Basic Information

Gene Symbol
ARID2
Assembly
GCA_963921195.1
Location
OY992536.1:98941676-98967122[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 6.6e-27 4.4e-23 82.8 0.0 2 89 74 159 73 159 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTATTAAACCAATCAATGAAATCATCAAATATTTCACAATATAATCGAAATGAAAGTGCTACACAAAGCAGCAGTGCATCGAACGCGGTTGGCGTCACCTCTGGTGGCTCTGCAACTGGAACACCTGCAAGGACACGCAATCAAAATAGGGATAGGCAGCAATCTGATGATAAACAGGATAATGCAAATTTTAAGGGTAAAAATCCACCAAAACCTCCAGAGGAATTCTATAAAGATTTAAAAGAGTTTCATGAAAAGAGAGGcACATCCATTATGAATATGCCTAAAATTACTGGACGTGAGGTCGATCTTCATCGTTTATACTGTGAGGTAACCGAAAGAGGTGGTTTTCAAAAAATCAATATGAAGGATGAATGGGATGAAGTTTTACCCGAATTGGGTTTAAGTGAGAAAATCGTTAATGGATCCACAGCTCTAAAGTATATATATCGTCGTGTTTTGGAAAAATATGAACGTTTAAATTATTTCGGTGAAGATCCAGATAAAGTTGAGGCTCAAGAAGCAGCTGAAATGGCAGAATTAAATATTAGTCAAGGACGCGGAAGAGGTTCGCGATATCCATCAACTTATGGTAGCACAAATTCTGCCATAATACATAATGTAGCAATGACTTATAATTATAGGCAACACAATGTTAATATGGATCGCCGAAGACAGTTTAAATTATCGACAGATTTACATAAGGCATCGCCATATGAAAAATTGATGTTATCAATGCTGTCTCCATTGCCAAATGAACAAGATTTTGCTATCAACGCCTGTACTCTGATGGCTAATGAAAGTAAACatactttgaaattgaatgagtATCCCAAGTTGTTGGATGCTTTATTGGCTCATACGGGAGTCTATTCAGATTATACTATGCGCAAATTATTTCAACATATTTATAGTGGTATACGACATCATTCTTTGTATGGATTTTGGTATGATTTATTAAATGACAGACCACAAATATTGGAATTATATACAGATGAACAGGCTTTAAGAGATGCCGCTTTAATAGATGATTATGATGATGGTAAAACAGAGATGGAGGGAATATGGGAAGATTGTAAAGAATTGGATTTTCTAAATTTACGCACTGGTCTGGGAACTCAAGACTATGTGGGTCAAAGAGTTTTACAGATTATTTCCATATTaagaaatttaagttttctggagGAAAATTTAACGgtattggtaaaaaataaaacgtttttacGATTTTTGGTAATGTGTTCCAATATACGTTGGGGTAATGTTCATATACAAGCTTTAGAAATTGCTGGTAATATAGCAGGTGAGTTGGAAATATTAGATCCTACTAATGACAATTTATCACGTTGTCTTATGTCTACCCTATGTGAGGGCATAGAAGGACCCGATAGAGGTGTTATTATTAATTGCTTagagattttgtataaaatatgtcaAAAGGATACTAACGAGGAATTTATTTTGAAATCTTTAAATATGAATTTCTACAATACTATTGCTTTGTTTATGTCTCTAAATGATATAatgcttttactattcacactGGAAGCCATATACGCCTTGACCTGTTTGGGTTCAAAAAGTTGTCATTCCATGATGCAAGTTAAGGGTATAGTTGATCAATTAATATCATTAATTACTGTCGAGGCTCAATCGTATGGGCCGGATGGTTGTATATTAATGCGTGTAGTAGAAACTGTACCCGGCAATATGTTACCTATGGTAGCACAAAATATTGCCAATTTACAAAATGTGGCTGTTACACAAAAGCCGCCGGCAAACACCTCAACAAGTCATCTTATGATGAATCAAATAAAACCACAAGTTCTTATGCCTAATCCTGTGCAAGCTACAGAGGTAACAGACAACTTTGCTGAACATTCACAACTACAAATGCCTCAAAATTTTACACAGGATGATGAACAATATGCGTTAGCTTGGCTAGGTGCAACTTTCGAACGAGCCACTAGTTTAGATAGTCATATTGAGACACAAGAACTATATCGCATGTATTTGTCGCATTGTCAGAAATCTGGTAAACATTCAGTAGTCAATCATTTACATTTTCCCAAATTGATACGTCTTATTTTTACTAATAATGTGGGTCCGGCTGCTGTAAGAAAGTCGGATGGTACAGATTTACCAGGATTATATTATGTTGGTTTAAGGCTAAGAGCATTACCTTTGCCATTGCAACAAAAATCTGCAATAACAGTTGGAGGTCAAACGCCGCCGACTGGAGGTAAACCAGCTGATACGACAGGATCAGCTAGAAAAggtaaaaagaaacaaaaaccaCAAATAGAAACAAATGTAACAACAACACCAACTAATCCTATAGTGACTGCAACAAATGATGCTAATACGACCATTGTAACAGAATCCATAAAACCAGATAACATTATATTATCCTCTGCAGAAGAGTCTCTTAAACCTTTAACTCCTAAACCCATGGATACTAAATGTGAAGAAAAAATGGATATTGAGGAACCAGCAGAAACTACTAAAGCTGAAAATAAATCAGATTTAAAACAAACACCAGCGGCGGAACCTATGCAAATCGTAGACTCTAATATAGTACAAGCTTCCCTTATACCAGGAGCACCCAGTGGATCATCTTCTtcattaataaaaagtttattggCCAATAAAGTCAATCAAagacaacaaaaacaaaatgttaaTACAAATCCCACTACCATGACCTCTACAACTCCAATAAATACTAATCCTACAATAACAACAACAGTTACAAATCCTTCTACTCCAACACAAAACATTAAAGTGGCTAGCACCGCTATAACAGCCTTGGTTAATAATACTATAATGCAGCATACTCCTGTCAAAGTAGGGCAAACTACTATTAAACCTTTAAGTTCCCATTCTGCATTGGATAAAAAACCCCAACCACCAACACAACCGCTACCACAAATATCAGAATCTACACCACCACCATTGGCTCCTTTAAGTGGTGCAAATGTAGCTAAAGATGCTTCAGGAAGACCTATAATTTTGGCCAATCAAATGCTGGTAGATATATTGGATACAAAAAGAGTTGATCCACCTATACCAGGTATAATACAAAAACGTAAACTGGAAGATCAAATATCCAATCCAAAACGTTTAGCTGTAGAATCTTCGACGTCATCGTCTACTTTAGAAGAGCCACAGGTTACACCCTCAAAAAATGCCGCTAATTTATATGCCGAAATGGCTGCTTCCATTTTAGAAGATGAAGATCTTGAAGAATTTTCTACACAACCGATTGTACAACAACCCCCTCCTCCACCTCTATTGGAACAACAAAATATACAACAAACTTCTCTTATAATACCAACTAAATCTGCTCCTCAAAATGTACAACGACAATTGGTATTTCAAacccaacagcaacaacaaccacAACTTAAATTAACACAAACCGCAGGCGGTGGAGCTCACAATAATCAACAAATGCCAAATGCTGTAGCCACAATTAAAACAGATCAGGGATTACAAACTGTACCCGTTATACTGCAACAAAAACCAATGGAACAACATCAGCAGCAACAAATAATACAACAAATTATACAACCGGCACCGCAACAGCAGCATCAACAAACACAATATGTTTTGGCTACCAATCAGCAAGGGCAAACCTATTTAGTGGCACAACAAGCAccggcccaacaacaacaacagcaacaacccaCACAAACAGTATTGGTAACACAAACACCACAACAACAAACAACTGGacaaaaaactataattattttgCAACAGCAAACAATGCCAGGACAGCAACAACAAATTATCACTACTGGTCCACCAGGACAAGGACAAAAAATGATTATGACCACAGCACAAGGACAACAAGTGTTGGTAACTCAAAGACCCCAAACGCCGCAGCAAATTTTTATTAATCCCCAAACGGGAGCAGCCACACATATACAACATATGCCAGTACAAACACAAACTAGGCAGATAATACAAACTACAACGGGACAACAGCATCAACAACAACATCAGCAgctgcagcagcaacaacaacagacgCAACAAATACAAGCTGGACAAATATCACCCTCCTTACTGAATCAACTTAATCAAATACCAGCTACTATTAAACTACATCAACCAATAGCTCAATCGGGACAAACACCAACTGGAGGACAACAATCTCAAGCAACAGCTATAAATCGAATGCAACAGGGTAAAACAGTATCATTGATACAAGCTGCTCCATCATCTACACCACCAGCACCGGTAGCTATACCTCAGCTACAGCAACATCAATCTATAATACAACAACATATAATATCGGGACCCGCCGAAAAACGTCATGTTATACTTGGGGGTGGACGTGCTATAGAAATAAAAGAAACTGTTATTACACAAGCCCAACCACCACCACAACAATGTCAACTAAATTCTCAGACAATAATAACAACACAACCAGCAAATGCTGGAGGTGGTGGTAGCTCTGCATCTCCAACACCACCACCACCTCTTTTGCAGCAACAAGTCCAACAACAGGTACAACAACATATACGTGCTGTCATTGAACAACAGCAACATCCATCAATAATACAACAGAAAATAACATCATTGCCGGTAGTGCAACAGCAACAACAGACACCACAGCAACAAAGTCAAGTCACGGTACAGGCATCTGCTTCTGTTGCTAATGCCACAACAACCACTCATAATCAACCACAAAAACAAACGCCACCACCACCTACGCTTGTAGCAGCTAAGtTACCAGATCCAACACAATCCCTAATACAGCCCAAGACTATAAATCAGCCACAAAATGTTGTACAATCGATTATACCAGCACCTAGTGGCGCAAATCCAGCATCTATGGCCAATGTTAAAAAGCCACCAACATTAATAAAGCCGTCATTGCCTGCAGTAAAGTTACCGACACTGTTAAACTCAGGACCACCACCTTTGGCGGCAGTTAACAGTAATCCCAACATAACTACTGCAGCGGGTCAGCAAACAGATTTAATGATGGATGCTAATAAGAATGAGGAAGCTGGAAAAACTGCACAAACATCTGCAGCTGGACTTGCAACAACAACACACAATCCAATACAAACTACTAGCTCAACGACAACATCAACACAAGCAGCACAAACTTCAGCAACAACCTCAAATATAGTTTCATCTACTGCTGCTGGTAATACTACTGCAGCAACATCTACTGCACAAACTCAACCCTTAAGTGGACAACAGCCACTACCCCAACCTCTTCAACTACAGCCACAACCACCCGCTGTTCTTCCACCACAACAACCCCAACTTTCTCCCGCTGAAGCTCAATGGTTATACATTTGTGATTGGCGTAATTGTCCACGTAAGAATTTTAAATCAATGGCAGATTTACAACATCATGTTTGCACTTCTCACGCTCCCGATCATTTAGATCATGCAGCGGAAATTTTTTGTCAATGGGGTGTCGGTCCTGGTTTATGTGATGGTATACCACGTAAACGTTTTTCCCTTATGACCCATTTAATAGATCGTCATTTAACAACGGAAAGTTTAAGAGCAGCTGTTCAACGTAGAATTGCCACTGGCATATACAATATAGCTCCGGCAAAGCCGCCCGTAACTATAGTGCGTAATATTGAAATGACCCAAAGAGCTAATAATGCTTCGCCAGCTCCTTCGACATCATCATCGTCTAGTTCACAAACGCCAGCCACTGGCTCATCAGCATTGCAAGCTATTAAACGTCATACCGCAGATTTTATGAACTCTAAAGAACTAATGGATGAAAATGAAGGTCCCGTTACAAAAAGTATACGTTTGACCGCCTCTTTAATATTACGTAATTTGGTTACTTATACTGCAACTGCTAAACGTAGTATACGTCGTTTTGAACCTCACTTGGCAAATATTGCTTTAAGTAATGTAGAATCTAGTGGTACTATATCTCATATTCTCTACGAGTTAAATGGCTAA
Protein Sequence
MLLNQSMKSSNISQYNRNESATQSSSASNAVGVTSGGSATGTPARTRNQNRDRQQSDDKQDNANFKGKNPPKPPEEFYKDLKEFHEKRGTSIMNMPKITGREVDLHRLYCEVTERGGFQKINMKDEWDEVLPELGLSEKIVNGSTALKYIYRRVLEKYERLNYFGEDPDKVEAQEAAEMAELNISQGRGRGSRYPSTYGSTNSAIIHNVAMTYNYRQHNVNMDRRRQFKLSTDLHKASPYEKLMLSMLSPLPNEQDFAINACTLMANESKHTLKLNEYPKLLDALLAHTGVYSDYTMRKLFQHIYSGIRHHSLYGFWYDLLNDRPQILELYTDEQALRDAALIDDYDDGKTEMEGIWEDCKELDFLNLRTGLGTQDYVGQRVLQIISILRNLSFLEENLTVLVKNKTFLRFLVMCSNIRWGNVHIQALEIAGNIAGELEILDPTNDNLSRCLMSTLCEGIEGPDRGVIINCLEILYKICQKDTNEEFILKSLNMNFYNTIALFMSLNDIMLLLFTLEAIYALTCLGSKSCHSMMQVKGIVDQLISLITVEAQSYGPDGCILMRVVETVPGNMLPMVAQNIANLQNVAVTQKPPANTSTSHLMMNQIKPQVLMPNPVQATEVTDNFAEHSQLQMPQNFTQDDEQYALAWLGATFERATSLDSHIETQELYRMYLSHCQKSGKHSVVNHLHFPKLIRLIFTNNVGPAAVRKSDGTDLPGLYYVGLRLRALPLPLQQKSAITVGGQTPPTGGKPADTTGSARKGKKKQKPQIETNVTTTPTNPIVTATNDANTTIVTESIKPDNIILSSAEESLKPLTPKPMDTKCEEKMDIEEPAETTKAENKSDLKQTPAAEPMQIVDSNIVQASLIPGAPSGSSSSLIKSLLANKVNQRQQKQNVNTNPTTMTSTTPINTNPTITTTVTNPSTPTQNIKVASTAITALVNNTIMQHTPVKVGQTTIKPLSSHSALDKKPQPPTQPLPQISESTPPPLAPLSGANVAKDASGRPIILANQMLVDILDTKRVDPPIPGIIQKRKLEDQISNPKRLAVESSTSSSTLEEPQVTPSKNAANLYAEMAASILEDEDLEEFSTQPIVQQPPPPPLLEQQNIQQTSLIIPTKSAPQNVQRQLVFQTQQQQQPQLKLTQTAGGGAHNNQQMPNAVATIKTDQGLQTVPVILQQKPMEQHQQQQIIQQIIQPAPQQQHQQTQYVLATNQQGQTYLVAQQAPAQQQQQQQPTQTVLVTQTPQQQTTGQKTIIILQQQTMPGQQQQIITTGPPGQGQKMIMTTAQGQQVLVTQRPQTPQQIFINPQTGAATHIQHMPVQTQTRQIIQTTTGQQHQQQHQQLQQQQQQTQQIQAGQISPSLLNQLNQIPATIKLHQPIAQSGQTPTGGQQSQATAINRMQQGKTVSLIQAAPSSTPPAPVAIPQLQQHQSIIQQHIISGPAEKRHVILGGGRAIEIKETVITQAQPPPQQCQLNSQTIITTQPANAGGGGSSASPTPPPPLLQQQVQQQVQQHIRAVIEQQQHPSIIQQKITSLPVVQQQQQTPQQQSQVTVQASASVANATTTTHNQPQKQTPPPPTLVAAKLPDPTQSLIQPKTINQPQNVVQSIIPAPSGANPASMANVKKPPTLIKPSLPAVKLPTLLNSGPPPLAAVNSNPNITTAAGQQTDLMMDANKNEEAGKTAQTSAAGLATTTHNPIQTTSSTTTSTQAAQTSATTSNIVSSTAAGNTTAATSTAQTQPLSGQQPLPQPLQLQPQPPAVLPPQQPQLSPAEAQWLYICDWRNCPRKNFKSMADLQHHVCTSHAPDHLDHAAEIFCQWGVGPGLCDGIPRKRFSLMTHLIDRHLTTESLRAAVQRRIATGIYNIAPAKPPVTIVRNIEMTQRANNASPAPSTSSSSSSQTPATGSSALQAIKRHTADFMNSKELMDENEGPVTKSIRLTASLILRNLVTYTATAKRSIRRFEPHLANIALSNVESSGTISHILYELNG

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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