Basic Information

Gene Symbol
mybL
Assembly
GCA_027564355.1
Location
JANSTX010040673.1:5615-9975[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 4.8 5.3e+03 -2.5 0.1 32 46 238 252 226 252 0.64
2 5 1.8e-11 2e-08 34.1 0.1 3 43 260 301 258 303 0.94
3 5 9.6e-11 1.1e-07 31.8 0.1 2 43 313 358 312 359 0.96
4 5 6.4e-09 7.1e-06 25.9 0.0 1 46 367 413 367 413 0.93
5 5 1.4e-08 1.6e-05 24.8 0.3 3 44 421 463 420 465 0.93

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCTGTCCGAAGTTCTGGTGATGAACGTGAAAGTAGAAATTCATATAATACTGATTATGAAAGTGAAACAGTTGATACAGAAAATGAATCGGCTGATGAACGTCCTGAAACAATTGCTACTGATGATTTTGTTAGTGAAGCAAAACATATAATATATAAACATTCGGACATAACAATAGAAAATGCATTAGTTTTAAATAAAAAAATGCAAGAAATGTTAAGACTGTTTAAACATAAATTAGAAAATATTTTAAATATTTGTTTGGAAAAATATAAACAAAATGAAATATGCTTAAATGAATTTGTAATTGCGAAGAAACGTTTTCCCGGTCGTTATATATCTTATTATCATTGTGGCATACCATTTTTTAAAAATAATGAATTAATACATTGTCCAGCTAATGATGATTATAAATATCGTAAAATTGTGTTAAAAGAATTTTTTCCCTGCGATTATGAAAGTAATTGCACATGGTCATCAAGAGACAAATGTTGTCTGATACAAGGTGTTAAAAGGCAACTTATAAATTATTTAAATGTTCAAAAGTCACATATTAAAAGAAAAACGACAAATAATTTAACTGTAAAACAATGCAGTAAATTGGAAAATTTATCATTAAAACCATTAACTgaattattaaaaatatctgaagattatgatggttttcatatagactggaatttaatttcatttgaaaatgttgatgaacgtcatcaagccaaacaatgttctgctatttggcataattatttgatgcccaatttaaatcgaaaaatatggtctaaagatgaagaatttcaattattgaatgcagttaataagtatcgtcaacaaaattggactgcaattggaaatgaaattgaaggtcgttcgccatatcaatgttttgtacactatcAATGTGTTTTTAGTGAAAAAAATTTATTAAAACATGATAAATGGACAAAAGAGGAGGATAAATTATTAATAGAAGCAATTGGAAATTGTAAAATTGGTAATATGATACCATGGAATCAAGTTGTCAATCGTATGCCCGGTAGAAATAAGATGCAAATTTATAATCGttactgtttttcaataaaaccaggcattaaaaaagataaatttagtgtcgaagaagattgtattgtagttgcagtcatcaaagaatatggtacaaattttgcaaattttccatttcatttattaccgggacgtaccttagtacaaatacgtaatcgttacaataatgtattacgttttgttggtaaagtaaaacattgggatgccgaaaaggataaagaattaatGGAATTGGTCAAACAATATGGTACATCCGATTGGGTGAAAATTGCAAAAGAAATTAAGGATTTTAATCGTTTTAGTTGCCGTACACGTTACAAAACAATAATGAAATATTTAAATCAAAATCCTAATTTTGATATTGTTAATATACCAAGAAAAAAACGGAAAATGTCAACAATTGTAACAGCTGACAATTGGATGGAAACAATAATTAAGGATAAACAAGCACAATATTTAAAAGCACCAGCCATTCAAAATATGAATATGAAatcatcaacagcaacagcagaagcagctgcagcgtcctcatcaacatcaccatcggataaattaacaacagattTTTATAGTTTTTTTAAATATTCATATGATTATGATATTTGGGAAAGAAAACCACCACAAAAAGATATAGCCGAAAATCTAATGGTTTTAGGGCAATTACTTAATGGCAGATTAAATGATAGTTTTAAAAAACCACTCTATTTACCAATAAATATTGATACAAAATCAATAACATTAGAACATTTGTACAAAGAATTTCTAAATACTTATAGTAATAATAATTTCATATTATCACCAAATTGGAATACTGCATTAGGTTTACGTGGTCTATCCATAATGTTTCCATATTCTGATGATACAATCAAATACCAAAGTGTTGACACAAATAAATCTTATGATGTTAAAAATTATCATCATCAAAAAGCTGAACAATTATTTAAAAAACGATTTAATATGATATTTTATAGTACATTATTATTATCACAATTAAATTTACCAGTGTTAGTGGCTAGTGATAGAAAAGTAAATAGtaataataataaaaatttaaattctgaacatatatttaatgtaaatgagttagatatggattgtatggatggatatgaagaggatgaaaatgatggtgataattttaataatgatggtgatgatggtgatgatgatgatgagaatggtgatgatgatgagaatggttattattgtgataataatgaaattgacaaagaaattattaatggtaatgaagcgtattgtgtcacgaatggagttgataaaaataatgcatCTTCTGAACCAAATCATATTAATACAAATAGATTAGATATTATTTATAGAGAACAAAATTTAAATCCTATGGAAATACCAGACAATTCTATAGTGATAAGTAATGAACCAATAGTTGAAAATGGACATAATATAATTGAAAGTAATGATTTTGTTCATTGCAATCAAATAATTCAGAATAATGAAATAGTTATTATTAATGATGAACACATACCACCCAATGATAAAACGATAATGATGAACGCGGAACAACGAATAGTTAATCCAATAATTGATGATGGAAAAAATTCCAGTTGTGAACAAGTTTTATTGGAAAATAAACATGATATTGTATTAATTCGAAATTTAAATGTAGAATTAAATAATGATCTTACAACAATGCCATCATCAACATCAACAACATCGCTGACGACAATAACAACACCATCTAGTAATTACTCAAGTTCAATTGCCACTGTTAATAATATAACTAATATCGTTCCAATTAATATTGATTATTCAAAACCAATTTTTGATTATACATTAGAAACAACAGAAGGTAGTTTTAAAATTTCATTACTTGAAATGGATCCGAAAATAATAGACAATAATGTTAAGAAAAGAAAAAATCAATTGTTAACAAATGACAATGAAGTAACAGGGGAACATAAGAGAATAAAGGAAAATCCTCAGTAA
Protein Sequence
MSVRSSGDERESRNSYNTDYESETVDTENESADERPETIATDDFVSEAKHIIYKHSDITIENALVLNKKMQEMLRLFKHKLENILNICLEKYKQNEICLNEFVIAKKRFPGRYISYYHCGIPFFKNNELIHCPANDDYKYRKIVLKEFFPCDYESNCTWSSRDKCCLIQGVKRQLINYLNVQKSHIKRKTTNNLTVKQCSKLENLSLKPLTELLKISEDYDGFHIDWNLISFENVDERHQAKQCSAIWHNYLMPNLNRKIWSKDEEFQLLNAVNKYRQQNWTAIGNEIEGRSPYQCFVHYQCVFSEKNLLKHDKWTKEEDKLLIEAIGNCKIGNMIPWNQVVNRMPGRNKMQIYNRYCFSIKPGIKKDKFSVEEDCIVVAVIKEYGTNFANFPFHLLPGRTLVQIRNRYNNVLRFVGKVKHWDAEKDKELMELVKQYGTSDWVKIAKEIKDFNRFSCRTRYKTIMKYLNQNPNFDIVNIPRKKRKMSTIVTADNWMETIIKDKQAQYLKAPAIQNMNMKSSTATAEAAAASSSTSPSDKLTTDFYSFFKYSYDYDIWERKPPQKDIAENLMVLGQLLNGRLNDSFKKPLYLPINIDTKSITLEHLYKEFLNTYSNNNFILSPNWNTALGLRGLSIMFPYSDDTIKYQSVDTNKSYDVKNYHHQKAEQLFKKRFNMIFYSTLLLSQLNLPVLVASDRKVNSNNNKNLNSEHIFNVNELDMDCMDGYEEDENDGDNFNNDGDDGDDDDENGDDDENGYYCDNNEIDKEIINGNEAYCVTNGVDKNNASSEPNHINTNRLDIIYREQNLNPMEIPDNSIVISNEPIVENGHNIIESNDFVHCNQIIQNNEIVIINDEHIPPNDKTIMMNAEQRIVNPIIDDGKNSSCEQVLLENKHDIVLIRNLNVELNNDLTTMPSSTSTTSLTTITTPSSNYSSSIATVNNITNIVPINIDYSKPIFDYTLETTEGSFKISLLEMDPKIIDNNVKKRKNQLLTNDNEVTGEHKRIKENPQ

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
-