Priv003613.1
Basic Information
- Insect
- Pedicia rivosa
- Gene Symbol
- snpc-4
- Assembly
- GCA_963082725.1
- Location
- OY720151.1:47720318-47722893[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 4 7.4e-10 8.1e-07 29.3 0.4 1 44 277 321 277 323 0.95 2 4 4.1e-10 4.5e-07 30.1 0.0 3 43 333 377 331 380 0.94 3 4 2.8e-12 3.1e-09 37.1 0.0 2 46 387 432 386 432 0.92 4 4 2.2e-11 2.4e-08 34.2 0.5 4 44 443 484 440 486 0.96
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGAATTTATAATAACTGAAGTTGGTGAAGCATCTACTAatttaattgaACATGGCCGAGAAAGAACTTCATCACAATCCTCTAACTCAAATTCCTATAGCTCTGAATTTACATCAGGCTCAGAATATGAAacggaagaagaagaagataatgAGGATGAATATTTTTCGCTTCTAAAATCACATGATTACATTGCAGAAGTGAAGAACACAATAATCAGCAATGAAGAAGTTAATTTATCAAATGCAATTGCATTAAATGAAACATTTGTAAAGGTATTAATTAATCTTAGATCGAAATTTGAATCCCTTTTGAAAAAATGTCAAGAGAGATATGTGTTCAATGAAAACAGGCTGAGAAAATTGAGATCTAAACCTAACATTAAATTTCGTGGTAAAAGAGGATCTCACTATATCTGTGGAATaccatttattaaaaataaaacgctGAAACCATCTCCAGCCAATCAAGATTATCTGTATAGAAAATGTACATTAAAGGAATTTTTTCCGGTTGAATTACAATTATATAAACCCGCAAGCTGGTTAACAACAGATAAAACAGCATTGGTACAAGGAATTAAAACTCAAATaatagattattttaaaaactacTATTCGAATgtattaatagaaaaaaaattaatcaaatcgATTGGAGAAATAGACGGTTTAAGTAGAAATAAATTCCCGAAATTATATGAAATAGTTAAAGATAGTCCTTTTAAGGTAAATTGGCAAAGCATATCAGTATATGATTTAAACTCACGTCATCCAGCTGAAACATGTATGGCTATGTGGTATGGATATCTTCAGCCGGATCTAAATCGTACGTGTTGGActaaaacagaagaagataatttaactaaaattgcaaaaaaatttgaatgcCAGAATTGGGATAGAATTTCTCAAGAAATTCCAAAGAGATCAGCATTTCAATGTTTTCTCCAATACCAAAGTAAATTATCTGCAGAAGCTGAAGTAAAAAATTCCAAATggacaaaagaagaagatgaattACTTCTTTCTGTGGTCGAACAAACAAGGATGGGCAATTATGTACCATGGTGTAAAGTAAGTGAATACATTCCtggaagaaataaaattcaagttTATCATCGTTATATGTTATCACTAGATCCAACAATAAAGCATGAAAAATTTACGGTTGAAGAAGATTGTTTGTTATTGGCTGCAATTGAACAATATGGAAcaaattttgctgcaataccACATGATGTCTTACCTGGTCGTACAACAGTACAATTaagaaatcattttaattatgttcTTAAAGAAACTATTAAAAGAGATGGAAAAGGTTGGACATGTGAAGAAGATAAACAGTTATTagaatttgttaaaaacaatgGTGTTAAAAAGTGGGctgaaatttcaaaaattttgaaaaatcatAATAGAATGGTTTGTCGTTCACGTTATAATACTATTACAACATATATGAAAAAACATCCCAATGTCAAGTTAGAGAATGTACCAAGAAAATCTAGACGACAAAGTACACCTGTGACACGcgataattttattgaaacaataataaaaataaaacaagggAAATTTGTTCCAATGAAGCCTAAAACCAGAACTAagtatattaaaaaaaaggaacatttatcattttatgATAGATTGAATAAAGCTGACAAAggtttattcaatttttttaaatatgcttttcaatttaaatatggTCCGACAATTACTGATCCTATTTATAAGACAATTAATATGCTTATGTTGtctaaaatgttaaaagttaATTTGTGTAATGAGGTTATTggattaaaatctaaaaatttttcaattgagGAATTATCTCAATTATGTGAAgcaacaaatattaaattgtgtaCTGAtattaatgttaaatttaaacaatttgaaAAAAGTGACGTATTAATTCCACTAAATTTAAGTAATACATTGTTATTACGTGGTCTTACAATAATGTTTCCCACATATTTGGAAGAATGTAATAATTCCGAATCaccaccatcatcatcatcatcccaAAATTTAGATTCAATACTTCCAGCAGCTGCAATGTTCAAAAAACGTTTATATTCGTTGTTATTTTGGCCAACAATATTATCGAAATTAAAAATGTCTTCTATAAATAATGCTTCTGGAGATTATGAAGGCGAAATCTTAGGTGAATATTATGTTGATCCACAAAATGAAGATgatatgaatttaattgatttagaAGAAAACAATGATAATAATACGAATccaaataatgaaataattttggatgaaaatacaaattatacaatttctGTATTGAGAACGGATTTAGAAAAGATAAACCCAACGCCGGTAGTAACAGAGAATAAACTAATTTCACCAAACCAGAGAACAGTAAAAAGGCGCAAtccttttaaacaaaattgtgctaaaaaaattaaacaagaaaaataa
- Protein Sequence
- MEFIITEVGEASTNLIEHGRERTSSQSSNSNSYSSEFTSGSEYETEEEEDNEDEYFSLLKSHDYIAEVKNTIISNEEVNLSNAIALNETFVKVLINLRSKFESLLKKCQERYVFNENRLRKLRSKPNIKFRGKRGSHYICGIPFIKNKTLKPSPANQDYLYRKCTLKEFFPVELQLYKPASWLTTDKTALVQGIKTQIIDYFKNYYSNVLIEKKLIKSIGEIDGLSRNKFPKLYEIVKDSPFKVNWQSISVYDLNSRHPAETCMAMWYGYLQPDLNRTCWTKTEEDNLTKIAKKFECQNWDRISQEIPKRSAFQCFLQYQSKLSAEAEVKNSKWTKEEDELLLSVVEQTRMGNYVPWCKVSEYIPGRNKIQVYHRYMLSLDPTIKHEKFTVEEDCLLLAAIEQYGTNFAAIPHDVLPGRTTVQLRNHFNYVLKETIKRDGKGWTCEEDKQLLEFVKNNGVKKWAEISKILKNHNRMVCRSRYNTITTYMKKHPNVKLENVPRKSRRQSTPVTRDNFIETIIKIKQGKFVPMKPKTRTKYIKKKEHLSFYDRLNKADKGLFNFFKYAFQFKYGPTITDPIYKTINMLMLSKMLKVNLCNEVIGLKSKNFSIEELSQLCEATNIKLCTDINVKFKQFEKSDVLIPLNLSNTLLLRGLTIMFPTYLEECNNSESPPSSSSSQNLDSILPAAAMFKKRLYSLLFWPTILSKLKMSSINNASGDYEGEILGEYYVDPQNEDDMNLIDLEENNDNNTNPNNEIILDENTNYTISVLRTDLEKINPTPVVTENKLISPNQRTVKRRNPFKQNCAKKIKQEK
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -