Basic Information

Insect: Pedicia rivosa
Gene Symbol: Jarid2
Assembly: GCA_963082725.1
Location: OY720155.1:4811162-4818827[+]

Transcription Factor Domain

TF Family: ARID
Domain: ARID domain
PFAM: PF01388
TF Group: Helix-turn-helix
Description: This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 1 7.3e-22 1.8e-18 67.0 0.0 6 89 1704 1785 1700 1785 0.93

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	1	7.3e-22	1.8e-18	67.0	0.0	6	89	1704	1785	1700	1785	0.93

Sequence Information

Coding Sequence: ATGGTTATATCAAAGGATGGAAAacgtaaaagaaaagaaatacaaCCACTGGAAACAGTGGAATTACCGAAAagaacaaAAGTTCACGCACAACGTAAATTTGCTCAAGGACAAGGTtcagcatcatcatcatcatttccTGTAACAAGTTTAATTCCATCAATACCAATACAACCACAACCGGTAACACCAATTAAAGCTCCATCACCGCCAACAGaattaattacaacaaataataaaagaccACCACATACAGAAGATTTTTTaacatatttatgttttagAGGAACACCAATTTTACCACCACAtctagattattttaattcaaatacaaataataatcgtGGAATAgaattatcatcatcatcaacagtaactacaaccacaacaacattaataaataatgataaaattaatttattatcaaatacATCAACAACAACTTCAATTATTCTTCCATCcgatgaaaaaggaaaatctgATAATGTTTCTggaaaacatgaaaaaatggaaattgtaaccgcaacaacaacaacaactgcagcatcaacaacaaataatgataaaaatgaatCCACCAATTTTATACCATTTGGTGTTAGAAAACGTGCTGAACAAATACCAGATAGAAAACATCGTGAAAAAGTGCAAGCATTACGGAAAAAATATCATGAACAAAGAATGGCAAAGTTACGTACAAAACGTTTTAGTAAAAATCGTTCATCAATACAAACACGTTCAAATCCAATACCAAAGGCTGTAAGCCCGGATGTTTCACCACCTTCATCTCCACATCATCCAACAATTGTTGAtagtaaaaggaaaaaagaaattgaaaaagatGAAACAATTAGAATCACGCAAcaaaataaacgtaaaattGGTTTAAGAAGTGGATTAATAATATCAAATGTTGAAACACAGAAAACATTGAAACAAGTCAAGTCAGAGAAATTAAGTGATGAGAAgatgaaagaaacaaaagtttcaataaaaaaagaggTAGCATCGAAAAAAGAATCcaaggaacaaaaaaataaattagaagaaaaggaaaaagatgAATCAGTTCTGacattaagaaataaaaaaataatacaaagtaAAACTATACCGAACAAAGATAGTGAGGTTCCGCGAATGACacgacaaacaaaaataagaaatccAACAAAAGatgaatcaataaaaattgaatcacATATTGAATCGGAAGACTTTTCATCAGATGATGATGCACCATTAGCAGCtattaaaaagataaaaacaaaggATGAAGTGAAAATGACTAGAAGTAAAAAAGTTTTGaatgttgaaaaaaatgtacaaacgTTACATATTAAAACAGAAGTACAACGTTCTCCAACAATTAAATCTAGGCGGCAAACTAGTCTCACAAGAATGAATACACGCTTCTCTGATGTCATTCCACAACGGTCTAATTCCAGAAGTCAAACGTCTGATGTTAGTTCAAAAATTTCAGATGTCgatgttaagaaaaaaattattcctaTTAAAAAATTAGCACCAACGAAAAAACAAGAAGTTCCAAAAAAATCTACTGATATTCTTCAATCAAAAGccagtaaaattaaaattgaacgTGATTATAGTTCAAGTAATAAATCTGATATTGAATCTCCTTCAATTACACCACAAAAACCACTTCCACCTAAAAAGGTTGGacgtaaaaagaaaattaattcagaGGCTGAGAAGCCAGATGTACATTCCCATATACCAACAGCAACAACGATAATAAATGATATAAGTGAAACAGAAATGAGACAAGCAAGACCAactagaaaaacaaaagaagctGCTACAATTTATATGGAATTAATtggaagaaaattaaatttaaaagagacagattttgatgatgatgcaATGTCATTGGATAGTTTTCCAGAGTTACCAAATGTtagaaaaacagaacaaatggaaaatgaaatgaaatcaaattataataaagataaaaacaaaatgaaattaattcagaaacaagcaaaagtaaaaaaagttTCAGTTAAAGTAAAGAAGGAGGATTCGATTCAGTTGGAAGAAATTGATGAACAAGAAGTGATAGCAGCGACAGAAGAGCCggaaattattgttaaaaaattaataaaaaaaaaagaatcaaaaaacttaaaacaaacTGAATTAGAATCAGAATCTGATTATGAAATTGGTGATATAATAAAAGAACGGGTTAAAAAGAAACTTATTTTAGATGAAactgttaataaaaataataaagaaaaaaagaaaaaagatgaaaCTAAATTGGAAAAAAGTTTTAGTGAGTCAGATGAAGAACCATTAGCATCAAAAGTTttgaaaaaacgaaaattaccaacaaaacaacaacaaaaaaatagttcATTAAATGTagttacaacaacaacaacagatacGATTgcgataacaacaacaaccaattCTCTTGAAATACctgaatcaaaaaatattgttaaaattgaATTCCCAACACCTGTTACAATTGTTAAACAATCGCCTCCAACTATTGAGGCACGAAATTTTCACCAAAAACCAGAAATTTCTAAaagtttaattgaaaaatttaaagaacaaaatctTGGTAATTTAACGAGAGgaattcaacaacaacaacaacagcaacaacagaaTGTTAAAGATGACCAAATATCAATAAAAGTAAATCGTTCAAGTGAATTTAACAGTAAATCTTTTGATacaaattcaacaaataaattaaatcgttctggtaatgaaattgaaaatttaattaaacatcagaaacaacaacaacaaattgatgaaacaaaaaataatagtacattaaaaaataatgattcaatttttataaaacaaataaagcaAGCGGCAATGAATTCAATGCGTGATCTTATGAATCCTTTACCTAGTCAAGAGGAATCTGGTAAAATTTTTGGTATTGCAAGTGTAAGTTTAGCACAAAGTTCTGGACCATTAGATACAAAATGTACACTTGGTAAATGTGGCTCAATACATAAGCCACCATTAGGGCCAGTTGTACCAACCGAAGCTATACTTGGTGAACATTTAACAAGTAAAGAAAGGCGTAGAGCAAAAGTAAATATGACACAtgaacaaatacaaaaatggcTTGTTGAAAGTTCCTGTACACCAGATCCAAATGATATGCATGATGATTTTATGGATGATGATTTTGATCTTAAAACACCACCAAAACCAATAAGTTATTTATCATCACCATCACCTTCACCATCACCATATAGACCAGATGAACCATCAACATCTTCTACATTTCGTGTTGCAAAAactaaacaagaaaaaatctttttaaataataaagaaaaaagttcaTCATCTGTTACAAAAGGACCAACACTTAAAGCAAAACCAATTTTAgtcaaagaagaaaaacgtgAAGAAAGTATTGATAGAAATCCTGTACAAGAAAGGAATAAATTAGATAATAAAATTGGTAAATATGAAAGACAAAGTGGtaaaacaacagaaaacaaaattaaagaaaaagttctTCCATCTTCTTCATCCTCTTCTTTTATACCCAAAATTgatgttaaaataaaagaagaagtaatTTCATTACTGGATTCATCTGATCAAAAATcagtaaaagaagaaagatcCTCCGTTGCATCTGTAACTACGTCAATAAAACCACCTGCATCaattacagaaataaaaacaactcCAAAAACTggtacaacaaaaacaaaatcaaattcgTCAGCACAAAAATTAGGTACAACTATAACAACAGATcgtaaattaatatttaatcaacGTCGTCTTCCCGTTTATAATGCAAAATTACAAGAAAcaccaaaaattaaacaaatagtTAAAAACACATTTGGTGCATTTTCACCAGATAATGAAACAAGCGTTTATTCATTTGATAAAGAAGATGATGTTATACCAGTTGCAACACCATTTAGACGTCATGATTCACGTCGAGAATCAAATAATTCACGACAGGATGATTCATTAGAACGTTTACCAACAACACAAACACCAACTACAAatcaaccaacaacaacaacaaatgcaATGAAAAAAGCAAATGAACAAATAAcaccaataaaaaataatttacaaccAGAAGTTTCATTAACATTAAGTCCAGATGATAACACTAAATCAGCATCAATTGTTGTACAAACATTTTTAGATGAAATACCAGCAACAGTTGAGAAttgtaaaaaacaaataattaataataatattagttGTGATAAACAAGATGATAATAGTAATaatcatataaataatgattGTTTAAATGATTCAAATTCTTCTGATGGgcaaacattttatataccATTACAGGGTACAAATATAATTGGTAATAAATCAGAACAAATAATACAAGGTGTTGCTGTTAAATTAGGTACAGAAGGACCAGATGGACCAAATCAACGTGTTATTATGCATGCAAAATTAGTTACAAAAACTCAAATGggtacaacaacaactacaacaacatcaacagcAGCAACTGGAGGTAATGGAAATCAATTAATAGATACACTTGGCAATAATGTACAAGAATTAGTCAAAAGTCTAATTGGTAATAATAGTAAAGAACAATTAGGTTCAAAATCTGTACCAGTTGGTACAGTACAACCACGATTTAAATCAAGTGATTCAATTATTGAACAATTACGTTCTTTATCACCCCAACAATCAACATCGGAACAATTACCACGTGTTAATTCGAATTCATCAATTACTTcacaaaattctaaaatacaaaaactgacaaccataacaacaacatcatcatcaagtgcaataaaaataaaaaatgattttcctttacaacaaacaaataatacaacatTTCCAAGACATGATGATCCAGCACAAATGGTCGATGCACCAATATTTAAACCAActgaaaaagaatttcaagATCCATTAGAATATATTGAAAGAATTTCATCAGTTGCATCACGTTTTGgtgtttgtaaaattattcC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Protein Sequence: MVISKDGKRKRKEIQPLETVELPKRTKVHAQRKFAQGQGSASSSSFPVTSLIPSIPIQPQPVTPIKAPSPPTELITTNNKRPPHTEDFLTYLCFRGTPILPPHLDYFNSNTNNNRGIELSSSSTVTTTTTTLINNDKINLLSNTSTTTSIILPSDEKGKSDNVSGKHEKMEIVTATTTTTAASTTNNDKNESTNFIPFGVRKRAEQIPDRKHREKVQALRKKYHEQRMAKLRTKRFSKNRSSIQTRSNPIPKAVSPDVSPPSSPHHPTIVDSKRKKEIEKDETIRITQQNKRKIGLRSGLIISNVETQKTLKQVKSEKLSDEKMKETKVSIKKEVASKKESKEQKNKLEEKEKDESVLTLRNKKIIQSKTIPNKDSEVPRMTRQTKIRNPTKDESIKIESHIESEDFSSDDDAPLAAIKKIKTKDEVKMTRSKKVLNVEKNVQTLHIKTEVQRSPTIKSRRQTSLTRMNTRFSDVIPQRSNSRSQTSDVSSKISDVDVKKKIIPIKKLAPTKKQEVPKKSTDILQSKASKIKIERDYSSSNKSDIESPSITPQKPLPPKKVGRKKKINSEAEKPDVHSHIPTATTIINDISETEMRQARPTRKTKEAATIYMELIGRKLNLKETDFDDDAMSLDSFPELPNVRKTEQMENEMKSNYNKDKNKMKLIQKQAKVKKVSVKVKKEDSIQLEEIDEQEVIAATEEPEIIVKKLIKKKESKNLKQTELESESDYEIGDIIKERVKKKLILDETVNKNNKEKKKKDETKLEKSFSESDEEPLASKVLKKRKLPTKQQQKNSSLNVVTTTTTDTIAITTTTNSLEIPESKNIVKIEFPTPVTIVKQSPPTIEARNFHQKPEISKSLIEKFKEQNLGNLTRGIQQQQQQQQQNVKDDQISIKVNRSSEFNSKSFDTNSTNKLNRSGNEIENLIKHQKQQQQIDETKNNSTLKNNDSIFIKQIKQAAMNSMRDLMNPLPSQEESGKIFGIASVSLAQSSGPLDTKCTLGKCGSIHKPPLGPVVPTEAILGEHLTSKERRRAKVNMTHEQIQKWLVESSCTPDPNDMHDDFMDDDFDLKTPPKPISYLSSPSPSPSPYRPDEPSTSSTFRVAKTKQEKIFLNNKEKSSSSVTKGPTLKAKPILVKEEKREESIDRNPVQERNKLDNKIGKYERQSGKTTENKIKEKVLPSSSSSSFIPKIDVKIKEEVISLLDSSDQKSVKEERSSVASVTTSIKPPASITEIKTTPKTGTTKTKSNSSAQKLGTTITTDRKLIFNQRRLPVYNAKLQETPKIKQIVKNTFGAFSPDNETSVYSFDKEDDVIPVATPFRRHDSRRESNNSRQDDSLERLPTTQTPTTNQPTTTTNAMKKANEQITPIKNNLQPEVSLTLSPDDNTKSASIVVQTFLDEIPATVENCKKQIINNNISCDKQDDNSNNHINNDCLNDSNSSDGQTFYIPLQGTNIIGNKSEQIIQGVAVKLGTEGPDGPNQRVIMHAKLVTKTQMGTTTTTTTSTAATGGNGNQLIDTLGNNVQELVKSLIGNNSKEQLGSKSVPVGTVQPRFKSSDSIIEQLRSLSPQQSTSEQLPRVNSNSSITSQNSKIQKLTTITTTSSSSAIKIKNDFPLQQTNNTTFPRHDDPAQMVDAPIFKPTEKEFQDPLEYIERISSVASRFGVCKIIPPNSFKPECRLSDDMRFTAYNQYVHKMLQRWGPSTKELSAIKKYLATQSITLTHPPWIGGMEVDLPRLYHTVQELGGLSEVIEKKKWVRVAEEMCIPKTAHDRVTKLDDIYCKYLLPYDTLSPNERQKLFDEVEADWAKRETKARHNSDRCANNETNSNSDDDDDDDEDDESDNSDGDTMECIVKGRSMPLSAFFRIARNTMSLWFKNSEPTINEIETEFWRHVAVRDSHVCVHSGSIDSSGWGYGFPTPGPKTKNSPCSKHPWNLKVLTNNIGSILRSLGPVMGVTVPTLQFGMLFSGCCWYRDPHGLPWIEYLHTGASKIWYGVPDDQSANLRSAVMTLVPTHCQNKTIWLPSDTAMVPPHMLTERGVSLCRTEQQPGQFIVVFPRAYTSSVCTGYLVSESVYFGTNSWLESAKQDFKDIQESGEPPVFSLEQLLFAISSDQRSNLETLEQILPMVTEMYEKEVSSRKLLKAAGVTSIEKLVIQKSSRKVQTEVNECNICRANLYISMVKIDDDTIYCLHHTIKYLNNLRIKTNQCKLIYSYGTDEIEQMLENLRERIAIQKKKLYNKKNQMQQQKGGQQQQNKLINHNLNG

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity: -
90% Identity: -
80% Identity: -