACAGGCTACTACCAGTGCAcacaataatgaatttttagggCCTGCAACGGCGGCGACGACTTCAACGACAACTACGAATTTGAATTTATCGTCTTTGGCTGTTAAAACACCACAATTCATATCAGTTGTCAACGAAACATCAAACCAAACAGTGTTACGTACATCAGCTACGAACATTAACGAAGttcaaaatacacaaaaaattaatcaacATCAACAAGACGAACAGCAGCAACCAAAGACAAATACAATTATAACCGCAACGACAACAGtttcaacaattaaaaataataatcacaacaacactaataataataataacaatagtttatcaacaacaacaacagttgcAAACATAAATGATGAGACAAAAGATCATTATCATGTTAAGAAATTCTCAAATATAAATTGTCTTAAATCTCCTATAACCGCAAATGagcaaaaattagaaaattgtaataaaaataatttcaataaaagtgaCGTACAAGAAAgtgtcaataataataataataacaacaacaacaatacaaataataacaataataatgatattgatAATAACAGTGAAACGTtagaaaatcaacaaaaaattataaataatacaaatgcaAGTgataatactttaaataaaacagtgaTAAATAGTgttataacaacaactacagctGCCACTaatactttagaaaattttaataatacaaataatgcaaaaaatcaattaaataatacagCTCCTCAAAATTATCGTGGTGCTAATAATTCAGTGATAATAactaattacaataataataacaacaataataataattcccaTAGTTCACAATCACCTCAAacacaaaattctttatataattcaaGTGATTTTGTGACATCAGATAATATACTCAATACCTCTAGCAATgatccaaatttaaatttggctGTTATAGGTACAACGGCACAACTAACATCACAAGCTCCTTCACCTTTAAACGGATCCCAGCTACATACCCCATTGAACCAACATCATCCACAAAGTTCTTTATCAGCAGAACATTGGTTAAATACTTATAATTCATGTGCCTATGATTTGTCTTTAAATCATCCGTCTTCAGCTGGTGATAATACGGgcaaagatttaataaatttacaattgtTTTCTCCTTTAACACAACTACATCATCATACGGTTCATCATTCACATCCGCAAAACAATCAACATCACAGTCAAACTCCTGCCTACTATACCACCACTACACACCTTATAAATCCTGCCACTAATAGCAGTAATAATAATTCATCTCCtgcaaatacaaattatttgcaCGACGACACCATGAGATCAAATTTGGCACTCTATTCCACCTCGTATAATCCTCATCACGAGTCAATGCACCATCATCATTCTCTGATGGGTGGACAAAATATTACTGCCTCCACTCATACTCCCACCAGCATAGATGAGGTTATACAGGACACTTTAAAAGATGAATGTCTAGATGATCATCATACCGGAGTCAGTTATTTAACTTTAAGTTCTGTGGTCGATGTTCAGTCTCTAAAGGATTCCTATCATACGGCTAATTTAACACATGAATTAACACATTTGCCTTCCATTGCTCCCGCCCATATGCAGACTTCGTCACCACATCATCATTTACAGAGTATACATCATTTACATCATAATAATTCGGCCAGTTCGGGAGCAAATTCTCCCTCGCCCTCATCGGCTCTATCACAATCGGGTGATATGGCGACTTTACAAAGTTTTACCCAGTTAACAAATGCCAGTGGAGCGGGACATCGTGATATTTATACCATGTTGACGGGTCCCGAtcaaacacaattgtttaattttacctCACCGCCTTCACCCGTTCTTTCGAATAGttcaGTGTATGCGGCACCTTTGCTAGCTTCAGCTTCAAATGGCATGTCATATGGTATGCAAACAACAGCCTCAGCATCACCACCACCATCAGCAACAGCCTCAACACATCATAGCTCTGGATCAGGTGTAAACAGTGCAGCAGTGACATCTTGTAGTCAAAGTAATCATACTTCAGCTGTAGCAACATCACTTACAACTAATTCAAACAATAATAATCTACATGAAACACATTCCAATTCTGATGACTATGGTTCACCTAAAAGTACACAAAGTAGTGGTGGTGGCGTTGGTGGTGGTAGTGGCGGTACTTTGCCAGCATTCCAACGTATAGCTACAACAACCTATAACCAAAATACCCATACAACAGGCGTCGATCGTTATGGCTCATTGAGTAATTATAGAAGTCATaacgATACTTGGTCTAGTCCCTATGAAGCTATTAGTTATGCTCCCTCTTCAATGGTGGCTAATCAAGCTTTGAATAATGTTTTAACTGCTGCCAATACAAATGTTATACGTTCCGCTGTTAATGGTCGTTCTATAGTCAATTCATCAGCCGAAGTAACAAATCCTGCTGCCACTAATTTAGTAGCAGCACATTTGTCAGCTTCAGCTTCATTGTCAGCAACATTATTTGATGCCGATTTTTATACGGAGGGGCGAGAATGTGTCAATTGTGGTGCTATTTCAACTCCACTATGGCGACGTGATAATACCGGACATTATTTATGCAATGCGTGCGGTCTTTATCATAAAATGAACGGAATGAATCGTCCCTTAATTAAACCACCCAGAAGattgAGTGCTTCAAGACGAGCTGGTTTGACTTGCTCCAATTGTTTGACCACCCAGACTTCATTGTGGCGCCGTAATCCTAGTGGTGAACCGGTGTGTAATGCCTGTGGTTTATATTATAAGCTACATAGTGTTAAGAGGCCTTTAACCATGAAAAAGGATACTATAcagacaCGCAAACGTAAACCGAAAGGTTGTAAAGCcgaaaaactttcaaaaaaacaaGCTGCAGCTAATGCTGCTGCTGCCTCAGCTTCAGAACATTCTATCAATTCATCCAATAATACTCTCAATACCAGCACTGAAAGTGTTACTAACAATATGAGCATGCTCAATGGCGATCATGataTTAAACCTTTAACACAACAACTATTAAATGCATCAACATCATCACTAACACAATCGGCTGCATCATCACCCACCAATAGTATATCATCGCCttctcataataataataataacaataatcacAGTATGACTATGTCACCAACATCACCGttaatgcaacaacaacatcaacaacagcaactgcATACAAATAATATGGGTAATATGTCACCACAAGAATATCAACAACATAATcagcaacatcaacaacaaatgTCACCAATTATGTTTCAACATCATACAACAGCCTCATCAGCTTCATCATCACCtaccaataacaataataatttaaataatactaacaataataatacaacaacatttaataatcataatgataatgaaaatttaaaatttatgcaaaaatatatacaacaacagcagcaagcGGAACAACAATTAATGAATACAACAAcccaacagcaacagcaacagcagcagcaacatacGACGAATACCCTACTGAATCCCAATTCACCCAACACATCACCAACAGCCAACAAATGTGCAACacccaacaacagcaacaacaattctCAGACCCAACAACAGCAATTtctgcagcagcaacaacatcaaatacaccaccaccaacaacaacaccagCAACTAATAGCAGCCAACAATCCTCATGGTCCCCATCCCAACAATCTTCATATGGGgtctaacaacaacaacaacaatcacaGTCCATTAAATACCTACCATCATGAAGGACCATCCACAAATTCACCACCCACCTCACCGGTTTATGAAAGTTATGGTGAATTAATACCCAACGACTCGGGTAACAGCATTAAAATTGAACAATTACATCAACAACTAGCCGAtgagcaacaacagcaacatcaacaAATTCTACAAggacatttaaataatataagtcGTAGTCCTTCCATGGACGATGATTATGAATATCATCAATTTTTATTACGTCAGCAACATTTGCATGatttgcaacaacaacaatttttacaatttgtacCACAACATTTGCATGATTTTGGTAGAAAATTCGATAGGGAAACGGTAGTGaaaatggaataa
- Protein Sequence
- MKCANNRNLPLSSKLAKNKNRVNSSNSLLTNAANMKITKAIANSKQNRKLTNKGLTSLTTASQMSLLNNNDNNTLQQQQQQPYQQPLPQISYERENEIKNKGSLLQDHKFNKETYMSEKLTTNSSNNNLMQKEMDYRKEQNSPLNSTQTTTTTNNLTNTTISADIQRTATTTATTTTARRNSPTHEQEQQQQGVTITEREQQATTSAHNNEFLGPATAATTSTTTTNLNLSSLAVKTPQFISVVNETSNQTVLRTSATNINEVQNTQKINQHQQDEQQQPKTNTIITATTTVSTIKNNNHNNTNNNNNNSLSTTTTVANINDETKDHYHVKKFSNINCLKSPITANEQKLENCNKNNFNKSDVQESVNNNNNNNNNNTNNNNNNDIDNNSETLENQQKIINNTNASDNTLNKTVINSVITTTTAATNTLENFNNTNNAKNQLNNTAPQNYRGANNSVIITNYNNNNNNNNNSHSSQSPQTQNSLYNSSDFVTSDNILNTSSNDPNLNLAVIGTTAQLTSQAPSPLNGSQLHTPLNQHHPQSSLSAEHWLNTYNSCAYDLSLNHPSSAGDNTGKDLINLQLFSPLTQLHHHTVHHSHPQNNQHHSQTPAYYTTTTHLINPATNSSNNNSSPANTNYLHDDTMRSNLALYSTSYNPHHESMHHHHSLMGGQNITASTHTPTSIDEVIQDTLKDECLDDHHTGVSYLTLSSVVDVQSLKDSYHTANLTHELTHLPSIAPAHMQTSSPHHHLQSIHHLHHNNSASSGANSPSPSSALSQSGDMATLQSFTQLTNASGAGHRDIYTMLTGPDQTQLFNFTSPPSPVLSNSSVYAAPLLASASNGMSYGMQTTASASPPPSATASTHHSSGSGVNSAAVTSCSQSNHTSAVATSLTTNSNNNNLHETHSNSDDYGSPKSTQSSGGGVGGGSGGTLPAFQRIATTTYNQNTHTTGVDRYGSLSNYRSHNDTWSSPYEAISYAPSSMVANQALNNVLTAANTNVIRSAVNGRSIVNSSAEVTNPAATNLVAAHLSASASLSATLFDADFYTEGRECVNCGAISTPLWRRDNTGHYLCNACGLYHKMNGMNRPLIKPPRRLSASRRAGLTCSNCLTTQTSLWRRNPSGEPVCNACGLYYKLHSVKRPLTMKKDTIQTRKRKPKGCKAEKLSKKQAAANAAAASASEHSINSSNNTLNTSTESVTNNMSMLNGDHDIKPLTQQLLNASTSSLTQSAASSPTNSISSPSHNNNNNNNHSMTMSPTSPLMQQQHQQQQLHTNNMGNMSPQEYQQHNQQHQQQMSPIMFQHHTTASSASSSPTNNNNNLNNTNNNNTTTFNNHNDNENLKFMQKYIQQQQQAEQQLMNTTTQQQQQQQQQHTTNTLLNPNSPNTSPTANKCATPNNSNNNSQTQQQQFLQQQQHQIHHHQQQHQQLIAANNPHGPHPNNLHMGSNNNNNNHSPLNTYHHEGPSTNSPPTSPVYESYGELIPNDSGNSIKIEQLHQQLADEQQQQHQQILQGHLNNISRSPSMDDDYEYHQFLLRQQHLHDLQQQQFLQFVPQHLHDFGRKFDRETVVKME
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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- iTF_01261557;
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- iTF_01261557;
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