Basic Information

Insect: Philopedon plagiatum
Gene Symbol: X-element\ORF2
Assembly: GCA_963971165.1
Location: OZ020191.1:92677915-92692580[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: HTH
Domain: HTH_psq domain
PFAM: PF05225
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 5.1e-10 5.9e-08 34.7 0.0 2 45 1497 1539 1496 1539 0.95

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	5.1e-10	5.9e-08	34.7	0.0	2	45	1497	1539	1496	1539	0.95

Sequence Information

Coding Sequence: ATGTGTAATGTTCTTACTGAGAATTATGATGTAATACTGTTAACTGAGACATTCTTGGATACCACTGTTTTGTCGGGAGAACTTGGCCTTGATGGTTATTGTGTATTTAGATGTGACAGATCGGAATCGACTAGTAATTGTGTGACTCAGGGTGGAGTGCTTATTGCTGTGAAGAGTACACTACAGTGTCATCTTCTTGTTCCAATATTAAATAGTGTGGAGCAAGTTTTTGTCCTGATCACTGTTGGTGCAAATAGAATTCTGATTGGCAATGTATATATACCTGGTGTCTCAACTGTAGAATTGTACGAAAGTTTCTGTCTCTCTGTTATGCAATTGTGTGATGAGACTGACTTTACTGATGTGCTACTTTGGGGTGATTTTAACTTACCCAGGGTGTCTTGGATCAATGATGAAAATGGATCTTCTCCTACCGGAAATGTGTCAGGTGAGGTTACAGTGATATCGGACTGCGCAGCCTATTTAGGCTTGTTTCAAAATATAACCATTCCAAATAAGTATGGAAATTTTTTAGATCTACTGTTTTCAAATCATATAGATACACATGTCACAATTTGTGATAAACCTTTAGTGCGACTAAATGCACCCCATCCAGCTTTTGAATGTAACTATAAATTAGGAAGTCCCATACCAAATAATATCTCatgtgattatttttattatgattttaaGCGTGCTGACTATGCTGAAATTAATTTGTTACTAGCTAGTGTTGATTGGAGCTTCATTTCTGAGTGTACTGATGTGGATTTTGTTGTTTCtcaattttataatattctgtATTTTGCAATTGAACTATTTACACCTATTTCACAATATAAAACACCAAAGTTTCCGAAATGGATGAGTTCCGACTTGAAAGccttaattataaataaaaaggaagctcacagaaattttaaacaatcaGGGACATTGCATGATTACACTATCTTTTCAAACCTGAGAACGCAATGTAGAAATATGTCTTATTCCGTTCACCATGAACATATAGCAACGGTTGAGGCGCAGCTGACTGATAGAGCTTCCTTTTGGAAGTTTGTAAACTCAAAAAGAGGAAACAATGAATATCCACAGTGTATGTCTCTTAATCATAATCTAAGTAGTGATCCACAGGAGATTTCAGAAATGTTTAATGAGTATTTCTCCTCAGTATACTTGGAACATGAGGAATCCAACGTCTTTTTTGATTGTGATAGGTCTGTTAGTGTAGGATTTTTAAACTTGTCTGTGATTGATGTTTTTAATAGGATTAGTATGTTGAAATCTAGTCTTGGACCAGGGCCTGATGGCATACCTGttattttgttacaaaattgTAAGTTTGTCCTAGCtgatattttatgtaaaatttataaCCTATCACTTAGATGCGGGATTTTTCCCACTTATTGGAAGAAGTCATATGTTACACCAGTTTTTAAGGATGGTAATCGGGCAGATATGAAAAATTATAGAGCCATCTCTAAGATGTGtttaacttcaaaaatatttgaagcctTGGTTTCAGATAGTATAACTCCACTTTTTAGACAGGTTATGATTAGTGAACAGCACGGCTTTATAAAGGGGAGATCAACTGTTCGAACCTGTTATGCTATGAGCAGATACTGTTGGGAGCTTTCGAGAGTGGGTACCAGGTCCAAAGGTGGATGGAATAATAACCCCAGCGCCCGTCAGTTTATGGGTGCATATAAACGTCTGCTCATAAGGGGGGAAGTAAGAGAGGGTGGTGTGGGAAATTGTATTCCACTCGATCACATTCCAGTGTTAGTAGCTTCATCCACAACCAATTATACCAACCCAGAAGATCACATAAACTACAGTACACCTGGATTTACTGAacaagatctaaatttaaaagaagATATATTTGAAATTGTAAACGATCACGACTATATTATGAATACTATTGTCATGACAGATTGCTCGTCTCAAATTGTTATATACATTGCAGAAGCACTATACAAAGCCTTCGAACTAAATGGGAAAATACAGGATCATTGGATAGAAGGGCTGGAAGTGGCAGAAGAAAAATTTCAAACTGTATCGAATGCCCATCCTGTGCTTCATGTTGATAATAACCATCCTCCAGTGGCCTTCTTTATCGACCTGCCTCACCATTCTTCCCAAGATGTAAGTCCTCAAGCATCAAACTTTTATTACGATTTTAAGTCAGCAAATTTTGATTTGCTTAACAATTACCTTATTTCTATACCCTGGGAAACCTATTTTGCTGAGCATGACGACATAAGCGACATGCTTGGAATATTTTATGATGAATTGTACTCCGCTATCCAGTCCTTTGTCCCTCTGAAAAAAGTGTCATCCAGAAGGTTTCCTAGATGGTTCTCACAGGAACTTAAACAATTGACAGTCCAAAAAAAGATTGCTCATAAGAAATTTAAGTCTTCGGGATCAGACTGTGATTATGCTGTGTTTTCCGAATTGCGTGCTCAATGTGTTAGGCTGTCAAGAAGCTGCTATAGAGGTTTTGTGCAGGATACTGAGTCAGGTCTTAGCAGTAGTATGAAACAGTTCTGGAATTTCATGAATAGTAAACGTCAGCTTAGTGGTTTACCTTCTgaattatttttcaatgataTTCAGGTGCCTATGGGTCCAGATGCCGCTGAGCTTTTTGCCGATTATTTTGGGACAGTTTATTCCAATACAGAAGTTGAACCTCATGAGGTACTTTCTGATAATGATCTAAATATTCATACCTTTTCTGTATCTCTTTCTGATGTGTATACTGAACTGAGTAGTCTGGATTGCAATAAGGGTCCTGGCCCTGACGGCATACATCCCTTTCTGCTCAGGAAGTGTGCTTTTGTTTTGGCCAAGCCTCTGCAGATAATTTTTAATAGGTCCTTGAACCTGGGAATTTTTCCGGACTTTTGGAAGATAAGTTTTGTTGTTCCTATTCACAAATCTGGCAATAGGGCTGATGTCCAAAACTATAGGCCTAGTAGCATAATTAGTACTATCCCTAAAATCTTTGAGAAAATTATAGCCAACAATTTGACGGCACTTTTAGGGTCCCTGATAATTGATCAACAGTTTGGTTTTTGTGTGGGTAAAAACACGGAATTGAATCTAGTGTCCTATGTCGATACCTTGTTTGGGGCCTTGGAGGGAGGATTTGAGGTACATTCGATTTACACAGatttttccaaggcctttgacaggGTCCCTCATGGGATACTAATGCGAAAATTGCAAGCACTGGGACTCTCCGGATCAGTGCTTCAATGGGCCAAGAGTTATCTGAGTAACCGTCGTCAGTTAGTCCGCGTTAACAACTTTGTGTCCTCAGAGATACCTGTCCCCTCTGGAGTCCCGCAAGGATCTCACATTGGTCCACTTctttttaatctatttgttaatgATGTTGGTGAGTGCTTTCGTTCAAGTAAGTTTTCTCTTTTTGCAGATGATATGAAGGTTTATAATGTGATCAGGGGTTATAATGACTGTGTTGATCTTCAGAATGATTTAGACAGGTTTGTCGAGTGGTGTGACGTAAATCACATGGACTTGAATATTTCCAAATGCAAATTCATCAAATTTTCCAGGTTGCATTCTTCCCATGATTTTCCATATCAAATACAAGAACAGGTTATTTTAGAGACTGAGTCAATAAAGGACCTTGGAGTGACCTTGGACAAAACACTTTCTTTTGTGCCTCATATAtcacaaataacaaataaagcACTACAAATGCTTGGATTTATTAAGCTACACACAAATGAATTTTCTAATATAAACTCCTTTAAGCTTCTTTACTGTGCACTGGTCAGGACTCATCTAGAATATGCTTCCTGTTTGTGGAATCCACACTATAACACCCATATTCAACGACTCGAGCAAGTGCAAAGAAAAttccttaaatttattaactacAAATTTAAGAATCAAGACTTTAACTATGAGACCCTGTGCTCGGAGCTTAACATGCTACCACTGGTTACTAGGCGGGATAATAGAGACCTACTCTtgttgtacaaaattttaaatagtattgCTAATTGTCCAACATTACTGTCAAGGGTGGGTCTTCGTGTCCCGCCTAGAAATACCCGATCTAACCAGACTTTTCATCGGCAGCTTTATAGAACTAATTATGCATGCAATTCATTTATTCCAAGAGCTACAGCTTTGGCTAATGAGCTCGGtgaacttgatttttttggtacccCATTGAGGCAGTTTAAAGGAAGGCTATTGTTGCGGGACCATACAGCTGTTGAAGCACACAGCCAAACTAATTTTCCTGGGACAGTAAGAACAGCAAGAAATCGTATAAGGAAAAATTCAGAATTGAGAAATAGGGTAGCTGCTAGAAAgccatttttgacaaatatgaaTAAAGAGCATAGAATGGGGTTTGCACTGGAATATTTACCGCAAGGTGTCAATTATGGGAAAGATGGTTGGGAAAAAAAGCCTTTTTTCCGATATTCACAAGAAAATATGGAGGCGGCAATTGCAGCCTGCCGCCTTGGAATGCCATTTTCAACTGCCGCCAAGCAATATGGAGTCCCAAGAAACACACTAAAGAACAAAGTTAAAGGGAAGACACCAGTAAAACGTAAAATGGGTCCACCTTCCATTTTACCAAAAGCAGAGGAAGACGCCCTATGTAAATGGATAATTGAAGTTTCCGATAGAGGATTTTCCCTTCATAAAGATGATCTATTAATAACGGttcaaaaaattatgaaaagcaGCAATCGAAAAAATCCATTTCGTAATGATAAACCTGGTAGAAAATGGTtggaagcattttttaaaagaaacccTACCATATCTCTCAGAGTTCCTGAAACTGTGTCAGCTACGAGGGCCACAGTGACAGAAAAAAATCTTAGAAATTGGTTTCAAGAAGTACACAGctatttagaaaaagaaaacctgactgaaattttaaattgtccGGAACGCATTTTTAATTGCGATGAGTCAGCTTTTCAGAT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Protein Sequence: MCNVLTENYDVILLTETFLDTTVLSGELGLDGYCVFRCDRSESTSNCVTQGGVLIAVKSTLQCHLLVPILNSVEQVFVLITVGANRILIGNVYIPGVSTVELYESFCLSVMQLCDETDFTDVLLWGDFNLPRVSWINDENGSSPTGNVSGEVTVISDCAAYLGLFQNITIPNKYGNFLDLLFSNHIDTHVTICDKPLVRLNAPHPAFECNYKLGSPIPNNISCDYFYYDFKRADYAEINLLLASVDWSFISECTDVDFVVSQFYNILYFAIELFTPISQYKTPKFPKWMSSDLKALIINKKEAHRNFKQSGTLHDYTIFSNLRTQCRNMSYSVHHEHIATVEAQLTDRASFWKFVNSKRGNNEYPQCMSLNHNLSSDPQEISEMFNEYFSSVYLEHEESNVFFDCDRSVSVGFLNLSVIDVFNRISMLKSSLGPGPDGIPVILLQNCKFVLADILCKIYNLSLRCGIFPTYWKKSYVTPVFKDGNRADMKNYRAISKMCLTSKIFEALVSDSITPLFRQVMISEQHGFIKGRSTVRTCYAMSRYCWELSRVGTRSKGGWNNNPSARQFMGAYKRLLIRGEVREGGVGNCIPLDHIPVLVASSTTNYTNPEDHINYSTPGFTEQDLNLKEDIFEIVNDHDYIMNTIVMTDCSSQIVIYIAEALYKAFELNGKIQDHWIEGLEVAEEKFQTVSNAHPVLHVDNNHPPVAFFIDLPHHSSQDVSPQASNFYYDFKSANFDLLNNYLISIPWETYFAEHDDISDMLGIFYDELYSAIQSFVPLKKVSSRRFPRWFSQELKQLTVQKKIAHKKFKSSGSDCDYAVFSELRAQCVRLSRSCYRGFVQDTESGLSSSMKQFWNFMNSKRQLSGLPSELFFNDIQVPMGPDAAELFADYFGTVYSNTEVEPHEVLSDNDLNIHTFSVSLSDVYTELSSLDCNKGPGPDGIHPFLLRKCAFVLAKPLQIIFNRSLNLGIFPDFWKISFVVPIHKSGNRADVQNYRPSSIISTIPKIFEKIIANNLTALLGSLIIDQQFGFCVGKNTELNLVSYVDTLFGALEGGFEVHSIYTDFSKAFDRVPHGILMRKLQALGLSGSVLQWAKSYLSNRRQLVRVNNFVSSEIPVPSGVPQGSHIGPLLFNLFVNDVGECFRSSKFSLFADDMKVYNVIRGYNDCVDLQNDLDRFVEWCDVNHMDLNISKCKFIKFSRLHSSHDFPYQIQEQVILETESIKDLGVTLDKTLSFVPHISQITNKALQMLGFIKLHTNEFSNINSFKLLYCALVRTHLEYASCLWNPHYNTHIQRLEQVQRKFLKFINYKFKNQDFNYETLCSELNMLPLVTRRDNRDLLLLYKILNSIANCPTLLSRVGLRVPPRNTRSNQTFHRQLYRTNYACNSFIPRATALANELGELDFFGTPLRQFKGRLLLRDHTAVEAHSQTNFPGTVRTARNRIRKNSELRNRVAARKPFLTNMNKEHRMGFALEYLPQGVNYGKDGWEKKPFFRYSQENMEAAIAACRLGMPFSTAAKQYGVPRNTLKNKVKGKTPVKRKMGPPSILPKAEEDALCKWIIEVSDRGFSLHKDDLLITVQKIMKSSNRKNPFRNDKPGRKWLEAFFKRNPTISLRVPETVSATRATVTEKNLRNWFQEVHSYLEKENLTEILNCPERIFNCDESAFQICPKSNKVIGPRGGKNIYEIAKGSEKESITVAITVSADGTLLPPFLLFSYSRFPGALVTNVPNEWALGKSEKGWMTGESFYEYVANVFYPWLIKNQITLPVILFIDGHQSHLTMALSEFCEEKKIILVALYPNATHIIQPCDVSVFRPLKDQWRKTVHRWILDCNIEVLNKTNFPLMFVEAIKGITKECITNGFRKCGLYPWSPDAVDYSKCIKDRCSKQNQEVLNVHALQVQKESVSHIKYLETFIDSAILNRFRECSDEETWNGEEKWTELYNVWLKIKKQYDVEHSKKIVRNNDVDLSAEPIAGPSSAFDLSLPEADTIEKTPLKTTTEVLIDTNLQTPPLHSNKPSNKPNNFTPLLVNDNSNLSVGTPFKRALFYPDKKDNKSGKKKSNNRGKNISVVSSKEWKKDKREKEEKKRKAESEKEQRKKQRLEKKQLKLQEKEKKKILTSNKKKKKGPWDSESSSSGDESIKYADSTSSASEDFSDLERQDDEDRISLGILSTDHVSNMEVKLIPESYYAVYYDEQYFIGRIIRIDYENSKAAVKFLKEITPNSFLWPFKDDIDEVHLYRVFFGPIDLIGNNPFAIDNDVIKKINSAYKLFKTKRRVGK

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -