Pfun002355.1
Basic Information
- Insect
- Penthetria funebris
- Gene Symbol
- CSRNP1
- Assembly
- GCA_027564355.1
- Location
- JANSTX010057276.1:4590-9109[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CSRNP_N
- Domain
- CSRNP_N domain
- PFAM
- PF16019
- TF Group
- Unclassified Structure
- Description
- This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 5 1.4e-32 2.3e-28 99.5 0.2 2 93 344 437 343 460 0.84 2 5 2.9e-66 4.9e-62 209.6 9.0 84 218 495 629 480 629 0.89 3 5 0.36 6.1e+03 -3.2 10.8 46 93 713 762 701 784 0.57 4 5 0.19 3.2e+03 -2.3 0.8 81 103 1000 1022 965 1063 0.52 5 5 0.25 4.2e+03 -2.7 0.3 76 103 1082 1109 1054 1148 0.54
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGTTTGTAGTAAAATTAATTTAATTGAAATCAATTATTTTAGTATATCATCCAATATGAATACAGCAACAACGGTTGTGGGCGAATCAATTATGGAATCAACTATTGAAAGTAACACAATTTTAGAAAATATTGATCCACTATCGTCTGATTTATTATCAACTGATCCATTATCGACTGATCCATTATCGAGTGATCCATCATTACTAACTGATCCATTATCAGATCCAATTGAATTAGATGAACATGGTACAATAATATGTTCTAATAAAAGTACTATTAATAATAAAACAATCATAAATTCAGACACACCGACTTCATCATTATCGAGTGATTCATCATTATTGACTGATCAATTATCAGATCCAATAGAATTAGATGAATGTGGTACAATATGTACAAAGAGTAGTAGTATTAATAATAGTACTATTGATAATAAAACAATAAATTTAGTAGACACAGATGTTAAAAATGAAAATACAATTATTTTTAATGTAAATAATATAAGACATGATTTAATATTATCCAATTTAAATAGTAAGTCAATTGAAATCGTGAATATTGAAGATGATAATAATTATTTAGAAAATAATAATATAGAAAATGAACAAGAAATTGACATGTTGGATGTTGATAAAGCGATTGTAGTACATGACGGTACAATTAATGTTGTGGATACAATTGCTATTGATGACGTTGCAATGAATGTTGATGAACAAATTGTTGTGGATCCACTCATTGATAGTCAAAATATTGTTGATATTCCAGGACTAATTGATAGTGAAAATGAAATTGATGATGGTTGTTCTTATGATGTACCATCAGCGACAACGCTAATTATTGAAGAAACTGGTGAAGAGGCTGGTGTACGTAGTGATGGATCCGATTCTGGTCTTGGTTTAGATTCATCGTCATCATTATTATTATTAGATTCAATAAATAATATTCGACCAGTTATTTCAAATGTACCAAATCGAAGTAATTTAAAACGGCGATCAGATGGTGCCCAACCAAATAATTCAAAGAGATCTAAACGTAGTATAACATTTGATACAGTAACAGTATATTATTTTCCACGGTCACAAGGTTTTGCTTGTGTACCATCACAAGGTGGATGCACATTGGGAATGAGTTTACATCATAGTCATTGTAAATCGTATACATTAGCCGAACATGCGGCTGAACAACGAAAATTACATCGTCAACAATTAcaaagtgaattacatccacgtaatatttccacaaataatatacggaataattcaattgctagtgatgtagtaacaactgtagctacgacattatcaacaatatcatcatcagcaacattaacagcagcaacagcagcagcaacgccatcatcatcatcaacgacaacctcatcaacagcaaccactgtttctactattaatagtagtactattcttgttgatggcgttagtgatattattgttactaatagcaatggtattgctaataatGGTTCGTCAAGTGATGATTCTTCGTCTAGTGAAGAGGAAATTACAGATAATAGTGGTTCTGAAATGGATGCCGAATCAAATGGATTTTTACATCCGGTACCGACAAGGCAACGACGTGCACTATTAAAAGCGGCTGGTATACGAAAAATAGATTCAATTGAAAAAGATGAATGTCGAACAATACGTACATCTAGAGAATTTTGTGGATGTAATTGTCGTGGTTATTGTGATCCAGAAACATGTTTCTGTAGTCAATCCGGTATTAAATGTCAAGTTGATCGTCCAAATTTTCCATGCGGTTGTACAAGGGATAGTTGTGGCAATGTTTTTGGTCGTGTTGAATTTAATCAGGCACGTGTTCGAACACATTTAATACATACATTGGTACGTTTAGATATGGAAAAGAAACAAAATAATGTTGAAGATATTACGGGATCATCATCAGAATGGAATcaacaattacccgatattcagaattttattaatagtaataatgcatataataataatagttgtgttaataatacgaatagtaatgataataataatagtacatacaattgtggtagtaataatgaggataacaatagtaatacaacaaataatatactaaatgaattaaataatattaatagtaattataataatgatggtactattgaacaacatcatcataatgatcatcatcatcatcatcatcatcatcagcagcagcagcagcagcatgaacagcaacatgaacagcataatcatcaattaatagacgaattcgttcaaatgCGTACACCAAATGAATCTCTTGATTTAGATTATGCCTATAGAGATGATTATGGATTAACAACTTCGGCAACAGAAAAAACAGGAACAATTACGTCATTAGTTAATAATGATTTAACAAAAATAAAtgatagattagtaacattatcgtcatcatcatcgtcatcgttactgccatcaacaattaatgttgacgacgatcaaaatgattatttaaataaaatttataataataatagtcatgaaataaatacaaataatatatatagtaatcatcagtattcattaaatgatgatgttgatgatcacggtggaggtgttgatgatggttttggtggtggtggtggtggtggtgatgaagattgtgacgttggtacggatattaattgtgctgataatattattgagaacaacagtattaataatgatattactattagtacagatacttgtgatagttctccaataaatgattataataattgtgatgataaaaatattaatattattgatAGCATTAAATATACAACTACTGATGTACTACATAATAATTCTACTGAAATTAATGTTGATGGTGTTAGATTTAGTAATTTAGAAGATAAAAATAATCAAATTATAATAAATCATTCATCGCATTCCTCAATTTATCAATCAACAAAAAAATTATTAAACACACCaattgaaacttcatcatcgactttaattaatttaaattgtaatgatgataatcttattcataataatagtaatagtaataataataataataatagtaatattaatagtaataataataatgaattaaataatattattaataatattgaaaataaacaattatgcaatcaatTATCATCTAACGATGATGAGATAAATGATTTTGTTAATTTACATCCACCAAAAGCAAATTCAGCACAAATGGATGTAATAAATAATTTATTGGAAAATAATCGTTATAATTCATCAACAACATTATCATTAAATGTAAATATAAATAATGATGATAATCATAATGGAAAAGATGAAATGAATTacaacagcaataataccaataagggtgatgatgatacgacaactgaagttttaaaaattaatcatttaaatgataataaagtatcaataaatgtacttgataattgtaatttaaataatatcaatagtaataatgattgtagtaatagcagcagtaaATCGGTAAATATATCAGTAGTTGAAACTGAGGAAAAATTAAGTGAATTATTAAAGAATACAATTTCCGCATCAGTTTCATCCACATAA
- Protein Sequence
- MVCSKINLIEINYFSISSNMNTATTVVGESIMESTIESNTILENIDPLSSDLLSTDPLSTDPLSSDPSLLTDPLSDPIELDEHGTIICSNKSTINNKTIINSDTPTSSLSSDSSLLTDQLSDPIELDECGTICTKSSSINNSTIDNKTINLVDTDVKNENTIIFNVNNIRHDLILSNLNSKSIEIVNIEDDNNYLENNNIENEQEIDMLDVDKAIVVHDGTINVVDTIAIDDVAMNVDEQIVVDPLIDSQNIVDIPGLIDSENEIDDGCSYDVPSATTLIIEETGEEAGVRSDGSDSGLGLDSSSSLLLLDSINNIRPVISNVPNRSNLKRRSDGAQPNNSKRSKRSITFDTVTVYYFPRSQGFACVPSQGGCTLGMSLHHSHCKSYTLAEHAAEQRKLHRQQLQSELHPRNISTNNIRNNSIASDVVTTVATTLSTISSSATLTAATAAATPSSSSTTTSSTATTVSTINSSTILVDGVSDIIVTNSNGIANNGSSSDDSSSSEEEITDNSGSEMDAESNGFLHPVPTRQRRALLKAAGIRKIDSIEKDECRTIRTSREFCGCNCRGYCDPETCFCSQSGIKCQVDRPNFPCGCTRDSCGNVFGRVEFNQARVRTHLIHTLVRLDMEKKQNNVEDITGSSSEWNQQLPDIQNFINSNNAYNNNSCVNNTNSNDNNNSTYNCGSNNEDNNSNTTNNILNELNNINSNYNNDGTIEQHHHNDHHHHHHHHQQQQQQHEQQHEQHNHQLIDEFVQMRTPNESLDLDYAYRDDYGLTTSATEKTGTITSLVNNDLTKINDRLVTLSSSSSSSLLPSTINVDDDQNDYLNKIYNNNSHEINTNNIYSNHQYSLNDDVDDHGGGVDDGFGGGGGGGDEDCDVGTDINCADNIIENNSINNDITISTDTCDSSPINDYNNCDDKNINIIDSIKYTTTDVLHNNSTEINVDGVRFSNLEDKNNQIIINHSSHSSIYQSTKKLLNTPIETSSSTLINLNCNDDNLIHNNSNSNNNNNNSNINSNNNNELNNIINNIENKQLCNQLSSNDDEINDFVNLHPPKANSAQMDVINNLLENNRYNSSTTLSLNVNINNDDNHNGKDEMNYNSNNTNKGDDDTTTEVLKINHLNDNKVSINVLDNCNLNNINSNNDCSNSSSKSVNISVVETEEKLSELLKNTISASVSST
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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