Basic Information

Gene Symbol
TRERF1
Assembly
GCA_003055125.1
Location
NDXZ01033565.1:866-14257[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 2.4e-11 2.8e-08 34.1 0.3 3 45 1727 1769 1725 1770 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTGTAGTGCATCGGTGGGTACGGAAACTTCGGTAACACTACAACTGCGCGATGTTAATTCCAATGACTCAATACAATCCAATCAATCATCCTCAGAAGCAAACGCTGCTGCAGCAACAATTTATACATCGTCAACAAATAATCATCATACAGGCGGAACAGGAGCAACAGTATCTggagcagcaacaacaacaacattggATAATGCATTAACTATTGGTTATCCAGATCCAGAAATGTTGGCTGATGTTTTAGGCACATTACAAACTGCATctctaaaaaatacaaatcccAGTAGTGAGAGTACAAAGCAAAATTCCTTCAAATTAACAAATACCAGCGATAttacaaataacaatttaaatggTGCAATTAAAAATCGTATAACAATTAGTAAAAGATCCTCGAATACAATTAACAATTCCCAAAATAGCAGCAATATTATTAACAATACCAACAATTGTCTTCGTGATATTTCCAAAACGACTACCACATCGGGGATACAAACAGTATCGACCTCGACGAACACTACAACCGCTGTCAATAAAACCaatagttatataaaaaattgtctaataCGTAGCAGCAGTTGCAGCAATACTACCAACATAACATCCCTGGCTCAGATAATGAGCAATAGTAGTAATAGCAGTAGTGctacaaataacaacaacaacaacaacaacagcagcagcagtggTCATAATAATAGCAATATAAATagtaatcaaataaataatagcaATAGCTCAACTATTAGCTGTAACGGCATTAATAGCATCAGCAATAACAATTTGAATCAACCAAATAGCAACAATACAGCAACTGCTAACAGCAATAATAGCTGCAATAGCAATTTCAGTTCCAGCAGTAACGATAGTTGCTTTAGCTATAGCAGCAACAGCAGTGGCGGTAATTCCGCTGCTCGTACTATTACACCGCTGAGTCACGGTAGCCGAAAAGTTCCTGGTCCATTAACAACAAATCCaccgaaaatattaaaaaagagcCGTTCAAAAATATCATCACCCAGTCGTCACGGTCCGCAGCAGTGTCAGatttgtaataaaatttttggaaatgcaTCAGCGCTGGCCAAACATAAACTGACACACAGTGACGAACGGAAATACGTGTGTGTTATGTGCTCGAAGGCATTTAAGCGACAAGATCAtttAAATGGACATATGATGAcacatagaaataaaaaaccatatGAATGTAAAGCTGAAGGTTGTGGAAAATCATATTGTGATGCTCGTTCATTAAGAAGACATACGGAAAATCATCACGCCGGAATAATTACGCCACAAAATCAACAACACTCTATATCCAATAATAATTCCAATTCAAATTTGAGTTTATCCCCAGCAACAGCAAATGGAGACGCCAGTTCACCAGATGGTGCCACCTGCTTAGGAACATATCTTTCCAACGGTGGTACAGTAGTTGATGCAGCAACTGGTTTAGCTTTAACAGAAGAAGAACTGAAAGCTTTAAATGTGCCCCTTAAAACGGGCGTAACCTTATTATCACCCACATCGACTACATCTTCTATGCCTTCATCGAGCAGTATGTCAAACGGTCCTGGTGCAACCATAACTCTTACAGATAATAGTGGTAATATGGAAGGAGAAGGTTTGACCCGAGAACAACTGGatttaattagtaaaataatgAGGCAAACTAAACAGACAACAGCCCAAGTAACAGTATCCTCACCCACCAGTAGCCAGTCATATAAAATAGATACAAATCCCCAAAATACGGCCCAGACACAAACACAAATTTCCCGACCTAGAACCTGGAATATGCAATTGCTAAATTCCTCCCAAAGTGTTGCCATTACTGTTGACGAGGTCAATTCGGACAGCAACAATGATTCCTCTAGAAGTTCCCAACCCAAACTTAAGGAAGAGGAAATTGAAATTGATTTATCCAATACCATTAACTCCaatctttttaatttggttAAGATTGAACAAAAACCAGTAGAGTGCAATTTATGTCatcgtaaatttaaaaatgtacccGCCCTCAACGGTCACATGCGTTTGCATGGCGGCTATTTTAAAAAGGATCCTGAAACCAAAAAGAATGAGAAAAAGGAAAATAGTGGTCCTCCTTTGCAAACGGCCAGTATTGGTGTAAGAGCTTTAATAgaggaaaaaattataagtaaacGTAGCAAAGATTTAAACAAGGGTGCCTTTGTAGTCCCCGCACCACCCTCAAGTAGTACCCAAAATAATGCAACTACCATGCGCAGATCTATTAGTGATTTAGATACTTTCCTAAATCCCAAGACACAACCGAATGGTACAACTAcaacaaatcaacaaaattccatacagcaacagcagcaacagttaCCAGCGGCTTCAACCATTAAGAATAATGCAAAAACCAATATCAGTGTGCAAGACATAAATTTGCCACAAAGTATCGAAATCTTTAGTACCAAACAATCGCAGCAACAAAAGACAATGAATAATATTGGGGTGGGTACTATAACAAGCACCAGCCTAAATGCCGAGCGTAGTGCAAcgaaaacaaatacaacaacttCAGCAGCAACGATTAATACAACGACAACTCGTAGCACATCAACCGATCCAAAAGATTCGACTCTTATCGAATTACTTAAGCGAGGCACACGTATAGCCGTAACCCAAAAACAgccaaataacaacaacacacCTTTAGGTGGTGTTACCCGCCAAATTATtacgaataaaaataattgtagtgTCATTATACCCTCCGAAGTCCAGGTGGTATCGTCAAAGGCTAAACTCAAGAAGGAGGATAATATACAAATGTCAAATGCCGCTAACGTTACCCTGCCTGATGGCACACCTTTGTCTCTGACGATTGCCCAGGGGGCGGATAATAATAGTGAAGTATACACGGTCACCTACACCAGTGACGGTTCAGCCATATTTGGTGAGAATGAGGTATATAATGTTAGTGAAGCCGAAATGCTGTTGCAAACTGTCGATACCATGCAACTATTGAGTGATACtggagaaaatttaaaatctgaACATTCCGAACAATATGAGAtgatgaataataaaattaagctaGAAATTGAGCAGCAAAATTATGTGGATCAACAacggcagcagcagcaacaacaacaacaacaacagttgcAACAAAACCCCAACCAGTGTCAAACAACACAAACTTTACCAAACTTTCAACATTTCCATTCCAAAGAACTTATCATACAAAATCCTGCCATGATAAATCACCAGCATATAAGAACAAATACCTTGTCTTTGCCACAGGATATTAAAAATCAGTTTGCTTCCAGCATCAATTCACCCATACATTCACCTCTAGCTTATCCCACACCACCCTCTAGTCATGAAAATGTTACACAAACTTCTCCCTACATAGAGGACAATCATCACTTCAACGAcacatcaaatatatttttcaatgagtCACTAATTTCCTCTAACAATGCCGGAGAATCGGAAAATGATAAGATAATGAAATTGAAAAGTGTACTCGAAGACAATTCCTTTGATTCCAATATTAAGGTTGAAGATTTGCTAAATAGTACAGATCCCGATACAGAATGTGATTTACGAGAATTCGCCGAAGCAAATCTTTCGTTCTTGGATGAAGATGAAGAGTTTCTAAATGATTCTCGTAATGCCACTTCGCCGCTTTCGGAATCATTTTTTACCAGTGGCATTGGCACAGCCGAAGAGGTTAAGGAGGTTTTACGTGAAGTTCTAACCGAGGATCAGCTTAATTTGAATTGTGAAAATCAAGGAGAAAATATCAtagatttatattatttacctGGTCTCAGTTTGCAATCGCAAATGATGCCTAATTCCGAAGATCCTTTGCTATCGTCTTCACCCCGTGATTTTGGCCAGcagcaaaaactacaaaatattgtGCCACAATCGCCACAGACGCaaccacaacaacagcaacaacaaacccAAAACATTcctcaacaacagcaacaaccacaacaacagcaacatgaTATACAATACAATAACCAACAACAAATGTCAGCACATCAAATTCAAACCGTTAAACTTTGTTTGGATTCAAATACACAACCGACTTCTAGTTCCACTAATTCCTCCTCCTCAGaaataaatcatttgattttaaatatacctGCAAATGCAATACAGAATTCCTGCAATTCCAATTCGGCTAACTCCTCCTCTTCTGGTTCAACTTCTACTCTACACTATAATGTACAAAACCTACCACAagtacaaaatcaaataaataatcagTTGCAACAGCAATCGCTTCAtatgcaacaacagcagcagcaacaacatcaaaCACAATTTCTCACATCCGCAAGCATAAACTCACTTAACGAGGCCTTAATGAAGCCGATAATTTACACCAGTGGTACCACCGATAAAATGGAACTAAAATTAGACATCAACAACCCCAACTCTACAAACTcacaaatgcaaaatatattaaatctcAATAAACCCCTAGAGACTTCTAAAAATATGTCGACGAGTCATATAATTTTTACGCAACAAAATCACATCCCTACATCAACTGTAAGCACATCATTGCAACCGCTATCGAATCAAACAAATTCTATATTGAAAAGACGTTTGAAAGGTCATTCCTCGTTGGATTCGTCATCTTTACACTCTTCGTATTCCAAATATCAAGCTTTATCGCCCTACAAGTCAAAACTGCGCAAACCATCACGTACCCATTATACGCCAGCTCCCATTCTCAATCCCGAACGTAAAGGACATGGTTTGTACTGTAACGTTTTAAAACAGCTTGGTTGCTCTCTGCTAAGCTTTGATAATTTCGATGATGATTTTGATGATCCAGTGGGTTTGGTCGACTTTTCCGATGAGTCCAAAGTTAATTTGGGATCAGCCTACCAAGCCGCTATACCTGCATTTAATGAAAACGTCTGCTCTGGTTCTGTTGTCGAAGAAACTGTCGGTTGTGATCTCATGTGGGATCCGGAAGTGCAAAAGGATGAAAAGATTTTAATGAGATTTATCGATTTAAGCAAATCCTCTGCTGTGCCCTTGGGTAGTCATTCTGAGGAGGTTGCCTTGCAGGCCCTGTTGAAAGCTGAAGGTAATACTGCAACAGCTGTTTTAGGTTTGTTGCAGACTCAATCAAACTCATTCCAAAGAAAATGGTCAGCGCAAGAATTGGAGATATTCCTGAAGGGTTTGGAGAAACACGGAAAGGAGTTTAGTGAGATTTCTAAAGAGCTGGGTTCAAAAACAATTGGAGAATGTGTACAAATGTATTATTTCTGGAAAAAATTATGTGTTGACTATAAGGTTACCCACCTAAAAACTGAAGCACCACCACAAAATCATGCCACTGATCCCAAGCCTTATGTATGCGAGATACCAGATTGCTCAGCgAGCTTTTCCTCTAAAGCAGCTCTGCATGGTCATACTCGCATCCATACTTATGGCCGTAATTCCCACAATAATCAAAACAGTAATAGCAATAATGCGAATGCAAATGCAACAACAACTACTAACACAAATGCAAATTCCACGCAAGGTTCTGCTACCAATAGTAATAATCATCATCCAATGCATAACAATGCCCAATCTAGTCATGCCAACACGGCGAATCAAAGTCAAAAAGATACTAATGCCAATAAAGATAATACAGAATTCCCCTGCAAGGTGTGCGGCAAagtatttaataaaattaaaagtcgtAGTGCCCATATGAAGACCCATCGTGCAACAGATAATGAAACAACtgtacaaattacaaataatcaaaaccaaatcacacaacaacaacaacagcagccgCAGCCGCAACAACAGCTGCAGcaacaaacacaacaattataa
Protein Sequence
MCSASVGTETSVTLQLRDVNSNDSIQSNQSSSEANAAAATIYTSSTNNHHTGGTGATVSGAATTTTLDNALTIGYPDPEMLADVLGTLQTASLKNTNPSSESTKQNSFKLTNTSDITNNNLNGAIKNRITISKRSSNTINNSQNSSNIINNTNNCLRDISKTTTTSGIQTVSTSTNTTTAVNKTNSYIKNCLIRSSSCSNTTNITSLAQIMSNSSNSSSATNNNNNNNNSSSSGHNNSNINSNQINNSNSSTISCNGINSISNNNLNQPNSNNTATANSNNSCNSNFSSSSNDSCFSYSSNSSGGNSAARTITPLSHGSRKVPGPLTTNPPKILKKSRSKISSPSRHGPQQCQICNKIFGNASALAKHKLTHSDERKYVCVMCSKAFKRQDHLNGHMMTHRNKKPYECKAEGCGKSYCDARSLRRHTENHHAGIITPQNQQHSISNNNSNSNLSLSPATANGDASSPDGATCLGTYLSNGGTVVDAATGLALTEEELKALNVPLKTGVTLLSPTSTTSSMPSSSSMSNGPGATITLTDNSGNMEGEGLTREQLDLISKIMRQTKQTTAQVTVSSPTSSQSYKIDTNPQNTAQTQTQISRPRTWNMQLLNSSQSVAITVDEVNSDSNNDSSRSSQPKLKEEEIEIDLSNTINSNLFNLVKIEQKPVECNLCHRKFKNVPALNGHMRLHGGYFKKDPETKKNEKKENSGPPLQTASIGVRALIEEKIISKRSKDLNKGAFVVPAPPSSSTQNNATTMRRSISDLDTFLNPKTQPNGTTTTNQQNSIQQQQQQLPAASTIKNNAKTNISVQDINLPQSIEIFSTKQSQQQKTMNNIGVGTITSTSLNAERSATKTNTTTSAATINTTTTRSTSTDPKDSTLIELLKRGTRIAVTQKQPNNNNTPLGGVTRQIITNKNNCSVIIPSEVQVVSSKAKLKKEDNIQMSNAANVTLPDGTPLSLTIAQGADNNSEVYTVTYTSDGSAIFGENEVYNVSEAEMLLQTVDTMQLLSDTGENLKSEHSEQYEMMNNKIKLEIEQQNYVDQQRQQQQQQQQQQLQQNPNQCQTTQTLPNFQHFHSKELIIQNPAMINHQHIRTNTLSLPQDIKNQFASSINSPIHSPLAYPTPPSSHENVTQTSPYIEDNHHFNDTSNIFFNESLISSNNAGESENDKIMKLKSVLEDNSFDSNIKVEDLLNSTDPDTECDLREFAEANLSFLDEDEEFLNDSRNATSPLSESFFTSGIGTAEEVKEVLREVLTEDQLNLNCENQGENIIDLYYLPGLSLQSQMMPNSEDPLLSSSPRDFGQQQKLQNIVPQSPQTQPQQQQQQTQNIPQQQQQPQQQQHDIQYNNQQQMSAHQIQTVKLCLDSNTQPTSSSTNSSSSEINHLILNIPANAIQNSCNSNSANSSSSGSTSTLHYNVQNLPQVQNQINNQLQQQSLHMQQQQQQQHQTQFLTSASINSLNEALMKPIIYTSGTTDKMELKLDINNPNSTNSQMQNILNLNKPLETSKNMSTSHIIFTQQNHIPTSTVSTSLQPLSNQTNSILKRRLKGHSSLDSSSLHSSYSKYQALSPYKSKLRKPSRTHYTPAPILNPERKGHGLYCNVLKQLGCSLLSFDNFDDDFDDPVGLVDFSDESKVNLGSAYQAAIPAFNENVCSGSVVEETVGCDLMWDPEVQKDEKILMRFIDLSKSSAVPLGSHSEEVALQALLKAEGNTATAVLGLLQTQSNSFQRKWSAQELEIFLKGLEKHGKEFSEISKELGSKTIGECVQMYYFWKKLCVDYKVTHLKTEAPPQNHATDPKPYVCEIPDCSASFSSKAALHGHTRIHTYGRNSHNNQNSNSNNANANATTTTNTNANSTQGSATNSNNHHPMHNNAQSSHANTANQSQKDTNANKDNTEFPCKVCGKVFNKIKSRSAHMKTHRATDNETTVQITNNQNQITQQQQQQPQPQQQLQQQTQQL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00921633;
90% Identity
iTF_01162532;
80% Identity
iTF_01162532;