Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_963921195.1
Location
OY992537.1:231557060-231589099[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
THAP
Domain
THAP domain
PFAM
PF05485
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 34 7e-15 1.6e-11 46.2 0.9 1 86 781 853 781 854 0.84
2 34 4.9e-15 1.1e-11 46.7 4.9 1 87 881 950 881 950 0.81
3 34 3e-15 6.6e-12 47.4 0.1 1 87 971 1043 971 1043 0.84
4 34 9.6e-14 2.2e-10 42.5 3.4 1 86 1126 1193 1126 1194 0.78
5 34 1.2e-14 2.7e-11 45.4 5.7 1 87 1218 1290 1218 1290 0.80
6 34 1e-11 2.3e-08 36.0 1.0 1 87 1325 1393 1325 1393 0.81
7 34 7.7e-11 1.7e-07 33.2 2.2 1 85 1434 1502 1434 1509 0.72
8 34 1.4e-15 3.1e-12 48.4 1.9 1 87 1531 1601 1531 1601 0.82
9 34 4.1e-14 9.2e-11 43.7 0.7 1 86 1623 1692 1623 1693 0.78
10 34 1.6e-13 3.7e-10 41.8 1.9 1 87 1721 1793 1721 1793 0.86
11 34 2e-07 0.00044 22.3 1.0 1 63 1861 1917 1861 1940 0.71
12 34 2.3e-10 5.1e-07 31.7 0.1 1 87 1957 2028 1957 2028 0.78
13 34 1.9e-12 4.3e-09 38.3 4.0 1 87 2059 2130 2059 2130 0.77
14 34 4.2e-13 9.4e-10 40.5 3.2 1 87 2177 2248 2177 2248 0.77
15 34 7.6e-13 1.7e-09 39.6 1.3 1 87 2270 2338 2270 2338 0.80
16 34 3.1e-14 7.1e-11 44.1 0.1 1 87 2638 2707 2638 2707 0.81
17 34 9e-12 2e-08 36.2 3.2 1 85 2765 2844 2765 2846 0.80
18 34 6.6e-10 1.5e-06 30.2 1.3 1 87 2904 2976 2904 2976 0.78
19 34 3e-12 6.8e-09 37.7 0.5 1 87 3003 3072 3003 3072 0.82
20 34 2.5e-13 5.6e-10 41.2 1.0 1 87 3095 3165 3095 3165 0.79
21 34 1.4e-13 3.3e-10 41.9 1.5 2 86 3189 3259 3188 3260 0.78
22 34 9.6e-05 0.22 13.7 0.1 1 59 3277 3324 3277 3348 0.76
23 34 3.9e-13 8.9e-10 40.6 2.9 1 86 3365 3434 3365 3435 0.81
24 34 8.2e-13 1.8e-09 39.5 3.6 1 86 3460 3530 3460 3531 0.81
25 34 4.8e-12 1.1e-08 37.1 1.5 1 86 3551 3623 3551 3624 0.80
26 34 4.1e-10 9.2e-07 30.9 2.1 1 86 3646 3714 3646 3715 0.80
27 34 1.7e-14 3.9e-11 44.9 3.7 1 87 4217 4289 4217 4289 0.81
28 34 3.1e-10 7.1e-07 31.3 2.8 1 86 4313 4383 4313 4384 0.75
29 34 5.3e-12 1.2e-08 36.9 3.5 1 86 4415 4489 4415 4490 0.81
30 34 0.28 6.4e+02 2.6 0.9 12 59 4529 4575 4509 4593 0.56
31 34 2.6e-10 5.9e-07 31.5 5.9 1 87 4621 4696 4621 4696 0.84
32 34 3.4e-15 7.6e-12 47.2 0.3 1 86 4720 4792 4720 4793 0.86
33 34 9.7e-13 2.2e-09 39.3 5.3 1 87 5029 5102 5029 5102 0.78
34 34 2.2e-11 5e-08 34.9 0.0 1 86 5126 5193 5126 5194 0.80

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTCACAACGTAAACATTATCACATACATGCTCCCTATCAACACCCCCAACAACAAccacaacatcatcatcatcatgcgcagcagcagcaacaacaacagcagcagcatcaTCATGCACAGCAACACCAACAACAATGGTACACACATGGTAATTTAACACAGCCACAACAGCAACATTATCATCATCATGGTCTTCATATGAGAGATTCCCGCCATATacatcaacaacaacagcagcaaccacATCACAATCATCATACAATGCCACCACATATGTTTACAAGTGGTTATGCTGTTGGTATGCCAACTGCAGCAGCATCAGGAATTGCTGGTAGTGGTGTGGGGGGAAGTTCAACACATAGTACATCGACAGCAGCAATAGCACAACATAACATACCGGCATCTTCTTCGTTACATTATTCTACAACAATGCCGTCTGCTTCAAGTGGGGGTGGCTCGTCTAGCAGTAATAGTAGCGGTGTTATTGTTGGTCGTAACAGAATTTTTGACCTTGAAATGTTAAATGCACAACATAGTGTATCATCATCTGCTTCACATTCTATGTTGTCTGGTGGTGGAAGTGGCAATAATAACAGCAATAATCCAGCTATTGTTAGTGGACGTGTTGGTAGTGCATTTGATGCATATTCTCATAGTTCTTTATATTCCCAACAAAATCCAAGACATCATCCGCACCATCATCCACCTGCTCCTCCTCCTCCACATCCAATACATCATTCCCATCATCACCAACAACAACCACATCATCTTCATCATCAGCAACATTATTATCCGCATCATCATTCTCAACAGCAATCCTTGCATATTCAACcacaacaacatcatcatcaacAACTTATGCCGCCAATGATGCAAAATATAAAATCAGAGCCAGTGGAGCAAGTAACATTAACACCGTCTATACAAACGGAGGAAATTATTATAAAATctgaacCCATGGATGAAGtaacatttcataaaaatgctCCAAATCCCTATAATATGGAAGAAAAACGTAAAGAACaagaacaacagcagcaacaacaattaCGAGAACAACAACAACGAGAAAAACATCATCAGCTACAGCAACAAAAACAATATCAGCAACAACAAGAACAGAAAAAACAGCAGCATCAACAAGAACAgataaaacaacagcaacaacaagaacagaaacaacaacaaaaaatacatcaacaacaTTATCATCATCAAGAACAACATCATCATGaaaatgttttgccacaaacACAACGTACAAATTCGGAGAATTCTTCCACTACTACTGCTTTACCAACAACAACTGAGGAAAAACAACAAgataaacaaaaacaacaaatatcCTTGACTAATGTAAAAACAGAACCAAAgCCCCTAAACTTTCCACGTCGCAAATTACAAACAGAACGTTCATCTACTCTACCCATATGTCAAAGATGTAAACAAGTTTTTTTAAAGCGTCAAAGCTATACACAACATGTTGCTCTATCTTCTTGTACAATAGTTGAATACGATTTTAAATGTTCCATTTGCCCCATGTCCTTTATGTCGAATGAAGAACTGCAGACACATGAACAATTGCATCGTATGAATAggtatttttgtcaaaaatattgtgGTAAATTCTATGAAACTATCGAGGAATGTGAACGACATGAATATGGGCAGCATGAATATGAAATGTATAAATGTAATATATGCTGTATATCTTTATCTCAACGTGATCAATTATTTAATCACCTGAATGAACACAGACATCAACCACGTTTCGATTGTTGTATATGTCGTTTATGTTTTCAAACTTCCCTGGAATTACATGAACATTATATGGCAAATGAAGATTTTTGTGGTAAATATTATGATAAACAAGccTTTAAAACTCAACAAATTACCTCTGCATCTTATCTGGGTAAACCGGAAAGTTCACATCTTGAAATAGCAAATACTTTTTCATTGAAGGATATTTCACCTTTAAAAAGTCATGAATTGCAACCATTATACGGTACACATCAACAGCAAGAAACACAATCTTCCCTGGAACCACCACCACACACACCTTCTACACATGCATCTTACAGCAATATTCCTGAATTTCCATTAGAACCACAGGTAGAGGTAAAAACCGAAATAAAGGTTGAACCTGATTTTTATCCACCCATGGATCATATGGACTATTCCTCCTATGACAATGATTATGCCACACCAGATTATCCAGTTAattcaaatcaacaaaatttagcATTCCTACAAGATTACCAAGATAATGCATCAAATTCTACAAATTCTTCGTTTTCATTTAATAATTCTGATGTTATAAATGATGAAGATGCCGTATGCTGTGTGCCCAAATGTGGTGTACGTAAAATTTCTTCGCCATCGTTACAGTTTTTTAGCTTTCCAAAACTTGAAAAGTATCTTTCACAATGGTTACATAATTTAAAAATGTCTTATGATCCTAATATTAATTATGGTAATTATCGTATATGTGGTTTACATTTTCCAAAACGTTGTATAGCTCGTTATGCGTTAAGCCATTGGGCAGTGCCCACATTTAATTTGGGCCATGATGATGTTGGGAATTTATATCAAAATCGCGAAAGTTCTGGTGGATTTCCTGGTGGTGAAATGGCTAAATGTAGTATGCCCGGGTGTCCTTCCCAGAGGGgagaaacaaatgtaaaatttcatgTTTTTCCCCGAGATTTGAAAACATTAATAAAATGGTGTCAAAATTCTAGATTACCCGTTCATAGTAAAGAGAATCGTTTTTTCTGTTCCAgacattttgaagaaaaatgttttggtaaATTTCGTTTAAAACCTTGGGCTATACCTACTTTAAATTTGGGCACTGTCTATGGTAAAATTCATGATAATCCCAATATATATCAGGAAGAGAAAAAATGCTACCTACCCTATTGTCGTCGCAGTAGATCGTATGATTGTAATTTATCGCTATATAGATTTCCTAGAGATGAGACTTTATTACGTAGATGGTGTTATAATTTAAGATTAGATCCCGAAGTTTATCggggaaaaaatcataaaatatgtTCATCGCATTTTATTAAAGAAGCCTTAGGTTTGAGGAAACTTAATCCGGGTGCAGTACCCACTTTAAATTTAGGGCACAATGACCGttttaatatttatgaaaatgaaTTGTATACCCCACCACCTCCTCCCTCACCACAACCCTCTACTTCCTCGGCTTCTGCCAAGGCACGGAGATTTGAAGAAATGTTTAAACAGGAAATGGGCAACTCTCACATCTATGATGAAGTTTTTGTCAGTTCTATGATACAAAAGTTTTCTTCATCCTCAAACTCTAATTCCTCGTCTAATCCCAATCTCGATTTGGGAGATGTTTGCTTGGTACCTTCGTGTAAGAGAACCAGACATTCCGATGTTACTTTACATACCGTCCCTAAGAGACCAGAACAATTGAAGAAATGGTGCCATAACTTAAAAATGGATCTATACAAAATGCATAAGAGTGTACGTATATGCAGTGctcattttgaaaaatattgtattgGCGGTTGTATGAGACCATTTGCTGTACCCACTTTAGAATTGGGCCATGATGATTCAAATATTTATCGTAATCCGGATGTTATAAAGAAATTAAATATACGCGAAACCTGTTGTATACAATCCTGTAAGCGAAATCGTGATCGCGATCATGCCAATTTACATCGTTTCCCCACCCACCCTGAGCTGCTACAAAAGTGGTGTGAAAATTTACAGAAACCCATACCAGATGGTAATAAGCTTTTTAATGATGCTGTTTGTGAGATACATTTCGAAGACCGTTGTTTGCGTAATAAACGTTTAGAGAAATGGGCTATACCTACCATGAATTTAGGTTATGATGAGGCACCTCACATGTTACCTTCCGAAGAAGAAATAACCGAATTATGGACTAAACCATTTGCTCCCAACAATGGAGATGAACAGGGTGAATGCTGTGTTACGACCTGTAAACGTAATCCTCAAATTGATGATGTCAAATTATATAGACCTCCTGAAGATGCTGAACAAATGGTTAAATGGGCTCATAATCTTCAAGTGGAAGTAATCGATTTGCCTAATCTTAAAATATGTAATCTACACTTTGAGCAACATTGTATTGGTAAACGTTTATTAAACTGGGCTATGCCAACATTAAATTTAGCTTCCAAAGTGGAACATCTCTTTGAAAATCCTCCACCTGCTCCTACCATATACAAGAAAAAAGGGAAACCCGAAAGAATTCATTCCATGGTCGATGGTATAAAGTGGTCGCCACGTTGCAGTTTGCCACACTGTCGTAAAAGTCGTACTTTGGATCGGGTACATCTTTTCCGATTTCCTTACAATAATCGCCAGACTATGCATAAATGGTGTCATAATTTACAATTGCCTTTAGTGGGAAGTTCTCATCGCCGCATATGCTCTAGTCACTTTGAAACGTCGGTATTAACAAAAAGATGTCCCATGACTTTGGCTGTTCCAACGTTGGATCTTAATGCTCCTCCTGGTTATAAAATCTATCCAAATCCTACACGTTTGAAACAACTTAAGGTGGGTCCGCAAAGACAGTGTCTTATTGAAACGTGTCGTAAAACGAAATTGGATGATGTAACTCTATTCCGTTTCCCTAATAATAGAAACATATTACAAAAATGGAAACACAATATTAAAAATTGCCCTAAAGGTAAATTAAGCAATCAATTTAGAATCTGTTCTCAACATTTTGAGCCTCACTCGGTAGGACAGAAAAGACTATCACCCGGCGCAATACCCACTTTAAATTTGGGTCATGAGGGTAAAGACCTATATCCCAATGAAACAAGATCATTCTTTGATTTGAAAAAATGTGCTGTCAGCAATTGTGATTCACGTAAAGATATGGAGGATATAAGACTTTTTAAATTCCCTAGAGATGATGATGATTTACTAAGAAAATGgtgtaataatttaaaaatagagCCCAATGATTGTGTGGGTAT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Protein Sequence
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