Priv018940.1
Basic Information
- Insect
- Pedicia rivosa
- Gene Symbol
- Kdm5
- Assembly
- GCA_963082725.1
- Location
- OY720156.1:3679914-3695148[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 1 2.7e-25 6.6e-22 78.0 0.0 2 89 260 343 259 343 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGTATCAAAAGTTGAAAAAAGTAgtttaaataatgtaaacaataaagaaactacaactacaactgTAACAACaggaataacaacaacagcatctgcaacaacaacaacaggaaCGACAACATGTAatacatcaacaacaacaatagttGGAGGAGGATTACAACAAACTACATCAGTAATAACATCACCAGtaacaacatcatcaacaacaacaacaacaacaggagGTGTAAGTGTTAGTGGTGGTGCACAAGTAACGGCAGCttcaacaccaacaacaacaacaaatatattacaacaattacatcgtatacaacaacaacaacaattacaacaaaatttgaataataatcataataatcatcataataataataataataataatataacattacaacaacaacatcggCAACAACAtgaaagacaacaacaacaacaacaaagacataatcaacaacaaaatataaataatataacaataCAGCCACAACAttcaataaacaataaaaatcataCACAATTTTCatggaataaaaatgaagattttaattttgatgtaCCACCAGAAGCACCAGTATTTGTACCAACAGaagatgaatttaaaaatccattaaattATATCAATAAAATACGTCCATATGCTGAAAAATATGGTATATGTAAAATAAAGCCACCACCGgcATGGCAACCACCATTTACAGTGGATGTAGATAAATTACGTTTTACACCAAGAATACAACGTCTTAATGAATTGGAAGCAAAAACAcgtgttaaattaaattttttggatCAAATTGCAAAATTTTGGGATTTACAAGGATCATCACTTAAAATACCAATGGTCGAAAGAAAAGCACTTGATCTATATTCATTACATCGTGTTGTTCAAGAAGAAGgtGGAATggaacaaacaataaataatcgtAAATGGTCAAAAGTAGCAACACGTATGGGTTATCCACAAGGTAAAAGTGTTGGTACAATACTTAAAACACATTATGAACGTATATTATATCCATTTGATGTTTATACATCTGGTAAAGCAATTGatattaaattagaaacaGAAATACCAACAATTGATGATCATGATTATAAACCACATGGTATATTATCACGTCAATTAGTATTACCACCACAAGAAACAACAGCAAGACGTTCTAAACgttttacacaaaataatcaaacaacaacaacaacagcaacaacatcaataacaacaactgGTACAAATTTTCTATCACCAACAAAATATGGTAATAcacaaaatcataataatgattataataatataaaatcagaaaattGTTCACCATTAACACAAATAACACAATTAAGTGGTAATTGTAATATAAGTGGTGGTAGTAGTGGTAGTAGTGGTAATGGTAATGAACTTAAAAGAGAATTAGGACTTGATAATAAtctaacaaaattattaccaacaaatctaaattatttaaaatataatcatgatgatgatagtaaaaattgtgaattaCGTCGTTTACAATTTTATGGTGCTGGACCTAAAATGGCTGGTTTTAAAACAGGTGCAACaaattcaacaacaaataaattaataacagATACAAAATCACGTATGAAtatgaaaaaacaacaaaatcaacaaatagataataatattcaatcatCAAGACGTCGTGTACATTCAGATCCATTTGCTAAATATATTTGTCATACATGTAATCGTGGTGATATTGAAGAATCAATGTTATTATGTGATGGTTGTGATGATAGTTATCatacattttgtttaataCCACCATTACAGGATGTACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCAAAATGTGTTGTTGAAGAAGTTAATAAACCAATAGAAGCATTTGGTTTTGAACAAGCACAACGTGAATATACATTACAACAATTTGGTGAAATGGCTGATCAATTTAAAgctgattattttaatataccTGTACATTTAGTACCAACCGAATTAGTTGAACGTGAATTTTGGCGTATTGTATCATCAATTGATGAAGATGTTACTGTTGAATATGGTGCTGATTTACATACAATGGATCATGGTTCTGGTTttccaacaaaaaattctattaatttattacaagGTGATCAAGAATATGCTGAATCTAGttggaatttaaataatttaccatTATTAGAAGAATCAATATTAGGACATATAAATGCCGATATAAGTGGTATGAAAGTACCATGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaataaattatttacattggGGTGAACCAAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTAGTAAAGCTGAAGCATTTGAAGAGACAATGAAAAGTGCTGCACCAGAATTATTTCATTCACAACCAGATTTATTACATCAATTAGTAACAATAATGAATCCAAATATATTAATGAATGCTGGTGTACCAGTTTATCGTACTGATCAACATGCTGGTGAATTTGTTATAACATTTCCAAGAGCATATCATGCTGGTTTTAATCAAGGTTATAATTTTGCTGAAGCTGTTAATTTTGCACCAGCTGATTGGATGAAAATGGGACGTGAGTGTATAAATCATTATTCAACATTACGACGTTTTTGTGTATTCTCACATGATGAACTTGTATGTAAAATGGCACTTGATCCAGATAATCTTAATTTTGGTATTGCAACTGCATGTTATATTGATATGGCCGAAATGGTtgattcagaaaaaaaattaagaaaatcatTACTAGAATGGGGTGTAACAAAAGCAGAACGTGAAGCATTTGAATTAATACCAGATGATGAACGTCAATGTGAAATATGTAAAACAACATGTTTTTTATCAGCAGTTACATGTTCATGTAGTAAATCACTTGTATGTTTAAGACATTATTCTGAATTATGTCAATGTTCATCAGATAAACATACATTAAAGTATCGTTATACATTAGATGAATTACCATTAatgttaagaaaattaaaaataaaagcagaATCATTTGAGGCATGGTTAAGAAAAGTACGTGATGTATTAAATCCAAATACACCAGCTGCAATAACATTAGATGAATTACAAGAATTAGCAAATGAGGCAGctgataaaaaatttccaaattcAATTGTATTAGACCGTATTAATTCAGCTGTATTAGAAGCTGAAAAATGTGTAACAGTTATACAACAAttagatataaataaaatgcgTACACGTACACGTAATTCATGTGAATTtgctaaatataaattaacattAGATGAATTAGAAATGTTTGTACAAGAAATTGATAATTTATGTTGTATTATTGAAGAAGGTAATTCTGTACGTGAATTACAATTAATGGGTAAAGAATTTGTTGTACAAGCAAATGATGCATTAAATAAAGCGATAAATAATGCAAGTGAAGAACAAATTGAGAAATTAATAGATGAAGGTAGTTCACTATGTATTGAATTACATCAAATAAAAGCATTAAAAGATCGTTTAACACAAGTACATTGGTATAATTTAGTAAGAAGTGTACgtaattcaaatgaaaaaattccattaattataataaaaaaattattaaatgatggtttaCAAATAACACCAGATGTTATACTTGAACATGAATTAGCTgatttacaattaataatgaTATCTGTTGAAAATTGGgaaaaacaagcaaaaaattgttttgaaacGGGTACAGAACATCAGATAccagaaattgaaaatttattaaagcaAGCTGAAATAATTGATGGACAATTACCATCACATGCACCATTAAAAGATGCATTAAAAAAGGCTAAAGAATGGTTAACAACAGTTGAAATATTACAATCACATGAAAATTATCCATATTTTAATACATTAGAAAATGTTGTAAATCGTGGAAAAAATATACCATTTCAATTAGAGGAATTAAAACGTATGGAAAGTTATTTACAATTAGCAAAAATTTGGAAAGAACGTACATGTCGTACatttcttaaaaaacaaacatcaTTTACATTAATGAATACATTATCACCTAGAATAAATTCAGTTATGTTACCTACTagtcaattaaataaaacacaaacaacaatgattacaacgacaacaacaacaaatacaataacaacaacatcatcaataatgaatcaaaatcaacaaataattattggtAATAAtggtttaattaaatatgatgaaaatattacgttaaataataaagatttcaCAGAAGAAATGTCACCAGTACAAATGGTTATTGCATTTAAACaatcagaagaaaaagaaatgtcAGAAATGCGTGAATTACGACGTGttaatataagtaaaaatcCAGAAACAGATAAATATTGTATATGTAAACGTAATTTTTATGGACAAATGTATAATTGTCAATTATGTAAAGATTGGTTTCATATACAATGTGTACCAGTACCAAAAAATACAGTACGTCCACGTCCAATAAATTCAACAGCACCTAATTTAGGTGTACTTATACCACCATTAATAAAACGTGAAAAAGATcgtgaaataaaatatttatgtccATCATGTATGCGTTCACGTCGTCCACGTTTAGAAACAATATTATCATTACTTGTATCATTACAACGATTACCAATACGTATACCAGAAGGTGAAGCATTACAATGTTTAACAGAACGTGCGATGAATTGGCAAGATCGTGCTAGACAGGCATTAAGTACAAATGAAATAACCAATACAATtggtaaattattaataatatcaCAAAAGCATATAAcagatgaaaataataaattaaaagatacAATAATACAATCAGCGAATACAATATCACctacatcatcatcatcatcatcatcatcaataataacaacaacaacaacaacaacaacaacagcagcatcAACAGCAATATCACCATTATCAACAACatcaatatcatcatcatcatcatcaacaacaacaacaactacattAGATACAGATACAAGTATAACAACGATAGCATTAGC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- Protein Sequence
- MVSKVEKSSLNNVNNKETTTTTVTTGITTTASATTTTGTTTCNTSTTTIVGGGLQQTTSVITSPVTTSSTTTTTTGGVSVSGGAQVTAASTPTTTTNILQQLHRIQQQQQLQQNLNNNHNNHHNNNNNNNITLQQQHRQQHERQQQQQQRHNQQQNINNITIQPQHSINNKNHTQFSWNKNEDFNFDVPPEAPVFVPTEDEFKNPLNYINKIRPYAEKYGICKIKPPPAWQPPFTVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWDLQGSSLKIPMVERKALDLYSLHRVVQEEGGMEQTINNRKWSKVATRMGYPQGKSVGTILKTHYERILYPFDVYTSGKAIDIKLETEIPTIDDHDYKPHGILSRQLVLPPQETTARRSKRFTQNNQTTTTTATTSITTTGTNFLSPTKYGNTQNHNNDYNNIKSENCSPLTQITQLSGNCNISGGSSGSSGNGNELKRELGLDNNLTKLLPTNLNYLKYNHDDDSKNCELRRLQFYGAGPKMAGFKTGATNSTTNKLITDTKSRMNMKKQQNQQIDNNIQSSRRRVHSDPFAKYICHTCNRGDIEESMLLCDGCDDSYHTFCLIPPLQDVPKGDWRCPKCVVEEVNKPIEAFGFEQAQREYTLQQFGEMADQFKADYFNIPVHLVPTELVEREFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKNSINLLQGDQEYAESSWNLNNLPLLEESILGHINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGSKAEAFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMNAGVPVYRTDQHAGEFVITFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWMKMGRECINHYSTLRRFCVFSHDELVCKMALDPDNLNFGIATACYIDMAEMVDSEKKLRKSLLEWGVTKAEREAFELIPDDERQCEICKTTCFLSAVTCSCSKSLVCLRHYSELCQCSSDKHTLKYRYTLDELPLMLRKLKIKAESFEAWLRKVRDVLNPNTPAAITLDELQELANEAADKKFPNSIVLDRINSAVLEAEKCVTVIQQLDINKMRTRTRNSCEFAKYKLTLDELEMFVQEIDNLCCIIEEGNSVRELQLMGKEFVVQANDALNKAINNASEEQIEKLIDEGSSLCIELHQIKALKDRLTQVHWYNLVRSVRNSNEKIPLIIIKKLLNDGLQITPDVILEHELADLQLIMISVENWEKQAKNCFETGTEHQIPEIENLLKQAEIIDGQLPSHAPLKDALKKAKEWLTTVEILQSHENYPYFNTLENVVNRGKNIPFQLEELKRMESYLQLAKIWKERTCRTFLKKQTSFTLMNTLSPRINSVMLPTSQLNKTQTTMITTTTTTNTITTTSSIMNQNQQIIIGNNGLIKYDENITLNNKDFTEEMSPVQMVIAFKQSEEKEMSEMRELRRVNISKNPETDKYCICKRNFYGQMYNCQLCKDWFHIQCVPVPKNTVRPRPINSTAPNLGVLIPPLIKREKDREIKYLCPSCMRSRRPRLETILSLLVSLQRLPIRIPEGEALQCLTERAMNWQDRARQALSTNEITNTIGKLLIISQKHITDENNKLKDTIIQSANTISPTSSSSSSSSIITTTTTTTTTAASTAISPLSTTSISSSSSSTTTTTTLDTDTSITTIALANSGIINNSKEGTTVQQQSKPLSELKKNNNKTKKSKKTIDLQIQATTTTTTTTTDSSSDEDEFNFQFRDEELASGNSSPSPTNIEHAYSVPPPTFPHYGKYGNPLLKPEPSLIQLCKTTKEYLEDLMMEGDLLEVSLDETQHLWRILNAAKPCYSDLAVIHFKYKIMPYPNEILVNMKKRKSDENTNIKKQPKLTKSSDLMSLLTMTPTATINETTTTIPTTTGTTTITAASLSTTGTTTTSSSSLSSIQSGKTIASPTATGTTTTGSTLTPTINDNNVQTIKVKRGRKTKTTSDKLLTLSECGKKKRIIIQNKNKDKHQSHNDSLTTSDEDEDCSAKTCVRPGGREVDWVQCDGGCNKWFHMLCVGLAKNQIKPDDDFICKKCKKMPPQPYEKKLRTSVASNFLRLKTNLKTTTKKMTRKTTITASNKKPILINADDDDDDDVEEDDDNDEYIDYDDDDDDDLKDINNLDDDDIININNDKQTTNLNQT
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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