Pinf005227.1
Basic Information
- Insect
- Pegoplata infirma
- Gene Symbol
- ARID2
- Assembly
- GCA_963921195.1
- Location
- OY992536.1:98941676-98967122[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 6.6e-27 4.4e-23 82.8 0.0 2 89 74 159 73 159 0.94
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGTTATTAAACCAATCAATGAAATCATCAAATATTTCACAATATAATCGAAATGAAAGTGCTACACAAAGCAGCAGTGCATCGAACGCGGTTGGCGTCACCTCTGGTGGCTCTGCAACTGGAACACCTGCAAGGACACGCAATCAAAATAGGGATAGGCAGCAATCTGATGATAAACAGGATAATGCAAATTTTAAGGGTAAAAATCCACCAAAACCTCCAGAGGAATTCTATAAAGATTTAAAAGAGTTTCATGAAAAGAGAGGcACATCCATTATGAATATGCCTAAAATTACTGGACGTGAGGTCGATCTTCATCGTTTATACTGTGAGGTAACCGAAAGAGGTGGTTTTCAAAAAATCAATATGAAGGATGAATGGGATGAAGTTTTACCCGAATTGGGTTTAAGTGAGAAAATCGTTAATGGATCCACAGCTCTAAAGTATATATATCGTCGTGTTTTGGAAAAATATGAACGTTTAAATTATTTCGGTGAAGATCCAGATAAAGTTGAGGCTCAAGAAGCAGCTGAAATGGCAGAATTAAATATTAGTCAAGGACGCGGAAGAGGTTCGCGATATCCATCAACTTATGGTAGCACAAATTCTGCCATAATACATAATGTAGCAATGACTTATAATTATAGGCAACACAATGTTAATATGGATCGCCGAAGACAGTTTAAATTATCGACAGATTTACATAAGGCATCGCCATATGAAAAATTGATGTTATCAATGCTGTCTCCATTGCCAAATGAACAAGATTTTGCTATCAACGCCTGTACTCTGATGGCTAATGAAAGTAAACatactttgaaattgaatgagtATCCCAAGTTGTTGGATGCTTTATTGGCTCATACGGGAGTCTATTCAGATTATACTATGCGCAAATTATTTCAACATATTTATAGTGGTATACGACATCATTCTTTGTATGGATTTTGGTATGATTTATTAAATGACAGACCACAAATATTGGAATTATATACAGATGAACAGGCTTTAAGAGATGCCGCTTTAATAGATGATTATGATGATGGTAAAACAGAGATGGAGGGAATATGGGAAGATTGTAAAGAATTGGATTTTCTAAATTTACGCACTGGTCTGGGAACTCAAGACTATGTGGGTCAAAGAGTTTTACAGATTATTTCCATATTaagaaatttaagttttctggagGAAAATTTAACGgtattggtaaaaaataaaacgtttttacGATTTTTGGTAATGTGTTCCAATATACGTTGGGGTAATGTTCATATACAAGCTTTAGAAATTGCTGGTAATATAGCAGGTGAGTTGGAAATATTAGATCCTACTAATGACAATTTATCACGTTGTCTTATGTCTACCCTATGTGAGGGCATAGAAGGACCCGATAGAGGTGTTATTATTAATTGCTTagagattttgtataaaatatgtcaAAAGGATACTAACGAGGAATTTATTTTGAAATCTTTAAATATGAATTTCTACAATACTATTGCTTTGTTTATGTCTCTAAATGATATAatgcttttactattcacactGGAAGCCATATACGCCTTGACCTGTTTGGGTTCAAAAAGTTGTCATTCCATGATGCAAGTTAAGGGTATAGTTGATCAATTAATATCATTAATTACTGTCGAGGCTCAATCGTATGGGCCGGATGGTTGTATATTAATGCGTGTAGTAGAAACTGTACCCGGCAATATGTTACCTATGGTAGCACAAAATATTGCCAATTTACAAAATGTGGCTGTTACACAAAAGCCGCCGGCAAACACCTCAACAAGTCATCTTATGATGAATCAAATAAAACCACAAGTTCTTATGCCTAATCCTGTGCAAGCTACAGAGGTAACAGACAACTTTGCTGAACATTCACAACTACAAATGCCTCAAAATTTTACACAGGATGATGAACAATATGCGTTAGCTTGGCTAGGTGCAACTTTCGAACGAGCCACTAGTTTAGATAGTCATATTGAGACACAAGAACTATATCGCATGTATTTGTCGCATTGTCAGAAATCTGGTAAACATTCAGTAGTCAATCATTTACATTTTCCCAAATTGATACGTCTTATTTTTACTAATAATGTGGGTCCGGCTGCTGTAAGAAAGTCGGATGGTACAGATTTACCAGGATTATATTATGTTGGTTTAAGGCTAAGAGCATTACCTTTGCCATTGCAACAAAAATCTGCAATAACAGTTGGAGGTCAAACGCCGCCGACTGGAGGTAAACCAGCTGATACGACAGGATCAGCTAGAAAAggtaaaaagaaacaaaaaccaCAAATAGAAACAAATGTAACAACAACACCAACTAATCCTATAGTGACTGCAACAAATGATGCTAATACGACCATTGTAACAGAATCCATAAAACCAGATAACATTATATTATCCTCTGCAGAAGAGTCTCTTAAACCTTTAACTCCTAAACCCATGGATACTAAATGTGAAGAAAAAATGGATATTGAGGAACCAGCAGAAACTACTAAAGCTGAAAATAAATCAGATTTAAAACAAACACCAGCGGCGGAACCTATGCAAATCGTAGACTCTAATATAGTACAAGCTTCCCTTATACCAGGAGCACCCAGTGGATCATCTTCTtcattaataaaaagtttattggCCAATAAAGTCAATCAAagacaacaaaaacaaaatgttaaTACAAATCCCACTACCATGACCTCTACAACTCCAATAAATACTAATCCTACAATAACAACAACAGTTACAAATCCTTCTACTCCAACACAAAACATTAAAGTGGCTAGCACCGCTATAACAGCCTTGGTTAATAATACTATAATGCAGCATACTCCTGTCAAAGTAGGGCAAACTACTATTAAACCTTTAAGTTCCCATTCTGCATTGGATAAAAAACCCCAACCACCAACACAACCGCTACCACAAATATCAGAATCTACACCACCACCATTGGCTCCTTTAAGTGGTGCAAATGTAGCTAAAGATGCTTCAGGAAGACCTATAATTTTGGCCAATCAAATGCTGGTAGATATATTGGATACAAAAAGAGTTGATCCACCTATACCAGGTATAATACAAAAACGTAAACTGGAAGATCAAATATCCAATCCAAAACGTTTAGCTGTAGAATCTTCGACGTCATCGTCTACTTTAGAAGAGCCACAGGTTACACCCTCAAAAAATGCCGCTAATTTATATGCCGAAATGGCTGCTTCCATTTTAGAAGATGAAGATCTTGAAGAATTTTCTACACAACCGATTGTACAACAACCCCCTCCTCCACCTCTATTGGAACAACAAAATATACAACAAACTTCTCTTATAATACCAACTAAATCTGCTCCTCAAAATGTACAACGACAATTGGTATTTCAAacccaacagcaacaacaaccacAACTTAAATTAACACAAACCGCAGGCGGTGGAGCTCACAATAATCAACAAATGCCAAATGCTGTAGCCACAATTAAAACAGATCAGGGATTACAAACTGTACCCGTTATACTGCAACAAAAACCAATGGAACAACATCAGCAGCAACAAATAATACAACAAATTATACAACCGGCACCGCAACAGCAGCATCAACAAACACAATATGTTTTGGCTACCAATCAGCAAGGGCAAACCTATTTAGTGGCACAACAAGCAccggcccaacaacaacaacagcaacaacccaCACAAACAGTATTGGTAACACAAACACCACAACAACAAACAACTGGacaaaaaactataattattttgCAACAGCAAACAATGCCAGGACAGCAACAACAAATTATCACTACTGGTCCACCAGGACAAGGACAAAAAATGATTATGACCACAGCACAAGGACAACAAGTGTTGGTAACTCAAAGACCCCAAACGCCGCAGCAAATTTTTATTAATCCCCAAACGGGAGCAGCCACACATATACAACATATGCCAGTACAAACACAAACTAGGCAGATAATACAAACTACAACGGGACAACAGCATCAACAACAACATCAGCAgctgcagcagcaacaacaacagacgCAACAAATACAAGCTGGACAAATATCACCCTCCTTACTGAATCAACTTAATCAAATACCAGCTACTATTAAACTACATCAACCAATAGCTCAATCGGGACAAACACCAACTGGAGGACAACAATCTCAAGCAACAGCTATAAATCGAATGCAACAGGGTAAAACAGTATCATTGATACAAGCTGCTCCATCATCTACACCACCAGCACCGGTAGCTATACCTCAGCTACAGCAACATCAATCTATAATACAACAACATATAATATCGGGACCCGCCGAAAAACGTCATGTTATACTTGGGGGTGGACGTGCTATAGAAATAAAAGAAACTGTTATTACACAAGCCCAACCACCACCACAACAATGTCAACTAAATTCTCAGACAATAATAACAACACAACCAGCAAATGCTGGAGGTGGTGGTAGCTCTGCATCTCCAACACCACCACCACCTCTTTTGCAGCAACAAGTCCAACAACAGGTACAACAACATATACGTGCTGTCATTGAACAACAGCAACATCCATCAATAATACAACAGAAAATAACATCATTGCCGGTAGTGCAACAGCAACAACAGACACCACAGCAACAAAGTCAAGTCACGGTACAGGCATCTGCTTCTGTTGCTAATGCCACAACAACCACTCATAATCAACCACAAAAACAAACGCCACCACCACCTACGCTTGTAGCAGCTAAGtTACCAGATCCAACACAATCCCTAATACAGCCCAAGACTATAAATCAGCCACAAAATGTTGTACAATCGATTATACCAGCACCTAGTGGCGCAAATCCAGCATCTATGGCCAATGTTAAAAAGCCACCAACATTAATAAAGCCGTCATTGCCTGCAGTAAAGTTACCGACACTGTTAAACTCAGGACCACCACCTTTGGCGGCAGTTAACAGTAATCCCAACATAACTACTGCAGCGGGTCAGCAAACAGATTTAAT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- Protein Sequence
- MLLNQSMKSSNISQYNRNESATQSSSASNAVGVTSGGSATGTPARTRNQNRDRQQSDDKQDNANFKGKNPPKPPEEFYKDLKEFHEKRGTSIMNMPKITGREVDLHRLYCEVTERGGFQKINMKDEWDEVLPELGLSEKIVNGSTALKYIYRRVLEKYERLNYFGEDPDKVEAQEAAEMAELNISQGRGRGSRYPSTYGSTNSAIIHNVAMTYNYRQHNVNMDRRRQFKLSTDLHKASPYEKLMLSMLSPLPNEQDFAINACTLMANESKHTLKLNEYPKLLDALLAHTGVYSDYTMRKLFQHIYSGIRHHSLYGFWYDLLNDRPQILELYTDEQALRDAALIDDYDDGKTEMEGIWEDCKELDFLNLRTGLGTQDYVGQRVLQIISILRNLSFLEENLTVLVKNKTFLRFLVMCSNIRWGNVHIQALEIAGNIAGELEILDPTNDNLSRCLMSTLCEGIEGPDRGVIINCLEILYKICQKDTNEEFILKSLNMNFYNTIALFMSLNDIMLLLFTLEAIYALTCLGSKSCHSMMQVKGIVDQLISLITVEAQSYGPDGCILMRVVETVPGNMLPMVAQNIANLQNVAVTQKPPANTSTSHLMMNQIKPQVLMPNPVQATEVTDNFAEHSQLQMPQNFTQDDEQYALAWLGATFERATSLDSHIETQELYRMYLSHCQKSGKHSVVNHLHFPKLIRLIFTNNVGPAAVRKSDGTDLPGLYYVGLRLRALPLPLQQKSAITVGGQTPPTGGKPADTTGSARKGKKKQKPQIETNVTTTPTNPIVTATNDANTTIVTESIKPDNIILSSAEESLKPLTPKPMDTKCEEKMDIEEPAETTKAENKSDLKQTPAAEPMQIVDSNIVQASLIPGAPSGSSSSLIKSLLANKVNQRQQKQNVNTNPTTMTSTTPINTNPTITTTVTNPSTPTQNIKVASTAITALVNNTIMQHTPVKVGQTTIKPLSSHSALDKKPQPPTQPLPQISESTPPPLAPLSGANVAKDASGRPIILANQMLVDILDTKRVDPPIPGIIQKRKLEDQISNPKRLAVESSTSSSTLEEPQVTPSKNAANLYAEMAASILEDEDLEEFSTQPIVQQPPPPPLLEQQNIQQTSLIIPTKSAPQNVQRQLVFQTQQQQQPQLKLTQTAGGGAHNNQQMPNAVATIKTDQGLQTVPVILQQKPMEQHQQQQIIQQIIQPAPQQQHQQTQYVLATNQQGQTYLVAQQAPAQQQQQQQPTQTVLVTQTPQQQTTGQKTIIILQQQTMPGQQQQIITTGPPGQGQKMIMTTAQGQQVLVTQRPQTPQQIFINPQTGAATHIQHMPVQTQTRQIIQTTTGQQHQQQHQQLQQQQQQTQQIQAGQISPSLLNQLNQIPATIKLHQPIAQSGQTPTGGQQSQATAINRMQQGKTVSLIQAAPSSTPPAPVAIPQLQQHQSIIQQHIISGPAEKRHVILGGGRAIEIKETVITQAQPPPQQCQLNSQTIITTQPANAGGGGSSASPTPPPPLLQQQVQQQVQQHIRAVIEQQQHPSIIQQKITSLPVVQQQQQTPQQQSQVTVQASASVANATTTTHNQPQKQTPPPPTLVAAKLPDPTQSLIQPKTINQPQNVVQSIIPAPSGANPASMANVKKPPTLIKPSLPAVKLPTLLNSGPPPLAAVNSNPNITTAAGQQTDLMMDANKNEEAGKTAQTSAAGLATTTHNPIQTTSSTTTSTQAAQTSATTSNIVSSTAAGNTTAATSTAQTQPLSGQQPLPQPLQLQPQPPAVLPPQQPQLSPAEAQWLYICDWRNCPRKNFKSMADLQHHVCTSHAPDHLDHAAEIFCQWGVGPGLCDGIPRKRFSLMTHLIDRHLTTESLRAAVQRRIATGIYNIAPAKPPVTIVRNIEMTQRANNASPAPSTSSSSSSQTPATGSSALQAIKRHTADFMNSKELMDENEGPVTKSIRLTASLILRNLVTYTATAKRSIRRFEPHLANIALSNVESSGTISHILYELNG
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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- 80% Identity
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