Mvar003961.1
Basic Information
- Insect
- Mylabris variabilis
- Gene Symbol
- snpc-4
- Assembly
- GCA_037464815.1
- Location
- JAZBGW010001215.1:8466-10943[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 5 2.4e-05 0.021 14.9 0.0 22 43 268 291 264 293 0.94 2 5 1.6e-08 1.4e-05 25.1 0.3 1 43 300 344 300 345 0.96 3 5 1.5e-12 1.3e-09 37.9 0.1 1 46 353 402 353 402 0.97 4 5 3.5e-09 3e-06 27.2 0.0 1 46 410 455 410 455 0.97 5 5 1.5e-07 0.00013 22.0 0.1 1 45 461 505 461 506 0.95
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGATGATAACGAACAAGacgtagaaaaattaaatgagattCTAAGCCACCACAAAACTAATGCATTCGAGGaggaattttgtaatttcctCGACTCAAACCAATATACAGAGGAAGATgTATTCTTCGATGATAATACCGATACATCAGATATTGATGAATTCGATACTGATACAATCAATGTTTTAACAGaggatgaaattgaaattatcaacaCATGTATGGattatgatttaaaacaaatattagaattgaatcgtatcaaaaatttcaaattaattaaattacgtgCATATATTGAGaatttaattgagaattgtaatgaaatgattaaagaaaatcaagaAGAAATCTTGGATGtagataataaacaacaaatgaatgtTGATTGTGTAAAATTATTACCACCAATTAAAATACCCATATGGAAATTGGGTGCACCGTAttttaaatgtcaaaattattatttcagtCCTTATAATGATGATGTGAAACGGAAACGTTATAATaaggaattattattaaatgattatttatatgAACCGAAAGCATGGACAAAGTTAGATTGTCATAGTCTATTGaatggtgttttattttattataatatcaaTCGACAAAACGACATTAAAAGAGAGATTGCTAATTTAAAAGTCATCATTCATGATGTGGGTAATGATGTGGATTTATTAACGGAATTACACAGATTACAAGACGAATTGGAACGGTTGAATACACAAAAACAGATAAAAAACGTCGATAAGGCTGTATTACCTATATTACCAAAGAGTGATGATTATATAGATTGGAATAAAATCGCTGAAATGTTCTTTTACGataaaaaaacagCAGAAGAGTGTCGCACCTTTTGGCATATTTATGCACATCCcagtataaataaacaaacatggACAAAAGACGAGAATACTAAATTACGAAAATTAGTAAAATCttacaattatcaaaattgggAAATGATAACTAACGagttaaataataatcgtacAGCTTTTACAATAGCATTACATTTCTATCGTgatttatacaataaatttttacgTCGTAAATTCACTAATAATGaagatcaattattattagaattaattgatttatatcgTATGGGTGATTTTATATCGTGGCGTAAAATTTccgaatattttccaaatcgatCACGTCAACAATtatatcatcattatcgttattatttatcaatgaatcaaacaataaaaaaaggtaAATTCACCGATGCTGaagatatattattattaatattagtaGATCGTTATGGTACCGATTTTGGTAAATGTTCGAAATTTATCGAGAATCGTAGTCATGTACAATTAAAGAGTCGTTATCGacaaaatttagaaacttATAAACGTAAAGGTACATTTACAATAGATGATGATATGGAGATTATAAAACATGTTGAAATTAATGGTGAAAGTAAATGGGGTAAATTGAGTATTAAATTGAATCGTACACGTGGTACTGTACGGCAACgttatcaaacaattaaacaatatttaaaaatgaatcgTAATGCTACAATTGAAGATATACCGAAACGTAAACATGGTGAATTAATGAAAACGAATCAACAACATTATGAATTTATAAGGTATGTTGcggataaatttaaaaattcacaaattatACCAACATTAGagatgattgaaaaattcttaaataatgataatgatgatgatggtttaGTTGatagatttaataaaaaacaaaaaaattatcaacaaagtATTGATGCAATGTTGGTGGATTTCTTTGCAAACTCGTGTACgttaaaacaacacaaatataCGAATAAGAGTTtcgataaaatttcaaatgataTTATTAAGattctatcaattttaaatgttaatctAGAAATACCCGAAAATCTCGACGATTTACAATTAGATCGTATCGATacgattattttaaatcaactcaaaacaacaaaaatggaattgaatggaaattatttaataccgCCGAATATTAATACGTTAGTTGGTTTAAGAAGTATGTTGTTGCGATATCAATTACTAGATAAACACGATAATCAAACTTTATTGGAAATTGAATGTGATTTACAACAACACAGTATTGATGAACGAAATCAAATCCTTAATGAGCGACAACAATTCAGTGAACgtttcaataaattgtttatgtgGAGTTCGATTTTATCGTTAGAATCACCAACATCCAATGATTTTGATTGTGGTGAATCGACATCTAAacgaaaattggaaaatataaaaacttaCAGTAAACGACGCAAAACACGTTTTGATGATCTCGAATTTTTATAA
- Protein Sequence
- MDDNEQDVEKLNEILSHHKTNAFEEEFCNFLDSNQYTEEDVFFDDNTDTSDIDEFDTDTINVLTEDEIEIINTCMDYDLKQILELNRIKNFKLIKLRAYIENLIENCNEMIKENQEEILDVDNKQQMNVDCVKLLPPIKIPIWKLGAPYFKCQNYYFSPYNDDVKRKRYNKELLLNDYLYEPKAWTKLDCHSLLNGVLFYYNINRQNDIKREIANLKVIIHDVGNDVDLLTELHRLQDELERLNTQKQIKNVDKAVLPILPKSDDYIDWNKIAEMFFYDKKTAEECRTFWHIYAHPSINKQTWTKDENTKLRKLVKSYNYQNWEMITNELNNNRTAFTIALHFYRDLYNKFLRRKFTNNEDQLLLELIDLYRMGDFISWRKISEYFPNRSRQQLYHHYRYYLSMNQTIKKGKFTDAEDILLLILVDRYGTDFGKCSKFIENRSHVQLKSRYRQNLETYKRKGTFTIDDDMEIIKHVEINGESKWGKLSIKLNRTRGTVRQRYQTIKQYLKMNRNATIEDIPKRKHGELMKTNQQHYEFIRYVADKFKNSQIIPTLEMIEKFLNNDNDDDGLVDRFNKKQKNYQQSIDAMLVDFFANSCTLKQHKYTNKSFDKISNDIIKILSILNVNLEIPENLDDLQLDRIDTIILNQLKTTKMELNGNYLIPPNINTLVGLRSMLLRYQLLDKHDNQTLLEIECDLQQHSIDERNQILNERQQFSERFNKLFMWSSILSLESPTSNDFDCGESTSKRKLENIKTYSKRRKTRFDDLEFL
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- -
- 90% Identity
- -
- 80% Identity
- -