Pbuc038926.1
Basic Information
- Insect
- Phalera bucephala
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_905147815.1
- Location
- LR990629.1:25409939-25423516[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- zf-C2H2
- Domain
- zf-C2H2 domain
- PFAM
- PF00096
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 20 0.0015 0.21 13.6 0.2 1 23 153 175 153 175 0.98 2 20 0.0031 0.44 12.6 0.1 1 23 181 203 181 203 0.96 3 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 210 226 208 228 0.94 4 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 344 360 342 362 0.94 5 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 435 451 433 453 0.94 6 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 526 542 524 544 0.94 7 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 639 656 639 658 0.95 8 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 774 791 774 793 0.95 9 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 866 882 864 884 0.94 10 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 957 973 955 975 0.94 11 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 1048 1064 1046 1066 0.94 12 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 1139 1155 1137 1157 0.94 13 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 1227 1244 1227 1246 0.95 14 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 1362 1379 1362 1381 0.95 15 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 1500 1516 1498 1518 0.94 16 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 1591 1607 1589 1609 0.94 17 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 1679 1696 1679 1698 0.95 18 20 0.31 44 6.3 0.0 3 19 1771 1787 1769 1789 0.94 19 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 1859 1876 1859 1878 0.95 20 20 0.19 27 6.9 0.0 2 19 1994 2011 1994 2013 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGCTACGGAAGTAATGAAGTTTGAAGTGGAAGGCGAGACGTGTTGCGTGTGCGGTGGCGGCGGCGAGCTGCTCACCCCCGAGGAGCACGACGCCGGTACGCACACGCCGGTGCCGCTGCGGACTATGCTGCTGCAGCTCAACTCCAACAAGgtAGTGCCAGATGGACGTCTTTGTGCTAATTGCATTCGCCGTGCCATGGAGGCATATGAATTTAGCTCTGCATTGTCTACTAAAGGGACTCCACCACTCAGTGAGAAGATTAGAGCGTTGCGCAGGAGATTGCATGAATTAACTCAGAAGATTGATGTATTCATTGTGATTGGTGGTGCGGGAGGTGCAGGCTCCTACAGTGAGGATGACATCATCATGGTGGAGCGAGATGCACTAGCTGCTGCTGCAGCTGCTGATGATGAGGACCTGGAGAAAGCTAGGAATGCTAGAGGAGACTCGGTGTACCAATGTTCTGTGTGCCCACTGTCATTTCAGCGCGTGTCCGAGTACCGCGTGCACGTGGGCACGCACCCGGAGGACGCGCAGCACTCGTGCTGGACGTGCGGCGCGCAGTTCAGCACGCGCGGGGCCCTCGCGTCGCACGCGGCCACGCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGCCGCTCGCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACCCCGACAGGTACGTGCCGCGGTCACTGCGGCGCCGCCCTCGCCTGCCAGCTGTGCGGGCGCGCCGCCGCCAGCGCCGCCGAGCTGCGCCGCCACGAGGCCGCCTGCCCGCCGCGCTGCCCCGCCTGCGCACAGCTGCACATCTCCCATTATCTACTCAGTTGGGCGAGGGATCTTTACAACTTTACCAGGTGGGGCACTTTAACCAGAGGGCAGGTGTTTAA
- Protein Sequence
- MATEVMKFEVEGETCCVCGGGGELLTPEEHDAGTHTPVPLRTMLLQLNSNKVVPDGRLCANCIRRAMEAYEFSSALSTKGTPPLSEKIRALRRRLHELTQKIDVFIVIGGAGGAGSYSEDDIIMVERDALAAAAAADDEDLEKARNARGDSVYQCSVCPLSFQRVSEYRVHVGTHPEDAQHSCWTCGAQFSTRGALASHAATHCGAALACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCGAALACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDSAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAAPPSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCGAALACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAAPPSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLAASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCGAALACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLACQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRSPASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAPRQVRAAVTAPLAASCAGAPPPAPPSCAATRPPARRAAPPAHSCTPTGTCRGHCAARCQLCGRAAASAAELRRHEAACPPRCPACAQLHPDRYVPRSLRRRPRLPAVRARRRQRRRAAPPRGRLPAALPRLRTAAHLPLSTQLGEGSLQLYQVGHFNQRAGV*
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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