Nrev013169.1


Basic Information
Transcription Factor Domain
Sequence Information
Similer Transcription Factors

Basic Information

Insect
Nycteola revayana
Gene Symbol
-
Assembly
GCA_947037095.2
Location
OX344845.2:3689138-3696540[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
HTH
Domain
HTH_psq domain
PFAM
PF05225
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This DNA-binding motif is found in four copies in the pipsqueak protein of Drosophila melanogaster [1]. In pipsqueak this domain binds to GAGA sequence [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 79 2.1 5.1e+02 1.5 0.0 14 33 194 213 189 216 0.83
2 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 218 243 213 248 0.80
3 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 242 264 237 271 0.80
4 79 1.2 2.8e+02 2.3 0.0 14 36 266 288 262 295 0.80
5 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 290 312 285 319 0.80
6 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 314 336 309 343 0.80
7 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 338 360 333 367 0.80
8 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 362 387 357 393 0.81
9 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 386 408 381 415 0.80
10 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 410 435 405 440 0.80
11 79 0.98 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 434 459 428 464 0.81
12 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 458 480 453 487 0.80
13 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 482 507 477 512 0.80
14 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 506 531 501 536 0.80
15 79 1.1 2.5e+02 2.4 0.0 14 36 530 552 524 559 0.80
16 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 554 579 549 584 0.80
17 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 578 603 573 609 0.81
18 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 602 624 597 631 0.80
19 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 626 651 621 656 0.80
20 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 650 675 645 680 0.80
21 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 674 699 669 704 0.80
22 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 698 723 693 729 0.81
23 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 722 747 717 752 0.80
24 79 0.99 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 746 771 741 776 0.80
25 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 39 770 795 766 800 0.80
26 79 1.3 3.2e+02 2.1 0.0 14 35 794 815 787 822 0.83
27 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 818 843 813 848 0.80
28 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 842 867 837 872 0.80
29 79 1.2 2.8e+02 2.3 0.0 14 36 866 888 862 895 0.80
30 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 890 915 885 920 0.80
31 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 914 936 909 943 0.80
32 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 938 963 933 968 0.80
33 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 962 987 957 992 0.80
34 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 986 1008 981 1015 0.80
35 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1010 1032 1005 1039 0.80
36 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1034 1059 1029 1065 0.81
37 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1058 1080 1053 1087 0.80
38 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1082 1107 1077 1113 0.81
39 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1106 1131 1101 1137 0.81
40 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1130 1152 1125 1159 0.80
41 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1154 1179 1149 1185 0.81
42 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1178 1200 1173 1207 0.80
43 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1202 1227 1197 1233 0.81
44 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1226 1251 1221 1257 0.81
45 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1250 1275 1245 1280 0.80
46 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1274 1296 1269 1303 0.80
47 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1298 1320 1293 1327 0.80
48 79 0.99 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1322 1347 1317 1352 0.80
49 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1346 1368 1341 1375 0.80
50 79 0.99 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1370 1395 1365 1400 0.80
51 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1394 1416 1389 1423 0.80
52 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1418 1440 1413 1447 0.80
53 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1442 1467 1437 1472 0.80
54 79 1.1 2.5e+02 2.4 0.0 14 36 1466 1488 1460 1495 0.80
55 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1490 1512 1485 1519 0.80
56 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1514 1536 1509 1543 0.80
57 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 39 1538 1563 1534 1568 0.80
58 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1562 1587 1557 1593 0.81
59 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1586 1611 1581 1616 0.80
60 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1610 1635 1605 1640 0.80
61 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1634 1656 1629 1663 0.80
62 79 1.1 2.5e+02 2.4 0.0 14 36 1658 1680 1652 1687 0.80
63 79 1.1 2.5e+02 2.4 0.0 14 36 1682 1704 1676 1711 0.80
64 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1706 1731 1701 1737 0.81
65 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1730 1752 1725 1759 0.80
66 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1754 1776 1749 1783 0.80
67 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1778 1803 1773 1808 0.80
68 79 0.99 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1802 1827 1797 1832 0.80
69 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1826 1851 1821 1857 0.81
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71 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 1874 1896 1869 1903 0.80
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73 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1922 1947 1917 1952 0.80
74 79 1 2.4e+02 2.5 0.0 14 39 1946 1971 1941 1976 0.80
75 79 0.98 2.4e+02 2.5 0.1 14 39 1970 1995 1964 2000 0.81
76 79 0.96 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 1994 2019 1989 2025 0.81
77 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 2018 2040 2013 2047 0.80
78 79 1.1 2.6e+02 2.4 0.0 14 36 2042 2064 2037 2071 0.80
79 79 0.95 2.3e+02 2.6 0.0 14 39 2066 2091 2061 2097 0.81

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAAGCTTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCGCACGCCGCTGACGCCCcccccgccgccgcgccgctgcccCTCGAAGTACGCGGCGCCGTGCCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCCGTGCCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCCGTGCCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCGCACGCCGCTGACGCCCcccccgccgccgcgccgctgcccCTCGAAGTACGCGGCGCCGTGCCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCCGTGCCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCCGTGCCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCAGTGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAGCCCACCTCGCGGATAGTTACTCACTCATGAGCGCGGGCTGGTGCGCGGCCCGCGCGGCGCTGTGTCGGTAG
Protein Sequence
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