Basic Information

Gene Symbol
mybM
Assembly
GCA_028455855.1
Location
JAPTHL010000054.1:431234-433763[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 0.0016 1.1 9.0 0.1 22 45 262 287 260 288 0.90
2 5 5.6e-09 4e-06 26.4 0.8 1 43 294 338 294 339 0.96
3 5 3.2e-10 2.3e-07 30.4 0.1 2 46 348 396 347 396 0.96
4 5 4.9e-10 3.4e-07 29.8 0.0 1 46 403 448 403 448 0.97
5 5 1.3e-06 0.00091 18.9 0.1 1 45 454 498 454 499 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGATTATAACGAAAATAATGAACAAGATGTGGCGAAATTAATTGAAATTATAAAACACCATAAAACCGAAATAAGCAAGGAACTTGAAGATGAATTCGGTGATTTTATTAATTTCGAACAAAATGCGAATGAGGATATATTTGAAGATTCCGATACAGATATTGAAACATTCGATGAAAACCACCAACAAGAACAATCATCAAATAATTGTTTGACCGAATATGAAGTTGAACTGATAAATTCATGTATAGATCATGAATTACAACAAGTACTCATATTGAATCGTTCAAAAAACTTTAAATTAATCAAATTACGCGCCTACATTGATAATTTATTATACGATTGTGATAAAACAATTAATCAAGAGAATATTAATTGTGGGGATGATATCAAATTATCACCACCAATTAAAACACCAGTATGGAAATTGGGGGCACCATATTTTAAATGTTCAAATTATTATTGTAGTCCATATAATGAAGATGTTGAACGGAAGAAATATAATAAAGAATTATTATTAAACGATTTGTTATATGAACCACAACCATGGACGAAATTAGATTGTGATAATTTATTGAATGGTGTTCTATTGAATTATAATATTAACAAGCAAACTGATATAAAAAGGAGGATATGCAATTTAAAACGTAAAATTACTGATGATGTTGATGGTAAGCAGAATTTGTCAACAGTAATACAAGATTTAGAAAGCGATTTAGATCGATTGAATAATGCAGATGCAAATGATACACCGCCAGTATTGAATAGTGATGAATATATCGATTGGAATAAAGTAGCAGATTCATTCTTCCAAGACAGAAGAACAGGGGATGAGTGTCGCGCTTTATGGCATATCTATCTACATCCAAATATAAATAAAAAATCATGGACCAAAGAGGAGAATAACAAATTAAATAAACTGGTAAAAGAATACAATTATCAAAATTGGGAGATAATCTCATTAAAATTAGAAAGTAATCGTTCACAATTTACAGTAGCATTACATTATTATCGTGATATACACGATAAATATGCACATGTAAAATTTACCAAAAATGAAGATAAATTATTATTAGAATTAATTGATTTATATCGTATGGCCAATTTTATACCATGGCGTAAAATATCTGAATACTTTTCAAATAGATCACGTCAACAATTATACCATCATTACACATATTATTTGTCAAAGAATGATGTGAAGAAAGGCAAATTCTCAGATGCTGAAGATATTCTATTATTGATTTTAGTTGATCAATACGGTACGGATTTTCGGAAATGTTCTGAATTTATTGAGAATCGTAGCCAAGTACAATTGAAAAGTCGTTATCGACAAAATTTAGAAAATTATAAACGTAAAGGCACATTCACAATTGACGATGATATGGAAATTTTAAAACATGTTAAGCATAATGGTGAACGTTCATGGGGTGTATTAAGTAAGAAATTGAATCGCACTAGAGGCACATTACGGCAACGCTATCTAACAATTAAACAATATTTAAAAACAAACGCAAATGCTAACATTGAAGATATACCAAAACGTAAACACCATGAACTGATGAAGAAACATCAACATTACGAATTTGTACGATATGTTGCTGATAAATTTAAAAATATCGAAAATGTACCGACATTAGGGATGATTGAAGAATTCCTAGAAAATACAAatgatgatgatgatgatgatggtaatgacgataccacaactacaaaaaAAACGAATAGAAATAATAGGAATTCTAGGAAAACTATCGACACAATGTTGATAAATTTCTTTGCGAATTCTTGTAAAATCAAACAACAGAAATATGTGAAAAACTATGATAGAATCTCAAATGATATCAATGAAATTCTAACAATTCTAAATGTTGATTTAGACATACCAACAGATTATCAAAACGATCACCGATTGGATCATAGCGACAAAATTATTTTAAATCAATTGTCAATAAAGAATAATCTAACAATAAATACAAATCAATTGATACCACCAAATATCAATACATTAATTGGCTTAAGAAGTATGCTACTTAAACACAAATATTTAGAGAAAAATCAAAATGAACAAAATCGACTTTTATGGGAAATTGAACGTGATTTATTAAATTACAATATCGATGAACAGAATCGAATAATAAATGATAGAAAATTGTTTACTGAACGTTTTAATAAATTGCATACATGGAGTTCAATTTTATCACTTGAACCACCACCAAATTGTATCGATGATAGTGATGATGATTTAGAGCCGATAGCAAAACGACGAAAACTCGAAAATATTAAAACATATTCGAAAAGAACCGAACCAAAACCGTCTACAAGTCGATGTGATTTATGA
Protein Sequence
MDYNENNEQDVAKLIEIIKHHKTEISKELEDEFGDFINFEQNANEDIFEDSDTDIETFDENHQQEQSSNNCLTEYEVELINSCIDHELQQVLILNRSKNFKLIKLRAYIDNLLYDCDKTINQENINCGDDIKLSPPIKTPVWKLGAPYFKCSNYYCSPYNEDVERKKYNKELLLNDLLYEPQPWTKLDCDNLLNGVLLNYNINKQTDIKRRICNLKRKITDDVDGKQNLSTVIQDLESDLDRLNNADANDTPPVLNSDEYIDWNKVADSFFQDRRTGDECRALWHIYLHPNINKKSWTKEENNKLNKLVKEYNYQNWEIISLKLESNRSQFTVALHYYRDIHDKYAHVKFTKNEDKLLLELIDLYRMANFIPWRKISEYFSNRSRQQLYHHYTYYLSKNDVKKGKFSDAEDILLLILVDQYGTDFRKCSEFIENRSQVQLKSRYRQNLENYKRKGTFTIDDDMEILKHVKHNGERSWGVLSKKLNRTRGTLRQRYLTIKQYLKTNANANIEDIPKRKHHELMKKHQHYEFVRYVADKFKNIENVPTLGMIEEFLENTNDDDDDDGNDDTTTTKKTNRNNRNSRKTIDTMLINFFANSCKIKQQKYVKNYDRISNDINEILTILNVDLDIPTDYQNDHRLDHSDKIILNQLSIKNNLTINTNQLIPPNINTLIGLRSMLLKHKYLEKNQNEQNRLLWEIERDLLNYNIDEQNRIINDRKLFTERFNKLHTWSSILSLEPPPNCIDDSDDDLEPIAKRRKLENIKTYSKRTEPKPSTSRCDL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
-