Basic Information

Insect: Pedicia rivosa
Gene Symbol: ndl
Assembly: GCA_963082725.1
Location: OY720154.1:34531194-34565571[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-MIZ
Domain: zf-MIZ domain
PFAM: PF02891
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 3 0.38 4.1e+03 -2.1 1.2 4 24 580 600 577 603 0.89

2 3 1.1e-24 1.2e-20 73.3 3.9 3 49 678 724 676 725 0.97

3 3 2 2.2e+04 -6.6 2.8 15 28 3478 3491 3467 3494 0.72

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	3	0.38	4.1e+03	-2.1	1.2	4	24	580	600	577	603	0.89
2	3	1.1e-24	1.2e-20	73.3	3.9	3	49	678	724	676	725	0.97
3	3	2	2.2e+04	-6.6	2.8	15	28	3478	3491	3467	3494	0.72

Sequence Information

Coding Sequence: ATGAGTGCCCAAGGGGGCTCCTCGGGGGCTCCAGTATTAGGGGGCCGAGTTTCTCCATTAGGGATCTACCCGGAGCCCCAAAATCAGCATTCAAATACAATTGGTTCTCTCggaaatcaaacaaataataatcacaATACACATCAGCAGACACAATTACAACatcagcagcaacaacaacatctgCAACatcaccaacaacaacaacaacatcaaaattCTTTACACCAACAATTTAGTCAAAGCAATTATCAAAATAGTAACAATTTACATAGTCAAAATCAGTATAATAATAGTCTTGGACATCATAATATAAATCACAATTTTACtgttcaacaacaacaacagcatttactacagcaacaacaattacatcaacaacaacaacagcagcagcagcagcaacaacatcaTACTACCGGCGCAAGTAGTAACTTGGGAAACGGCAATAATCATAGTAGCAATAACAGCAATTTTATTGGTAATAATAGCAATTGTTTACCaaataataatctaaataTGGTAGCGGCAAGTGCTGGTGGTATAATACAGCAACAAAGTGGAATTGAAATGGGTTTTAATACATCACAAATGAATGCAATGGGTATGATGCATACTCAACAGCCATCACAACATCAATATATGAATCAAATGAACCAAATGAATGGTATAAATCATAATATGAGTCATAGTATGGTAAATGGTGGCGTTAATGGTATGAATGGTATACCAATGAATCAAATGGGACCACTTAATGGAATGAATTACAATGCACAACGGCATCATCATATGAATCCAATGGCACAAATGAGCGGTATGACAATGGGTATGAATCATATGAGTCAAATGAATCAAATGAATGGAATGAATCAAATGAATCCAATGGCTAAAATGCAGGGCATGGCTAATGGATATGCACCAAGACGAATATCGCCATATCCATCACCACAAATGCATGCTGCCCAAAAACGTGGTATGTATCCAATTGGGCAAGGGCCACAAGTGCCTGGCCCTGGACAAATGCAATTTTCACAGCATCAAGGAAGTGTTGTTGGTGGAGCTAACGGTGTACCAGTACCAATGCAGCAGGGTGGTTATGGACGACAATCAAGTGTTAGTTCGTATGGTAGGGCGCCCGGTATGATGCCACAACAAAGGCAAAATACACCACCTTATAATGCTGCTGCAgtacagcaacaacagcagcaactgcagcaacagcaacaacaacaacagcagcagcaacaacaacagcaacagcagcaacaacagtTTTATAATACAGGAGGATATCAAAATGTTCAGGGTTTTCAACAGGACGTCCGTATGAATTATCAGCATAGTCCTGTTCCTGGTAATCCTACACCACCATTAACACCAGCATCATCAATGACACCTTATATTAGTCCAAATCCTGATGTCAAGCCACCACCAACTATTCACAAAGATGATGAACTTCGATTAACATTTCCTGTTAGAGATGGTATAATATTATCACCATTTAGATTGGAACATAACCTCGCAGTCAGTAATCATGTGTTTcaactaaaacaaaatttacacaGTACACTATTGTCAAAACCCGATTTagaattacaattaaaatgttttcatcATGAGGATCGTCAAATGAATACAAATTGGCCAGCCAGTGTACAAGTATCAGCAAATGCAAATCCACTTGTGATAGATCGAGgtgaaaataaaagttcacATCGTCCGCTTTATTTAAAGAATGTTTGTCAGCCGGGAAGGAATACCATACAGATAACAGTTAGCACGTGTTGCTGTtCACATTTATTTGTCCTTCAAGTGGTACATAGACCAACAGTACGTCATGCCTTACAAGGTTTATTACGTCGTAATTTATTACCAGCTGAAAATTGTATAGCCAAAATTAAACGGAATTTTGCTGCTGGACATACAAATatacaacagcagcaacagttgcaacaacaacagaatcCAACAGGAGTTGAATcacatcaacaaaaaattgaaccAATGGAACAAACATCactaaaagtttttcttaaatGTCCGATAACATTTAAACGTATAACATTACCGGCACGTGGGCACGATTGTAAACACATACAATGTTTTGATTTAGAAtcatatttacaattaaattgtgaacGAGGTAGTTGGCGATGTCCTGTTTGCAATAAAGCGGCACTAACAGAGGGCTTAGAAATAGATCAGTATATGTGGGCTATTTTGGATAATAGTGATGCAGAGGAGGTATCCATTGATTCAGCGGCTAATTGGAAAGCTGTAAGACCTATTAATACAAGTGGAATTAAGACGGAAGATGATCATGATTCAAAACGTTTCCTAAAAGTAATGTCACCTGGTTCAACAACATTACCAGCGTGGGATAATTCACAGGCAATGAGTCCTTACATGTGCCCAGATATGAATACGATAGCAAGTGGTAGTATGATGGGCGGAGGTTATAATGCGTCACGAAACTCGTTTGACACATTTAATTCACCGGCAACAAGTGAAGGTTCTGGTGGTCCAAATAATGGTTCTGTGAATGAATACGGAAATGGAACAAATCCTTTAGCGCATTTAAATGATACAGTTAATTCACTTGATCCATTAAATGCAATggaaaaatcattaaatgaacagATGCCTCATACACCGCATACACCACATACACCGGGTGGTGGTTCATCAAGTCATCCATTAACACCTGGTGGTCCACCAAGTGTACCATCAGCATCATCAACACAAAATGATAATCACAGTCaaacaacagcaacatcaacaacaacaacgtcATCAATATCATCATCCGCATTATCATCAACATTATCAACATCTTCAtcatcagcaacaacaacaacaaataataataataataataataataatagtaataataatttattaggaAATTCTAATCTTAATTCACCACATTCATCACATGCGTCGCCACAACAACATCCACAGCATCAACATCctcaacaacagcaacaacaacagcatcagcaacaacatcaaataccacaacaacatcaacaacagcatcaacaacaaaatttaatgaattcacAAAATGTTATGAATTCACCACAAAATGTTATGAATTCACCACAAAATATGAATAACAACAGTAACATGATGAATGCATCAAGAGAACAAATAAtgaattcattattaaattcacAAACGGCTGGTTTAATTAGTTTAACAGAAGCCGATTTAAATgctgatttaaattttgatcCAGCTGCCGTTATTGATGGTGAAGGAAATAATGACGCGTTAAATctTTTACCTGATAATGTTGTTGATCCAATGGAACTTCTATCATATTTGGATCCACCTGATCTCAATACACCACCATCAAGTGGTTCAAaaacacCAAAGTCACCTCCTGATATTAAACGCCCGTCAATTATATGCGTCTCATGTTCAACaacatcaaaattaattttaattttaacaattctTTGTATCGGTTCACTACTGCTAGGAATTTCCATTGGAATTTATTCATCCCTATTACAAAAAGATGAACCAATTGCTGTACAAAAATTTgatcatttattaaaagttggcaataaaatggaaaaaaatataaaaattaaatttttaccaCAAGCAAATCAATTGTATCAAGATACAGTTGCTATCattgagaatatttttaaacgtGATGAACATAAAGTAAAACGTAACGCAGACATGTTTGATAAAAAGCCAACATTtcttgaaataattaaagcaGCATCATCAAATGAATGTgcaaaaaaacaagagaattctgattttaatgaattttcatttgaaataagTTTTCCAACAAaagatgaattaaaaaaatatacaatgaATCGATTGAAACGTGatgttgaaataataaataaagaatcaTTAAAtccaattgaattaaaacaaaataatttagatgaaaatttattacgtGAAAAACGTAAAGCTGAACgtgaattaatttcattacATAATCAATATTCACgttgtaaaaaagaaatagaacCACAACAATGTGAACATATTTATCAACGTCTTCATTTAATGGCAGAAGAAATCggacaaaaatattcaacaatgacaaatattttacaaggattaaaaacaaatcaagaatttgatgaaaaaaatttaccaaaaCAAAATGATGTGAATTTTCCACCGGGTAATCATGATTCTAATGGTGTACCAATTATAGAATTTACCGATCGTAATGGTAAACAAATTCAATGGGTTCCATCTTTTGATGGgaaaaaagattttcaaataaaaattaaggagaaaaaaaataaaaaaaaagaggaaaaaattaattcgtctgaagaacaaaaacaatattttatacttGATGATGGAAGAAAAGTTGTATTtgatagaaagaagaaaattggaaaatctACAATTAATTTACCAGAATTTCAAAATTCAGCAATTATtccaaatgaaaatattcctcatgaattttctgaaatacaaaaaaaaacagcaaaatcAATGAGCTTTGCCGGTACAATGGACACTCATCAAATATCTAATTTTCCAGAATTACCCCATTTGTATCCCACAATGATTCCACACAATCAGGAACTTCCGGACAGTTTTCCTAACTTTCATACAAAGAAAGCGGGAAAATCCATGAGCTTTCCAGAATTACCCCATTTGTATCCCACAATGATTCCACAACATCAAGATATTCCAGAAAATTTTcctaattttcattcaaaaaaagCGGGGAAATCAATCAGCTTTCCAGAATTACCCCATTTGTATCCCACAATGATTCCACAACATCAAGATATTCCGGAAAATTTTcctaattttcattcaaaaaaagCGGGGAAGTCAATGAGCTTTCCGGAATTACCCCATTTGTATCCTACAATGATTCCACAAAAACAGGAACTTCCGGAAAATTTTCCTAATTTCCATTCAAAAAAAGCGGGAAAATCAATTAACTTTGGTGgtgaaattgataaaataaacacGAATAG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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

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