Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_004796505.1
Location
SSSI01010214.1:13415-16178[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 0.0016 1.7 8.9 0.1 22 45 251 276 245 277 0.87
2 5 1.9e-07 0.0002 21.5 0.1 3 45 285 331 283 332 0.88
3 5 5.5e-11 5.7e-08 32.8 0.1 1 46 338 387 338 387 0.97
4 5 1.2e-10 1.3e-07 31.7 0.0 1 46 394 439 394 439 0.97
5 5 7.9e-08 8.1e-05 22.7 0.1 1 43 445 489 445 491 0.92

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAGTGATGAAGATGATCTTTTAAAGATCAATAAAGCATTAAAAGAATACAAGGAAGGGAATGAGtttatatgcgatgaatttattaattacggCGACGAAAATGATGAAGAAGGTTTGGATGATGATTCTGACTCAAATATTATTCTTAATGAGTTAAATAGCGCagatttaacaacaatttctaCGTATTCCTTAACGAACTTAAAAcctaatgaaaaatatataatcgaCAATTGTGTCAATTCAGAATTGAAgaatttattgatattaaatCGAAGGAAATATACTAGTTTAATTGAATTCTAcaataaagtgaaaaatatattgtatgtgacacaatctaatataaaaacaaagtaTACATTAATTAAGGAACGCTTTGAAGAGAAAAAAGATTCAAAGTTTTATCCGTTAACAAAATTAGGAGCCCCATATTTTAAAGATAGGCAACTGTATTCATGTCAGCCAAATTTAGatgtattaaataaacgaCAAAATAACGAACTCTCAATTTACGATTTAAATACGACAATTAAATGGCGGGAATCTGAATGTATCAAACTGAAAGGGGctgttaaaacaaattatagtattaacatgcaaaaacATTTAGCAAAAGAAATTAACAACATTAACACTACACTCAGTGATCCAGATTCAACTGTTCTTCtcaatttcaaacaaaaattagcATATTTTGAATCAAACGACAACATTATTCCTCCAAAGAATTCAGACGATTTTATAGATTGGAATAGAATATCGGAGGTATTCATGAATAATAAACACAGTGCCTTAGAGTGTCGTTCATTTTGGCATATCTATTTACATCCTTCTATTAATAAGTCACTTTGGTCACAAGAAGAAATGCAACAactaacaaatataataaaaagaaattcaaagGGAGTTCAAAATTGGGATGAAATCGCACAGGAATTGAACACAAATAGAAGTGGATTCACTGTTGCTTTTCATTATTTCagtaatttacataaaaaatacaaacgtggtgaatttacaaaacaagaagataaattactgaaaaatttAGTGGATCGTTataaaactggtaattatatACCATGGAATAAAGTTTCAGATCGATTTAAAAATCGTTCAAGACATCAATTATTTTATCGTTACACATATTATTTAACTACACCAACATTAAATCGGAAGCGTTTTACCGAAGCCgaagatattttattgttaatattagtTGGCAAATTTGGTAGAAATTTTTCGAAGTGTGCCGAATACTTTCCAGAACGTTCACAAGTCCAATTGAAATCCAGATATAATACGAATTTAGTGAAAGCACTTAAAAAAGGATCTTTTACTACGGAAGAGGATCATGTGATATGGAATTTTGTaatggaaaatgaaaataatccTAACAAGTGGTCTAATTTGGCGAAAATCTTGGACCGTTGTAGAGGACAAATTCGACAacgttataatattattaaacaatacttAGAGAGTGGAGAGGGGCGAAAATTAGAAGATGTACCAAGTCGTAGACATGCAATTACTCCGGAAAATGATCGATGTTACGGTTTTTTAAGgCATACGgctgataaatttaaaaacctAAACACAATTCCTACATTAGctacaatagaaaattttatgaaagagTCTTCTACTGATCCAGAAGTGAATGAAAATGATGATCAGGTTTCGGATGAGTTTAATACGATAGACGATATGTTAACcgattttttctttaactCAATTAAATTAGGCCCTTCtctaaaatcaataaatgatAACAATCTTAATGAAGTCACGGATAATGTACAAATCGTATTAGACTTATTACAAGTAAATTTCATATTGCCTAAAAATTATCATGATAATCCTCATTTAGATAGTTTGGATAAAaagattttagaaaatttagctgaaaaacaaaataaatctcTTGAAAGAAAACCAACCATAATAtgttacaataacaaaaatttagatgagattttttcaccaaatataaatacattgaTTGGTTTGCgtagtttattaattaatcatcgactatataaacaaaatacaaaatattttttaactgaaaTATCGTGGAGcgttgaaaaatatgtaaaagaaATGTCAGTAACACGAAAAGTTCGATTTAAAGTTGAAActgatttgttttttaaaagatttaaagCGTTATTTAAATGGCCGTCTATTTTAACACTACATGAACCAAATATTTCtcttttaaattctttaaaaattggaCATGttggaaataatataaaaacaagaaCTTATGGTAGTAAAAAAAGAACTTTGACTAATACTGACATGCAAATTTGTAAGAAACCAAGAATAATTGATATCAGTGTTCCATCAACTAGTGATAATAGTGGATTTAATGAGTTAAGTGATCTGGAAAAATTACAGCGCGTATTAAGTACTCAAAATGATTTAACAGATGAGAGTGATAATGATAGTGATAGCAGTGAAGTAATTACGGGtctttaa
Protein Sequence
MSDEDDLLKINKALKEYKEGNEFICDEFINYGDENDEEGLDDDSDSNIILNELNSADLTTISTYSLTNLKPNEKYIIDNCVNSELKNLLILNRRKYTSLIEFYNKVKNILYVTQSNIKTKYTLIKERFEEKKDSKFYPLTKLGAPYFKDRQLYSCQPNLDVLNKRQNNELSIYDLNTTIKWRESECIKLKGAVKTNYSINMQKHLAKEINNINTTLSDPDSTVLLNFKQKLAYFESNDNIIPPKNSDDFIDWNRISEVFMNNKHSALECRSFWHIYLHPSINKSLWSQEEMQQLTNIIKRNSKGVQNWDEIAQELNTNRSGFTVAFHYFSNLHKKYKRGEFTKQEDKLLKNLVDRYKTGNYIPWNKVSDRFKNRSRHQLFYRYTYYLTTPTLNRKRFTEAEDILLLILVGKFGRNFSKCAEYFPERSQVQLKSRYNTNLVKALKKGSFTTEEDHVIWNFVMENENNPNKWSNLAKILDRCRGQIRQRYNIIKQYLESGEGRKLEDVPSRRHAITPENDRCYGFLRHTADKFKNLNTIPTLATIENFMKESSTDPEVNENDDQVSDEFNTIDDMLTDFFFNSIKLGPSLKSINDNNLNEVTDNVQIVLDLLQVNFILPKNYHDNPHLDSLDKKILENLAEKQNKSLERKPTIICYNNKNLDEIFSPNINTLIGLRSLLINHRLYKQNTKYFLTEISWSVEKYVKEMSVTRKVRFKVETDLFFKRFKALFKWPSILTLHEPNISLLNSLKIGHVGNNIKTRTYGSKKRTLTNTDMQICKKPRIIDISVPSTSDNSGFNELSDLEKLQRVLSTQNDLTDESDNDSDSSEVITGL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
-