Pmau002528.1
Basic Information
- Insect
- Paykullia maculata
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_003055125.1
- Location
- NDXZ01034230.1:30990-46638[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- THAP
- Domain
- THAP domain
- PFAM
- PF05485
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 34 8.3e-16 1.5e-12 48.5 0.9 1 86 323 395 323 396 0.85 2 34 2.5e-15 4.5e-12 46.9 4.7 1 87 423 492 423 492 0.80 3 34 2e-15 3.5e-12 47.3 0.3 1 87 513 585 513 585 0.83 4 34 4.2e-14 7.5e-11 43.0 3.2 1 86 668 736 668 737 0.78 5 34 7.1e-15 1.3e-11 45.5 6.0 1 86 761 832 761 833 0.80 6 34 1.1e-12 2e-09 38.4 1.5 1 87 868 936 868 936 0.81 7 34 1.3e-11 2.3e-08 35.0 2.7 1 86 977 1046 977 1052 0.73 8 34 9.5e-16 1.7e-12 48.3 0.3 1 86 1074 1143 1074 1144 0.81 9 34 7.2e-15 1.3e-11 45.5 1.2 1 86 1166 1235 1166 1236 0.79 10 34 4.4e-13 8e-10 39.7 2.8 1 87 1264 1336 1264 1336 0.85 11 34 8.3e-06 0.015 16.4 0.0 1 74 1403 1471 1403 1479 0.71 12 34 9.6e-10 1.7e-06 29.0 0.9 1 87 1500 1572 1500 1572 0.78 13 34 5.4e-14 9.8e-11 42.6 5.1 1 87 1603 1674 1603 1674 0.79 14 34 4.5e-14 8.1e-11 42.9 4.0 1 87 1720 1793 1720 1793 0.84 15 34 4.7e-13 8.4e-10 39.7 0.2 1 87 1815 1883 1815 1883 0.80 16 34 2.3e-15 4.1e-12 47.1 0.6 1 87 2212 2281 2212 2281 0.81 17 34 1.5e-13 2.6e-10 41.3 3.4 1 86 2339 2425 2339 2426 0.80 18 34 5.8e-11 1e-07 32.9 3.7 1 87 2456 2528 2456 2528 0.76 19 34 9.5e-14 1.7e-10 41.9 1.8 1 87 2556 2625 2556 2625 0.81 20 34 3.7e-15 6.6e-12 46.4 0.7 1 86 2645 2714 2645 2715 0.81 21 34 3.5e-14 6.2e-11 43.3 2.3 1 87 2738 2809 2738 2809 0.82 22 34 1e-05 0.018 16.2 0.1 1 62 2825 2886 2825 2909 0.68 23 34 2e-11 3.5e-08 34.5 4.2 1 86 2913 2982 2913 2983 0.82 24 34 1.6e-11 3e-08 34.7 2.5 1 86 3008 3078 3008 3079 0.79 25 34 1.1e-14 1.9e-11 44.9 1.2 1 86 3099 3171 3099 3172 0.80 26 34 5.6e-11 1e-07 33.0 1.9 1 86 3192 3261 3192 3262 0.81 27 34 6.7e-14 1.2e-10 42.3 6.7 1 86 3562 3638 3562 3639 0.82 28 34 4.6e-07 0.00082 20.4 2.9 1 86 3658 3727 3658 3728 0.75 29 34 3.4e-15 6.1e-12 46.5 3.1 1 87 3749 3818 3749 3818 0.81 30 34 0.0012 2.1 9.5 1.6 1 80 3864 3948 3864 3953 0.68 31 34 2.1e-13 3.7e-10 40.8 4.2 1 87 3968 4042 3968 4042 0.84 32 34 4.1e-13 7.3e-10 39.8 0.9 1 85 4065 4137 4065 4139 0.83 33 34 1.5e-13 2.6e-10 41.3 3.0 1 87 4261 4334 4261 4334 0.78 34 34 1.1e-15 1.9e-12 48.1 0.3 1 87 4359 4430 4359 4430 0.86
Sequence Information
- Coding Sequence
- 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- Protein Sequence
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